1例脑脊液中表型特异的地衣芽孢杆菌的生化特征及其分子生物学鉴定

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地衣芽孢杆菌序列

地衣芽孢杆菌序列

地衣芽孢杆菌序列
地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)的序列是指该菌种的基因组或基因的DNA序列。

地衣芽孢杆菌是一种常见的细菌,存在于土壤、水体和植物表面等环境中。

它具有广泛的生物学功能和应用潜力,例如产生酶、抗生素和其他生物活性物质,以及参与有机物降解和环境修复等过程。

地衣芽孢杆菌的基因组序列已经在科学研究中得到了广泛的研究。

通过对地衣芽孢杆菌的基因组进行测序和分析,科学家们可以深入了解该菌种的基因组结构、基因功能和代谢途径等信息。

这有助于揭示地衣芽孢杆菌的生物学特性,为其应用于农业、环境和生物制品生产等领域提供理论依据和技术支持。

地衣芽孢杆菌的基因组序列可以通过公共数据库如GenBank(美国国家生物技术信息中心)或ENA(欧洲核酸序列数据库)进行获取。

这些数据库存储了大量的细菌、动植物等生物的基因组序列和相关信息,科学家们可以通过关键词搜索或特定菌种的ID号来获取地衣芽孢杆菌的序列信息。

59株铜绿假单胞菌的耐药性分析

59株铜绿假单胞菌的耐药性分析

[ ] 宁 明哲 , 之 烽 , 瀚 , . 0 5 2 0 6 张 沈 等 2 0 ~ 0 8年 铜 绿 假 单 胞 菌 耐 药 情 况 变 迁 分 析 [] 医学 研 究 杂 志 ,0 0 3 ( ) 9 3 J. 2 1 ,9 1 :卜9 .
[ ] 王辉 , 民钧 . 9 4 2 0 7 陈 1 9  ̄ 0 1年 中 国 重 症 监 护 病 房 非 发 酵 糖 细 菌 的
( . 东省广 州 市花 都人 爱 医院检 验科 5 0 0 ; . 东医学 院附属 深圳 市福 田人 民 医院检 验 1广 18 0 2 广 医学部 5 8 0 ;. 东省广 州 市花都 区妇 幼保健 院 5 0 0 ) 10 03 广 1 8 0
文献标识码 : C 文 章 编 号 : 6 34 3 ( 0 1 1 7 30 17 —10 2 1 )51 8—2
使 用 亚胺 培南 。铜 绿 假 单 胞 菌 的 耐 药 机 制 非 常 复 杂 , 几 包 括
13 统 计 学 处 理 .
统计分析 。
2 结 果
药 敏 试 验 结 果 用 W HON T5 6软 件 进 行 E .
2 1 5 株 铜 绿 假 单 胞 菌 的 病 区分 布 及 来 源 见 表 1 . 9 。
3 讨 论
。 为 了 解 基 层
医 院该 菌 的 耐 药 性 特 点 , 者 对 2 1 笔 0 0年 度 分 离 的 铜 绿 假 单 胞
从 药 敏 结 果 可 以看 出 , 院 分 离 的 铜 绿 假 单 胞 菌 耐 药性 较 本
低 , 了三 代 头 孢 菌 素 中 的 头 孢 噻 肟 和 头 孢 曲松 外 , 他 1 除 其 2种
左氧氟沙星 、 大霉素 、 庆 阿米 卡 星 、 布 霉 素 。标 准 质 控 菌 株 为 妥

一株土壤源地衣芽孢杆菌的鉴定及生物学特性研究

一株土壤源地衣芽孢杆菌的鉴定及生物学特性研究

一株土壤源地衣芽孢杆菌的鉴定及生物学特性研究
全爽;陈涛;毛宗林;杨凤娟;宋青龙
【期刊名称】《中国畜牧杂志》
【年(卷),期】2023(59)1
【摘要】试验旨在筛选优质土壤源益生菌菌种资源,为畜牧生产中微生态制剂研发提供候选菌株。

试验以北京市郊区农田土壤为材料,经紫外诱变、革兰氏染色和接触酶试验分离并筛选出1株对金黄色葡萄球菌具有明显抑制能力的菌株。

通过
16S rRNA基因进化分析和种属鉴定,判定该菌为一株地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)。

进一步通过耐热、耐酸、耐胆盐和抗生素敏感性检测,发现该地衣芽孢杆菌在85℃处理10 min后存活率高达93.33%,pH为3.0及2.5时对其活性均影响较小,并且在0.3%、1.0%和2.0%的胆盐浓度下培养3 h仍可继续生长,表现出优良的抗逆性。

通过与病原菌混合培养以及对多种致病菌的抑菌试验检测,发现该菌株对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都具有抑制作用。

【总页数】6页(P217-222)
【作者】全爽;陈涛;毛宗林;杨凤娟;宋青龙
【作者单位】中国农业大学动物科学技术学院;国家饲料工程技术研究中心;贵州大北农牧业科技有限公司
【正文语种】中文
【中图分类】S816
【相关文献】
1.骆驼刺源产乳酸的地衣芽孢杆菌分离鉴定和菌株特性研究
2.一株藏绵羊源短小芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究
3.一株虹鳟源枯草芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究
4.一株兔源地衣芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究
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地衣芽孢杆菌的分离和鉴定

地衣芽孢杆菌的分离和鉴定

地衣芽孢杆菌的分离和鉴定作者:布帕提买木·麦麦提潘姣姣阿迪莱·卡哈曼伍麦尔·麦海提陈荟旭张秋林李莲瑞来源:《农业与技术》2020年第17期摘要:为了從土壤中分离得到地衣芽孢杆菌,开展后续研究,试验采集塔里木盆地的土壤进行细菌培养,采用台盼蓝平板方法,对分离培养得到的单菌落进行生物学特性研究、生理生化试验和16S rDNA鉴定。

根据《伯杰细菌鉴定手册》,初步鉴定为芽孢杆菌,提取DNA 进行PCR扩增并送测序。

结果表明,从塔里木盆地土壤中分离得到的细菌为地衣芽孢杆菌,说明该土壤中存在地衣芽孢杆菌,并为后续进一步研究及应用奠定基础。

关键词:土壤;分离和鉴定;16S rDNA;地衣芽孢杆菌中图分类号:S-3文献标识码:ADOI:10.19754/j.nyyjs.20200915005收稿日期:2020-08-17基金项目:大学生创新项目(项目编号:201810757029)作者简介:布帕提买木·麦麦提(1996-),女,硕士在读。

研究方向:动物性食品卫生与安全;通信作者李莲瑞(1968-),女,博士,教授。

研究方向:动物性食品卫生与安全。

地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)为革兰氏阳性菌,广泛分布于微生物混合培养物中[1]。

呈杆状,芽孢为椭圆形,孢囊稍膨大,为非致病性菌,细菌最适生长温度约为50℃,酶的最适生长温度为37℃。

地衣芽胞杆菌耐热、含酶量多、产酶量高的优良特性被广泛应用于工业生产中,主要用来生产淀粉酶[2]及蛋白酶[3]。

芽孢杆菌具有耐酸、耐盐、耐高温等特点,这使得其可以在条件不利的情况下形成芽孢,自我保护,并在环境适宜的条件下复活。

地衣芽孢杆菌在代谢过程中能产生多种酶和活性物质,具有益生保健[4],降解农药[5]和净化水体[6]的作用。

为了解塔里木盆地土壤中是否存在地衣芽孢杆菌,本试验从塔里木盆地的1份土壤中筛选出1株镜检有芽孢的单菌落,对该菌株进行分离纯化,经过生理生化实验鉴定、16S rDNA基因测序,最终鉴定为地衣芽孢杆菌,且为后续开展地衣芽孢杆菌的应用研究奠定基础。

地衣芽孢杆菌介绍

地衣芽孢杆菌介绍

名称:地衣芽孢杆菌英文名:PWD一1 (Baclicus lincheniformis PWD一1)俗称:整肠生(地衣芽孢杆菌胶囊)种属:芽孢杆菌科细菌革兰氏染色性;为革兰氏阳性杆菌细胞大小:0.8μm×(1.5~3.5)μm细胞形态及特点:细胞形态和排列呈杆状、单生。

细胞内无聚-β-羟基丁酸盐(P HB)颗粒芽孢形态:产生近中生的椭圆状芽孢,孢囊稍膨大培养特性:在肉汁培养基上的菌落为扁平、边缘不整齐、白色、表面粗糙皱褶,24h后菌落直径为3mm生化形状:本菌有动力地衣芽孢杆菌的作用机制是以菌治菌,活菌进入肠道后,对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用,而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化性链球菌有促进生长作用,从而可调整菌群失调达到治疗目的。

可促使机体产生抗菌活性物质、杀灭致病菌。

此外通过夺氧生物效应使肠道缺氧,有利于大量厌氧菌生长,造成肠道低氧环境,对肠道内的双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌等有益健康的厌氧菌的生长繁殖有促进作用;对葡萄球菌、白色念球菌、酵母样菌等致病菌则有拮抗作用。

通过这种双重作用可以调整肠道菌群失调,维持机体肠道微生态平衡,从而对肠道疾病达到治疗和预防的目的。

【性状】地衣芽孢杆菌高纯粉≥250亿/克水分≤10%【主要用途】1、促进肠道内正常生理性厌氧菌的生长,调整肠道菌群失调,恢复肠道功能;2、对肠道细菌感染具有特效,对轻型或重型急性肠炎,轻型及普通型的急性菌痢等,均有明显疗效;3、能产生抗活性物质,并具有独特的生物夺氧作用机制,能抑制致病菌的生长繁殖。

【适用对象】适用于细菌原因引起的肠道菌群失调症以及肠道需要保健的养殖动物。

【用法用量】添加在饲料中的量为:50~100克/吨(全价料),注意混合均匀。

一株地衣内生真菌Daldinia childiae的化学成分

一株地衣内生真菌Daldinia childiae的化学成分

Research paper 研究论文22 January 2021, 40(1): 40-47 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Q DOI: 10.13346/j.mycosystema.200083付少彬遵义医科大学教授,硕士研究生导师。

“贵州省高层次创新型人才“千”层次人才”、“贵州省首批创新创业导师”。

主要从事地衣型真菌、大型真菌的资源调查及地衣内生菌、食药用真菌的化学成分研究。

贵州省药学会药学教育与科普专业委员会委员;遵义医科大学药学学科学位评定分委员会委员;《Modern Chemistry》*《SCIREAJournal of Chemistry》期刊编委。

第一作者或通讯作者在《TetrahedronMRSC Advances》《Fitoterapia》等国内外学术刊物发表论文20余篇,授权发明专利6项。

—株地衣内生真菌D a/d/>?/a d n7c W a e的化学成分周凝1杨彩玲1孟庆峰2刘乐1付少彬O遵义医科大学药学院贵州遵义563000©遵义医科大学公共卫生学院贵州遵义563000摘要:本研究对分离自星点梅衣属地衣Pczncte//a sp.的一株内生真菌蔡氏轮层炭壳菌0a/c//n/a c/?//c//ae 进行大米固体发酵培养,乙酸乙酯萃取发酵产物,采用硅胶柱色谱法、重结晶等方法分离纯化次生代谢产物,结合核磁共振波谱与质谱技术对单体化合物进行结构解析,运用D P P H法测定化合物的自由基清除能力。

结果分离得到8个化合物,分别鉴定为4-hydroxy-benzeneethanol (1)、4-m ethoxy-5-car-bom ethoxy-6-pentyl-2H-pyran-2-one ( 2 )、l-(2,6-dih ydroxyp h en yl)b u tan-l-on e (3)、8-m ethoxy-l-naphtho l(4)、1,8-dim ethoxynaphthalene (5 )、m ethyl 2-undecenoate-3-undecanoate-cyclohexyl-l,4-dienyl ester (6)、uracil (7)和acetic acid (8),化合物1、6和8均首次从轮层炭壳菌属D a/d/n/a中分离得到;化合物4在浓度为3m g/m L时具有较强的自由基清除活性,化合物3和5具有轻微的自由基清除能力。

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》篇一一、引言植物内生菌是一种生活在植物组织内部,与植物形成共生或互生关系的微生物。

近年来,随着微生物生态学和分子生物学的发展,植物内生菌的种类和功能逐渐被揭示。

其中,水芽孢杆菌作为一种重要的植物内生菌,具有丰富的生物多样性和潜在的应用价值。

本文报道了一株新发现的植物内生水芽孢杆菌,对其进行了分类鉴定和基因组分析,为进一步了解该菌的生物特性和开发其应用提供理论基础。

二、材料与方法2.1 材料实验所使用的植物样品采自中国某地区,经过预处理后,成功分离出一株新的水芽孢杆菌。

实验中所用到的试剂、培养基等均为市售产品。

2.2 方法2.2.1 菌种分离与纯化从植物组织中分离出细菌,通过划线分离法进行纯化,获得单菌落。

2.2.2 形态学鉴定通过显微镜观察菌体的形态、大小、鞭毛数量等特征。

2.2.3 分子生物学鉴定提取菌体DNA,进行PCR扩增,获得16S rRNA基因序列。

将序列送至生物信息公司进行比对分析,确定菌种分类地位。

2.2.4 基因组分析利用新一代测序技术对菌体基因组进行测序,获得基因组数据。

通过生物信息学分析,预测基因功能、代谢途径等。

三、结果与分析3.1 形态学鉴定结果通过显微镜观察,该菌体呈杆状,大小适中,具有多条鞭毛,符合水芽孢杆菌的形态特征。

3.2 分子生物学鉴定结果PCR扩增获得16S rRNA基因序列后,通过NCBI数据库比对分析,发现该菌与已知的水芽孢杆菌种存在一定差异,属于新种。

3.3 基因组分析结果基因组测序获得大量数据,经过生物信息学分析,预测了该菌的基因功能、代谢途径等。

与已知的水芽孢杆菌基因组相比,该菌具有一些独特的基因和代谢途径。

同时,该菌基因组中存在大量与植物互生相关的基因,表明其可能具有开发为生物农药或生物肥料等应用的价值。

四、讨论本实验成功分离出一株新的植物内生水芽孢杆菌,通过形态学鉴定和分子生物学鉴定,确定了其分类地位。

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》篇一一、引言植物内生菌是植物体内的一种重要微生物资源,它们在植物生长、抗病、抗虫等方面具有重要作用。

近年来,随着微生物生态学和基因组学的发展,对植物内生菌的研究越来越深入。

本文报道了一株新的植物内生水芽孢杆菌的分类鉴定和基因组分析结果,旨在为进一步了解该菌的生物学特性和应用价值提供理论依据。

二、材料与方法2.1 样品来源与分离纯化本研究所用样品来源于我国某地区健康植物叶片,经组织破碎后分离纯化得到一株水芽孢杆菌。

2.2 分类鉴定采用形态观察、生理生化试验、16S rRNA基因序列分析等方法对菌株进行分类鉴定。

2.3 基因组分析利用新一代测序技术对菌株进行全基因组测序,对测序结果进行组装、注释和分析。

三、结果与分析3.1 形态特征与生理生化特性该菌株在显微镜下呈短杆状,革兰氏染色阳性,具有明显的芽孢形成能力。

在生理生化试验中,该菌株具有较好的耐盐性、耐酸性等特性。

3.2 16S rRNA基因序列分析通过16S rRNA基因序列分析,将该菌株与已知的水芽孢杆菌菌株进行比对,结果显示该菌株与已知菌株存在较大差异,为新的水芽孢杆菌种。

3.3 基因组特征该菌株全基因组大小为X百万碱基对,共编码X个蛋白质。

通过基因组注释,发现该菌株具有多种与代谢、抗逆、信号传导等相关的基因。

此外,还发现了一些与植物生长促进、抗病等相关的基因。

3.4 基因组比较分析将该菌株的基因组与其他已知的水芽孢杆菌基因组进行比较分析,发现该菌株具有一些独特的基因和基因簇,这些基因可能与其独特的生物学特性有关。

此外,还发现该菌株与其他水芽孢杆菌在基因组成和结构上存在一定差异。

四、讨论本研究成功地对一株新的植物内生水芽孢杆菌进行了分类鉴定和基因组分析。

通过形态观察、生理生化试验和16S rRNA基因序列分析,证实了该菌株为新的水芽孢杆菌种。

通过基因组分析,发现了该菌株具有多种与代谢、抗逆、信号传导等相关的基因,以及一些与植物生长促进、抗病等相关的基因。

芽孢杆菌属一新种的鉴定

芽孢杆菌属一新种的鉴定

芽孢杆菌属一新种的鉴定基于现有数据和学术文献,本文探讨了芽孢杆菌属一新种的鉴定。

芽孢杆菌属的分布较广,因此,对其仔细的分类研究显得至关重要。

本文概述了芽孢杆菌属的分类历史,概述了最近研究发现的新种。

芽孢杆菌属是一个广泛分布的属,包括细菌、古菌、嗜热古菌、变形菌和衣原体等多种微生物。

其分布主要集中在湿润到半湿润的地区,在温暖的海洋中也有分布。

芽孢杆菌属的分类史可以追溯到十九世纪中叶,当时由de Bary提出,并按其形态生理特性,分出了多个种。

随后,更多新种随着科学家们对芽孢杆菌属的研究而出现。

现今,研究人员已经拥有了数据和新技术,可以以更精确的方式着手鉴定新种。

通常,鉴定需要收集芽孢杆菌属样本,采用形态学特性和分子生物学特性(如DNA-DNA混、子钟树等)进行分析。

重要的是,鉴定的结果必须符合遗传学的原则。

根据这些原则,新种可以被识别出来,并且可以有效地分类。

近年来,有多个新的种类在芽孢杆菌属的分类中出现,其中一些是根据DNA-DNA混、子钟树等方法发现的,而另一些是基于现有的技术,如分子生物学分析、菌细胞壁等。

当然,也有例外,如根据现有的形态特征来发现新种。

比如,青藏高原上的一种芽孢杆菌种被发现显示出与其他种不同的形态特征,因此被认为是一个新种泰格尼奥肯酵母(Tegneinococcus thermospharicus)。

总而言之,芽孢杆菌属是一个多样性丰富、布广泛的属,其分类研究具有重要的意义。

随着现代科学技术的发展,研究更新的种类也越来越容易。

精准的鉴定,不仅可以帮助我们进一步构建芽孢杆菌属的分类学体系,还可以帮助我们更好地理解它们在环境中的作用。

只有通过深入的研究,才能更好地利用芽孢杆菌属的多样性,以改善人类的生活。

一株解淀粉芽孢杆菌的分离鉴定及其生物学特性研究

一株解淀粉芽孢杆菌的分离鉴定及其生物学特性研究

一株解淀粉芽孢杆菌的分离鉴定及其生物学特性研究杨冬静;张成玲;徐振;赵永强;孙厚俊;谢逸萍【摘要】In this study, we isolated a strain of antagonistic bacterium with broad-spectrum antimicrobial activity from soil, which was named as XZ-1.The antagonistic activity of XZ-1 was tested by using the method of plate confrontation culture, and the results showed that XZ-1 had strong antagonistic activity against eight kinds of plant pathogenic fungi, such as Pleospora herbarum, Colletotrichum fragariae and so on, and the diameter of inhibition zone was all more than 10 mm.The 16S rDNA fragment of XZ-1 was amplified by PCR, its phylogenetic tree was constructed by MEGA 6.0, and this strain was preliminarily identified as Bacillus amyloliquefaciens.Single-factor experimental design was adopted to study the biological characteristics of XZ-1, and the results indicated that: the best pH-value for the growth of XZ-1 was 6, and the suitable salinity for its growth was 0~10 g/L sodium chloride;XZ-1 was not sensitive to light and darkness;the lethal temperature w as 100 ℃ for 10 min.%从土壤中分离筛选到一株具有广谱抗菌活性的拮抗细菌,命名为XZ-1.采用平板对峙培养法测定其抑菌活性,结果显示:XZ-1对大蒜叶枯病菌、草莓炭疽病菌等8种重要农作物病害的病原真菌均具有较强的拮抗活性,且抑菌带直径均大于10mm.采用PCR扩增16SrDNA片段并用MEGA6.0软件构建系统发育进化树,结果表明XZ-1与解淀粉芽孢杆菌16SrDNA序列KY828923聚为一簇,因此初步鉴定该菌株为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens).采用单因素试验设计对XZ-1的生物学特性进行研究,结果表明:XZ-1在pH值为6时生长最佳,在氯化钠浓度为0~10g/L之间时生长情况相对较好;对光暗不敏感,致死温度为100℃、10min.【期刊名称】《江西农业学报》【年(卷),期】2017(029)009【总页数】6页(P69-74)【关键词】解淀粉芽孢杆菌;拮抗活性;生物学特性【作者】杨冬静;张成玲;徐振;赵永强;孙厚俊;谢逸萍【作者单位】江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏徐州 221131【正文语种】中文【中图分类】S476化学药剂在病害防治中起到重要作用,但生产上频繁和高浓度地使用化学药剂会导致农药残留增加和环境污染问题,严重威胁人类健康。

地衣芽孢杆菌原生质体的制备、再生及转化研究

地衣芽孢杆菌原生质体的制备、再生及转化研究

this paper,B.1icheniformis 303 Was served as a host strain,systematic investigation Was
carried out on factors affecting formation and regeneration of protoplast,prelimiariarily optimized protoplast transformation of丑lichenifo,.珑捃303,and laid the foundations for
关键词:地衣芽孢杆菌,原生质体,制备,再生,转化
Abstract
Abstract
Bacitlus licheniformis is one of the most important strains for industrial bioteehnologjtcal processes,and widely used in fields such as medicine,plant diseases,food,feed,and environment.们1e performance of B.1icheniformis wide type strain generally Can not meet the production need,therefore,genetic modification iS needed.The transfer of alien DNA into丑 licheniformis is the premise and foundation for molecular operation and genetic study to host,
transformation of丑licheniformis strains.it’S need to carry on the optimized analysis to its

地衣生物学

地衣生物学

地衣生物学
哈勒.,马;杜天理
【期刊名称】《攀枝花科技》
【年(卷),期】1991(000)002
【总页数】87页(P1-87)
【作者】哈勒.,马;杜天理
【作者单位】不详;不详
【正文语种】中文
【中图分类】Q949.34
【相关文献】
1.1例脑脊液中表型特异的地衣芽孢杆菌的生化特征及其分子生物学鉴定 [J], 马翔;聂署萍;温小玲;赵娟;朱焕金;邹燕;陆学东
2.地衣的新概念:地衣是三种生物共生的生命复合体 [J], 贺琼
3.一株兔源地衣芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究 [J], 魏振;柯静;崔荷枫;周峻明;张博宣;刘恬麟;兰月;姚贝贝;龙淼
4.饲用地衣芽孢杆菌的生物学特性研究 [J], 董尚智;王国霞;陈远凤;程萍
5.中国地衣学现状与潜力——祝贺魏江春院士八旬地衣学文集 [J], 刘华杰
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一株兔源地衣芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究

一株兔源地衣芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性研究

收稿日期:2015-02-22
the isolate was a strain of Bacillus licheniformis,
项目来源:沈阳工学院大学生创新项目
named as Bacillus licheniformis WZ01, which the
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[4] Debyser W, Derdelinckx G , Delcour J A. Arabinoxylan solubilisa⁃ tion and inhibition of the barely malt xylanolytic system by wheat during brewing with wheat whole meal adjunct: evidence for a new class of enzyme inhibitor[J]. Journal of the American Society Brewing Chemists, 1997, 55: 153-156.
类饲料中抑制蛋白对外加木聚糖酶制剂的阻碍作 用,饲料中添加 GH11 木聚糖酶比添加 GH10 木聚糖 酶将会有较小的酶活力损失,有利于发挥木聚糖酶 的活性,预计将会更好地解除非淀粉多糖的抗营养

芽孢杆菌生理生化特性分析_倪鑫鑫

芽孢杆菌生理生化特性分析_倪鑫鑫

作者简介:倪鑫鑫(1988-),女,硕士,研究方向:工业废水处理,环境微生物及其应用。 收稿日期:2015-03-31
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安徽农学通报,Anhui Agri.Sci.Bull.2015,21(07)
分别在不同温度条件下培养,以 37℃培养菌株为阳性对 檬酸盐培养液、缓冲葡萄糖蛋白胨培养液中培养,一定时
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芽孢杆菌形态特征

芽孢杆菌形态特征

芽孢杆菌形态特征1.蕈状芽胞杆菌:蕈状芽胞杆菌——营养琼脂48h菌落:蕈状芽胞杆菌——革兰氏染色:2.地衣芽胞杆菌:地衣芽孢杆菌:革兰氏阳性杆状。

0.6~0.8×1.5~3.0微米。

无荚膜,不成链,能运动。

芽孢椭圆形至柱状,中生或次端生,0.6~0.9×1.0~1.5微米。

菌落粗糙,不透明,粘着,扩展。

明胶液化,淀粉水解,V.P试验阳性,柠檬酸盐利用。

广泛分布在土壤和食品中。

也是实验室中普遍存在的污染菌。

从某些菌株培养物中可获得杆菌肽素和地衣形杆菌素。

有的能产生碱性蛋白酶。

但也是引起罐头食品腐败的平酸腐败菌,是罐头生产中应严加注意的一种污染菌。

地衣芽胞杆菌——18h革兰氏染色:地衣芽胞杆菌——24h营养琼脂菌落:地衣芽胞杆菌——36h革兰氏染色:地衣芽胞杆菌——36h芽胞染色:地衣芽胞杆菌——48h营养琼脂菌落:地衣芽胞杆菌卵磷脂酶阳性:腊样芽胞杆菌卵磷脂酶:附:卵磷脂酶试验操作:1.鸡蛋一枚浸泡于75%酒精中30min ~24h;2.50或100ml小三角烧瓶,放置10粒左右玻璃珠,盛10ml生理盐水,15P灭菌15min;3. 根据用量配制营养琼脂,15P灭菌15min(与盐水同时高压;4.用无菌小镊子在已灭菌的鸡蛋两端打孔,让蛋清流出,弃之不用;5.打开蛋壳使蛋黄全部留入三角瓶中,轻轻摇匀,玻璃珠起搅匀蛋黄的作用;6.琼脂温度至45度左右,以10%量加入蛋黄液(无菌吸管),摇匀,倒平板(4mm 规格平即可,太大浪费);7.将待检菌点种(穿刺)入平板,35孵育,菌落周围有如图所示混浊圈即为卵磷脂酶阳性.否则,阴性.试验结果如下图:蜡样芽孢杆菌:杆状,1.0~1.2×3.0~5.0微米。

末端方,成短或长链。

革兰氏阳性,无荚膜,运动。

芽孢椭圆形,中生或次端生,1.0~1.5微米,孢囊无明显膨大。

菌落大,表面粗糙,扁平,不规则。

它可用于明胶液化,牛奶胨化,还原硝酸盐,水解淀粉。

地衣芽孢杆菌16S-ITS标记及其特异性分析

地衣芽孢杆菌16S-ITS标记及其特异性分析

地衣芽孢杆菌16S-ITS标记及其特异性分析陈冲;佟建明;张潞生【摘要】[目的]建立地衣芽孢杆菌的分子鉴定方法.[方法]通过对地衣芽孢杆菌TS-01的16S和ITS序列进行克隆测序和差异性分析,以该区序列为靶序列设计地衣芽孢杆菌TS-01的特异性引物,并用该引物扩增全部受试菌种.[结果]从ITS和16S rDNA区间设计了地衣芽孢杆菌种特异性引物,特异性引物PCR的最佳退火温度为67.2℃,循环数为24个;地衣芽孢杆菌TS-01可扩增出1条905 bp的标记片段,其他受试菌株均为阴性,从而证明试验得到了在种水平上对该菌种进行准确鉴定的特异16S-ITS标记.[结论]地衣芽孢杆菌TS-01分子鉴定方法的建立,为地衣芽孢杆菌的分子诊断奠定了基础.%[ Objective ] The study aimed to establish the molecular identification methods of Bacillus licheniformis. [ Method ] Through the cloning sequencing test and the difference analysis on 16Sand ITS sequences of B. licheniformis TS-01 ,the specific primer of B. licheniformis TS-01 was designed with the sequence of the above regionsas the target sequence and the whole tested strains were amplified by using this specific primer.[ Result]The specific primers of B. licheniformis were designed resp. from the DNA section of 16S and from that of ITS and the optimum annealing temperature for the specific primer PCR was 67.2 ℃ with the cycle times of 24. B. licheniformis TS-01 could amplify a marker fragment of 905 bp and other tested strains were all negative, thus proving that this test obtained the specific 16S-ITS marker that could accurately identify this strain at the level of the specie. [ Conclusion] Establishment onthe molecular identification methods of B. licheniformis TS-01 laid the foundation for molecular diagnosis of B. licheniformis.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2011(039)014【总页数】2页(P8206-8207)【关键词】地衣芽孢杆菌;特异引物;16S;ITS【作者】陈冲;佟建明;张潞生【作者单位】山西农业大学信息学院,山西太古,030801;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100094;中国农业大学农学与生物技术学院,北京,100094【正文语种】中文【中图分类】S816.3地衣芽孢杆菌是芽孢杆菌中具有应用潜力的益生菌种之一,在饲料加工等方面有着广泛的应用。

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》范文

《一株植物内生水芽孢杆菌新种的分类鉴定和基因组分析》篇一摘要:本篇论文对一株植物内生水芽孢杆菌新种进行了详细的分类鉴定和基因组分析。

首先,通过对该菌株的形态学特征、生理生化特性以及分子生物学方法进行综合分析,明确了其分类地位。

其次,利用全基因组测序技术,对该菌株的基因组进行了全面的解析,为进一步研究其生物学特性和功能奠定了基础。

一、引言植物内生菌是指生活在植物组织内部,与植物形成共生或寄生关系的微生物。

近年来,随着微生物生态学和分子生物学技术的发展,植物内生菌的研究逐渐成为热点。

水芽孢杆菌作为一种常见的植物内生菌,具有丰富的生物多样性和潜在的生物活性,对其新种的研究有助于深入了解植物内生菌的多样性及其生态功能。

二、材料与方法1. 实验材料本实验所使用的植物内生水芽孢杆菌新种来源于某地区植物组织内部。

在实验前,对该菌株进行了初步的分离、纯化和保存。

2. 分类鉴定方法(1)形态学特征观察:采用光学显微镜和电子显微镜对菌株的形态进行观察和描述。

(2)生理生化特性分析:通过测定菌株的碳源利用、氮源利用、酶活性等生理生化特性,初步确定其分类地位。

(3)分子生物学方法:利用16S rRNA基因序列分析和全基因组测序技术对菌株进行分子鉴定。

三、结果与分析1. 形态学特征观察结果通过光学显微镜和电子显微镜观察,该植物内生水芽孢杆菌新种呈现出典型的杆状形态,无芽孢形成。

细胞表面光滑,无鞭毛,不产色素。

这些形态学特征与已知的水芽孢杆菌属细菌具有一定的相似性。

2. 生理生化特性分析结果该菌株具有广泛的碳源利用能力和氮源利用能力,能够利用多种有机物和无机物作为营养来源。

此外,该菌株还具有较高的酶活性,包括蛋白酶、淀粉酶等。

这些生理生化特性进一步证实了其属于水芽孢杆菌属的分类地位。

3. 分子生物学鉴定结果(1)16S rRNA基因序列分析:通过PCR扩增和测序技术获得该菌株的16S rRNA基因序列,将其与已知的水芽孢杆菌属细菌的序列进行比对和分析,发现该菌株与已知种类的序列具有较高的相似性,但存在一定的差异,表明其可能为水芽孢杆菌属的一个新种。

一株产生广谱抗菌物质地衣芽孢杆菌的筛选与鉴定

一株产生广谱抗菌物质地衣芽孢杆菌的筛选与鉴定

一株产生广谱抗菌物质地衣芽孢杆菌的筛选与鉴定
高兆建;樊陈;陈尚龙;巫友华
【期刊名称】《徐州工程学院学报(自然科学版)》
【年(卷),期】2012(027)002
【摘要】采用异步培养法,从土壤样品中筛选到一株产抗菌物质活性较强的菌株
F69.结合菌落形态、生理生化指标和16SrDNA序列分析对菌株F69进行菌种鉴定.菌株F69在系统发育上属于芽孢杆菌属,它和地衣芽胞杆菌菌株的16SrDNA 序列相似性最高为99%,该菌株被鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis).菌株F69可作为抗菌物质产生菌进行进一步深入研究.【总页数】5页(P40-44)
【作者】高兆建;樊陈;陈尚龙;巫友华
【作者单位】徐州工程学院,江苏徐州221008;徐州工程学院,江苏徐州221008;徐
州工程学院,江苏徐州221008;徐州工程学院,江苏徐州221008
【正文语种】中文
【中图分类】Q93-331
【相关文献】
1.广谱抗菌芽孢杆菌的筛选及其抗酵母物质的纯化和鉴定 [J], 石举然;别小妹;吕凤霞;陆兆新
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通 过 芽 孢 染 色 , 介 绍 相 差 显 微 镜 更 便 于 芽 孢 的 观 察 , 用 含 据 可 5mg L硫 酸 锰 的 营 养 琼 脂 转 种 促 使 芽 孢 形 成 [ 。相 对 于 其 他 / 5 ] 细 菌 , 孢 杆 菌 的 分 类 鉴 定 缺 少 易 于 测 定 的 常规 特 征 , 床 实 芽 临
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旦 检验医学杂志 21 年 9 01 月第3 卷第 l 期 It 1 dSpe e 21, o 3, o 1 2 5 n I ,et r 01V 1 2N . J }Me mb . 5
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[ ] 汪 复 , 德 妹 , 付 品 , .0 8年 中 国 CHI T 细 菌 耐药 性 监 测 5 朱 胡 等 20 NE
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细 菌 学 分 离 结 果
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医学 杂 志 , 6 l ( ) 1 1 1 9 , 2 : . 9 9 4
[ 3 张维 国 , 宇 光 , 远 志 , . 膜 炎 奈 瑟 菌 地 农 芽 孢 杆 菌 i 嘎 4 周 李 等 脑 , 混合 感 染 1 [] 中 华 检验 医 学杂 志 , 9 ,9 4 : 1. 例 J. l 6 1 ( ) 3d 9 [] 徐 建 国 , 国栋 , 来 君 , 临 床 微 生 物 学 手册 [ ] 北 京 : 学 5 梁 邢 等. M . 科
出版 社 , 0 5 9 1 . 2 0 :45 1
分 离 株 是 否纯 生 长 或优 势 生 长 , 次检 出井 结 合 临 床 症 状 分 析 多 才 能 确 定 致 病 性 。此 患 儿 因 转 院 , 做 进 一 步 观 察 , 床 和 实 未 临
上 菌 落 稍 小 而 干 燥 。陈 旧 的 菌 苔 呈 干 燥 的 “ 壳 ” 。进 一 步 衣 样 观察特征如下 : C A平板 生长物 划线接种 营养琼 脂 ( 将 B NA) 、 水 解 酶 蛋 白琼 脂 ( H)麦 康 凯 ( ) 板 各 2个 , 别 放 普 通 M 、 MC 平 分 和 5 ~ 1 C 产 气 袋 中 培 养 2 , O 0。 4h MC 平 板 上 无 细 菌 生 长 。在 NA 和 MH 平 板 上 除 具 有 C A 平 板 菌 落 的 特 征 外 , B 特 别 是 在 MH 平 板 ( O C 环 境 ) 菌 落 为 典 型 “ 煎 蛋 ” 见 图 卜 的 油 , d 。温 度 生 长试 验 ,O 6 3 ~ o℃生 长 良好 ,5℃ 以下 和 6 2 5℃ 以上
菌 , 合 AP 0 ( 1 联 I E 前 2项 试 验 ) 也 鉴 定 为 地 衣 芽 孢 杆 菌 。 2 ,
除严 格 致 病 的炭 疽 芽 孢 杆 菌 外 , 他 芽 孢 杆 菌 也 从 胸 水 、 其
脑脊 液 、 液 等 临 床 标 本 中分 离 出来 ] 血 。芽 孢 杆 菌 的 确 认 可
( B 平板放 3 C A) 5℃孵 育 ( 中 C 平 板 放 5 ~ 1 C 产气 其 A O O 袋 中 ) 2 ,4h后 , B C A平 板 上 的菌 落 直 径 2mm 左 右 , 形 、 圆 凸
起 、 滑 、 齐 、 润 、 稠 、 滴 样 ( 图 lc 。 但 在 C 平 板 光 边 湿 黏 水 见 ) A
国际检验 医学 杂志 21 01年 9月第 3 卷 第 1 期 2 5
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[] Ani co e t C e te,0 6 5 ( ) 4 —8 J . t rbAg ns h mohr2 0 ,0 1 :34 . mi [ ] 褚 海 青 , 惠 萍 , 国 钧 . 绿 假 单胞 菌 的 耐 药 机 制 [] 中 国 抗 感 3 李 何 铜 J.
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1 临床 资 料
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2 方 法
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卜b 。取 沉 淀 物 划 线 接 种 巧 克 力 琼 脂 ( A) 哥 伦 比亚 血 琼 脂 C 、
东南 大 学 出版 社 , 0 6 7 17 3 2 0 : 4 —4 .
方 法 。据 报 道 电镜 下 地 农 芽孢 杆 菌 有 单 根 鞭 毛 。
此 株 地 农 芽 孢 杆 菌 在 AP 0 H 中反 应 典 型 , 菌 经 表 型 I C 5 该 特 征 和 l Sr A 测序 , 确 了 菌 种 的 鉴 定 。此 外 , 衣 芽 孢 6 DN 明 地
染化 疗 杂 志 , 0 3 3 1 : 4 5 . 2 0 ,( ) 6—6
[ ] 宁 明哲 , 之 烽 , 瀚 , . 0 5 2 0 6 张 沈 等 2 0 ~ 0 8年 铜 绿 假 单 胞 菌 耐 药 情 况 变 迁 分 析 [] 医学 研 究 杂 志 ,0 0 3 ( ) 9 3 J. 2 1 ,9 1 :卜9 .
( . 东省广 州 市花 都人 爱 医院检 验科 5 0 0 ; . 东医学 院附属 深圳 市福 田人 民 医院检 验 1广 18 0 2 广 医学部 5 8 0 ;. 东省广 州 市花都 区妇 幼保健 院 5 0 0 ) 10 03 广 1 8 0
文献标识码 : C 文 章 编 号 : 6 34 3 ( 0 1 1 7 30 17 —10 2 1 )51 8—2
[] 中 国感 染 与化 疗 杂 志 , 0 9 9 5 : 2 2 . J. 2 0 , ( ) 3 13 9

( 收稿 日期 :0 10 O 2 1 -41)
个案 与短 篇 ・
1例脑 脊 液 中表 型 特异 的地衣 芽 孢杆 菌 的生化 特 征 及 其分 子 生物 学鉴 定
马 翔 聂署 萍 温 小玲。赵 , , , 娟 朱焕金。 邹 燕 陆学 东 , , ,
次 入 院 。手 指 血 白 细 胞 计 数 1 . 1 1。L, 中 性 粒 细 胞 2 o × O/ 嗜
1. 、 巴 细 胞 6 . 、 核 细 胞 1. 、 酸 性 粒 细 胞 67 淋 82 单 41 嗜 0 5 、 碱 性 粒 细 胞 0 5 。无 菌 抽 取 脑 脊 液 培 养 出 纯 生 长 . 嗜 . 的 地 衣 芽 孢 杆 菌 。脑 脊 液 常 规 : 观微 浊 , 氏试 验 阴性 , 细 外 潘 白 胞 计 数 0 0 ×1 。L。脑 脊 液 生 化 : 萄 糖 2 2mmo/ 氯 化 .4 0/ 葡 . lL, 物 11mmo/ 蛋 白 49mg I 患儿 自行 转 院 。 2  ̄L, . 0 / 。
验 室 准确 鉴定 到种 仍 有 困难 。一 些 简 便 可 行 的 试 验 有 助 于 区 别 , : 衣 芽 孢 杆 菌和 蜡 样 芽孢 杆 菌兼 性 厌 氧 , 枯 草 芽 孢 杆 如 地 而
2 3 分 子 生 物 学 鉴 定 提 取 细 菌 总 DNA, 1Sr NA 保 守 . 在 6 D 区 域 设 计 引 物 扩 增 1 S r NA 基 因 , 后 使 用 B cma 6 D 然 ek n
中华 检 验 医 学 杂 志 , 0 4 2 ( ) 3 4 2 0 , 7 1 : 84 .
E ] B s J cb 4 uh K, ao y GA, d i s Meer AA u cin lc sict n o .A fn t a l sf ai o a i o
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