基因检测报告深度综合解读 肿瘤临床NGS检测报告解读与精准诊疗

分子生物学改变：基因组学、表 观组学、转录组学、蛋白质组学、
代谢组学、免疫组学、内分泌 组…
图片来自网络 Department of Pathology
传统肿瘤诊断模式存在明显局限性
肿瘤 患者
临床
影像
诊断
学
传统肿
其他 瘤诊疗 实验
检查
病理
室检 验
（金
标准）
局限性
诊断延 迟性
预测性 较差
局限 性
ຫໍສະໝຸດ Baidu
主观性 较强
➢ 至少年20万人死于用药不当。
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肿瘤进化、高度复杂
大众健康需求呼唤精准医学
控制癌症 降低成本
治疗困境、成本高昂 专业精准、患者期待
促进健康
动态性 不足
标准化 欠缺
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化疗的作用与副作用
化疗作用
化疗副作用
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美国的不精准用药情况
➢ 许多药物只对少数病人（蓝 色）起作用
➢ 但许多患者（红色）同样在 服用
中国不当用药形势严峻
➢ 至少每年超过250万人因用药 不当住院。
• 肿瘤基因组演化、变异过程受到体内外环境因素的影响。
N Engl J Med. 2012;366(23):2207-14; Science. 2013 ;339(6127):1546-58; PNAS. 2008 ;105(11):4283-8; Cell. 2011;144(5):646-74
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我国恶性肿瘤早诊率低，复发率高
• 目前我国肿瘤诊断与美国等发达国家相比存在差距：早诊率低、针对 性不足。大多数肿瘤在诊断时已经是晚期，五年生存率不足30%。
• 晚期肿瘤最大的危害是转移与耐药。
1.CA Cancer J Clin. 2017 Jan;67(1):7-30；2. CA Cancer J Clin. 2016 Mar;66(2):115-32.
人类基因 组计划
人类基因组 计划完成
基因组医学 概念提出
全民健康计划
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肿瘤是“基因组”疾病
人类基 因组计 划完成
1953年 DNA双螺 旋结构发
表
逆转录 酶发现
癌基因
抑癌基 因发现
单克隆 抗体发
明
限制性 内切酶
PCR技术 发明
20世纪生命科学 与医学新成就
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病例一: NGS检测报告与用药推荐02
TMB：8.7；MSS， 癌细胞PD-L阴性
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病例一: NGS检测报告与用药推荐02
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病例一: 肺腺癌诊疗经过
诊疗经过
• 2018年5月起到国内12家三甲医院就医或咨询。同时联系 了3家日本质子重离子治疗机构。也联系了Mayo、MSKCC、 MD Anderson医生，准备前往就医，但因肺部炎症未成行。 亦在社交媒体平台全球咨询。
肿瘤临床NGS检测报告解读与精准诊疗
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声明
• 本报告内容仅代表个人学术观点，供学术 交流使用。不存在任何利益冲突，案例分 析仅供学术讨论参考，不涉及用药处方。
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提纲
• 肿瘤NGS检测报告临床解读的必要性！ • 如何进行NGS检测报告的临床解读？ • 展望
分子水平 认识疾病
肿瘤是“基因组” 12条常见肿瘤相关
肿瘤十大特征
疾病
信号通路异常激活
• 肿瘤是“基因组”疾病
• 肿瘤是基因组突变长期积累的结果:需要20-30年 • 大多数突变不影响细胞的生物学行为（Passengers),少数突变使细胞过度增殖或抑制细胞凋亡
（Driver)。
• 肿瘤基因组的进化、演变导致基因组变异差异性很大。
• 2019年3月，痰脱落细胞学提示低分化癌。 • 2019年5月，血浆基因检测一直阴性，患者家属
自己看文献后要求以痰液做基因检测，样本送两 家公司，检测结果基本一致，成功检出驱动基因。
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病例一: NGS检测报告与用药推荐01
TMB：8.6；MSS， 癌细胞PD-L阴性
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不同器官肿瘤基因组驱动变异存在巨大差异
2020/10/23
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Nat Rev Cancer. 2017 ;17(4):239-253
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肿瘤的分子改变远远早于形态与功能变化
主诉、临床症状体征、生理生化变化 、影像学改变、病理形态变化
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PCR技术发明
DNA 双螺旋 结构发表
基因组科学发展是精准医学的基础
人类基因组 计划草图
癌症基因组计 划，二代测序
精准医学计划
泛癌基因组计划
1975
1990
1953
1985
2003 2001
2005
2011
2015
2016
2018
一代测序
• 获得如下治疗方案
• 方案一：服中药治疗。 • 方案二：先用安罗替尼，缓解后PD-1抗体。 • 方案三：培美曲塞单药化疗。 • 方案四：化疗+ PD1抗体。
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病例一: NGS检测后带来的问题
问题
• 本例患者基因检测报告结果与用药推荐是否合理？ • 四个治疗方案是否做到精准？ • 是否还有其他可行方案？ • 您的建议？
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提纲
• 肿瘤NGS检测报告临床解读的必要性！ • 如何进行NGS检测报告的临床解读？ • 展望
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病例一: 肺腺癌病史
简要病史
• 男性患者，86岁，2018年5月咯血，发现右上肺 病灶1.1cm，抗炎2周出院，自服中药。
肿瘤基因组处于动态进化过程
• 1.肿瘤基因组进化极为复杂，存在明 显时空差异性
• 2.肿瘤治疗过程促进产生新的变异-赋 予肿瘤生命体更为顽强的生命力，产 生治疗抵抗。
晚期肿瘤细胞克隆复杂进化
PLOS Genetics | DOI:10.1371/journal.pgen.1005778 FeBruary 18, 2016