母体血浆中DNA的半导体测序技术SSP可作为胎儿亚染色体异常的无创检测

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母体血浆中DNA的半导体测序技术SSP可作为胎儿亚染色体异常的无创检测
摘要
对母体血浆中胎儿游离DNA的无创产前检查—测序,能在产前精确的检测出非整倍体,并在临床上日益被接受。

我们的研究目的是在无创产前检查中使用半导体测序技术,是否能够可靠的检测出高危患儿中存在的亚染色体的缺失或成倍复制的现象。

首先,我们在异常DNA浓度增加的样本中,加深DNA测序的深度。

其次,我们分析了1456个孕妇的血清,采用了一种基于DNA碎片分布的大小去评估胎儿游离DNA的浓度的方法。

最后,我们收集了1476个孕妇中的血浆,这些孕妇的胎儿经超声检测发现存在结构的异常,同时对他们也进行了有创检查,我们对母体的血浆DNA中使用半导体测序技术去检测亚染色体的异常,并且使用阵列比较基因组杂交aCGH来验证我们的结果。

在3.5百万的阅读量时,SSP的检测率为56 of 78 (71.8%)与用aCGH来检测亚染色体异常相比,当增加序列深度达到10百万的阅读量并限制畸形的尺寸›1Mb时,敏感性变为69 of 73(94.5%).其中有55个假阳性样本,35个是由于母体血浆中DNA存在缺失或成倍复制的现象,提示了验证试验的必要性—去排除母体核型的异常。

这个研究显示胎儿亚染色体异常的检测SSP是无创产前诊断的一个可行扩展,我们相信这种方法在基因的诊断上具有广阔的应用,例如分析环状肿瘤DNA去进行肿瘤的检测方面。

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