分子模拟实验--Expt-Intro
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计算化学实验
目的: 1. “结构化学”可视化和程序化 2. 了解计算化学的应用领域 3. 了解计算化学的科学思想
计算化学实验
基本要求:
1. 前导课程 — “结构化学”, “物理化学” 2. 熟悉计算机的基本操作(Windows) 3. 化学各学科的基本知识 4. 化学专业英文基础 5. 常用数据处理绘图软件(如Origin)
计算化学实验
实验方式: 1. 一人一机, 独立练习 2. 先预习, 再讲解(演示), 后上机 3. 填写电子实验报告 4. 拷贝实验结果到指定计算机
计算化学实验
考核方式: A (90 - 100) — 实验认真, 结果正确 B (80 - 89) — 实验认真, 结果多数正确 C (70 - 79) — 实验认真, 结果合理 D (60 - 69) — 实验认真, 结果多数合理 E (0 - 59) — 实验不认真
计算化学实验
实验内容: 1. 分子结构优化计算 — 建模, 处理, 优化, 合理化 2. 分子轨道计算和分析 — 化学键 3. 势能面计算和模拟 — 相互作用势, 构象分析 4. 化学反应模拟 — 化学热力学和动力学(过渡态) 5. 分子光谱研究 — 振动(红外), 激发态, NMR 6. 生物大分子的模拟 — 结构表示, 分子动力学 7. 综合实验
*如果你还没有达到以上5个要求, 最好先学习之验
Chem3D, ChemDraw, JMol — 绘图, 演示, 分析
计算模块 — Mopac: 半经验量子化学方法 (AM1, PM3) Gamess: 从头算方法(HF, MP2, CI, CC, MCSCF) MM2: 力场模型; 分子力学模拟 EHMO: 扩展的Huckel模型
目的: 1. “结构化学”可视化和程序化 2. 了解计算化学的应用领域 3. 了解计算化学的科学思想
计算化学实验
基本要求:
1. 前导课程 — “结构化学”, “物理化学” 2. 熟悉计算机的基本操作(Windows) 3. 化学各学科的基本知识 4. 化学专业英文基础 5. 常用数据处理绘图软件(如Origin)
计算化学实验
实验方式: 1. 一人一机, 独立练习 2. 先预习, 再讲解(演示), 后上机 3. 填写电子实验报告 4. 拷贝实验结果到指定计算机
计算化学实验
考核方式: A (90 - 100) — 实验认真, 结果正确 B (80 - 89) — 实验认真, 结果多数正确 C (70 - 79) — 实验认真, 结果合理 D (60 - 69) — 实验认真, 结果多数合理 E (0 - 59) — 实验不认真
计算化学实验
实验内容: 1. 分子结构优化计算 — 建模, 处理, 优化, 合理化 2. 分子轨道计算和分析 — 化学键 3. 势能面计算和模拟 — 相互作用势, 构象分析 4. 化学反应模拟 — 化学热力学和动力学(过渡态) 5. 分子光谱研究 — 振动(红外), 激发态, NMR 6. 生物大分子的模拟 — 结构表示, 分子动力学 7. 综合实验
*如果你还没有达到以上5个要求, 最好先学习之验
Chem3D, ChemDraw, JMol — 绘图, 演示, 分析
计算模块 — Mopac: 半经验量子化学方法 (AM1, PM3) Gamess: 从头算方法(HF, MP2, CI, CC, MCSCF) MM2: 力场模型; 分子力学模拟 EHMO: 扩展的Huckel模型