分子生物学PPT思考题

第二章染色体和DNA

思考题：

（1）Replicons（复制子）, Origins （复制原点）and termini？

Replicons（复制子）：生物体的复制单位称为复制子。

Origins （复制原点）：是DNA链上独特的具有起始DNA复制功能的碱基顺序。

Termini（终止点）：复制子中控制复制终止的位点

（2）如何证明DNA为半保留复制？（P43）

1、大肠杆菌在含15N(NH4CL形态)的培养基中繁殖多代，使嘧啶和嘌呤碱基中的14N全被置换成15N。

2、收集大肠杆菌，分离其中的DNA，然后用CsCl平衡密度梯度离心，这时DNA形成一单独的，浮力密度为1.724g/ml的条带。和对照(浮力密度为1.710g/ml)相比，DNA浮力密度(buoyant density)的这种增加是由于15N置换了14N。

3、在15N氮源中培养的大肠杆菌转移到含14N的培养基中传代，每隔一定时间取样，分离其DNA并进行密度梯度离心。这时，由浮力密度不同所产生的DNA条带显示了规律性变化(图5-2)。

4、这种规律性变化只能由DNA的半保留复制得到解释。

（3）如何证明DNA的半不连续复制？

1、用[3H]胸腺嘧啶脱氧核苷脉冲标记大肠杆菌培养物，这时优先标记的是新合成的DNA。

2、沉降分析证明新合成的大多是一些约含1000核苷酸的短片段。

3、如以培养物再在非放射性培养基中保温，标记就进入高分手量DNA中。

（4）DNA复制过程中的酶或蛋白质有哪些，DNA复制的过程？

DNA解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶、引物合成酶、DNA拓扑异构酶、SSB蛋白和滑动DNA夹蛋白。

DNA的复制过程：DNA复制过程大致可以分为复制的引发，DNA链的延伸和DNA复制的终止三个阶段。

（5）leading and lagging strand ？

Leading strand（前导链）：随着亲代双链DNA的解开而连续进行复制。

lagging strand（后随链）：一段亲本DNA单链首先暴露出来，然后以与复制叉移动相反的方向按照5’→3’方向合成一系列的冈崎片段，然后再把它们连接成完整的后随链。

（6）大肠杆菌具有DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ，它们的活性、功能及特点？

（7）画出DNA聚合酶Ⅰ的结构及功能？

（1）DNA聚合酶Ⅰ的结构域：

DNA聚合Ⅰ酶的作用：

①聚合酶活力。

②3’-5’核酸外切酶活力具有修复错配核苷酸的作用，保证DNA复制的准确性。

③5’-3’核酸外切酶活力使具切口的双链DNA的5’端DNA降解，在体内可切除嘧啶二聚体。在体外可用于标记探针。

（8）切口平移标记探针的原理？

1、在DNA酶1的作用下，双链DNA产生缺口。

2、在DNA聚合聚合酶的作用下，以缺口的3’端OH为引物合成DNA。

3、将同位素标记的核苷酸掺入到DNA中，使DNA成为探针。

（9）DNA聚合酶Ⅲ结构的特点，其中α、β和ε的作用？

1、DNA聚合酶Ⅲ结构的特点：包含7种不同的亚单位和9个亚基，生物活性形式为二聚体。他即使5’ →3’方向聚合酶活性，也有3’ →5’核酸外切酶活性。该酶的活性较强，为DNA聚合酶Ⅰ的15倍，DNA聚合酶Ⅱ的300倍。它能在引物的3’-OH以上每分钟约5万个核苷酸的速率延长新生的DNA链，是大肠杆菌DNA复制中链延长反应的主导聚合酶。

2、α作用:由ε水解双链ＤＮＡ需要α；

β作用:β亚基具有滑动夹子的功能；

ε作用:ε亚基具有外切核酸酶活性。

（10）大肠杆菌染色体的结构及组成？

大肠杆菌的染色体结构：它的染色体是由50-100个独立的负超螺旋组成的环状结构RNA蛋白质结合在上面，以保持其结构的稳定性。

组成：大肠杆菌的染色体DNA除与蛋白质结合外，还结合有RNA。

（11）真核生物染色质的结构？

真核生物染色质的结构：呈纤细的丝状结构，由核小体和连接丝组成。核小体: 由H2A、H2B、H3和H4 4种组蛋白构成。连接丝: DNA双链+ H1组蛋白。

（12）组蛋白的种类？

根据其凝胶电泳性质可以把组蛋白分为H1、H2A、H2B、H3、H4

（13）Genome、C-value、C-value paradox ？

Genome（基因组）：一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或者整套基因。

C-value（C值）：一种生物单倍体基因组DNA的总量。

C-value paradox （C只反常现象）：C只往往与种系进化的复杂程度不一致，某些低等生物却具有较大的C值。

（14）根据基因的拷贝数的多少可将DNA序列分为哪两种？

中度重复序列和高度重复序列

（15）Satellite DNA

Satellite DNA（卫星DNA）：真核细胞DNA的一部分是不被转录的异染色质成分，是高度串联重复的DNA。

（16）autonomously replicating sequences (ARSs)

autonomously replicating sequences，ARS（自主复制序列）：酵母的复制起始点

（17）转座子类型结构？

类型：插入序列和复合型转座子

所有转座子都有两个结构特征：

（1）两端有20~40bp的反向重复序列

（2）具有编码转座酶的基因

第三章生物信息的传递(上)

思考题

（1）Coding strand, template strand, Sense strand, Antisense strand

Coding strand（编码链）：指DNA双链中与mRNA序列（除T/U替换外）和方向相同的那条DNA链，又称为有义链（Sense strand）。

template strand（模板链）：指DNA双链中能作为转录模板通过碱基互补原则指导mRNA 前体合成的DNA链，又称反义链（Antisense strand）。

（2）Transcription unit, Promoter, RNA Terminator

Transcription unit（转录单位）：是一段可被RNA聚合酶转录成一条连续mRNA链的DNA。

RNA Terminator（RNA终止子）：用来终止mRNA合成的序列

（3）大肠杆菌RNA聚合酶的组成及功能？