不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织差异miRNA的鉴定及功能分析中期报告

不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织差异miRNA
的鉴定及功能分析中期报告
本项目旨在通过比较不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织的miRNA表达谱差异，进一步了解miRNA在猪圆环病毒Ⅱ型感染中的作用及机制。

本中期报告主要是对实验进展和结果的简要介绍。

1.实验进展
1.1 队列设计
本项目共涉及4个处理组和1个对照组，其中4个处理组分别是黑猪、长白猪、杜洛克猪和皮特兰猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织，对照组
为未感染的正常猪肺组织。

1.2 样品采集
使用4周龄的猪，分别在各个处理组和对照组进行采样。

处理组的
样品经过病毒感染后，在感染后24h进行采样，并与对照组样品进行对比。

采用RNA后组学技术对样品进行miRNA测序，并获取miRNA的表
达谱。

1.3 数据分析
利用R语言进行统计分析，分析miRNA表达谱差异，并通过GO分析和KEGG通路分析等手段，将miRNA与相关通路和功能进行联系。

2.实验结果
2.1 miRNA筛选
通过对miRNA测序数据的分析，共筛选出不同表达miRNA 190个，其中170个miRNA表达量上调，20个miRNA表达量下调。

经过进一步
筛选可得到DE-miRNA列表。

2.2 miRNA功能分析
通过GO和KEGG通路分析，得到了miRNA在免疫调节，代谢过程
等多个方面的相关通路和功能。

结果表明，在猪圆环病毒感染后，miRNA通过影响免疫和代谢等生物过程，参与圆环病毒感染的发展和肺
组织的病理过程。

3.结论
本中期报告报道了对不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织miRNA
表达谱差异的筛选及功能分析。

结果表明，miRNA在猪圆环病毒感染后，通过影响免疫和代谢等重要生物过程，参与圆环病毒感染的发展和肺组
织的病理过程。