福建地区2株猪嵴病毒 VP1基因的克隆及遗传进化分析

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福建地区2株猪嵴病毒 VP1基因的克隆及遗传进化分析张永军;胡永浩
【期刊名称】《安徽农业科学》
【年(卷),期】2016(044)014
【摘要】[目的]调查猪嵴病毒在福建地区腹泻猪群中的流行和变异情况。

[方法]根据 GenBank 中登陆的猪嵴病毒(porcine kobuvirus, PKoV)结构蛋白 VP1基因序列设计特异性引物,采用 RT -PCR 方法从某猪场采集腹泻小肠样品中扩增猪嵴病毒 VP1基因,将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。

应用生物信息学软件,将获得的2株猪嵴病毒 VP1和 GenBank 的猪嵴病毒株 VP1基因序列进行对比分析。

[结果]猪嵴病毒 CH /FJNP/12L/2015与匈牙利株 K -30-HU /2008/HUN(GQ249161)的核苷酸同源性最高,为88.1%,氨基酸同源性为95.3%。

CH /FJNP/12W1/2015与越南株714441/CAOLANH -VH /2012-2-21(KT266058)的核苷酸同源性最高,为88.2%,氨基酸同源性为96.1%,同源重组分析显示,2株毒株均无明显同源重组发生。

[结论]频繁的畜禽国际贸易,以及如今便捷的现代化交通工具,人们生活提供方便的同时,也加速了猪嵴病毒毒性的传播。

【总页数】3页(P149-151)
【作者】张永军;胡永浩
【作者单位】中农威特生物科技股份有限公司,甘肃兰州730046;甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070
【正文语种】中文
【中图分类】S852.65+1
【相关文献】
1.猪嵴病毒福建株3D基因的克隆及遗传进化分析 [J], 陈如敬;吴学敏;车勇良;王隆柏;魏宏;庄向生;刘玉涛;严山;周伦江
2.猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析 [J], 祝俊鹏;杨彬;兰喜;柳纪省;马小军
3.猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析 [J], 易春华;谢齐斌;唐薇薇;朱春刚;秦长串;伍和明;韦达有;
4.福建地区猪流行性腹泻病毒E基因的克隆及遗传进化分析 [J], 董波;戴爱玲;李晓华;陈燕玲;郭月萍;杨小燕
5.河南地区猪嵴病毒分子检测和VP1基因遗传进化分析 [J], 姬郭彪;赵军;周峰;魏亚鹏;常洪涛;郑逢梅;王川庆
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