Vitek 2 Compact GN卡用于不同培养基生长类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定结果分析
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果分析
黄梅会1,郑霄2,吴华1,王旭明1(1. 海南省人民医院检验科,海口 ; 570311 2. 中国疾病预防控制中心传染病预 防控制所,北京 ) 102206
摘要:目的 评估不同培养基生长类鼻疽伯克霍尔德菌在 Vitek 2 Compact 中的鉴定结果。方法 收集 2010 年 6 月至 2017 年 5 月海南省人民医院分离的类鼻疽伯克霍尔德菌 127 株,分别接种于哥伦比亚羊血平板(CBA)、麦康凯平板(MAC)和流感嗜 血巧克力平板(CHA)上,以多位点序列分型(MLST)为金标准,评估 Vitek 2 Compact VT2.R7.01 版 GN 卡对不同培养基上生长 的类鼻疽伯克霍尔德菌的鉴定准确性。结果 CBA 平板上生长的类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定准确率最高,为 98. , 4% 2 株被错 误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌;MAC 次之,准确率为 94.5%,其中 4 株被错误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,2 株为伯克霍尔德菌某 种,1 株被错误鉴定为铜绿假单胞菌;CHA 鉴定准确率最低,为 91.3%,其中 4 株被错误鉴定为洋葱伯克霍尔德菌,2 株为伯克 霍尔德菌某种,5 株无鉴定结果。结论 Vitek 2 Compact GN 卡对不同培养基上类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定准确率不同,建议优 先选择 CBA 平板上菌落。 关键词:类鼻疽伯克霍尔德菌;培养基;Vitek 2 Compact 中图分类号:R446.5 文献标志码:A
CHCA 基质液(法国生物梅里埃公司);TC48/ T/ H
()a PCR 扩增仪(Bioer 公司);DNA 提取试剂盒、
Taq DNA 聚合酶、PCR Buffer(大连宝生物公司);LB
琼脂平板、CBA 平板、麦康凯平板(MAC)、流感嗜血
巧克力平板(CHA,郑州安图生物公司);引物由天
一辉远公司合成。
1 材料与方法
1.1 菌株来源 收集海南省人民医院 2010 年 6 月 至 2017 年 5 月临床分离 137 株 Bp,常规分离后均 采用哥伦比亚羊血平板(CBA)进行转种,珠海迪尔
细菌鉴定系统、Vitek 2 Compact 及质谱仪(本实验室
已成功建立本地的 Bp 参考质谱图库)共同鉴定后
-80 ℃贮存。经中国疾病预防控制中心通过 MLST
分型确认的其中 127 株菌株进行本研究。质控菌株
阴沟肠杆菌 ATC仪器及试剂 DL96 细菌测定系统(珠海
迪尔生物公司);Vitek 2 Compact(软件版本为 VT2.
R7.01)及 配 套 GN 卡、Vitek MS 质 谱 仪 及 配 套
, 聚 合 酶 ( ) dNTP Mixture 4 μL Taq DNA
5 U / μL
0.4 μL,上、下游引物 (20 )各 μmoL/ L 1 μL,模板
。 反应条件: ; , DNA 1 μL PCR
94 ℃ 7 min 94 ℃ 45 s
1.3 质谱鉴定 质谱图库建立:获取经分子确认 30
株 Bp 质谱图,将质谱结果导入 SARAMIS 数据库,
创建 Reference Spectre 数据库。选取 130 株菌对其
进行验证,准确率为 98%。菌株鉴定:挑取单个细
菌菌落均匀涂布于靶板,待完全干燥后加 1 μL
CHCA 基质液形成结晶,按照仪器科研库操作说明
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临床检验杂志 年 月第 卷第 期 , , , 2019 7 37 7 Chin J Clin Lab Sci Jul. 2019 Vol.37 No.7
: DOI 10.13602 / j.cnki.jcls.2019.07.09
·临床实验研究·
Vitek 2 Compact GN 卡用于不同培养基生长类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定结
临床检验杂志 年 月第 卷第 期 , , , 2019 7 37 7 Chin J Clin Lab Sci Jul. 2019 Vol.37 No.7
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, DNA 1 ∶50 稀释后作为 PCR 模板使用。PCR 反应
体系 : , , 50 μL ddH2O 37.6 μL 10 ×PCR Buffer 5 μL
类鼻疽病(melioidosis)是类鼻疽伯克霍尔德菌 ( , )引起的一种起病急、 Burkholderia pseudomallei Bp 进展快和致死率较高的感染性疾病。当前检测 Bp 的方法有质谱技术、分子生物学方法、生化鉴定等。 质谱技术鉴定 Bp 具有简便、快速、可重复性高等特 点[1],但由于商业化的质谱图库尚无 Bp 的参考图 谱,需各地区建立本地的 Bp 参考质谱图库。分子 生物学方法如 16S 、多 rRNA 位点序列分型[2](multi , )、实时荧光环介导等温 locus sequence typing MLST 扩增技术[3]等鉴定快速、准确,但因其技术要求较 高,需要特殊的仪器而无法常规应用。快速生化分 析系统如 API 鉴定 20NE[4] Bp 准确率可达 80%以 上,但其结果不稳定,检测周转时间较长。Vitek 2 可快速鉴定大部分细菌(包括 Bp)及酵母菌,但其存 在将 Bp 误鉴定为洋葱伯克霍尔德或无鉴定结果的 情况[5]。本研究应用 Vitek 2 Compact 对 3 种不同 培养基上生长的 127 株类鼻疽伯克霍尔菌进行鉴 定,以期进一步了解不同培养基对该菌鉴定准确率 的影响。
书进行鉴定。
1.4
分型鉴定 MLST
[2]
细菌基因组 DNA 制备:选
取单个菌落密集划线接种于新鲜 LB 琼脂平板,
35 ℃培养 24 h 后使用 DNA 提取试剂盒提取基因组
基金项目:海南省重点研发项目(ZDYF2018113);海南省自然科学基金(817319)。 作者简介:黄梅会,1986 年生,女,硕士研究生,主治医师,从事临床微生物研究。 通信作者:王旭明,副主任技师,大学本科,Email:wxmhn1260@ 。 163.com