【图文】更换体系进行计算的流程

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【图文】更换体系进行计算的流程一、寻找体系
1.双击,打开软件。

2.点击左边按钮中的,出现如下对话框
3.出现如下对话框
①在此处输
②若不允许其他元素出现,可不
③点击
点击该4.出现如下对话框
在此处
①点击
“Author/Journal”
②点击
蓝色数字链
③随便
输入信息
④选择
⑤点击
出现如下页面
(另法:打开Conquest1.8,单击Author/Journal,在Authors Names一栏输入Cotton,单击search;start search后找到IZOYAX;单击菜单栏File, Export Entries as,点File Popup)
二、文件间的转换⑥在出现
的网页中输入⑦点击
⑧勾选
⑨随便
⑩点击该项,下
1.下载的文件用软件“mercury.exe”打开(图标为Hg的软件)。

2.单击file—save as,选择文件类型为Mol2 files (*xmol2),保存
3.用Gauss View打开保存的文件,右键选择Builder,单击Delete Atom,删除不需要的原子,然后Save(gjf)。

4.用Chemcraft打开保存文件,单击save point group ,选择Cn-C4,单击Choose;单击Coord +show in format + Molpro format,然后复制坐标到gjf文件
5.用Gauss view打开gjf文件,单击Edit,点Point Group,勾选Enable**,选择C4,然后save。

得到该体系的gjf文件。

三、gjf文件的修改
1.将保存的gjf文件重命名,例:1CrCrZn-b3pw91.gjf。

2.登陆学校机群下载之前成功算出的CrCrFe的gjf、pbs文件
3.打开CrCrFe的gjf文件
①将该段文件复制至1CrCrZn-b3pw91.gjf文
②将所用泛函复制1CrCrZn-b3pw91.gjf文件中取代坐标以下的文字,将Fe均修改Zn,最后空
四、pbs文件的修改
将此处修改跟
gjf文件相同即可保最后提交机群计算即可。

⑤在此菜
③重点修改这两
. . .
④。

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