6实验六质粒的提取和琼脂糖凝胶电泳检测

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7. 弃去收集液,加入720μl用乙醇稀释的DNA洗涤 缓冲液洗涤柱子,室温10,000×g离心1min,弃去 洗涤液。
五、实验结果与讨论
1. 实验结果 2. 讨论
附I:碱法提取质粒的原理和方法
(一)试剂等
1. SolutionⅠ 50 mmol/L 葡萄糖 25 mmol/L Tris.· Cl (pH 8.0) 10 mmol/L EDTA (pH 8.0) 高压灭菌后,4℃保存备用。 2. SolutionⅡ(现用现配制) 0.2 mol/L NaOH 1% SDS
9. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管 中,在吸附膜的中间部位加60-100 μl洗脱缓 冲液EB或双蒸水(洗脱缓冲液事先在65℃70℃水浴中加热效果更好),室温放置1分钟, 13,000rpm离心1分钟洗脱质粒DNA,可立即 用于下游分子生物学实验或-20℃保存。
洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要质粒 浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小不应 少于50μl,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒 产量。
(四) 实验操作步骤
1.
2.
3.
收集1.5-3mL 菌液的沉淀于1.5 mL Eppenforf离心管中,加入100μl溶液1,振 荡至彻底悬浮。 加入150 μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管 数次,使菌体充分裂解,裂解后的菌体 变得清亮。随后将离心管放置于冰上1-2 分钟(时间勿超!)。 加入150 μl溶液3,立即温和颠倒离心管 数次,室温放置5分钟。12,000rpm 离心 12 分钟。
4. 加400μl溶液P3,立即温和的上下翻转
6-10次,室温放置5分钟。室温13, 000rpm离心10分钟,小心取上清。 5 . (将吸附柱安置于收集管上,加入500μl 溶液P4 ,室温13,000rpm离心1分钟, 弃滤液;) 将上一步所得上清液加入吸附柱AC中 (吸附柱放入收集管中), 13,000rpm离心1分钟,弃滤液。

载体结构的三大要素: • 多克隆位点 • 选择标记(耐药性, LacZ) • 独立的复制单位 载体种类: • 质粒 • 噬菌体 • 酵母人工染色体 (YAC) • 反转录病毒载体 • 表达载体等
pBC SK map
三、实验仪器、材料与试剂
(一) 仪器
1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 恒温摇床 超净工作台 高压灭菌锅 高速台式离心机 微量取液器、 1.5mLEP管 LB液体和固体培养基 卷纸、无水乙醇、双蒸水
如有必要,可把裂解液置于室温静置2min。避免剧烈混 和裂解液,否则会使染色体DNA断裂而使得到的质粒纯 度降低。 当使用完ZL-II以后,须盖紧其瓶盖保存好。
4. 往上述混和液中加入350μl ZL-III,并温和地上下 颠倒离心管数次,直至形成白色絮狀沉淀。于室 温下10,000×g离心10min。 5. 仔细 取一干净的Mu-Pu质粒微量分离柱裝在一个 2ml收集试管上(已备)。小心吸出上清,并将其转 置于柱子內,确保转至柱內的上清中没有细胞杂 质沉淀。于室温下10,000×g离心1min,使裂解液 完全流过柱子。 6. 弃去离心甩出液,加入500μl的ZL缓冲液到柱子 上,室温下10,000×g 离心1min,确保除去残余 的蛋白质以得到后面操作所需的高质量DNA。

• • • •
实验目的 实验原理 实验仪器、材料与试剂 实验步骤 实验结果及讨论
一、实验目的
了解高纯质粒小量制备试剂盒和
碱法提取质粒的原理
掌握百泰克高纯质粒小量制备试
剂盒方法提取质粒的方法
二、实验原理
(百泰克高纯质粒小量制备试剂盒方法)
本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。
一、原理简介 本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞, 离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低PH值 状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA, 再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细 菌成分去除,最后低盐、高PH值的洗脱缓 冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。
11. 去掉上清(注意沉淀勿丢失),室温或
真空干燥沉淀。 12. 每管中加入25μL无菌水1μL RNase, 37℃溶解质粒DNA。
(三)实验结果及讨论
碱法提取质粒是实验室最常用的质粒 提取方法之一,提取量较大,便于操 作。 如有蛋白质残留,干燥后不透明,而 呈白色。
附II: B型质粒小样快速提取试剂盒
B.操作方案
1. 取1.5~5ml的菌液,于室温下10,000×g离心1min 以沉淀菌种。 2. 倒出或吸出培养基,弃去。往沉淀中加入250μl 的ZL-I/RNaseA混和液,漩涡振荡使细胞完全 重新悬浮。
细胞沉淀的完全重悬对于获得高的产量是十分重要的。
3.往重悬混和液中加入250μl ZL-II,轻轻翻转试管 4~6次混和溶液,以获得一澄清的裂解液。
附III:H.Q.&.Q. 高纯度质粒微量试剂盒
(HP Plasmid Miniprep Kit) A.样本制备
将带有目的质粒的E. coli 接种于裝有5ml LB/氨苄 青霉素(50μg/ml)培养基的10~20ml培养管中,37℃ 搖床培养12~16 hr,以扩增质粒。 建议使用endA 敏感型的E. coli 菌株来作常规质粒 的分离,例如DH5α® 和JM109®等菌株。
3. Solution Ⅲ(100 ml): 5mol/L KAc 60 ml 冰醋酸 11.5 ml 水 28.5 ml 配制成的溶液Ⅲ含3 mol/L钾盐、5 mol/L醋 酸 (pH 4.8)。 4. 胰RNA酶:将胰RNA酶(RNA 酶 A)溶 于10 mmol/L Tris.Cl (pH 7.5)、15 mmol/L NaCl中, 配成10 mg/ml的浓度,于100℃ 加热15分钟,缓慢冷却至室温,分装成小 份保存于-20℃。 5. 氯仿,乙醇 ,70%乙醇。

2. 用250 μl溶液P1重悬菌体沉淀,涡旋振 荡至彻底悬浮。
如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解, 导致提取量和 纯度偏低。
3. 加250 μl的溶液P2,温和的上下翻转6-10 次使菌体充分裂解,直到溶液变得清亮。
温和的混匀,不要剧烈震荡,以免基因组 DNA剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免 质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如 果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步。
(二) 材料和试剂
1. 含pUM-T (pMD18-T或 KS,pRT101)
质粒的大肠杆菌 DH10B(DH 5α或 HB101)。 2. 含外源基因的重组pUM-T (pMD18-T 或 KS,pRT101)质粒的大肠杆菌 DH10B(DH 5α或HB101) 。 3. 氨苄青霉素(Amp):用无菌水配制 成50-100 mg/ml 溶液,置-20℃冰箱保 存备用。
(二)实验步骤
1. 用灭菌的牙签挑取单菌落放入50ml LB液 2. 3.
4.
5.
体培养基(含Amp 0.1 mg/ml )中,37℃ 振荡培养过夜。 将菌液倒入1.5 ml Eppendorf管中,10,000 rpm离心1min,去掉上清液,重复两次。 沉淀悬于200μL SolutionI 中, 涡旋使充分 悬浮。 加入300μL SolutionII,混匀(注意动作 轻),冰箱3 ℃放置5 min。 加入300μL SolutionIII,混匀(注意动作 轻) ,冰箱3 ℃放置5 min。
1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. STE缓冲液 (溶液1) Lysis Buffer (溶液2) 3 M NaAc, PH 4.8 (溶液3) 结合缓冲液 浓缩漂洗液 洗脱缓冲液 离心吸附柱 废液收集管 RNaseA (10mg/ml)
(三) 实验准备
1.
2.
3.
试剂盒使用前,在5 mL溶液1中加入 300μl RNaseA(RNaseA终浓度为 0.6mg/mL)。溶液1使用完毕后,立即 于4 ℃保存。 浓缩漂洗液使用前按1:3的比例加入 无水乙醇,例如15 mL浓缩漂洗液中加 入45 mL无水乙醇,混匀后方可使用。 实验前检查溶液2及结合缓冲液是否有 高盐结晶。如有结晶,将盖拧松后加 热10-15秒,高盐结晶溶解后再使用。
4. 将420μl结合缓冲液加入离心吸附柱中,
然后将步骤3中的上清加入离心吸附柱中 (尽量去除杂质),混匀,12,000rpm 离心30秒钟。倒掉废液收集管中的废液。 5. 加入750 μl漂洗液于离心吸附柱中,静置1 分钟,12,000rpm 离心15秒。倒掉废液 收集管中的废液。重复一次。倒掉废液后, 再次于12,000rpm 离心2 分钟,尽量除去 漂洗缓冲液。 6. 下心取出离心吸附柱,将其套入一个干净 的1.5 mL Eppendorf离心管中,加入洗脱 缓冲液,常规50μl,室温放置2-5分钟,12, 000rpm 离心1 分钟。
实验原理(碱法)
质粒是一种细菌染色体外的、具有自主 复制能力的、共价闭合环状超螺旋结构 的小型DNA分子。 碱裂解法提取质粒是实验室常用的方法。 这种方法是根据共价闭合环状质粒DNA 与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来 分离它们。

在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体 DNA的双螺旋结构解开而变性,质粒DNA 的氢键虽然断裂但两条互补链彼此缠绕, 紧密结合在一起。 当加入乙酸钾恢复至中性时,染色体DNA 分子难以复性,而质粒DNA分子很快复性, 离心时染色体DNA与细胞碎片一起被沉淀 出来,而质粒DNA则留在上清液中。 用异丙醇或乙醇沉淀后洗涤,可得到较纯 的质粒DNA。
四、实验步骤
百泰克高纯质粒小量制备试剂盒
第一次使用前请先在15ml(25ml)漂洗液WB 中加入45ml (75ml)无水乙醇! 将RNase A全部加入溶液P1中,混匀,每次 使用后置于2-8℃保存。 1. 取1.5-4.5毫升过夜培养的菌液,9000rpm, 离心30秒,弃上清,收集菌体, 尽可能的 倒干上清。 处理超过1.5毫升菌液可以离心去上清后, 在同一个1.5ml管内加入更多的菌液,重复 步骤1,直到收集到足够的菌体。
6. 12,000rpm,离心5min,将上清移至1个新
7.
8.
9. 10.
Eppendorf 管中,注意所取体积(约600 μL ) 。 加入等体积氯仿(约600 μL ),混匀(注 意动作轻)。12,000rpm,4℃,离心 10min,取上清液。 上清液中加入预冷的等体积异丙醇,-20℃ 沉淀 20~30 min。 12,000 rpm离心15 min。 去上清,沉淀加入500μL 70%乙醇洗涤2次 ( 12,000 rpm离心3分钟)。
6. 加入500 μl去蛋白液PE,13,000rpm离 心30-60秒,弃滤液。
此步骤为了去除痕量核酸酶等杂质,如所用 菌株为JM系列、HB101等,因为核酸酶含量 丰富,应加此步骤;如所用菌株为XL-1 Blue 和DH5α等,核酸酶含量低,则可忽略此步骤。
7. 加入500 μl漂洗液WB(请先检查是否已 加入无水乙醇!),13,000rpm离心3060秒,弃滤液。 8. 重复步骤7一次,13,000rpm离心30-60秒, 弃滤液。 9. 空柱13,000rpm离心2 分钟。室温放置35分钟,除去残留乙醇。
一原理简介本试剂盒采用改进sds碱裂解法裂解细胞离心吸附柱内的硅基质膜在高盐低ph值状态下选择性地结合溶液中的质粒dna再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除最后低盐高ph值的洗脱缓冲液将纯净质粒dna从硅基质膜上洗脱
实验一 质粒的提取和琼脂糖 凝胶电泳检测
(高纯质粒小量制备试剂盒方法,百泰克)
北京博大泰克(BioDev)生物基因技术有限责任公司
(一) 概述
采用碱裂解--中和法,应用常规台式高速 离心机,经反应条件最优化后,使含有质粒 DNA的上清通过设计独特的离心吸附柱式结 构时,被特殊硅基质材料高效、专一地吸附。 被吸附的质粒DNA随后可用洗脱缓冲液从离 心吸附柱上洗脱下来。
(二) 试剂盒组成及包装
pMD18-T Vector
4. LB液体培养基(1L):
胰蛋白胨 10g , 酵母提取物 5 g , Байду номын сангаасaCl 10 g 。 加去离子水至800ml 搅拌,使溶质完全溶 解,用NaOH调节pH值至7.0,加入去离子 水至总体积为1升,高压蒸汽灭菌20 分钟。 5. LB固体培养基(1L): 在上述LB液体培养基(1L)中加入琼脂粉 (Agar)15g。
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