Sequence Scanner v1.0判断峰图

用Sequence Scanner v1.0软件看要寄走的质粒有没有双克隆，测序的峰图好不好，有没有污染峰。

Sequence Scanner v1.0只能打开没有经过截峰的原始测序结果。

所以质粒正确后
一、打开Sequence Scanner v1.0
二、点击import Traces或其图标
三、选中你的质粒测序的原始文件夹，如Taihe_CSXXX,不要双击进入。

选中后点击
，然后点击OK进入
四、点击右上角图标，可以看到所有结果峰图。

找到你的质粒的测序结果，双击
打开。

测序结果最下方有一排选项，
五、我们可以通过点击Raw这个选项看结果的信号高低。

六、点击Sequence可以看到整个测序结果的质量如何。

如果某一个碱基测序峰图可能有问题，会用红色、黄色等颜色标示出来，鼠标移到被标示的碱基，会给出这个碱基在哪个位置上。

记住这个位置。

七、点击Analyzed选项，在测序结果上找这个位置，
判断这一点是否有问题。

包括有无双克隆，污染峰等。

碱基的上方有带有不同颜色的长条形。

峰图的好坏决定长条形的长度和颜色，可根据这些特征快速找到出问题的点。

八、在Sequence选项中，会有很多碱基被标示出来，需要判断你要分析的区域在哪个范围，
如一个结果我可能只需分析20-800bp这一个区域，具体要分析区域根据你的结果判断。

一般情况下一个测序结果我们只需判断3个左右碱基的峰图有没有问题。

九、你可以在桌面建文件夹，把需要看的结果复制过来后将测序结果导入软件。