SNP在动植物遗传育种中的应用

SNP在动植物遗传育种中的应用
作者：杨彩琴杨素美邱翠丽
来源：《农业开发与装备》 2018年第10期
摘要：SNP是单核苷酸多态性的简称，属于第三代分子标记。

自身具有非常明显的特征，
存在的数量比较多，并且分布的范围非常广泛，具有良好的遗传稳定性。

从目前情况来看，在
动物遗传育种的过程当中，发挥着不可忽视的作用，并且在相关研究当中取得一定成绩。

通过PCR技术，并且结合荧光以及相关方法建立检测基因，在动物遗传育种过程当中发挥不可忽视
的作用。

关键词：SNP；检测方法；动物遗传育种；具体应用
0引言
在基因组水平之上，通过单个核苷酸碱基的转换作用，会形成SNP，这是一种具有广泛分
布特点的变异物质，在动植物生长过程当中存在分子标记。

另外，SNP具有极强的代表性作用，遗传过程当中，表现出高度的稳定性，能够进行自动化的检测和分析。

在基因组之内SNP有不
同的形式，其中包括大量单碱基变异形式以及基因编码区的功能性突变。

1常用的SNP检测方法
1.1分析未知SNP
对于未知的SNP进行有效分析，其中包括限制性片段长度多态性、温度梯度凝胶电泳和变
性梯度凝胶电泳、Taqman荧光探针法。

首先，限制性片段长度多态性，在具体的SNP位点进行
扩张，并且引入专门的碱基，从而形成内切酶位点，另外在充分应用限制性内切酶进行检测，
如果其中发现了SNP位点，那么长度和数量就会出现明显的差异。

这种技术方法是非常常见的，适合寻找并且检测少量的SNP位点工作。

其次，温度梯度，凝胶电泳和变相提供凝胶电泳。

这
种方法是通过构象分析来完成的。

设置温度梯度浓度，并且确保安检机突变的DNA发生不同的
迁移率，便可以保证分离目的。

另外对于DNA片段的检测工作可以应用TGGE，具有较高的检出率。

最后，Taqman荧光探针发。

这种方法充分应用在PCR的反应当中，通过荧光染料和荧光物
质在两端进行探针处理，如果发现探针没有和目标序列有机的结合在一起，便可以进行共振能
量的传递，保证染料不再发出荧光。

如果发现能够完全的结合，便可以将荧光染料从探针上取
出来，用于检测工作。

错配碱基的现象是普遍存在的，能够在很大程度上减少紧密程度，并且
可以减少荧光染料的活性，因此影响整体的释放能量。

1.2分析已知SNP
对于已知SNP的分析包括等位基因特意寡核苷酸片段分析、突变错配扩增检验以及基因芯
片技术。

第一种方法是探针和DNA样品进行杂交，并且通过扫描样品进行特异性的诊断和分析。

第二种方法原理就是针对突变的位点设置引物，并且发挥互补的作用，判断突变。

在检测样品
的过程当中加入两种不同的引物，从而形成平行PCR，判断基因型。

第三种基因芯片技术应用
也是比较广泛的，能够同时固定于支持物质上，并且解决分子数量小以及效率较低的问题。

这
种方式应用起来比较方便，并且经济成本较低，所以发展前景较好。

2SNP在动物遗传分析以及遗传育种当中的具体应用
在家禽遗传图谱的构建过程当中，广泛应用了SNP，除此之外SNP也能够进行QTL定位，
并且能够科学的分析功能基因，在很大程度上促进分子标记，并且辅助育种工作的顺利进行。

从目前情况来看，我国很多地区在研究动物育种的过程当中，对于SNP的研究工作仍然不够成熟，但是也有着比较好的开端。

存在一种普遍的现象就是，动物育种领域当中关于对SNP的研
究主要是针对猪以及鸡等动物的报道，对于牛和羊这一类动物的相关报道和研究是比较少见的，因此在家畜遗传图谱以及遗传育种当中，SNP有着良好的发展前景和空间。

对于家禽和家畜的遗传分析和遗传育种的分析过程当中广泛应用SNP，相关研究工作人员
利用PCR-SSCP方法对于猪的生长性状以及繁殖性状进行发掘，除此之外，也会应用PCR-RFLP
方法进行研究，除此之外，对于猪的肉质性状和抗病性状也有一部分的研究和发现，通过这些
分析和研究能够有效地揭示基因外显子和内含子，值得关注的是在调控区域之内的SNP多态性
和经济性，会明显的表现出连锁现象。

专业的研究工作人员应用不同种类的分析方法对牛生长激素受体基因的SNPP进行分析和检测工作，通过分析检测以及对检测结果的研究，发现牛生长激素抑制素对于牛的遗传育种工作
有着非常直接的影响，这种生长激素抑制素影响生长激素的不断分泌，是一种抑制因子。

另外
也有一些研究工作人员通过对纯种牛的DNA进行研究和检测，并且分析牛MSTN基因，通过使用SNP进行全面的分析和检测，提出了一整套完整的检测分析以及鉴定方法。

由此看来，在家禽
和家畜遗传分析工作和遗传育种工作进行的整个过程当中，应用测序和DHPLC相互之间有机结
合的方法，能够做出科学的筛选。

除此之外，充分应用DNA池进行比较，分析鸡SCD基因，在
整个编码区域之内进行搜寻。

并且应用不同的方法，对不同的品系分析肉鸡的钙蛋白酶，并且
不断地扩张基因外显子序列，通过对比，发现其中有两个SNP位点。

这种SNP的发掘方法在家
禽家畜遗传育种以及遗传分析过程当中发挥着巨大的作用，对于动物遗传育种研究工作来讲具
有深远的意义。

3结语
SNP在动物遗传分析和遗传育种当中具有明显作用，并且不断的发展和进步，因此必须得
到重视。

参考文献
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