东方巴贝斯虫EST序列分析及其线粒体基因的测定的开题报告

东方巴贝斯虫EST序列分析及其线粒体基因的测定的开题
报告
一、选题背景及意义
巴贝斯虫（Babesia orientalis）是一种原生动物，是引起水牛赤病的病原体，能够在水牛的红细胞内生长、繁殖并引起hemolytic anemia （溶血性贫血），给水牛生产和饲养业产生严重的经济损失。

目前，针对巴贝斯虫的预防和治疗手段较为有限，因此，加强对巴贝斯虫的生物学学习，探索其致病机理及繁殖规律，对于研发更加有效的预防和治疗手段具有重要的意义。

本选题将通过对东方巴贝斯虫EST序列进行分析，以及对其线粒体基因的测定，以期加深我们对巴贝斯虫基础生物学特征的认识，为进一步的研究提供理论依据。

二、研究内容
1. 对巴贝斯虫的EST序列进行分析，通过序列比对、功能注释、基因表达等方法对其进行分析，研究巴贝斯虫的基因型、表达特征、功能等。

2. 对巴贝斯虫的线粒体基因进行测定，包括线粒体基因组的测序、基因注释、线粒体基因表达水平的分析等。

三、拟采用的方法
1. EST序列分析：首先需要获取东方巴贝斯虫的EST序列数据，并通过Blast、GO、KEGG等数据库工具进行序列比对、注释和功能分析等。

2. 线粒体基因组测定：采用高通量测序技术进行线粒体基因组的测序，并通过基因注释、序列比对、同源性分析等方法对线粒体基因组进行分析。

四、预期研究结果
1. EST序列分析可研究出巴贝斯虫基因型、表达特征、功能等，为巴贝斯虫基础生物学研究提供理论支持。

2. 线粒体基因组分析可以揭示巴贝斯虫线粒体基因组的特点，包括基因组大小、结构、功能等，并为研究巴贝斯虫的能量代谢和生存策略提供理论依据。

五、经费与时间安排
本项目预计需要6个月的时间完成，经费为50万人民币。

六、可能存在的问题与解决方案
1. 数据获取难度大。

解决方案：争取和相关科研机构的合作，获取序列数据。

2. 数据处理过程中出现计算机性能瓶颈。

解决方案：升级计算机硬件，采用分布式计算技术。

3. 数据分析过程中存在误差。

解决方案：增加重复实验次数，采用多重检验法等。

七、初步结论
本研究将通过对巴贝斯虫EST序列的分析，以及对其线粒体基因的测定，揭示其基础生物学特征，为进一步研究巴贝斯虫致病机理、繁殖规律等提供理论基础。