生物信息学在预测和鉴定变形链球菌非编码RNA中的应用

生物信息学在预测和鉴定变形链球菌非编码RNA中的应用夏丽;王成龙;储冰峰
【期刊名称】《中华老年口腔医学杂志》
【年(卷),期】2015(13)4
【摘要】目的:通过生物信息学方法预测得到变形链球菌基因组中可能存在的非编码RNA,并进行序列鉴定.方法:通过4种生物信息学预测细菌非编码RNA的方法,系统分析变形链球菌UA159基因组,对部分序列采用RT-PCR实验进行初步验证,将实验证实的序列进行家族鉴定.结果:预测得到变形链球菌UA159中的sRNA共334条,对其中40条至少由两种生物信息学方法预测得到的序列,用RT-PCR进行初步验证,检测到5条sRNA.经生物信息学鉴定,2条属于已知的家族序列,3条未检测到家族序列.结论:生物信息学方法在预测和鉴定变形链球菌sRNA方面,有重要的应用价值.
【总页数】4页(P193-196)
【作者】夏丽;王成龙;储冰峰
【作者单位】解放军总医院海南分院口腔科海南572013;解放军总医院口腔科北京 100853;解放军总医院口腔科北京100853
【正文语种】中文
【中图分类】R78
【相关文献】
1.生物信息学在长非编码 RNA 研究中的应用 [J], 李俊豪;杨建华;屈良鹄
2.变形链球菌耐氟菌ffh基因siRNA干扰序列的筛选鉴定 [J], 张桐菲;王城坤;洪丽华;张志民
3.变形链球菌表面蛋白真核表达载体pcDNA3-PAc的构建Ⅲ.变形链球菌表面蛋白PAc编码基因pac的体外扩增 [J], 刘建国;刘天佳;周学东;杨德琴;张义正;王海燕
4.建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展 [J], 张海峰;吴炳礼;方国强;杜则澎;黄俏;许丽艳;李恩民
5.植物长链非编码RNA的生物信息学预测与分析研究进展 [J], 蔡媛;钟灿;刘浩;金剑;王勇庆;张水寒
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。