ARMS法检测非小细胞肺癌EGFR基因位点不同的比较性分析
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展机制 的深入 研究 。 目前检 测 EGFR基 因突变 状态 的试 剂 广泛应用 于临床 ,其 不但 可 以有 效指 导 分子 靶 向 药物 的 使 用 ,也可 以为肺癌发生 机制的研究及 EGFR基 因突变状况 提 供重要 的信息 。 目前艾 德 EGFR基 因突变检 测试 剂 已被 我 国批准用于临床 EGFR基 因突变 检测 ,在 市场上有 2种不 同 位点检测 试剂 盒供 临床使 用 ,即 EGFR基 因 4位点及 29位 点检测 ,前者费用低 ,后 者费用较高 ,但检测位点 较多 。本 文 回顾分析 NSCLC石蜡包埋 组织 ARMS法检 测 EGFR基 因突 变情况 ,旨在 了解艾 德 EGFR基 因 4位点 及 29位点 试剂 突 变检出率 的差异性 ,以供 临床参 考。
1 材 料 与方 法
1.1 材料 收集 漳州市医 院 2015年 5月 ~2016年 12月 行 原 发肺 癌手术切除 或活检 连续 检测 病例 373例 。其 中男 性 247例 ,女性 126例 ;年 龄 30—83岁 ,中位 年 龄 57岁 。行 EGFR基 因 4位点检测病 例 151例 ,行 EGFR基 因 29位点 检 测 病例 222例 。所有标本 均经 10%中性缓 冲福 尔马林 固定 , 常规石蜡包埋 。病理 类 型 :(1)行 EGFR基 因 4位点 检测 病 例 病理类型包括 :肺腺癌 121例 (包 括原位 腺癌 )、肺 鳞癌 l8 例 ,腺鳞癌 9例 ,神经 内分泌 癌 3例 ;(2)行 EGFR基因 29位 点检测病例病理类 型包 括 :肺腺癌 192例 (包 括原 位腺 癌 )、 肺 鳞癌 15例 ,腺鳞癌 10例 ,神经 内分 泌癌 5例 。 1.2 主要试剂与 仪器 DNA提取试 剂 盒 (厦 门艾 德公 司 ) 及 EGFR 4种 热 突 变 检 测 试 剂 盒 及 EGFR 29种 突 变 检 测 试 剂 盒 (厦 门艾德 公 司 )。Cobas Z480 PCR仪 ;微 型 干式 恒 温 器 (GY2101);ND2000微 型紫外分光光度仪 。 1.3 方 法 1.3.1 DNA提取 严格按 照 DNA提取试剂盒 说明书操作 , 紫外分光光度仪测 定提取 样本 DNA的纯 度和 浓度 ,纯 度 在 1.8—2.0之间的样本为好 。 1.3.2 ARMS法 采用 EGFR基 因突变 4种及 29种检测 试 剂盒 (厦 门艾德 公司 ),提取 DNA产物 为模 板 ,DNA稀 释 浓 度为 2—3 ng/txL;其 中,EGFR基 因热 点突 变 4种 ,包 括 EG— FR 基 因 的 19、20及 21外 显 子 ,位 点 包 含 Ex19 Del(2235— 2249del15、2236-2250del15)、Ex20.T790M 及 Ex21一L858R 4 个热点突 变 ;EGFR基 因 突 变 29位 点 ,包 括 EGFR 基 因 的 18、19、20及 21外显 子 ,位 点 包含 除 了含有 2235—2249de115 和 2236—2250de115,还 有 其 他 17 种 Exl9Del以 及 Ex20一 T790M、Ex21一L858R、3 种 Ex20一ins、Exl8一G719X (G719A、 G719S、G719C)、Ex20一¥768I、Ex21一L861Q等 29种突变 ,具 体 碱基变化及 Cosmic ID可以参考说 明书。4种 热点突变及 29
接 受 日期 :2018—01—12 基 金项 目:福建漳州市 自然科学基金 (ZZ2012J33) 作者单位 :福建 医科大学附属漳州市 医院病理科 ,漳 州 363000 作者简介 :陈顺平 ,男 ,主管技师 。E—mail:471231682@qq.tom
苏海燕 ,女 ,副主任 医师 ,通讯作 者 。E—mail:s ̄in000064
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临床 与 实验 病 理 学杂 志 J Clin Exp Pathol 2018 Mar;34(3)
网络 出版 时 间 :2018—3—29 14:00 网络 出版 地 址 :http://kns.cnki.net/kcms/detail/34.1073.R.20180329.1400.019.html
ARMS法检 测 非 小 细 胞 肺癌 EGFR基 因位 点不 同的 比较 性 分析
陈顺 平 ,苏海 燕 ,翁剑 鸣 ,吴文 乔 ,沈 洪武
摘 要 :目的 分析 扩增 阻滞 突变 系统 (ARMS)法检 测 EGFR 基 因不 同位 点 数 的 突变 检 出率 差 异 。方 法 回顾 性 分 析 ARMS法 对 非 小 细 胞 肺 癌 (non—small cell lung cancer, NSCLC)石蜡包埋组 织标 本 EGFR基 因 4位点 突 变及 29位 点 突变检测 情况 。结果 ARMS法 检测 NSCLC EGFR基 因 (19、20、21号 外显子 )4位点 突变 的 突变率 为 29.14% ,EG— FR基 因(18、19、20、21号外显子 )29位点 突变率为 44.60% 。 NSCLC中 EGFR基 因突变率在 4位 点与 29位点差异 具有显 著性 (P<0.001);EGFR基 因 4位 点在 NSCLC腺 癌 中 的突 变率为 32.23% ,而 29位 点 的突 变率 为 46.88% ,两者 突变 率差异 有显 著性 (P<0.001);但 19Del与 L858R点突 变各 自在两种不 同位 点试 剂检测 中 NSCLC突变率 及腺癌 突变率 差异无统计学 意义 (P>0.05)。EGFR 29位点 试剂 检 测 中 女性患 者 与 男 性 患 者 的 突变 率 差 异 有 统 计 学 意 义 (P < 0.001),但 4位点试 剂检 测差 异无 统计 学 意义 (P>0.05); 男 性患者检测 EGFR基 因 29位点的突变率 高于 4位 点突变 率 ,但差异无 统计学 意义 (P>0.05),女 性 患者 表现 出更 高 的突变 率 ,且 29位 点 与 4位 点 突变 率差 异 有 显著 性 (P< 0.001)。结论 艾 德公 司设计 EGFR基 因 29种 检测位 点在 NSCLC或腺癌或女性患者 中的突变率明显高 于 EGFR基 因 4 位 点突变率 ;同时 ,通过了解这两种不 同位点检测试剂所体 现 出不 同突变检 出率 ,还有助 于不 同情 况下不 同人群 EGFR靶 点检测选择提供 了数据支持 ,具有较高的临床意义 。 关键词 :肺 肿瘤 ;非 小细胞肺癌 ;EGFR;ARMS 中图分类号 :R 734.2 文献标 志码 :B 文 章 编 号 :1001—7399(2018)03—0322—04 doi:10.13315/j.cnki.cjcep.2018.03.019
EGFR被认 为是最有效 的肺 癌靶点 之一 ,它是 一种 跨细 胞膜糖蛋 白 ,属于酪氨 酸 酶 ,其 突变及 过表 达与 肿瘤 细胞 的增殖 、活动 性 、粘 连 性 、侵 袭性 、凋 亡 抑 制 和 血 管生 成 相 关 … 。近年来 ,以吉非替尼 (Gefitinib)为代 表 的酪氨酸 激酶 抑制剂在非小细胞 肺癌 (non—small cell lung cancer,NSCLC) 靶 向药物抑制肿瘤 细胞生长起 了积极 的疗 效 。 ,得 助于近 年来以 EGFR基 因为 首 的信 号传 导通 路在 NSCLC发 生 、发
展机制 的深入 研究 。 目前检 测 EGFR基 因突变 状态 的试 剂 广泛应用 于临床 ,其 不但 可 以有 效指 导 分子 靶 向 药物 的 使 用 ,也可 以为肺癌发生 机制的研究及 EGFR基 因突变状况 提 供重要 的信息 。 目前艾 德 EGFR基 因突变检 测试 剂 已被 我 国批准用于临床 EGFR基 因突变 检测 ,在 市场上有 2种不 同 位点检测 试剂 盒供 临床使 用 ,即 EGFR基 因 4位点及 29位 点检测 ,前者费用低 ,后 者费用较高 ,但检测位点 较多 。本 文 回顾分析 NSCLC石蜡包埋 组织 ARMS法检 测 EGFR基 因突 变情况 ,旨在 了解艾 德 EGFR基 因 4位点 及 29位点 试剂 突 变检出率 的差异性 ,以供 临床参 考。
1 材 料 与方 法
1.1 材料 收集 漳州市医 院 2015年 5月 ~2016年 12月 行 原 发肺 癌手术切除 或活检 连续 检测 病例 373例 。其 中男 性 247例 ,女性 126例 ;年 龄 30—83岁 ,中位 年 龄 57岁 。行 EGFR基 因 4位点检测病 例 151例 ,行 EGFR基 因 29位点 检 测 病例 222例 。所有标本 均经 10%中性缓 冲福 尔马林 固定 , 常规石蜡包埋 。病理 类 型 :(1)行 EGFR基 因 4位点 检测 病 例 病理类型包括 :肺腺癌 121例 (包 括原位 腺癌 )、肺 鳞癌 l8 例 ,腺鳞癌 9例 ,神经 内分泌 癌 3例 ;(2)行 EGFR基因 29位 点检测病例病理类 型包 括 :肺腺癌 192例 (包 括原 位腺 癌 )、 肺 鳞癌 15例 ,腺鳞癌 10例 ,神经 内分 泌癌 5例 。 1.2 主要试剂与 仪器 DNA提取试 剂 盒 (厦 门艾 德公 司 ) 及 EGFR 4种 热 突 变 检 测 试 剂 盒 及 EGFR 29种 突 变 检 测 试 剂 盒 (厦 门艾德 公 司 )。Cobas Z480 PCR仪 ;微 型 干式 恒 温 器 (GY2101);ND2000微 型紫外分光光度仪 。 1.3 方 法 1.3.1 DNA提取 严格按 照 DNA提取试剂盒 说明书操作 , 紫外分光光度仪测 定提取 样本 DNA的纯 度和 浓度 ,纯 度 在 1.8—2.0之间的样本为好 。 1.3.2 ARMS法 采用 EGFR基 因突变 4种及 29种检测 试 剂盒 (厦 门艾德 公司 ),提取 DNA产物 为模 板 ,DNA稀 释 浓 度为 2—3 ng/txL;其 中,EGFR基 因热 点突 变 4种 ,包 括 EG— FR 基 因 的 19、20及 21外 显 子 ,位 点 包 含 Ex19 Del(2235— 2249del15、2236-2250del15)、Ex20.T790M 及 Ex21一L858R 4 个热点突 变 ;EGFR基 因 突 变 29位 点 ,包 括 EGFR 基 因 的 18、19、20及 21外显 子 ,位 点 包含 除 了含有 2235—2249de115 和 2236—2250de115,还 有 其 他 17 种 Exl9Del以 及 Ex20一 T790M、Ex21一L858R、3 种 Ex20一ins、Exl8一G719X (G719A、 G719S、G719C)、Ex20一¥768I、Ex21一L861Q等 29种突变 ,具 体 碱基变化及 Cosmic ID可以参考说 明书。4种 热点突变及 29
接 受 日期 :2018—01—12 基 金项 目:福建漳州市 自然科学基金 (ZZ2012J33) 作者单位 :福建 医科大学附属漳州市 医院病理科 ,漳 州 363000 作者简介 :陈顺平 ,男 ,主管技师 。E—mail:471231682@qq.tom
苏海燕 ,女 ,副主任 医师 ,通讯作 者 。E—mail:s ̄in000064
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临床 与 实验 病 理 学杂 志 J Clin Exp Pathol 2018 Mar;34(3)
网络 出版 时 间 :2018—3—29 14:00 网络 出版 地 址 :http://kns.cnki.net/kcms/detail/34.1073.R.20180329.1400.019.html
ARMS法检 测 非 小 细 胞 肺癌 EGFR基 因位 点不 同的 比较 性 分析
陈顺 平 ,苏海 燕 ,翁剑 鸣 ,吴文 乔 ,沈 洪武
摘 要 :目的 分析 扩增 阻滞 突变 系统 (ARMS)法检 测 EGFR 基 因不 同位 点 数 的 突变 检 出率 差 异 。方 法 回顾 性 分 析 ARMS法 对 非 小 细 胞 肺 癌 (non—small cell lung cancer, NSCLC)石蜡包埋组 织标 本 EGFR基 因 4位点 突 变及 29位 点 突变检测 情况 。结果 ARMS法 检测 NSCLC EGFR基 因 (19、20、21号 外显子 )4位点 突变 的 突变率 为 29.14% ,EG— FR基 因(18、19、20、21号外显子 )29位点 突变率为 44.60% 。 NSCLC中 EGFR基 因突变率在 4位 点与 29位点差异 具有显 著性 (P<0.001);EGFR基 因 4位 点在 NSCLC腺 癌 中 的突 变率为 32.23% ,而 29位 点 的突 变率 为 46.88% ,两者 突变 率差异 有显 著性 (P<0.001);但 19Del与 L858R点突 变各 自在两种不 同位 点试 剂检测 中 NSCLC突变率 及腺癌 突变率 差异无统计学 意义 (P>0.05)。EGFR 29位点 试剂 检 测 中 女性患 者 与 男 性 患 者 的 突变 率 差 异 有 统 计 学 意 义 (P < 0.001),但 4位点试 剂检 测差 异无 统计 学 意义 (P>0.05); 男 性患者检测 EGFR基 因 29位点的突变率 高于 4位 点突变 率 ,但差异无 统计学 意义 (P>0.05),女 性 患者 表现 出更 高 的突变 率 ,且 29位 点 与 4位 点 突变 率差 异 有 显著 性 (P< 0.001)。结论 艾 德公 司设计 EGFR基 因 29种 检测位 点在 NSCLC或腺癌或女性患者 中的突变率明显高 于 EGFR基 因 4 位 点突变率 ;同时 ,通过了解这两种不 同位点检测试剂所体 现 出不 同突变检 出率 ,还有助 于不 同情 况下不 同人群 EGFR靶 点检测选择提供 了数据支持 ,具有较高的临床意义 。 关键词 :肺 肿瘤 ;非 小细胞肺癌 ;EGFR;ARMS 中图分类号 :R 734.2 文献标 志码 :B 文 章 编 号 :1001—7399(2018)03—0322—04 doi:10.13315/j.cnki.cjcep.2018.03.019
EGFR被认 为是最有效 的肺 癌靶点 之一 ,它是 一种 跨细 胞膜糖蛋 白 ,属于酪氨 酸 酶 ,其 突变及 过表 达与 肿瘤 细胞 的增殖 、活动 性 、粘 连 性 、侵 袭性 、凋 亡 抑 制 和 血 管生 成 相 关 … 。近年来 ,以吉非替尼 (Gefitinib)为代 表 的酪氨酸 激酶 抑制剂在非小细胞 肺癌 (non—small cell lung cancer,NSCLC) 靶 向药物抑制肿瘤 细胞生长起 了积极 的疗 效 。 ,得 助于近 年来以 EGFR基 因为 首 的信 号传 导通 路在 NSCLC发 生 、发