国外引进甘蔗品种鉴定及多样性分析
合集下载
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
究单位引进的国外甘蔗品种有一部分同名,但是否同种就难以辨认了;同时由于资源圃管理人员的变动,资
源圃中不同的圃位上存在个别同名,是否是同种需要确认。 这为提供利用带来较大的难度。 田间植株形态鉴
定是目前甘蔗品种鉴定主要采用的方法,但田间形态鉴定周期长、工作量大且受季节影响。 而对遗传背景相
对较近的品种,品种表型差异小,使得传统以形态学特性为基础的田间鉴定,难以应用于甘蔗品种鉴定,因此
Copyright©博看网 . All Rights Reserved.
30
Sugar Crops of China
2017
性 条 带 比 率(percentage of polymorphic bands, PPB)、Jaccard (1908)遗 传 相 似 性 (genetic similarity, GS),其 中
试验研究
中国糖料,2017,39(6):29-31
29
doi:10.13570/ki.scc.2017.06.008
国外引进甘蔗品种鉴定及多样性分析
苏火生,应雄美,刘洪博,刘新龙,徐超华,李存佳,林秀琴,毛钧,李旭娟,马丽,陆鑫*
(云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南开远 661699)
究 缘关系分析,以期待对国外品种的收集保存和快速准确鉴定提供技术基础与理论依据。
1 材料与方法
1
1.1 供试材料 来自于国家甘蔗种质资源圃的 40 个国外引进甘蔗材
料,名称见表 1。 1.2 叶片基因组 DNA 提取
参照蔡青等 [3] 方法并略加改进提取品种叶片基因组 DNA,对每个品种采集 10 个无性系单株新叶,混合后并迅 速剪碎并在-20℃冰箱中冷冻, 于次日加入预冷的 CTAB 抽提液在 RECH Mix Mills301 DNA 研磨机上研磨成浆,其 他步骤同常规 CTAB 法。 1.3 SSR 扩增与产物检测
u
s ed((((((((333333333333)))))))) in**+**+** 444444444444%-%"2+26t++*+++*+h"-88*"62isstudyNum++++++++++++++++++++ber
立数据集。 每对 SSR 引物检测 1 个位点,在相同迁移位置上,有带记为 1,无带记为 0。 使用标记位点的多态
摘 要:利用 3 对 SSR 引物,对 40 份国外甘蔗品种进行品种鉴定。 结果表明:同名种质除 CP78-1628
和 Ti80-5 同名种质的遗传相似系数分别为 0.24 和 0.50 相对较低外, 其他同名种质之间的遗传相似
系数相对较高,都≥0.95,平均 0.93。 聚类分析表明,除 CP78-1628 和 Ti80-5 两份种质出现分支外,其
他种质分支都按照同名种质分别聚类。基于遗传相似系数和聚类分析结果表明,CP78-1628 和 Ti80-5
为同名异种种质。
关键词:甘蔗;品种;鉴定;多样性
中 图 分 类 号 :S566.103
文 献 标 识 码 :A
文 章 编 号 :1007-2624(2017)06-0029-03
国外甘蔗品种的引进为甘蔗良种的选育和优良亲本的杂交利用提供了丰富的资源基础。 国外甘蔗品种
收 稿 日 期 :2017-05-26 基 金 项 目 : 农 业 部 物 种 资 源 保 护 项 目 (2016NWB021) ; 国 家 科 技 资 源 共 享 服 务 平 台 (NICGR2017-44) 。 作 者 介 绍 : 苏 火 生 (1980-) , 男 , 四 川 简 阳 人 , 助 理 研 究 员 , 主 要 从 事 甘 蔗 种 质 保 存 与 分 子 生 物 学 研 究 。 通信作者:陆鑫,副研究员,主要从事甘蔗种质保存与种质资源创新。 E-mail:xinlu_ky@
是甘蔗遗传育种中最重要的供体亲本之一。 近年来,随着国外品种交换规模的持续加大,国家甘蔗资源圃内
已经保存了来自 20 多个国家的甘蔗品种资源 700 余份,类型丰富多样,是我国甘蔗资源的宝贵基因库。保存
并提供好这些国外品种对甘蔗良种的选育具有重要意义。
国家资源圃在建圃初期,国外品种的来源主要是国内各甘蔗研究单位从国外引进的甘蔗品种。各甘蔗研
PPB = a/(a+b),Gsij=a/(a+b+c),a 为两个个体的共享片段数,b 和 c 为 i 个体和 j 个体各自拥有的多态片段数。
遗传相似性与 UPGMA (unweighted pair group method analysis)聚类分析通过 NTSYSpc2.1 软件实现[6]。
参照 Karen 等[4]方法进行 SSR 反应及 PCR 扩增。 扩增 产物经 95℃变性后在 5%的变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳分 离。 采用刘新龙等[5]建立的快速银染法染色。 1.4 数据统计分析
采用人工读带的方 式 ,SSR 扩 增 带 型 以 0、1 记 录 ,建
Table 1
!,,,,77777:::<:CCE;D
2 结果
2.1 SSR 标记分析 3 对 引 物 在 40 份 种 质 中 共 检 测 到
J";;$-"""--
#-**25"-622222K*%-68$$+56--8888% #6#$+#*%##-#####85"
#"#+""" 885+5#*"866# 68++$$""55$%8+"8-58 %$6+-$ 5
FFT ....h=GG////&99999999@BBBe>HHc'A0000u?II l1111t11ivars
准确、迅速、简便地鉴定甘蔗品种成为甘蔗保育和提供利用工作的重要内容。
在以 DNA 为基础的分子标记技术中,SSR 标记技术是目前用于种子纯度和品种真实性鉴定的最适宜技
术,其优点是简便快速、稳定性高、重复性好、费用相对低廉及多态性丰富[1-2]。 但目前利用 SSR 标记进行国外
引进品种鉴定方面的研究还未见报道。 本研究应用 SSR 标记对 40 个国外引进甘蔗材料进行品种鉴定与亲