浪潮培训教材

四：计算任务投放
❖ PBS基本组件
pbs command:用于提交、监视、修改和删除 作业。
pbs server: 提供基本的批处理服务，例如接 收/创建一个批处理作业，管理维护作业队列， 管理输出结果等。
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二：登录、退出系统连接
1. 登录方式
SSH： 缺省提供，该登录方式有一定强度的加密安全保证 软件可以使用Putty等
2. 文件上传与下载
SFTP： 缺省提供，暂不提供FTP方式 软件可以使用SecureFX、WinSCP等
3. 登录系统后的必要操作
使用mail命令，检查系统发送给用户的通知和信息 在属主目录下使用命令 du -kh | sort -n ，查看异常或较大的文件，并做相 应的清理
5. 不能在属主目录（登陆目录）下存放任务临时文件，必须在工作目（lustre） 录中存放临时文件。
6. 不能在登陆节点上直接运行任务，只能在登陆节点做简单的 vi编辑、查看、 管理自己的数据以及程序。
7. 刀片节点单个任务不能超过24GB内存。大内存任务投放至fuque上。
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软件信息 RedHat AS 5 update3 （内核2.6.18-128） Intel C++/Fortran 编译器/ Intel MKL数学核心库 Gaussian vasp Wien2k intel mpi 3.1 TSJM/PBS 浪潮天梭监管软件2.1
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图例：
集群物理拓扑图
保存退出后 source ~/.bashrc
❖ 使用命令 du -kh | sort -n ，查看异常或较大的文件
Inspur group 2020/6/17
三：属主目录使用
1. 属主目录为登录后缺省进入的目录： /home/<研究室>/<yourid>
2. 属主目录用于系统存放管理用户的登陆和所使用软件配置文件，严禁用户随 意存放执行程序的临时文件和非相关的文件，避免占用和耗费宝贵的系统存储 资源，影响登陆连接服务。每次登陆后在属主目录下使用命令 du -kh | sort –n 主动检查。异常或较大的文件并作相应清理。 3. 属主目录可以安装个人所需软件，如果软件所占空间较大，请联系管理员， 修改属主目录文件配额。
二：登录、退出系统连接
❖ 登陆天梭集群系统
ssh -l (your count) 202.127.207.132
❖ 第一次登陆设置环境变量
vi ~/.bashrc
source /opt/intel/impi/3.1/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/cce/10.1.021/bin/iccvars.sh source /opt/intel/fce/10.1.021/bin/ifortvars.sh source /opt/intel/mkl/10.2.2.025/tools/environment/mklvarsem64t.sh
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四：计算任务投放
1.不论任务有多紧急，请务必先检测提交程序的正确性以及资源占用的合理适 度，通过小批量测试数据预估占用CPU、内存和存储资源，强烈建议进行代码 优化以减少CPU、内存、I/O资源占用，及时释放申请的内存，优化文件目录 读写访问等I/O功能，避免资源和计算时间的浪费。
集群的软硬件配置
管理节点 登录节点 I/O节点 网格节点 计算节点 胖节点
存储 管理网络 计算网络
操作系统 编译器/数学库
应用软件 MPI实现 作业调度 集群管理
硬件信息 NF5220*1 2*146G SAS raid1 NF5220*1 2*146G SAS raid1 NF5220*1 2*146G SAS raid1 NF5220*2 5*300G SAS raid5 NX7140N*112 64G SSD NF560D2*2 1*146G SAS AS400 8*1T raid5 （1 热备盘） H3C千兆以太网 Qlogic 9120
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二：登录、退出系统连接
4. 长时间误操作，请结束访问，避免占用系统百度文库源 5. 结束系统访问必要操作
非停电、断网等意外设备故障导致，严禁在终端上直接关闭访问窗口或直 接关闭终端电源实现结束系统访问。
SSH访问必需主动使用exit命令一到多次确保最终结束连接。
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2. 大规模资源占用(占用实际内存超过1/4)或紧急任务时务必先联系管理员协调。 3. 计算任务提交后，应注意定时查看自己任务状态，当需要杀死自己进程或删 除任务时，以用qdel命令, 如果无法删除必要时联系主机组协助。 4. 应及时清除临时文件和计算中程序设计生成的监控跟踪记录文件。临时性文 件存放不要超过三个月。重要数据应打包或再压缩存放。
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内容提要
账号的申请和使用 登录、退出系统连接 属主目录使用 计算任务投放 存储空间使用 软件安装及使用规范 关机和启动 维护人员联系方式
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一：账号的申请和使用
1. 严禁使用集群账号及计算、存储资源进行与账号所属项目无关的任何活动和行 为，违者必究并将视影响、损失轻重予以锁闭账号等处理。 2. 主机资源申请，联系系统管理员进行申请。管理员联系方式见本指南维护人员 联系方式。 3. 建议避免公用账号，避免项目移交的时候数据混乱。 4. 人员发生调动时，请调动人员做好数据移交，并及时通知管理员申请权限改动。 5. 临时用户项目结束或阶段性完成时，请及时通知管理员清理/锁闭/注销临时账 号及项目组成员账号。 6. 注销账号时请整理好用此账号建立的所有数据，做好移交及备份清理工作，并 至少提前一天通知管理员。 7. 数据和程序（非公用程序）文件一律存放于自己的属主目录下，计算临时文件 存放于工作目录下（lustre），计算临时文件不得存放于自己的属主目录下。 8. 个人账号只限个人使用，严禁将帐号和密码泄露给外单位和项目组外人员，公 共组账号由管理员负责控制和使用分发。 9. 密码应定期（三个月）更换，建议8位以上并注意加强密码复杂度。