01-绪论化学生物学

• 生物化学的基本内容包括 :
发现和阐明构成生命物体的分子基础 ——生物分子的化学组成、结构和性质 ;
生物分子的结构、功能与生命现象的关系 ; 生物分子在生物机体中的相互作用及其变化规律。
生物体的化学组成
自然界所有的生命物体都由三类物质组成 :
水
约占生物体质量的三分之二 ,
生物分子 约占三分之一 ,
Genentech的骄人业绩
1976 Genentech创立 1977 首次在微生物里生产了人蛋白生长激素抑制素 1978 克隆了人胰岛素基因 1979 克隆了人生长激素素基因 1980 公司上市，募集$ 35million 1982 第一个基因重组药（人胰岛素）上市（转让给
Lilly公司） 1984 第一个VIII因子，转让给Cutter Biological 1985 第一个自己生产的产品（人生长激素） 1987 生产组织纤溶酶原激活剂（tPA） 1990 生产interferon 1 1990 与瑞士Roche医药公司合并（$ 2.1billion）
化学生物学的基本任务
运用化学的原理、语言和工具认识生命问题 揭示生命运动的化学本质 发展生命调控的化学方法 提供生命研究的化学技术
化学生物学主要研究方向简介：
（1） 蛋白质结构功能预测与分子设计
在后基因组时代所要解决的基本问题： — 基因产物—蛋白质的结构、功能及调控机制。 __ 蛋白质氨基酸序列与其空间结构的关系。
——是采用化学的手段,如运用小分子或人工设计合 成的分子作为配体来直接改变生物分子的功能。 在某种意义上, 使用小分子调节目标蛋白质,这与制 药公司发展新药类似.
生物化学
–研究生命现象化学本质的科学。 –具体讲：用化学的理论和方法研究生物体的化学
组成、结构、功能和生命活动过程中物质及能量 变化规律、阐明生命现象的化学本质的学科。 –简单讲：是生命的化学。
利用圆二色光谱、荧光光谱、微量量热与分子生物学实验及理 论模拟相结合研究: 蛋白质的折叠过程、 蛋白质与其它分子识别的机制， 以及蛋白质自组装成为复杂结构的机理。
（3） 基于结构的药物设计
• 利用高通量虚拟筛选及合理设计的方法进行 药物先导物的发现，针对疾病相关的蛋白质
靶标开展药物设计、合成及生物活性评价。
美国已批准上市的基因工程药物（2019.7）
中文名称 商品名称 英文名缩写
开发公司
胰岛素 人生长激素 干扰素
Humulin Insulin
Novolin lispoinsulin
Humalog
Protropin rhuGH
Humatrope
NutropinA Q
IntronA
rhuIFNa2b
ReferonA rhuIFNa2a
特定的条件下可能是有毒的， 而在另外一些条件下又可能 是无毒的。
反式脂肪酸 （trans-fatty acids TFAs ” ）
• 俗称的人造脂肪（人造黄油）。 • 是制造植物油的过程中通过微生物与氢化技术产生
的人造植物油脂。 • 人造植物油脂：能延长食品的保质期，增加食物的
可口程度，可以让糕点变得更酥脆；固定食品形状， 使其看上去比较美观。
• 同时着重研究药物设计中的难点问题，如： 药物与受体作用自由能计算、 药物与受体作用结合过程中受体构象变化、 化合物毒副作用计算等。
（4）功能基因组和蛋白质组研究热点
以功能基因开发为基础的“基因产业”正在形成： 基因是新兴生物制药业的源头， 对基因结构及其功能的阐明、发现 和鉴定具有重要功能蛋白的基因，
利用理论及模拟的方法研究蛋白质序列与结构的关系， 发展蛋白质结构预测的新方法；
通过蛋白质--蛋白质、蛋白质--小分子相互作用研究进行蛋白质功 能预测；在此基础上进行具有全新结构或功能蛋白质的设计，并 进行实验验证。
（2） 蛋白质折叠及生物分子识别机制研究
与蛋白质结构预测相对应的问题是: 蛋白质在溶液中是如何折叠及组装成生物活性状态的。
生物体的信息代谢
• 核酸是遗传信息的携带者
• 蛋白质是生命信息表达 ：
它的合成构成了生物体内遗传信息传递 的主要通路，
它的生物活性是表现生命活力所必需
• 生物体信息代谢的表征是分子生物学的研究核心。
化学与之生命的化学
• 20世纪70年后期，化学家在应用有机化学、分析 化学的理论和方法在分子水平上研究生命现象的化 学本质形成了生物化学的分支——生物有机化学、 生物分析化学。
药品名缩写
开发生产公司 批准时间 适应症
rhuINFa1b(外用） 长春生研所
rhuINFa1b
上海生研所
rhuINFa2a
深圳兴科
长春生研所
长生药业
三生药业
rhuIFNa2b
新大洲药业
里亚哈尔
华立达
安科
华新
1989试 2019正 2019正 2019正 2019正 2019正 2019正 2019正 2019正 2019试 2019试
（3）无机盐和水 常见无机盐K、Na 、Ca、Mg盐等。
•生物体的物质代谢、能量转换和代谢调节
• 新陈代谢—— 生物体与外界环境进行物质交换与 能量交换的过程。
同化作用：对外物的吸收、加工和转化构成自 身的合成过程。
异化作用：对内、外物分解排泄过程。
代谢调控是近代生物化学研究的一个重要方面
生物体活细胞内的数万个反应能在同一时间互不干 扰、互相配合、有条不紊地在各自代谢途径中进行， 而且在合成、分解速度和数量上，都恰到好处地合 乎生物体的各种需要。
说明一下
• 反式脂肪酸问题并非食品安全问题，这只 是一个营养问题，
• 不要过多的食用垃圾食品，
为什么？
• 为什么某些金属离子会引发疾病？会致癌？其真 正的化学本质是什么？
• 为什么表面活性剂对人体具有毒性？如何引起的？
• 为什么化学物质能够引起癌症？治疗癌症的药物 是如何起作用的？
• 为什么毒品可以上瘾？
将是21世纪生物高技术企业开发新产品的基础， 可为新药的开发带来决定性的影响。
例如：细胞的纠错功能
——癌细胞能克隆出正常胚胎 美国科学家利用
小白鼠大脑癌细胞基因克隆出正常的鼠胚胎。
操作方法 从肿瘤细胞中取出受损DNA的细胞核， 注入到小鼠的卵细胞中。
试验结果：卵细胞通过某种形式纠正了遗传错误， 发育成了一个正常胚胎。
化学生物学
生物化学基础
刘洛生
Tel: 82378 E-mail: sheng7ed126
关于我们的书
参考书目
生物化学 古练权， 高等教育出版社 医学生物化学 周爱儒，人民卫生出版社 生物化学(上下） 王镜岩， 高等教育出版社
学习成绩评议方式
1、课堂小作业、自学笔记——10%
2、文献综述——10%。
Avonix
rhuIFN
Betaseron rhuIFN1b
Actimmune rhuIFN1b
Alferon-N rhuIFNa3
Lilly Novo Nordisk Lilly Genentech Lilly Genentech
Schering Roche Biogen Chiron Genentech Interferon
3、期末考试：全面的复习、书上及课堂 讲过的内容——80%
绪
论
• 化学生物学与生物化学定义 • 生物化学的基本内容 • 化学生物学主要研究方向简介： • 化学、生物化学与其他学科的关系 • 学习过程中应注意的问题
化学生物学
——通过用化学的理论和方法研究生命现象、生命过程 的化学基础，通过探索干预和调整疾病发生发展的途径 和机理，为新药发现中提供必不可少的理论依据。
Panorex
MAB,blood clots
MAB,Kidney sup
MAB,diag inject
Centocor Ortho Biotech Cytogen Cytogen Cytogen Cytogen
Murine MAB
Glaxo Welcome
中国已经批准上市的基因工程药物（2019.5）
Hepatitis B vaccine
Bayer Baxter Genzyml
Genentech
Merck Smith Kline Merck
Smith Kline
体内用 单克隆 抗体
鼠单克 隆抗体
Reopro Ortho OKT-3 Onco Scint CR/OV Onco Scint OC103 Onco Scint CR103 Prostascint
说明什么？某些基因被活化的同时，某些基因的信 号被关闭，——调节了胚胎形成和发育
Genentech 公司——第一个基因工程公司 1976年：
27岁的风险投资人Robert Swanson 与 Herb Boyer教授（University of California） 共饮了几杯啤酒，讨论了基因工程技术的商业 前景。讨论结束时，他们决定建立一个公司， 并取名为Genentech（Genetic Engineering Technology）。
Chiron Amgen
rhuGM-GSF Immunex
rhuEPO rhuTPA
Amgen Ortho
Genentech
somatotrop Serono in
somatopin Genentech Serono Pharma/Upjoh n Novo Nordisk
抗血友病因子 VIII 葡萄脑苷脂酶
基因经济
• 基因经济（genee conomy） 以基因产品满足人 们精神和物质需求并能形成资本运作、资本市场、 扩大再生产和推动整个社会经济迅速增长和发展的 一种新经济。
• 基因经济目前正处于成长期。
• 到基因工程成为大规模的商业化市场时，基因经济 便臻成熟，届时将取代信息经济，跨进基因经济时 代。
(过的食用毒害人体)
• 长期以来，人们一直认为人造脂肪来自植物油，不会 像动物脂肪那样导致肥胖，多吃无害。
• 含多不饱和脂肪的红花油、玉米油、棉子油可以减低 胆固醇水平，但是当氢化为反式脂肪酸时，作用恰恰 相反，他们虽然不象饱和脂肪危害大，但是他们升高 血液胆固醇水平。
• 研究结果显示，对于心血管疾病的发生发展，人造脂 肪负有极大的责任，它导致心血管疾病的几率是饱和 脂肪酸的3-5倍，甚至还会损害人们的认知功能。
• 随后开始有意识地深入探讨生命体的无机化学组成 （除碳、氮、氧、氢之外的各种无机元素）与活动 状况，又促成了生物化学与无机化学的结合，从而 出现了新的边缘学科--生物无机化学。
• 目前化学家开始尝试用：
• 外源性活性小分子为探针，去探讨生物体中的分 子间相互作用和细胞发育与分化的调控作用及其 所包括的分子机制。
无机离子 约占百分之一。
• 在地 球上存在的 92 种天然元素中 , 只有 28 种元
素在生物体内被发现。
• 元素组成：C、H、O、N、P、S 及微量元素。 • 基本成分：
（1）蛋白质、核酸、多糖、脂类 ——生物体四大基本组成，作为生物体骨架， 提供能量。
（2）维生素、激素、有机酸——次生物质 酶、维生素、激素三者又称为催化调节物质。
谷物
农药 转基因
蔬菜
农药 增熟剂 保鲜剂
蛋类
化学成 分 ？
营养食物
苏丹红 激素
石膏 卤水 吊白块
肉类
抗生素 激素 瘦肉精
水果
农药 增熟剂 保鲜剂
豆制品
药物与毒物
• 毒物——在一定条件下，较 小剂量即能够对机体产生损 害作用或使机体出现异常反 应的外源化学物称为毒物。
• 毒物与药物之间并无绝对界 • 限，某种外源化学物在某些
白细胞介素2 Proleukin
粒细胞集落刺 激因子
粒细胞巨噬细胞 集落刺激因子
红细胞生成素
Neupogen
Leukine Epogen Procrit
组织溶纤原激长素
Nutropin Saizen Genotropin Norditropin
rhuIL2 rhuG-CSF
• ——用化学的和生物学的技术、工具、理论来系 统研究生命体系，开创化学生物学研究领域。
例如：食物、药物、农药和有 毒物质等。这些化学物质通 常被称为生理活性物质。
——它们对生物体内发生的生 物化学过程的调控作用。
•经过生活和实践的检验，人们发现，自己所服用的 药物、所吃的食物和使用的用品以及家居环境中无处 不存在化合物所造成的危害。
脱氧核糖核酸 酶 乙型肝炎疫苗
甲型肝炎疫苗
Kogenate Factor VIII
Recombinate
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