生物信息综合实验报告

生物信息综合实验报告集团标准化工作小组 #Q8QGGQT-GX8G08Q8-GNQGJ8-MHHGN#
实验五
一：流程图设计：
我主要是分析流感病毒h1n1。

在NCBI中查找h1n1的相关文献，了解有关h1n1的基本知识。

再对h1n1的核苷酸序列以及蛋白质序列进行分析。

大体过程如下：
一：下载两条h1n1的核苷酸序列
1.进入网站NCBI：，输入要查找的h1n1序列
2.将找到的序列以FASTA格式保存
二．用blasta对两条序列进行比对
三．用dnaman软件分析两条核苷酸序列
1.查看两条序列的理化性质
分析h1n1polymerase pb1
分析h1n1nucleocapsid protein np
2.两条序列的比对：
酶切位点分析
h1n1polymerase pb1
h1n1 nucleocapsid protein np
4.两序列同源性分析
5.引物设计：
h1n1polymerase pb1
另外一条序列的设计同上。

四．利用NCBI将核苷酸序列翻译为蛋白质序列
进入NCBI网站，点ORF finder，把核苷酸序列输入
五．在NCBI中查看蛋白质序列的二级结构或用Jpred分析二级结构也可用Jpred进行二级结构的预测
六．用SWISS-MODEL进行蛋白质三级结构预测
用Swiss-Pdb Viewer软件作的球棍模型。