实验九质粒DNA的制备和酶切
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碱基组成及结构等特点加以选择的，其中碱变性法 既经济且收得率较高,提取的质粒DNA可用于酶切, 连接与转化。
碱变性法基本原理
在pH 12.0-12.6碱性环境中，线性的大分子量细菌 染色体DNA变性，而共价闭环质粒DNA仍为自然状 态。
将PH调至中性并有高盐浓度存在的条件下，染色体 DNA之间交联形成不溶性网状结构，大部分DNA和 蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀，而质粒 DNA仍为可溶状态，通过离心可除去大部分细胞碎 片、染色体DNA、RNA及蛋白质，质粒DNA尚在上 清中，再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。
４．加入200μl溶液Ⅱ，盖严管盖轻柔颠倒５次以混匀内容 物，冰上放置5分钟。
５．加入150μl溶液Ⅲ，温和振荡数次，冰上放置５分钟。 ６．12000g 4 ℃离心５分钟，取上清移到１个新的
Eppendorf管中。
５．加入150μl溶液Ⅲ，温和振荡数次，冰上放置５Байду номын сангаас 钟。
６．12000g 4 ℃离心５分钟，取上清移到１个新的 Eppendorf管中。
１１．弃上清，抽干乙醇，室温干燥（5-15分钟）。
１２．加入50μl TE（含20μg/ml RNA 酶，不含DNA酶）溶 解DNA,然后交给助教加RNA 酶，之后37℃10分钟。
１２．加入50μl TE（含20μg/ml RNA 酶，不含DNA酶）溶解DNA,
然后交给助教加RNA 酶，之后 13．取2μl DNA溶37解℃液用1Ｔ0Ｅ分稀钟释至。200ul测定OD260
能蛋白，完全依赖于宿主提供的半衰期较长 的酶。即使蛋白质合成受抑制，质粒的复制 依然进行。当抑制蛋白质合成并阻断细菌染 色体复制的氯霉素等抗生素存在时，质粒的 拷贝数可达2000-3000拷贝。
2.严紧型质粒
严紧型质粒复制需要一个质粒编码的蛋白， 质粒的拷贝数不能通过用氯霉素等蛋白合成 抑制剂来增加。
三．实验方法
１．挑取琼脂培养板上的单菌落至5ml LB培养液中（含AmP 50μg/ml）， ３７℃强烈摇荡过夜。
２．取1.5ml培养液至Eppendorf管中，12000g离心30秒， 弃上清，用１ml STE悬浮菌体，再离心回收菌体，并重复一 次，弃上清，取沉淀。
３．将细菌沉淀悬浮于100μl预冷溶液Ⅰ中，振荡混匀，冰 上放置5分钟。
(７．加入等体积酚/氯仿（１：１），振荡混匀，12000g 4 ℃离心２分钟。取上清移至另１个Eppendorf管中。)
８．加入２倍体积无水乙醇，振荡混匀，于室温静置2分钟。
９． １２０００g ,4 ℃离心５分钟。
１０．弃上清，加入１ml 70%乙醇漂洗沉淀，盖严管盖颠 倒数次，１２000g 于4 ℃离心２分钟。
实验试剂
ＬＢ培养基：
胰化蛋白胨 10g
酵母提取物 5g 定容
1000ml pH
7.5
NaCl
10g
ＳＴＥ：
0.1M
NaCl
10mM
Tris HCl(pH8.0)
1mM
EDTA
ＡｍＰ 50mg/ml
溶菌酶 10mg/ml (用10mM Tris·HCl pH8.0新鲜配制）
试剂
溶液Ⅰ： 50mM 葡萄糖 25mM Tris·HCl（pH8.0） 10mM EDTA
质粒特点
质粒能在细菌中垂直遗传并且赋予宿主细胞 一些表型，是比病毒更简单的原始生命。
质粒通过细菌的结合作用，从雄性体转移到 雌性体， 是细菌有性繁殖的性因子.
１９５２年由Lederburg正式命名为质粒。
质粒类型
质粒按复制方式分为两种类型： 松弛型质粒 和 严紧型质粒
1.松弛型质粒 松弛型质粒的复制不需要质粒编码的功
质粒的应用
大多数基因工程使用松弛型质粒。 严紧型质粒用来表达一些可使宿主细胞受毒
害致死的基因。
质粒的特点使质粒成为携带外源基因进入细 菌中扩增或表达的重要媒介物，这种基因运 载工具在基因工程中具有极广泛的应用价值。
本实验目的
本实验要求掌握最常用的质粒的提取方法。
分离质粒DNA方法
从大肠杆菌中分离质粒DNA方法众多，目前常用的 碱变性法； 煮沸法； SDS法； 羟基磷灰石层析法等 各方法分离是依据宿主菌株类型、质粒分子大小、
溶液Ⅱ：（新鲜配制） 0.2N NaOH 1% SDS
溶液Ⅲ： 5M KAC 10ml 冰醋酸 11.5ml 水 28.5ml
酚，氯仿，乙醇 RNase 琼脂糖 ＴＥ： 10mM Tris-HCl(pH8.0) 1mM EDTA
Enzymes which cut pBluescript II KS(+) DNA once: Acc65I 755, AdeI 222, AflIII 1153, AloI 169, ApaI 749, BamHI 689, BcgI 2562, BcuI 683, BsaAI 225, Bsp120I 749, BstXI 658, Bsu15I 725, BtgI 661, CaiI 1564, Cfr9I 695, Cfr42I 661, Eam1105I 2041, Ecl136II 653, Eco31I 2113, Eco32I 713, Eco52I 670, EcoO109I 748, EcoRI 707, FaqI 457, GsuI 2131, Hin1I 2582, HincII 734, HindIII 719, KpnI 755, NotI 669, OliI 659, PdiI 328, PdmI 2641, PscI 1153, PsiI 97, PstI 701, SacI 653, SalI 734, SapI 1030, ScaI 2524, SmaI 695, TatI 2524, XbaI 677, XceI 1153, XhoI 740, XmiI 734.
实验十五 碱变性法小量制备质粒 DNA和DNA酶切
1、质粒DNA的提取
一．实验目的及背景
质粒是染色体外的DNA分子，大小可为 1kb到200kb。
大多数来自细菌的质粒是双链、共价闭合 环状的分子，以超螺旋形式存在。它是细 菌内的共生型遗传因子。
其复制和遗传独立于细菌染色体，但复制 和转录依赖于宿主编码的蛋白和酶。
碱变性法基本原理
在pH 12.0-12.6碱性环境中，线性的大分子量细菌 染色体DNA变性，而共价闭环质粒DNA仍为自然状 态。
将PH调至中性并有高盐浓度存在的条件下，染色体 DNA之间交联形成不溶性网状结构，大部分DNA和 蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀，而质粒 DNA仍为可溶状态，通过离心可除去大部分细胞碎 片、染色体DNA、RNA及蛋白质，质粒DNA尚在上 清中，再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。
４．加入200μl溶液Ⅱ，盖严管盖轻柔颠倒５次以混匀内容 物，冰上放置5分钟。
５．加入150μl溶液Ⅲ，温和振荡数次，冰上放置５分钟。 ６．12000g 4 ℃离心５分钟，取上清移到１个新的
Eppendorf管中。
５．加入150μl溶液Ⅲ，温和振荡数次，冰上放置５Байду номын сангаас 钟。
６．12000g 4 ℃离心５分钟，取上清移到１个新的 Eppendorf管中。
１１．弃上清，抽干乙醇，室温干燥（5-15分钟）。
１２．加入50μl TE（含20μg/ml RNA 酶，不含DNA酶）溶 解DNA,然后交给助教加RNA 酶，之后37℃10分钟。
１２．加入50μl TE（含20μg/ml RNA 酶，不含DNA酶）溶解DNA,
然后交给助教加RNA 酶，之后 13．取2μl DNA溶37解℃液用1Ｔ0Ｅ分稀钟释至。200ul测定OD260
能蛋白，完全依赖于宿主提供的半衰期较长 的酶。即使蛋白质合成受抑制，质粒的复制 依然进行。当抑制蛋白质合成并阻断细菌染 色体复制的氯霉素等抗生素存在时，质粒的 拷贝数可达2000-3000拷贝。
2.严紧型质粒
严紧型质粒复制需要一个质粒编码的蛋白， 质粒的拷贝数不能通过用氯霉素等蛋白合成 抑制剂来增加。
三．实验方法
１．挑取琼脂培养板上的单菌落至5ml LB培养液中（含AmP 50μg/ml）， ３７℃强烈摇荡过夜。
２．取1.5ml培养液至Eppendorf管中，12000g离心30秒， 弃上清，用１ml STE悬浮菌体，再离心回收菌体，并重复一 次，弃上清，取沉淀。
３．将细菌沉淀悬浮于100μl预冷溶液Ⅰ中，振荡混匀，冰 上放置5分钟。
(７．加入等体积酚/氯仿（１：１），振荡混匀，12000g 4 ℃离心２分钟。取上清移至另１个Eppendorf管中。)
８．加入２倍体积无水乙醇，振荡混匀，于室温静置2分钟。
９． １２０００g ,4 ℃离心５分钟。
１０．弃上清，加入１ml 70%乙醇漂洗沉淀，盖严管盖颠 倒数次，１２000g 于4 ℃离心２分钟。
实验试剂
ＬＢ培养基：
胰化蛋白胨 10g
酵母提取物 5g 定容
1000ml pH
7.5
NaCl
10g
ＳＴＥ：
0.1M
NaCl
10mM
Tris HCl(pH8.0)
1mM
EDTA
ＡｍＰ 50mg/ml
溶菌酶 10mg/ml (用10mM Tris·HCl pH8.0新鲜配制）
试剂
溶液Ⅰ： 50mM 葡萄糖 25mM Tris·HCl（pH8.0） 10mM EDTA
质粒特点
质粒能在细菌中垂直遗传并且赋予宿主细胞 一些表型，是比病毒更简单的原始生命。
质粒通过细菌的结合作用，从雄性体转移到 雌性体， 是细菌有性繁殖的性因子.
１９５２年由Lederburg正式命名为质粒。
质粒类型
质粒按复制方式分为两种类型： 松弛型质粒 和 严紧型质粒
1.松弛型质粒 松弛型质粒的复制不需要质粒编码的功
质粒的应用
大多数基因工程使用松弛型质粒。 严紧型质粒用来表达一些可使宿主细胞受毒
害致死的基因。
质粒的特点使质粒成为携带外源基因进入细 菌中扩增或表达的重要媒介物，这种基因运 载工具在基因工程中具有极广泛的应用价值。
本实验目的
本实验要求掌握最常用的质粒的提取方法。
分离质粒DNA方法
从大肠杆菌中分离质粒DNA方法众多，目前常用的 碱变性法； 煮沸法； SDS法； 羟基磷灰石层析法等 各方法分离是依据宿主菌株类型、质粒分子大小、
溶液Ⅱ：（新鲜配制） 0.2N NaOH 1% SDS
溶液Ⅲ： 5M KAC 10ml 冰醋酸 11.5ml 水 28.5ml
酚，氯仿，乙醇 RNase 琼脂糖 ＴＥ： 10mM Tris-HCl(pH8.0) 1mM EDTA
Enzymes which cut pBluescript II KS(+) DNA once: Acc65I 755, AdeI 222, AflIII 1153, AloI 169, ApaI 749, BamHI 689, BcgI 2562, BcuI 683, BsaAI 225, Bsp120I 749, BstXI 658, Bsu15I 725, BtgI 661, CaiI 1564, Cfr9I 695, Cfr42I 661, Eam1105I 2041, Ecl136II 653, Eco31I 2113, Eco32I 713, Eco52I 670, EcoO109I 748, EcoRI 707, FaqI 457, GsuI 2131, Hin1I 2582, HincII 734, HindIII 719, KpnI 755, NotI 669, OliI 659, PdiI 328, PdmI 2641, PscI 1153, PsiI 97, PstI 701, SacI 653, SalI 734, SapI 1030, ScaI 2524, SmaI 695, TatI 2524, XbaI 677, XceI 1153, XhoI 740, XmiI 734.
实验十五 碱变性法小量制备质粒 DNA和DNA酶切
1、质粒DNA的提取
一．实验目的及背景
质粒是染色体外的DNA分子，大小可为 1kb到200kb。
大多数来自细菌的质粒是双链、共价闭合 环状的分子，以超螺旋形式存在。它是细 菌内的共生型遗传因子。
其复制和遗传独立于细菌染色体，但复制 和转录依赖于宿主编码的蛋白和酶。