淋巴瘤基因克隆性重排检测
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(IGH, IGK,)(IGL)(TRB ,TRD,)( TRG)BIOMED-2方 案,唯一授权)
IGHV(依据ERIC指南)
新兴技术,更高灵敏度(10-6),更 高分辨率,更高的通量,更广泛的 应用。但成本高,仪器贵,操作复 杂,时间长。
IGH, IGK, TRB , TRG IGHV
从Biomed-2到Invivoscribe-唯一授权
新兴技术,更高灵敏度(10-6),更 高分辨率,更高的通量,更广泛的 应用。但成本高,仪器贵,操作复 杂,时间长。
IGH, IGK, TRB , TRG IGHV
IGHV SHM的检测
结合 Leader 和 FR1 区域的引物在 5’端连接有通用的测序片段,这种设计,配合 JH 反向测序引物,能 够实现 PCR 扩增产物的双向测序。目前,欧洲慢性淋巴细胞性白血病研究机构(European Research Initiative on CLL,ERIC)的指南即使用双向测序判断 IGH V区体细胞超突变(Somatic Hypermutation, SHM)状态。
7q32
TRG
7p15
TRD
14q11.2
多样性与克隆性
正常淋巴细胞成熟过程/良性病变 多克隆性
多种形式的基因重排
恶性淋巴瘤发生的过程
单克隆性
突出单一形式的基因重排
IGH, TRB & TRD: V, D, and J IGK, IGL, and TRG: V and J regions
淋巴细胞克隆性基因重排检测的临床意义
B 全方位解读基因变异 相关靶向药物信息
全面覆盖淋巴瘤相关已经上市和正在 临床试验的靶向药物
C 无创ctDNA检测
对于获取组织困难的情况,支持采用
外周血ctDNA检测
D 低频检测分析技术
Ampliseq HD技术有效降低高测序深 度下的背景信号噪音,实现低至0.1% 的检出限
谢谢大家!
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9、 人的价值,在招收诱惑的一瞬间被决定 。21.5. 1521.5 .15Sat urday, May 15, 2021
结果分析
▪ (单)克隆性:扩增产物电泳在预期大小范围内一或双条带(峰) 送检组织中,淋巴细胞抗原受体基因的重排方式为单一性。表明组织中存在单克隆性增生的细胞群。
▪ 多克隆性:扩增产物电泳呈弥散涂抹状(smear)或阶梯状(高斯分布) 送检组织中,淋巴细胞抗原受体基因的重排方式为多样性。表明组织中不存在单克隆性增生的细胞群。
Biomed-2研究项目
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9、 人的价值,在招收诱惑的一瞬间被决定 。2021/5/152021/5/15Saturday, May 15, 2021
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10、低头要有勇气,抬头要有低气。2021/5/152021/5/152021/5/155/15/2021 9:36:48 PM
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11、人总是珍惜为得到。2021/5/152021/5/152021/5/15May- 2115-M ayLeabharlann Baidu21
5%~15%的病例表现复杂,即使做了大量的免疫标志也可能难以鉴别其良恶性,需要进一步的手段区分。 利用分子生物学手段分析Ig和TCR基因的克隆性重排被WHO公认为该疾病诊断手段的重要补充。
▪ 鉴别诊断:明确是淋巴组织反应性还是淋巴细胞恶性增殖 ▪ 辅助诊断:少见类型淋巴瘤,如肝脾T细胞淋巴瘤 ▪ 亚类分析:明确是B淋巴恶性增殖还是T细胞恶性增殖 ▪ 区分同一患者两种淋巴细胞恶性肿瘤,包括复发与继发淋巴瘤 ▪ 微小残留病灶监测,评估治疗效果或复发风险(NGS方法) ▪ 细胞免疫治疗监测,监测回输T细胞增殖状况和淋巴组织来源肿瘤细胞清除效果(NGS)
基于PCR检测技术,简便、快 速、成本较低,所需DNA量少, 对DNA质量要求不高。灵敏度 高于10%,需配制胶,安全清 洁性较差。
基于PCR-毛细管电泳检测技术, 敏感性高,检测周期较长,结 果更加直观可靠
目前市场最被接受的检测方法。 灵敏度无法满足MRD要求,难 以定量和得到序列。
IGH, IGK, IGL, TRB ,TRD, TRG(BIOMED-2方案,唯一授权) IGHV(依据ERIC指南)
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14、抱最大的希望,作最大的努力。2 021年5 月15日 星期六 **21.5 .15
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15、一个人炫耀什么,说明他内心缺 少什么 。。202 1年5月 *21.5. 15*Ma y 15, 2021
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16、业余生活要有意义,不要越轨。* *5/15/ 2021
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17、一个人即使已登上顶峰,也仍要 自强不 息。*** 21.5.1 5
淋巴瘤51基因突变NGS检测
基于NGS技术一次性分析51基因
鉴别诊断
WM/LPL HCL
MCL
FL
BL
TLGL
NKTCL TPLL
DLBCL AITL ALCL
cHL
LyP
DLBCL基因分型
按细胞起源的基因分型 :GCB型和ABC型
《新英格兰医学杂志》 最新基因分型:MCD型 、N1型、BN2型、EZB 型
IGH V区体细胞超突变检测的临床意义
对以下疾病提供重要预后信息: 慢性淋巴细胞白血病(CLL)
前提: IGH克隆性重排为单克隆
例外: V3-21重排区表达与预后不良相关, 与IGHV突变状态无关。
SHM 判断标准:
IGHV突变比例
<2%
≥ 2%
SHM状态
为突变
突变
PFS
1-5年
9.2-18.9年
谢谢大家
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9、 人的价值,在招收诱惑的一瞬间被决定 。21.5. 1521.5 .15Sat urday, May 15, 2021
淋巴瘤应用基因重排检测进行辅助/鉴别诊断的方案
注意事项
▪ 检测到克隆性重排未必一定发生恶性病变 某些良性增生也可呈克隆性重排,如CD8+T细胞淋巴增生性病变、良性单克隆性丙种球蛋白病、皮肤淋
巴瘤样丘疹病、免疫缺陷患者严重的EB病毒感染等;
▪ 检测不到克隆性重排也不能排除恶性病变 某些明确恶性病变的免疫缺陷患者中偶尔检测不到克隆性重排,NK/T细胞淋巴瘤中IG和TCR基因呈胚系
B-Cell Receptors (BCR) /Immunoglobulins (Ig)
T-Cell Receptor (TCR)
蛋白 Ig重链 Ig轻链 Ig轻链
基因
染色体定位
IGH
14q32
IGK
2p12
IGL
22q11
蛋白 TCRα TCRβ TCRγ TCRδ
基因
染色体定位
TRA
14q11
TRB
淋巴细胞克隆性基因重排检测产品特点
1
BIOMED-2唯 一授权的商品
化试剂
2
3
全面涵盖各种 T\B细胞重排类
型
超过400例的临床样本验 证,反应体系稳定,结
果可靠
4
可疑淋巴组织增 生性疾病克隆性 分析的“金标准
”
5
最丰富的阳性 对照
淋巴细胞克隆性基因重排检测的目标分子Ig和TCR--单一 基因重排,即恶性淋巴细胞
专注分子诊断 | 引领精准医学
Biomed-2研究项目(IGH为例)
van Dongen, J. J. M., et al. (2003). Leukemia 17: 2257.
Biomed-2研究项目(IGH为例)
van Dongen, J. J. M., et al. (2003). Leukemia 17: 2257.
Invivoscribe 公 司 的 IdentiCloneTM 系 列 产 品是基于PCR的克隆性检测产品,是BIOMED2唯一授权的商品化试剂,获得CE认证,以其 高度的灵敏性和特异性,成为可疑淋巴组织增 生性疾病克隆性分析的“金标准”。
IdentiCloneTM系列产品具有精心优化的标 准化试剂组成,具有最丰富的阳性对照,涵盖 各种T\B细胞重排类型,经过了超过400例的临 床样本验证,按照临床产品的标准进行质检和 质控,反应体系稳定,结果可靠。
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12、人乱于心,不宽余请。2021/5/152021/5/152021/5/15Saturday, May 15, 2021
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13、生气是拿别人做错的事来惩罚自 己。2021/5/152021/5/152021/5/152021/5/155/15/2021
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14、抱最大的希望,作最大的努力。2021年5月15日 星期六 2021/5/152021/5/152021/5/15
淋巴瘤基因克隆性重排和 IGHV体细胞超突变检测
血液肿瘤(常规肿瘤)检测方案-MICM综合分子检测 (旌准方案)
形态学
(Morphology)
分子生物学 (Molecular)
• 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) • 毛细管凝胶电泳(CE) • 荧光实时定量PCR(RTQT-PCR) • 一代测序(Sanger) • 二代测序(NGS)
基于不同方法的产品系列-Invivoscribe公司
基于PCR检测技术,简便、快 速、成本较低,所需DNA量少, 对DNA质量要求不高。灵敏度 高于10%,需配制胶,安全清 洁性较差。
基于PCR-毛细管电泳检测技术, 敏感性高,检测周期较长,结 果更加直观可靠
目前市场最被接受的检测方法。 灵敏度无法满足MRD要求,难 以定量和得到序列。
血液 肿瘤
免疫学 (Immunology)
• 免疫组化(IHC) • 流式细胞术(FCM)
细胞遗传学(Cytogenetics)
• 荧光原位杂交(FISH)
辅助诊断
预后分析 指导用药 MRD检测
分子检测-淋巴瘤
Moffitt, A. B. and S. S. Dave (2017). J Clin Oncol 35(9): 955-962.
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15、一个人炫耀什么,说明他内心缺 少什么 。。2021年5月 2021/5/152021/5/152021/5/155/15/2021
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16、业余生活要有意义,不要越轨。2021/5/152021/5/15May 15, 2021
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17、一个人即使已登上顶峰,也仍要 自强不 息。2021/5/152021/5/152021/5/152021/5/15
结构,即也无克隆性重排。
▪ IG或TCR基因的重排不一定是谱系的标志 特别是大多数前驱淋巴细胞性肿瘤中存在谱系交叉,如血管免疫母细胞学淋巴瘤(AITL)。单一发生可
反映谱系,同时阳性只表示克隆性增生,不能判断谱系来源。
▪ 假阳性和假阴性 技术,引物,反应条件
✓ 分子克隆性结果分析,应结合临床、形态学和免疫表型特征,方可做出淋巴瘤的最终诊断和分类。
OS
3.2-10年
17.9-25.8年
预后
不良
良好
PFS:无进展生存期(Progression free survival) OS:总生存期(Overall survival)
IGH V区的SHM状态检测被推荐为新诊断CLL患者预后分析的生物标志物。
中国CLL/SLL的诊断与治疗指南(2018版)
基于不同方法的产品系列-Invivoscribe
分子检测 检测基因
方法
IG/TCR 基因重排
IGH,IGK, • GEL (PAGE) IGL,TRB, • ABI (CE) TRD,TRG • NGS
• GEL (PAGE)
IGHV超突变
IGH
• ABI (CE)
• NGS
基因突变
EZH2, DNMT3A, IDH2…
• Sanger • NGS
预后分层
CLL/CLL TLGL ALCL DLBCL WM/LPL
FL MCL PTLD SMZL
靶向治疗
DLBCL MCL WM HCL NKTCL
FL CLL/SLL BL AITL ALCL
淋巴瘤51基因突变NGS检测
产品特点
A 针对临床应用设计
全面覆盖WHO、NCCN、中国指南 和专家共识中涉及的相关基因 遵循临床常规诊断流程,同其它诊断 技术协同使用
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10、低头要有勇气,抬头要有低气。* **5/15 /2021 9:36:49 PM
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11、人总是珍惜为得到。21.5.15**M ay-211 5-May-2 1
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12、人乱于心,不宽余请。***Saturday, May 15, 2021
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13、生气是拿别人做错的事来惩罚自 己。21. 5.1521 .5.15* *May 15, 2021
▪ 无扩增产物:PCR扩增后电泳未见产物 送检组织中的细胞,抗原受体基因无重排(NK,非淋巴细胞)或DNA质量过差。
marker P M H2O S1 S1 S2 S2
500bp400bp-
300bp250bp-
200bp175bp-
150bp-
IGH B(250-295bp)
Products are heterodulex-treated followed by PAGE on 6% gel