Cytoscape软件画图说明

C y t o s c a p e软件画图说明 Prepared on 24 November 2020
Cytoscape 软件画图说明
1、画图前，先准备两个输入文件。

2、打开cytoscape 软件，导入数据。

导入文件
点击File ----Import ----Network
点击ok 得到原始图形
点击layout ----Apply Preferred Out 改变图形排列方式
此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。

改变画布背景。

点击左侧Contro Panel ----Style---network ---Backgroud paint
设置节点之间连线的宽度和颜色 Contro Panel ----Style---Edge
节点1，文件中
第一列 节点2，文件中第2列
连接类型，文
件中第3列
导入个文件
点击File ----Import ----Table
设置节点图形属性
Contro Panel ----Style---Node
1、node大小
通过设置Height和Width来控制大小2、Node性状
通过设置Shape来控制
3、Node填充色
通过设置Fill Color来控制
4、Node标签的设置
点击Properties -- Label Position 宽度颜色
点击Label Position来设置标签位置。

这里是一个示范操作，要细致调整标签位置还是要设置Column和Mapping Type两个参数。

设置完成之后图形
调节节点之间的距离
点击layout ----Scale
点击File ----Export----Network View as Graphics。