水饱和酚(Phenol Water)
各种试验中试剂的成分和作用
一、碱裂解法提质粒：2、每个曾经用碱法抽提过质粒的同学，希望你看本文后能有所思考，让中国的未来有希望。
为了方便理解，这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液：溶液I，50 mM葡萄糖/ 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA，pH 8.0；溶液II，0.2 M NaOH / 1% SDS；溶液III，3 M 醋酸钾/ 2 M 醋酸。
让我们先来看看溶液I的作用。
任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液，是再自然不过的了。
那么50mM 葡萄糖是干什么的呢？说起来不可思议，加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言，几乎没有任何影响。
所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
那么EDTA呢？大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I 中加入高达10 mM 的EDTA，无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要不磨洋工，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果哪天你手上正好缺了溶液I，可不可以抽提质粒呢？实话告诉你，只要用等体积的水，或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
轮到溶液II了。
这是用新鲜的0.4M的NaOH和2％的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4M的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS(?)，所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer（双层膜）结构向micelle（微囊）结构的相变化所导致。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理1．溶液I—溶菌液：溶菌酶：它是糖苷水解酶，能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键，因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时，溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖：增加溶液的粘度，维持渗透压，防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA：（1）螯合Mg2＋、Ca2＋等金属离子，抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用（DNase作用时需要一定的金属离子作辅基）;（2）EDTA的存在，有利于溶菌酶的作用，因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
2．溶液II－NaOH－SDS液：NaOH：核酸在pH大于5，小于9的溶液中，是稳定的。
但当pH＞12或pH＜3时，就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1／L，加抽提液时，该系统的pH就高达12.6，因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS：SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有：（1）溶解细胞膜上的脂质与蛋白，因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
（2）解聚细胞中的核蛋白。
（3）SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R＋-蛋白质的复合物，使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用，所以在以后的提取过程中，必须把它去除干净，防止在下一步操作中（用RNase去除RNA时）受到干扰。
3. 溶液III--3mol／L NaAc（pH4.8）溶液：NaAc的水溶液呈碱性，为了调节pH至4.8，必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液，调回pH至中性，使变性的质粒DNA能够复性，并能稳定存在。
而高盐的3mol／L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷，减少相斥力而互相聚合，后者是因为钠盐与SDS－蛋白复合物作用后，能形成较小的钠盐形式复合物，使沉淀更完全。
碱裂解提取质粒各个试剂作用
质粒提取试剂的原理碱裂解法从大肠杆菌制备质粒，是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。
可是我收研究生十几年了，几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。
追其原因，我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤，而没有对原理进行详细的论述。
这是导致我的学生误入歧途的主要原因。
后来我发现其实是整个中国的相关领域的研究生水平都差不多，甚至有很多“老师”也是这个状态。
这就不得不让人感到悲哀了。
为了方便理解，这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液：溶液I：50 mM葡萄糖/ 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA，pH 8.0；溶液II：0.2 N NaOH / 1% SDS；溶液III： 3 M 醋酸钾/ 2 M 醋酸。
让我们先来看看溶液I的作用。
任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM 葡萄糖是干什么的呢？说起来不可思议，加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言，几乎没有任何影响。
所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
那么EDTA呢？大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I 中加入高达10 mM 的EDTA，无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要不磨洋工，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果哪天你手上正好缺了溶液I，可不可以抽提质粒呢？实话告诉你，只要用等体积的水，或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
轮到溶液II了。
核酸提取常见试剂的作用原理
核酸提取常见试剂的作⽤原理异硫氰酸胍强⽤⼒的蛋⽩质变性剂，能迅速溶解蛋⽩质，导致细胞结构破碎，核蛋⽩由于其⼆级结构的破坏消失⽽迅速与核酸分离。
胍盐是破坏蛋⽩质三维结构的离液剂，在通常使⽤的蛋⽩质变性剂中作⽤最强的是异硫氰酸胍，它们可以使多数蛋⽩质转换成⼀随机的卷曲状态。
含有强⼒的阴离⼦和阳离⼦基团，它们可以形成较强的氢键。
在还原剂存在的情况下，异硫氰酸胍可以断裂氢键，⽽去垢剂，如SDS存在的情况下，可以破坏疏⽔作⽤。
盐酸胍、尿素盐酸胍是⼀个核酸酶的强抑制剂，它并不是⼀种⾜够强的变性剂，可以允许完整的RNA 从富含RNase的组织中提取出来。
4-8M可断裂氢键，有两种可能机制：1变性蛋⽩和盐酸胍、尿素优先结合，形成变性蛋⽩-变性剂复合物，当复合物被除去，从⽽引起N-D反应平衡向右移动，随着变性剂浓度增加，天然状态的蛋⽩不断转变为复合物，最终导致蛋⽩质完全变性；2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作⽤，能形成氢键，当浓度⾼时，能破坏⽔的氢键结构，结果盐酸胍、尿素就称为⾮极性残基的较好溶剂，使蛋⽩质内部的疏⽔残基伸展和溶解性加强，盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。
⾼浓度尿素使蛋⽩质变性并抑制Rnase活性⼗⼆烷基肌氨酸钠使蛋⽩质解体变性巯基试剂1防⽌蛋⽩质或酶等（如辅酶A）分⼦中SH基团氧化成⼆硫键，2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。
DTT，DDTE、巯基⼄醇应⽤最⼴，⾕胱⽢肽也常应⽤，由于他是⽣物体内的还原剂，同时氧化后能被⾕胱⽢肽还原酶原位释放。
DNA提取中，常使⽤巯基⼄醇，维持缓冲液的还原环境，防⽌多酚类氧化，由于具有⼀定的毒性，浓度不应⾼于2%。
巯基⼄醇β-巯基⼄醇的主要作⽤是破坏RNase蛋⽩质中的⼆硫键（肽和蛋⽩质分⼦中的半胱氨酸残基中的键）。
1 还原蛋⽩质⼆硫键，使Rna酶变性2 抑制酚类氧化，若氧化，核酸会变成灰⿊⾊，苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸⼆酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联3 保护蛋⽩质的巯基蛋⽩质提取中需要巯基⼄醇还原⼆硫键，使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏⽔键、盐键、氢键、范德华⼒使蛋⽩质变性但不影响肽键和⼆硫键，不能使蛋⽩质彻底变性加上还原剂巯基⼄醇或DTT，能还原⼆硫键，使RNA彻底变性DTT⼆硫苏糖醇刺激性⽓味要⼩很多，毒性也⽐巯基⼄醇低很多。
DNA提取的几种方法
DNA提取的几种方法DNA提取的几种方法(1).浓盐法利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同，将二者分离，常用的方法是用1M氯纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间，而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA钠盐沉淀出来.也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.以稀盐酸溶液提取DNA时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA的分离。
在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.(2).阴离子去污剂法：用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA.由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.(3).苯酚抽提法：苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相，而DNA溶于水相。
离心分层后取出水层，多次重复操作，再合并含DNA的水相，利用核酸不溶于醇的性质，用乙醇沉淀DNA。
此时DNA是十分粘稠的物质，可用玻璃漫漫绕成一团，取出。
此法的特点是使提取的DNA保持天然状态.(4).水抽提法：利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA，然后将沉淀溶于水中，使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66%٠；80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.提取DNA主要有SDS和CTAB法，其实提取效果的好坏主要看提取的对象是什么样的材料，在提取之前一定要好好分析材料的特性，然后在设计实验步骤。
水饱和苯酚配方
水饱和苯酚配方
水饱和苯酚是一种化学试剂，通常用于生物化学实验中，尤其是DNA提取过程中，作为沉淀蛋白质的试剂。
配方相对简单，但需要注意操作安全，因为苯酚对皮肤和眼睛有强烈刺激性，并且与水混合时会释放出热量。
水饱和苯酚配方如下：
取适量无水苯酚（纯度较高），加入一个耐化学品、耐高温的容器中。
缓慢加入等体积的蒸馏水（分多次加入），每次加水后需充分振荡或磁力搅拌使苯酚溶解，直至观察到溶液顶部出现一层清晰的油状层，底部是透明的水层，两层之间界限分明，此时即达到水饱和状态。
注意：由于苯酚在40-60℃左右与水形成恒沸物，因此在配制过程中需要小心控制温度，避免剧烈放热导致危险。
一般在冰浴条件下缓慢加入蒸馏水以防止过热。
最终得到的水饱和苯酚应当静置分层后，在4℃下保存备用，使用前轻轻摇匀，取上层液使用。
在实际操作中，通常不会直接给出具体的比例，而是根据实验需求通过分步添加水至不再溶解为止来获得。
(完整版)碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及可能出现的问题
碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及提取中可能出现的问题一、质粒提取三种溶液的作用：1.溶液I溶液Ⅰ：50 mM葡萄糖，25 mM Tris-HCl，10 mM EDTA，pH 8.0任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH 值的Tris-HCl溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言几乎没有任何影响，所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I中加入高达10 mM 的EDTA，就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果手上正好缺了溶液I，可不可以抽质粒呢？只要用等体积的水或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
1. 溶液II溶液II，0.2 N NaOH，1% SDS轮到溶液II了。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的0.4 N NaOH，即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下)，自然就难高效率抽提得到质粒。
钙盐染色液配方及使用方法
钙盐染色液，钙盐染色产品编码产品名称产品规格保存条件北京华越洋5NF061 钙盐染色液(茜素红S法) 2×50ml 室温,避光,6个月北京华越洋5NF062 钙盐染色液(改良茜素红S法)3×50ml 4℃,避光,6个月北京华越洋5NF063 钙盐染色液(硝酸银法) 2×50ml 4℃,避光,6个月用途：钙盐染色注意事项：钙沉积物成橘红色,染色时间取决于钙的含量,检测少量钙时更有效。
复染液为固绿。
MTT溶液过碘酸-雪夫（AB-PAS）染色试剂盒过碘酸-雪夫（快速）染色试剂盒糖原PAS过碘酸雪夫染色试剂盒Bennhold刚果红染色试剂盒钙盐染色液（FeH）染色试剂盒Gordon-Sweets银氨溶液100ml 结缔染色网状纤维染色,可区分胶原纤维网状纤维染色试剂盒(改良Gomori氨银法) 5×100ml 结缔染色网状纤维染色,可区分胶原纤维网状纤维染色试剂盒(改良Gomori氨银法) 5×50mlGomori氨银溶液500ml 结缔染色网状纤维染色,可区分胶原纤维羟胺溶液(1.5mol/L,pH8.5) 100ml 135 室温,3个月细胞其他青霉素-链霉素混合溶液(100×双抗) 100ml 68 —20℃,12个月抗生素青霉素-链霉素-庆大霉素混合溶液(100×三抗) 100ml 195 —20℃,12个月抗生素秋水仙碱溶液(Colchicine,10mg/ml) 5ml 143 4℃,避光,6个月药物去离子甲酰胺100ml 120 4℃,避光,12个月RNA溶液任氏液500ml 128 4℃,3个月细胞其他溶菌酶(Lysozyme,10mg/ml) 5ml 90 —20℃,12个月核酸提取鞣酸/单宁酸水溶液(5%) 100ml 68 室温,12个月结缔染色乳酸酚棉蓝染色液100ml 180 室温,避光,12个月微生物染色乳酸脱氢酶染色液(H型,四唑盐法) 2×50ml 375 4℃,避光,6个月酶类染色乳酸脱氢酶染色液(M型,四唑盐法) 2×50ml 375 4℃,避光,6个月酶类染色乳酸脱氢酶染色液(四唑盐法) 2×50ml 360 4℃,避光,6个月酶类染色乳酸银显影液100ml 105 室温,避光,6个月免疫组化瑞氏-姬姆萨复合染色液2×100ml 188 室温,12个月微生物染色瑞氏-姬姆萨复合染色液2×500ml 630 室温,12个月微生物染色瑞氏染色液(Wright stain) 2×50ml 75 室温,12个月微生物染色瑞氏染色液(Wright stain,) 2×100ml 113 室温,12个月微生物染色瑞氏染色液(Wright stain,) 2×500ml 390 室温,12个月微生物染色瑞氏染色液(Wright stain,即用型) 100ml 105 室温,12个月微生物染色瑞氏染色液(Wright stain,即用型) 500ml 375 室温,12个月微生物染色弱磷酸盐缓冲液(LoPBS,pH7.0) 100ml 120 4℃,12个月蛋白其他噻嗪红染色液(0.1%) 100ml 90 室温,避光,12个月染色其他噻嗪红染色液(0.2%) 100ml 105 室温,避光,12个月染色其他三磷酸腺苷溶液(ATP,10mmol/L) 10ml 75 —20℃,12个月PCR相关三氯化铁水溶液(10%) 100ml 53 室温,12个月常规其他三羟甲基甘氨酸加样缓冲液(2×) 10ml 75 4℃,6个月蛋白电泳沙黄/藏红T水溶液(2%) 100ml 83 室温,避光,6个月微生物染色山梨醇-磷酸盐溶液(1.2mol/L,pH7.5) 100ml 68 室温,6个月细胞组分分离山梨醇-磷酸盐溶液(1.2mol/L,pH7.5,无菌) 100ml 128 室温,6个月细胞组分分离山梨醇溶液(1.1mol/L,无菌) 100ml 113 室温,6个月细胞组分分离山梨醇溶液(1mol/L) 100ml 60 室温,6个月细胞组分分离山梨醇溶液(1mol/L,无菌) 100ml 105 室温,6个月细胞组分分离神经HRP示踪显色液(DAB法) 50T 165 4℃,避光,6个月神经染色神经HRP示踪显色液(TMB法) 50T 165 4℃,避光,6个月神经染色生理盐水(1×NS,无菌) 500ml 45 室温,12个月常规其他生理盐水(10×NS,无菌) 500ml 53 室温,12个月常规其他石碳酸复红染色液100ml 135 室温,避光,18个月微生物染色双链DNA变性缓冲液100ml 75 室温,12个月核酸杂交双缩脲法蛋白定量试剂盒500T 150 4℃,12个月蛋白检测双缩脲法蛋白定量试剂盒1000T 255 4℃,12个月蛋白检测双缩脲总蛋白试剂100ml 75 4℃,12个月蛋白检测水饱和酚(Phenol Water) 100ml 90 4℃,避光,3个月核酸提取顺丁稀二酸缓冲液(MAB,pH7.5) 500ml 90 室温,36个月核酸电泳苏丹Ⅲ酒精饱和溶液100ml 120 室温,避光,12个月脂类染色苏丹Ⅲ脂肪染色液3×50ml 240 室温,避光,12个月脂类染色苏丹Ⅳ染色液3×50ml 225 4℃,避光,12个月脂类染色苏丹Ⅳ染色液-A液100ml 120 室温,避光,12个月脂类染色酸性磷酸酶染色液(偶氮偶联法) 2×50ml 885 4℃,避光,6个月酶类染色酸性磷酸酶染色液(硝酸铅法) 2×50ml 300 4℃,避光,6个月酶类染色酸性乙醇分化液(0.5%) 500ml 75 室温,12个月染色其他。
质粒提取问题
质粒提取之达人建议碱裂解法从大肠杆菌制备质粒，是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。
可是我收研究生十几年了，几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。
追其原因，我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤，而没有对原理进行详细的论述。
这是导致我的学生误入歧途的主要原因。
后来我发现其实是整个中国的相关领域的研究生水平都差不多，甚至有很多“老师”也是这个状态。
这就不得不让人感到悲哀了。
我想这恐怕和我们的文化有点关系。
中国人崇尚读书，“学而优则仕”的观念深入人心。
经常听到的是父母对他们的独苗说，你只要专心读好书就可以了。
所以这读书的定义就是将教课书上的东西记住，考试的时候能拿高分……这就是现代科学没有在中国萌发的根本原因。
如果中国文化在这一点上不发生变化，那么科学是不能在中国真正扎根的，它只能蜕化成新的“八股学”。
生命科学是实验科学，它讲究动手。
如果实验科学只要看看书就可以了，那我想问有那位神仙看看书就会骑自行车了？或者听听体育老师的讲解就会滑冰了？可是光动手不思考，不就成了一个工匠？一个合格的生命科学研究者，需要在这两方面完善自己。
一个杰出的科学工作者，是一个熟知科学原理并善于应用的“艺术家”。
每个曾经用碱法抽提过质粒的同学，希望你看本文后能有所思考，让中国的未来有希望。
为了方便理解，这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液：溶液I，50 mM葡萄糖/ 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA，pH 8.0；溶液II，0.2 N NaOH / 1% SDS；溶液III，3 M 醋酸钾/ 2 M 醋酸。
让我们先来看看溶液I的作用。
任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？说起来不可思议，加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
碱裂解法提取质粒-配方,操作说明
碱裂解法提取质粒一、基本概念1．质粒：质粒是染色体外能够进行自主复制的遗传单位，包括真核生物的细胞器和细菌细胞中染色体以外的脱氧核糖核酸(DNA)分子。
现在习惯上用来专指细菌、酵母菌和放线菌等生物中染色体以外的DNA分子。
在基因工程中质粒常被用做基因的载体。
许多细菌除了染色体外，还有大量很小的环状DNA分子，这就是质粒(plasmid)。
质粒上常有抗生素的抗性基因，例如，四环素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。
有些质粒称为附加体(episome)，这类质粒能够整合进细菌的染色体，也能从整合位置上切离下来成为游离于染色体外的DNA分子。
目前，已发现有质粒的细菌有几百种，已知的绝大多数的细菌质粒都是闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。
细菌质粒的相对分子质量一般较小，约为细菌染色体的0.5%～3%。
根据相对分子质量的大小，大致上可以把质粒分成大小两类：较大一类的相对分子质量是40×106以上，较小一类的相对分子质量是10×106以下(少数质粒的相对分子质量介于两者之间)。
每个细胞中的质粒数主要决定于质粒本身的复制特性。
按照复制性质，可以把质粒分为两类：一类是严紧型质粒，当细胞染色体复制一次时，质粒也复制一次，每个细胞内只有1～2个质粒;另一类是松弛型质粒，当染色体复制停止后仍然能继续复制，每一个细胞内一般有20个左右质粒。
一般分子量较大的质粒属严紧型。
分子量较小的质粒属松弛型。
质粒的复制有时和它们的宿主细胞有关，某些质粒在大肠杆菌内的复制属严紧型，而在变形杆菌内则属松弛型。
在基因工程中，常用人工构建的质粒作为载体。
人工构建的质粒可以集多种有用的特征于一体，如含多种单一酶切位点、抗生素耐药性等。
常用的人工质粒运载体有pBR322、pSC101。
pBR322含有抗四环素基因(Tcr)和抗氨苄青霉素基因(Apr)，并含有5种内切酶的单一切点。
如果将DNA片段插入EcoRI切点，不会影响两个抗生素基因的表达。
质粒的提取
质粒DNA提取细菌质粒是一类双链、闭环的DNA，大小范围从1kb至200kb以上不等。
各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份，通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态，但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上，随着染色体的复制而复制，并通过细胞分裂传递到后代。
质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子，重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。
目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取，碱裂解法是最为常用的提取方法。
其优点是收获率高，适于多数的菌株，所得产物经纯化后可满足多数的DNA重组操作。
原理：用SDS和NaOH处理细菌后，会导致细菌细胞破裂，释放出质粒DNA 和染色体DNA，两种DNA在强碱环境都会变性。
由于质粒和主染色体的拓扑结构不同，变性时前者虽然两条链分离，却仍然缠绕在一起不分开；但后者完全变性甚至出现断裂，因此，当加入pH4.8的酸性乙酸钾降低溶液pH值，使溶液pH 值恢复较低的近中性水平时，质粒的两条小分子单链可迅速复性恢复双链结构，但是主染色体DNA则难以复性。
十二烷基磺酸钠（SDS）是一种阴离子表面活性剂，它既能使细菌细胞裂解，又能使一些蛋白质变性。
在离心时，大部分主染色体与细胞碎片，杂质等缠绕一起被沉淀，而可溶性的质粒DNA留在上清夜中。
再由苯酚/氯仿 /异戊醇沉淀、乙醇洗涤，可得到纯化的质粒DNA。
碱裂解法提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析等。
试剂配制及作用机理1. 溶液ⅠpH 8.0: 50mM葡萄糖，25mM Tris-HCl，10mM EDTA。
葡萄糖的作用是使悬浮后的大肠杆菌不会很快沉积到管子的底部，增加溶液的粘度，维持渗透压及防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA是Ca2＋和Mg2 ＋等二价金属离子的螯合剂，在溶液I中加入EDTA，是要把大肠杆菌细胞中的二价金属离子都螯合掉。
从而起到抑制DNase对DNA的降解和抑制微生物生长的作用。
HJ744-2015水质酚类化合物的测定气相色谱-质谱法
HJ744-2015⽔质酚类化合物的测定⽓相⾊谱-质谱法中华⼈民共和国国家环境保护标准HJ744-2015⽔质酚类化合物的测定⽓相⾊谱-质谱法Waterquality —Determinationofphenolscompounds—Gaschromatographymassspectrometry本电⼦版为发布稿。
请以中国环境科学出版社出版的正式标准⽂本为准。
2015-05-04发布2015-07-01实施（发布稿）环境保护部发布i⽬次前⾔ (II1)适⽤范围.............................................................................................................................................................12规范性引⽤⽂件................................................................................................................................................13⽅法原理 (14)试剂和材料........................................................................................................................................................15仪器和设备........................................................................................................................................................36样品 (37)分析步骤.............................................................................................................................................................48结果计算及表⽰................................................................................................................................................79精密度和准确度................................................................................................................................................810质量保证和质量控制 (811)废物处理...........................................................................................................................................................912注意事项..........................................................................................................................................................9附录A（规范性附录）⽅法的检出限和测定下限..................................................................................10附录B（资料性附录）⽅法的精密度和准确度汇总表 (11)ii前⾔为贯彻《中华⼈民共和国环境保护法》和《中华⼈民共和国⽔污染防治法》，保护环境，保障⼈体健康，规范⽔中酚类化合物的测定⽅法，制定本标准。
水饱和酚和Tris饱和酚的区别
水饱和酚和Tris饱和酚的区别
水饱和酚和Tris饱和酚的区别
水饱和酚和Tris饱和酚（ Phenoi Water/Tris-phenol）的区别：
一、水饱和酚又叫水平衡酚。
水饱和酚的PH小于7，一般是PH 为5.0左右，通常与异硫氢酸胍一
起使用，用于细胞RNA的提取，在酸性环境中，DNA在酚相，RNA在水相。
两者就分开了。
二、Tris饱和酚一般PH大于7.8，用于DNA的提取。
其中，酚是强的蛋白变性剂，可以使细胞或组织中的蛋白质变性析出。
而Tris 的主要作用是防治止酚类氧化，若酚类氧化，则会形成醌（两个苯环），醌含有强自由基，会破坏核酸结构。
同时，由于PH值大于7，在碱性环境中DNA处于水相，RNA处于
有机相。
从而分离上清，即可得到DNA。
Tris饱和酚的配置：
1、冰箱取出重蒸酚，室温放置－－－68度水浴溶化，切勿立即放入68度的水浴中，以防玻璃炸裂
2、加8－羟基喹啉至0.1％和β－巯基乙醇至0.2％，（原液14. 4MOL/ML），混匀，溶液呈现黄色，
倒入分液漏斗中（也可在烧杯中进行）
3、加入等溶剂的1MOL/ML的Tris(PH8.0),反复混匀后，静至分层；放出下层黄色酚液，弃上层
4、加固体Tris约1g/100ml酚，摇匀，去水相
5、加0.1MOL/MLTris(PH8.0)平衡数次，至PH为8.0
6、加0.1MOL/MLTris(PH8.0)于棕色瓶中4度保存
7、如黄色消失或呈粉红色（说明酚已经被氧化），则不能使用。
(完整版)碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及可能出现的问题
碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及提取中可能出现的问题一、质粒提取三种溶液的作用：1.溶液I溶液Ⅰ：50 mM葡萄糖，25 mM Tris-HCl，10 mM EDTA，pH 8.0任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH 值的Tris-HCl溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言几乎没有任何影响，所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I中加入高达10 mM 的EDTA，就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果手上正好缺了溶液I，可不可以抽质粒呢？只要用等体积的水或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
1. 溶液II溶液II，0.2 N NaOH，1% SDS轮到溶液II了。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的0.4 N NaOH，即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下)，自然就难高效率抽提得到质粒。
CTAB法原理总结
富含多糖和次生代谢产物的白桦成熟叶中总RNA的提取植物生理学通讯曾凡锁酚类物质是植物所特有的次生代谢物，它很容易被氧化成褐色的醌类物质，醌类物质与RNA的不可逆结合，不仅会使RNA的活性丧失，而且在苯酚和氯仿抽提时还会使RNA丢失，因此富含次生代谢产物的植物RNA提取一直是RNA分析研究中的障碍。
要获得完整性好的RNA，植物细胞破胞必须完全、迅速。
细胞破碎不完全，不仅使RNA 产量降低，而且还会因为植物细胞内部结构的破坏而产生内源性降解；时间过长则已释放的RNA酶还有可能会产生活性而降解RNA。
因此这是能否获得高质量RNA的最为关键性的一步（王玉成2002）。
其次则应考虑如何去除多糖。
但CTAB法通常要结合其他操作才能有效去除多糖，常见的方法有低浓度乙醇沉淀法、醋酸钾沉淀法、氯化锂沉淀法、提高缓冲液的氯化钠浓度等。
其中用氯化锂沉淀RNA是RNA提取中的常用方法，此法制备的RNA具有纯度高和无多糖等生物大分子共沉淀等优点。
改良CT AB-LiCl法提取枣总RNA体系的建立中国农学通报宋蓓比较不同沉淀方法CTAB较其它几种试剂更能有效去除多糖和酚类等物质。
β-巯基乙醇和PVP去除酚类，KAc及无水乙醇去除多糖。
RNA的沉淀方法很多，如LiC1、异丙醇、NaAc和无水乙醇等。
本试验对不同的方法进行了比较，其中LiC1沉淀需要在4℃放置过夜，时间长，但是RNA的产率比后两种方法高很多，且RNA纯度好，没有DNA污染，不需要进行去除DNA的纯化操作，减少了RNA 降解的几率；LiC1本身沉淀大片段RNA效果好的特点使得到的RNA大片段损失很少，更适于进行后续的分子生物学试验；而异丙醇沉淀获得的沉淀体积大，导致了多糖和酚类物质的共沉淀作用；1/10体积3 mol/L的NaAc和2.5倍体积的无水乙醇所得的RNA产率较低，且和异丙醇沉淀方法一样存在基因组DNA的污染，后续的纯化操作提高了RNA提取的成本且增加了降解的机会。
(完整版)碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及可能出现的问题
碱裂解法制备质粒的各种溶液的作用及提取中可能出现的问题一、质粒提取三种溶液的作用：1.溶液I溶液Ⅰ：50 mM葡萄糖，25 mM Tris-HCl，10 mM EDTA，pH 8.0任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH 值的Tris-HCl溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言几乎没有任何影响，所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I中加入高达10 mM 的EDTA，就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果手上正好缺了溶液I，可不可以抽质粒呢？只要用等体积的水或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
1. 溶液II溶液II，0.2 N NaOH，1% SDS轮到溶液II了。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的0.4 N NaOH，即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下)，自然就难高效率抽提得到质粒。
质粒抽提原理
为了方便理解，这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液：溶液I,50 mM葡萄糖 / 25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA，pH 8.0；溶液II，0.2 N NaOH / 1% SDS；溶液III，3 M 醋酸钾/ 2 M 醋酸。
让我们先来看看溶液I的作用。
任何生物化学反响，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl 溶液，是再自然不过的了。
那么50 mM葡萄糖是干什么的呢？说起来不可思议，加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言，几乎没有任何影响。
所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
那么EDTA呢？大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。
在溶液I中参加高达 10 mM 的EDTA，无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要不磨洋工，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果哪天你手上正好缺了溶液I，可不可以抽提质粒呢？实话告诉你，只要用等体积的水，或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是，菌体一定要悬浮均匀，不能有结块。
轮到溶液II了。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2％的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4 N的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最正确的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer〔双层膜〕结构向micelle〔微囊〕结构的相变化所导致。
细菌mRNA的提取方法
细菌mRNA的提取方法庞昕 周冬生 杨瑞馥(军事医学科学院微生物流行病研究所,北京100071)摘 要: mRNA提取技术不仅是分子生物学技术的重要组成部分,也是功能基因组学科研技术的重要基础。
随着细菌的后基因组时代的到来,寻求一种有效的提取细菌mRNA的方法成为迫切需要解决的问题。
介绍细菌mRNA的特点、提取方法、标记和稳定性问题。
关键词: 细菌 mRNA 提取Summ ary of B acteria mRNA ExtractionPang Xin Zhou Dongsheng Yang Ruifu(Instit ute of Microbiology and Epi demiology,Beiji ng100071)Abstract: mRNA extraction is not only the important part of molecular biology technology but also the basic of the functional genomics.With the advent of the bacterial post2genome era,there is an urgent need for high efficient mRNA extraction method from bacteria.Many scholars had done a lot about it in recent years.This review summarized the char2 acteristics,extraction,labeling and stability of bacteria mRNA based on the relevant research articles.K ey words: Bacteria mRNA Extraction mRNA即信使核糖核酸(messenger RNA)。