ABI 3500操作手册 基因测序

3500/3500XL简易操作手册
1.空间定位和光谱校正
1.1设置DyeSet进入library界面，选择DyeSets菜单，点击Create，在DyeSetName中输入“AGCU_E5”作为我公司DyeSet名称，从Chemistry下拉菜单中选择“MatrixStandard”，从DyeSetTemplate下拉菜单中选择“E5Template”，设置完成后点击Save保存设置。

1.2
1.2
孔反
一个
载96
试
并自
2.
2.1创建。

按
下图所示选择或设置各个参数，设置完成后点击Save保存。

注意将ProtocolName命名为“AGCU_E5_STR”，进样电压设置为3kv，进样时间可设置为6～10sec，DyeSet选择1.1步骤中已设置好的“AGCU_E5”，其他参数设置请参照下图。

2.2创建SizeStandard进入library界面，选择SizeStandards菜单，点击Create。

在SizeStandard 中输入“AGCU_SIZ500”，DyeColor下拉菜单中选择“Orange”，在左侧对话框中依次输入75、
100、139、150、160、200、300、340、350、400、450、490、500，每次输入结束后点击中间“AddSize”菜单即可将所输数字加入右侧对话框中。

待全部输入结束后点击Save保存。

2.3创建QCProtocol进入library界面，选择QCProtocols菜单，点击Create。

在ProtocolName 中输入“AGCU_QC”，SizeStandard下拉菜单中选择在2.2中已创建的“AGCU_SIZ500”，将UseBaselining改为38。

其他参数均按下图所示进行设置，设置完成后点击Save保存。

2.4创建Assay进入library界面，选择Assays菜单，点击Create。

在AssayName中输入“AGCU_STR”，ApplicationType下拉菜单中选择“HID”，InstrumentProtocol下拉菜单中选择2.1中创建的“AGCU_E5_STR”，QCProtocol下拉菜单中选择2.3中创建的“AGCU_QC”。

“并将其
2.5创建。

在
2.6创建中输入
“
Save
2.7创建下拉
“、
、
3．产物检测
3.1打开软件进入主界面，见下图
3.2点击主界面左上方导航键（蓝色箭头），打开DefinePlateProperties界面，在NewPlate按钮
中选择CreatePlatefromTemplate，或者直接点击快捷键CreatePlatefromTemplate。

3.3从已有的样品表模板中选择“AGCU_Platetemplate”打开。

输入本次检测样品表名称，如“”，
输入完成后点击AssignPlateContents进入下一界面。

3.4在AssignPlateContents界面点击Import在板号列表中选中相应的板号可导入列表，如果不需导入加样板可直接在PlateView中编写待检测的样品名。

3.5选中相应的待检测区域后（点击加样板左上角白色空格即可选中整版），在下方的Barcode框中单击即可分别选中Assays，FileNameConventions及ResultGroups。

全部选择完毕后点击“LinkPlateforRun”进入下一界面后点击“StartRun”即可开始电泳。

4．数据分析。