真菌胞内蛋白质提取方法的建立
真菌蛋白提取方法
真菌蛋白提取方法一TCA/丙酮法1 液氮将菌体研磨为粉末;2 向匀浆中加入10倍体积的丙酮(含13.3% (w/v) TCA和0.093% β巯基乙醇),过夜沉降;3 4 度20,000g 离心15 min;4 移处上清,用冰冷的含0.07% (v/v) β-巯基乙醇的丙酮清洗沉淀两次;5 离心后,沉淀干燥至丙酮挥发完全。
二酚抽提法1 在液氮中将 1g 菌体研磨为粉末2 加入 6 ml 水饱和酚(buffer-saturated phenol)和 2 ml提取液(20mMTris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100 (v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0,0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
3 在4度混合30分钟。
4 12000 rmp 离心1min,使两相分开。
5 弃沉淀,吸取上层的苯酚相,加入5倍体积的冷丙酮,-20度沉降2h。
6 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白,弃去上清。
7 沉淀干燥至丙酮挥发完全。
三提取液抽提丙酮沉淀法1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
2 取液氮冻存的菌体,放入预冷的研钵内研磨至粉末状。
3 向匀浆中加入2倍体积的抽提液(20mM Tris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100(v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0, 0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
4 混匀后4度震荡30分钟,以便蛋白溶解。
5 12000 rmp,4度,离心15分钟,吸取上清于另一EP管中。
7 向上清液中加入5倍体积的预冷丙酮(含有0.07%β-巯基乙醇),混匀,-20℃,2小时沉淀蛋白质。
8 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白。
弃去上清,沉淀用乙醇洗三次,自然干燥蛋白沉淀。
四甲醇氯仿水沉淀法Chloroform /Methanol/Water Precipitation1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
提取蛋白质的具体步骤
提取蛋白质的具体步骤全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:提取蛋白质是生物科学研究中非常重要的一个步骤,它能够帮助研究人员深入了解蛋白质的结构和功能。
下面将为您介绍一些常用的提取蛋白质的具体步骤,希望能对您有所帮助。
1. 选择样本:在进行蛋白质提取前,首先需要选择合适的样本。
样本可以是动植物组织、微生物、细胞等。
在选择样本时,需要考虑到所需提取的蛋白质种类和含量。
2. 细胞破碎:将样本破碎是提取蛋白质的第一步。
通过机械或化学方法破碎细胞壁,释放出蛋白质。
常用的方法包括超声波破碎、研钵研磨、高压破碎等。
3. 细胞裂解:将破碎后的细胞溶液进行裂解是提取蛋白质的下一步。
裂解可使蛋白质从细胞内释放出来。
常用的裂解方法包括离心、温度变化、酸碱处理等。
4. 蛋白质沉淀:裂解后的细胞溶液含有大量的蛋白质和其他杂质,需要进行沉淀分离。
常用的方法包括盐析、醇沉、酸沉淀等。
5. 蛋白质纯化:通过进一步的分离和纯化步骤,可以得到纯度较高的蛋白质。
常用的方法包括柱层析、凝胶电泳、亲和纯化等。
6. 蛋白质鉴定:最后一步是对提取得到的蛋白质进行鉴定和分析。
常用的鉴定方法包括质谱分析、Western blotting等。
以上就是提取蛋白质的具体步骤。
通过这些步骤,研究人员可以有效地提取并纯化蛋白质,为后续的实验和研究提供重要的支持。
希望以上内容对您有所帮助,谢谢!第二篇示例:蛋白质是生物体中重要的基本分子,具有多种生物学功能,包括结构支持、酶催化、信号传导等。
提取蛋白质是生物学研究中常用的实验方法之一。
下面我将介绍提取蛋白质的具体步骤。
1. 样品的制备首先要准备待提取的生物样品,可以是细胞、组织或者生物体。
样品的制备包括收集、洗涤、离心等步骤,确保样品的纯度和完整性。
2. 细胞破碎对于细胞样品,需要先将细胞破碎以释放蛋白质。
常用的细胞破碎方法包括超声波破碎、高压破碎、冻融破碎等,选择适合样品的方法进行破碎。
3. 蛋白质溶解破碎后的细胞溶液需要进行蛋白质溶解,这可以通过添加盐溶液、表面活性剂或有机溶剂等方法来实现。
真菌蛋白提取方法
真菌蛋白提取方法一TCA/丙酮法1 液氮将菌体研磨为粉末;2 向匀浆中加入10倍体积的丙酮(含13.3% (w/v) TCA和0.093% β巯基乙醇),过夜沉降;3 4 度20,000g 离心15 min;4 移处上清,用冰冷的含0.07% (v/v) β-巯基乙醇的丙酮清洗沉淀两次;5 离心后,沉淀干燥至丙酮挥发完全。
二酚抽提法1 在液氮中将 1g 菌体研磨为粉末2 加入 6 ml 水饱和酚(buffer-saturated phenol)和 2 ml提取液(20mMTris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100 (v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0,0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
3 在4度混合30分钟。
4 12000 rmp 离心1min,使两相分开。
5 弃沉淀,吸取上层的苯酚相,加入5倍体积的冷丙酮,-20度沉降2h。
6 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白,弃去上清。
7 沉淀干燥至丙酮挥发完全。
三提取液抽提丙酮沉淀法1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
2 取液氮冻存的菌体,放入预冷的研钵内研磨至粉末状。
3 向匀浆中加入2倍体积的抽提液(20mM Tris-Cl, pH 7.5, 0.5% Triton X-100(v/v), 0.5M EDTA, pH 7.5, pH 8.0, 0.07% β-巯基乙醇, protease inhibitors)。
4 混匀后4度震荡30分钟,以便蛋白溶解。
5 12000 rmp,4度,离心15分钟,吸取上清于另一EP管中。
7 向上清液中加入5倍体积的预冷丙酮(含有0.07%β-巯基乙醇),混匀,-20℃,2小时沉淀蛋白质。
8 12000 rmp,4度,离心15分钟沉淀蛋白。
弃去上清,沉淀用乙醇洗三次,自然干燥蛋白沉淀。
四甲醇氯仿水沉淀法Chloroform /Methanol/Water Precipitation1 预先将研钵置于-20℃的冰箱内冷冻。
蛋白质的分离提取方法
蛋白质的分离提取方法
蛋白质分离提取是生物分析中一种常见的分析方法。
它能够从各种细胞和蛋白溶液中分离提取出有用的蛋白质,并有效地检测蛋白质的结构和功能。
一般来说,蛋白质分离提取的具体工艺如下:
1.抽提溶解:通常,抽提溶解的工艺是将细胞或蛋白溶液抽提成单独的溶液,再通过更细的滤器或繁复的曲折手段将其中的一些蛋白分离提取出来。
抽提的溶液可以是一种细胞因子或去离子水,也可以是添加有特定蛋白的溶液。
抽提的方法包括溶胀(如乳酸钠溶解)、离心离液(如凝胶离心)、沉淀(如滤渣沉淀)和浓缩(如滤渣浓缩)等。
2.冷冻干燥:冷冻干燥的技术是改变物质的温度以及蒸发蒸馏,以将抽提的蛋白质溶解体转变为晶体状态。
冷冻干燥的具体工艺主要有:先冷冻、改变气压、蒸发水份,再加热恢复溶液容量。
3.结构分离:结构分离是指对抽提的蛋白质进行多种物理和化学方法分离提取,通过改变结构和性质来识别和纯化特定蛋白质。
结构分离的方法包括电泳(例如乳糖电泳)、离心离液(例如凝胶离心)、层析(例如膜滤层析)等。
提蛋白质的原理及步骤
蛋白质提取是一项基础实验,通常用于从组织或细胞中提取纯度较高的蛋白质样品,以便进行各种蛋白质研究。
常规的蛋白质提取步骤包括以下几个主要步骤:
1. 细胞或组织的裂解:将待提取的样品裂解以释放出蛋白质。
裂解方法取决于被裂解的细胞类型,可使用机械法、化学法、超声波或高压等方法进行裂解。
2. 蛋白质的分离:将蛋白质与非蛋白质组分进行分离,常用的方法有沉淀、过滤、离心和柱层析等。
3. 蛋白质的纯化:通过进一步的分离和纯化来获得高纯度的蛋白质。
这些步骤通常需要进行多次,每次都使用不同的方法来分离和纯化蛋白质。
提蛋白质的原理是基于蛋白质的化学和物理特性进行分离和纯化。
蛋白质分子量大小、电荷、亲水性等特性不同,容易与不同化学试剂、柱层析介质或生物酶相互作用。
通过调节这些条件和步骤,就可以使不同的蛋白质与其它组分分离出来,并得到纯度较高的蛋白质样品。
虽然蛋白质提取步骤较多,但因为各种蛋白质的特性不同,所以实验时需要根据需要选择不同的提取和分离方法以获得更理想的效果。
微生物蛋白提取和分离纯化
微生蛋白提取和分离纯化
预处理
菌体表达的胞外酶
上清(滤液)
菌体表达的胞外酶分解培养基形成的小肽 及一些氨基酸成分
未分解利用的部分培养基
沉淀(滤饼)
胞内匀浆:胞内表达的酶,小肽
微生物蛋白提取和分离纯化
离子交换柱层洗析脱液的的流速操也会作影响要离子点交换层析 分离效果,洗脱速度通常要保持恒定。
• 1.平衡缓冲液
一般洗脱速度慢比快的分辨率要好, 但洗脱速度过慢会造成分离时间长、
• 2.上样
样品扩散、谱峰变宽等副作用,所以 要根据实际情况选择合适的洗脱速度。
• 3.洗脱缓冲液要保证各个待如分果离洗物脱质峰(相如对蛋集白中质某)个的区稳域定造;成要重使各 个待分离物首质先叠与要,离保则子证应交在适换整当剂个缩有洗小适脱梯当液度的梯范结度围合范或,围降并内低尽,洗量使
– 一般来说,pH对弱酸和弱碱型离子交换剂影响 较大,如对于弱酸酸型离子交换剂在pH较高时, 电荷基团充分解离,交换容量大,而在较低的 pH时,电荷基团不易解离,交换容量小;同时 pH也影响样品组分的带电性。
– 离子强度增大,交换容量则下降。实验中增大 离子强度进行洗脱,就是要通过降低交换容量 把结合在离子交换剂上的样品组分洗脱下来。
微生物蛋白提取和分离纯化
层析过程
– (1)装柱 – (2)平衡(equilibrium) – (3)上样(loading) – (4)洗涤(washing) – (5)洗脱(elution) – (6)清洗与再生
微生物蛋白提取和分离纯化
离子交换柱特点
➢料液处理量大,在适宜的操作条件下,分离 过程具有浓缩作用;
真菌胞内蛋白质提取方法的建立
[文章编号] 1671-587Ⅹ(2012)03-0590-05[收稿日期] 2011-08-15[基金项目] 国家自然科学基金资助课题(30910103903,30770120)[作者简介] 王 爽(1976-),女,吉林省长春市人,主治医师,医学博士,主要从事真菌分子学鉴定及耐药机制的研究。
[通信作者] 王 丽(Tel:0431-85619486,E-mail:wli99@jlu.edu.cn)真菌胞内蛋白质提取方法的建立王 爽1,2,姜兰香1,张 宇2,3,贺 丹2,田 庄2,高 嵩2,横山耕治4,王 丽2(1.吉林大学第二医院皮肤科,吉林长春130041;2.吉林大学白求恩医学院病原生物学系,吉林长春130021;3.吉林大学第二医院检验科,吉林长春130041;4.日本千叶大学真菌研究中心,日本千叶260-8673)[摘 要] 目的:研究不同的提取方法对白假丝酵母和茄病镰刀菌胞内蛋白质浓度、种类及数量的影响,为建立一种稳定可靠的真菌胞内蛋白质提取方法提供依据。
方法:分别以白假丝酵母菌和茄病镰刀菌为研究对象,培养时间为36、48和72h,超声波工作时间为20s、3min、5min,10min,超声波功率为332.5和475.0W,通过蛋白质浓度检测和SDS-PAGE蛋白质电泳分析,比较不同条件下提取的蛋白质浓度、种类及数量,观察不同因素对蛋白质提取效果的影响。
结果:2株真菌均在培养36h时提取胞内蛋白质的浓度最大,白假丝酵母在功率332.5W、超声3min时得到胞内蛋白质的数量和种类最多,茄病镰刀菌在功率332.5W、超声10min时得到蛋白质的数量和种类最多。
结论:使用超声波法与玻璃珠研磨法结合提取胞内蛋白质,从菌株的培养时间、超声波工作时间和功率3方面建立了真菌胞内蛋白质的最佳提取方法。
[关键词] 白假丝酵母;茄病镰刀菌;超声波;培养时间[中图分类号] R379.2 [文献标志码] AEstablishment of intracellular protein extractionmethods from fungusWANG Shuang1,2,JING Lan-xiang1,ZHANG Yu2,3,HE Dan2,TIAN Zhuang2,GAO Song2,KOJI Yokoyama4,WANG Li 2(1.Department of Dermatology,Second Hospital,Jilin University,Changchun 130041,China;2.Department of Pathogen Biology,Norman Bethune College of Medicine,Jilin University,Changchun130021,China;3.Department of Laboratory,Second Hospital,Jilin University,Changchun130041,China;4.Medical Mycology Research Center,Chiber University,Chiba 260-8673,Japan)Abstract:Objective To study the effect of different cultivate time,ultrasonic time and ultrasonic power on theconcentration,type and quantity of the intracellular protein from Candida albicans and Fusarium solina and toprovide the theoretical basis for establishing a reliable and stable extraction method for intracellular protein fromfungus.Methods Candida albicans and Fusarium solina were cultured.The different parameters included theculture time(36,48,and 72h),ultrasonic time(20s,3min,5min,and 10min)and ultrasonic power(332.5Wand 475.0W).The concentrations,species and quantities of protein under different factors were detected by theprotein concentration detection and SDS-PAGE electrophoresis analysis.Results Both strains got the most quantityof protein when cultivated for 36h.The most quantity and species of Candida albicans were obtained when theultrasonic power was 332.5Wand ultrasonic time was 3min,but as to Fusarium solina,the correspondingparameters were 332.5Wand 10min,respectively.Conclusion The intracellular protein is extracted bycompositely using ultrasonic method and glass bead transformation method.The optimal extraction method of095第38卷 第3期2012年5月吉 林 大 学 学 报 (医 学 版)Journal of Jilin University(Medicine Edition)Vol.38No.3 May 2012intracellular protein from fungus is developed from the aspects of culture time,ultrasonic power and ultrasonicworking time of strains.Key words:Candida albicans;Fusarium solani;ultrasound;culture time 随着免疫力低下或免疫缺陷患者等易感人群的不断增加,条件致病性真菌感染的发生率呈上升趋势,严重威胁患者的健康和生命[1-2],真菌致病和耐药机制的研究已成为当前研究的热点问题。
蛋白质提取的方法和原理
蛋白质提取的方法和原理
1、蛋白质提取方法
1.1 热处理法
热处理是一种简单而有效的蛋白质提取方法,通过高温高压或烧
焦来破坏细胞壁和细胞膜,并释放出蛋白质。
如热溶液法、微波法、
热压法等。
1.2 酸碱法
酸碱法是一种常用的蛋白质提取方法,通过改变蛋白质的电荷性质,使其带有正负电荷,从而在特定的pH下沉淀出来。
如硫酸钾法、
亚硫酸盐法、三氯乙酸法等。
1.3 有机溶剂法
有机溶剂法是一种常见的蛋白质提取方法,常用有机溶剂如甲醇、丙酮、氯仿等,通过溶解细胞膜并使蛋白质溶于有机溶剂中,经离心
分离得到蛋白质。
如甲醇法、氯仿法、醋酸纤维素膜法等。
1.4 冻融法
冻融法是一种新兴的蛋白质提取方法,通过冻结细胞后迅速回温,使细胞壁破裂并释放出蛋白质。
该方法不需要使用有机溶剂或酸碱处理,可避免蛋白质的降解和失活。
2、蛋白质提取的原理
蛋白质提取的原理是利用特定的化学物质或物理条件,破坏细胞
膜和细胞壁,从而释放出蛋白质。
蛋白质在细胞内可以存在于细胞膜、细胞壁、细胞质或细胞核中,提取蛋白质需要根据不同的生物学样品
及其组分情况采用不同的方法。
其中,热处理法是利用高温高压或烧焦等方式破坏细胞壁和细胞膜,从而释放出蛋白质;酸碱法是通过改变蛋白质的电荷性质,在特
定的pH值下使其沉淀出来;有机溶剂法是利用有机溶剂溶解细胞膜,
并使蛋白质溶于有机溶剂中;冻融法则是通过冻结细胞后迅速回温,
使细胞壁破裂并释放出蛋白质。
在蛋白质提取过程中,需要注意避免蛋白质的降解和失活,以及
尽量减少对蛋白质的污染。
提取蛋白质的方法
提取蛋白质的方法一、背景介绍蛋白质是生物体中最基本的组成部分之一,它们在细胞代谢、信号传导和结构支撑等方面起着重要作用。
因此,蛋白质的提取是许多生物学研究的基础。
本文将介绍几种常见的蛋白质提取方法。
二、方法一:机械破碎法1. 原理机械破碎法是通过物理力量将细胞壁破坏,使得蛋白质从细胞内释放出来。
这种方法适用于非常坚硬的样品,如骨头或干燥的植物材料。
2. 步骤(1)将样品加入液氮中冷冻并粉碎成粉末。
(2)向粉末中加入适量缓冲液,并使用超声波或高压均质器进行打碎。
(3)离心样品以除去残留的细胞碎片和其他杂质。
(4)收集上清液进行后续处理。
三、方法二:化学提取法1. 原理化学提取法是利用化学试剂溶解或沉淀细胞,使蛋白质从细胞中释放出来。
这种方法适用于大多数样品,但可能会影响蛋白质的结构和功能。
(1)将样品加入适量缓冲液中,并加入化学试剂(如三氯乙酸、硫酸或氢氧化钠等)。
(2)在恒温条件下搅拌或震荡样品,使细胞完全破裂。
(3)离心样品以除去残留的细胞碎片和其他杂质。
(4)收集上清液进行后续处理。
四、方法三:凝胶层析法1. 原理凝胶层析法是一种基于分子大小和电荷的分离技术。
通过将混合物通入凝胶柱中,不同大小和电荷的分子会在柱中被分离出来。
这种方法可以用于纯化特定的蛋白质。
2. 步骤(1)制备凝胶柱,并加入相应的缓冲液。
(2)将样品加入凝胶柱,并使用缓冲液进行洗涤。
(3)根据需要调整pH值或添加其他试剂,以促进蛋白质的分离。
(4)收集不同分子大小或电荷的蛋白质进行后续处理。
五、方法四:亲和层析法1. 原理亲和层析法是一种基于蛋白质与特定配体之间相互作用的分离技术。
通过将混合物通入带有配体的凝胶柱中,只有与配体具有亲和力的蛋白质才会被捕获。
这种方法可以用于纯化特定的蛋白质。
(1)制备带有配体的凝胶柱,并加入相应的缓冲液。
(2)将样品加入凝胶柱,并使用缓冲液进行洗涤。
(3)根据需要调整pH值或添加其他试剂,以促进蛋白质的分离。
真菌蛋白的制造过程
真菌蛋白的制造过程引言:真菌蛋白是一类由真菌合成的蛋白质,具有广泛的生物学功能和应用价值。
其制造过程涉及到菌种选择、发酵培养、蛋白表达、纯化和验证等多个环节。
本文将详细介绍真菌蛋白的制造过程,并探讨其在生物医药和农业领域的应用前景。
一、菌种选择在制造真菌蛋白之前,首先需要选择合适的菌种。
常用的真菌菌种包括酿酒酵母、大肠杆菌、大黄蜂菌等。
选择菌种时需要考虑其生长速度、表达效率、分泌能力以及对外界条件的适应性等因素。
同时,还需考虑目标蛋白所在的真菌菌种,以便在后续的表达和纯化过程中获得较高的产量和纯度。
二、发酵培养选择好菌种后,接下来是进行发酵培养。
发酵培养是真菌蛋白制造的关键步骤之一。
其目的是提供适宜的生长环境,促进菌株的繁殖和蛋白表达。
发酵培养液的组成要根据菌株的需求进行调整,包括碳源、氮源、矿物质和生长因子等。
同时,还需要控制培养液的温度、pH值、氧气和搅拌速度等因素,以优化真菌的生长和蛋白表达。
三、蛋白表达在发酵培养过程中,真菌会合成目标蛋白。
蛋白表达的机制主要包括转录和翻译两个过程。
转录是真菌将基因信息转录成RNA的过程,而翻译则是将RNA翻译成蛋白质。
在蛋白表达过程中,可以通过基因工程技术来优化目标蛋白的表达水平和纯度。
例如,可以通过引入外源基因、调节启动子和增加信号肽等方式来提高蛋白表达的效率。
四、纯化在真菌蛋白表达后,需要对其进行纯化。
纯化是将目标蛋白从其他杂质中分离出来的过程,旨在获得高纯度的蛋白样品。
常用的纯化方法包括离心、过滤、层析和电泳等。
离心和过滤可以用于去除大分子杂质,层析则可以根据蛋白的特性选择合适的分离介质,电泳则可用于分离蛋白的大小和电荷。
在纯化过程中,还需要进行监测和分析,以确保蛋白的纯度和活性。
五、验证对制造的真菌蛋白进行验证是必不可少的一步。
验证的目的是确认蛋白的纯度、活性和功能等。
常用的验证方法包括质谱分析、酶活性测定、免疫印迹和功能性实验等。
通过这些验证手段,可以评估蛋白的质量和性能,并为其后续应用提供可靠的依据。
从酵液中分离纯化蛋白质等胞内产物的一般流程
从酵液中分离纯化蛋白质等胞内产物的一般流程包括以下步骤:
1. 预处理:采用加热、调整pH、絮凝等措施和单元操作改变发酵液的理化性质,为固液分离作准备。
2. 固液分离:采用珠磨、匀浆、酶溶、过滤、离心等单元操作除去固相,获得包含目的产物的液相,供进一步分离纯化用。
3. 初步纯化:采用萃取、吸附、沉淀、离心等单元操作,将目的成分与大部分杂质分离开来。
4. 精细纯化:采用层析、电泳、分子蒸馏等单元操作,将目的成分与杂质进一步分离,使产物达到预期标准。
5. 成品加工:采用结晶、浓缩、干燥等单元操作,将目的产物加工成适应市场需要的商品。
以上流程仅供参考,具体操作可能会因实际情况而有所不同。
真菌蛋白提取方法
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盒组分针对厚细胞壁样本进行优化,提取过程简单方便,可在 1 小时内完成。该试剂盒含有 的蛋白酶抑制剂混合物,阻止了蛋白酶对蛋白的降解,为提取高纯度的蛋白提供了保证。提 取的蛋白可用于 Western Blotting、蛋白质电泳、免疫共沉淀等下游蛋白研究。
使用方法: 1. 提取液制备:每 500ul 冷的真菌蛋白提取液中加入 2ul 蛋白酶抑制剂混合物, 4ul 蛋白稳定剂,混匀后置冰上备用。 2. 取 100mg 组织样本剪碎①,置于研钵中用液氮研磨。(没有液氮研磨条件也可直 接加入提取液后置冰上研磨即可) 3. 研磨后加入 500ul 真菌蛋白提取液。 4. 混匀后,在 4℃条件下振荡 20-30 分钟。 5. 在 4℃,14000rpm 条件下离心 10 分钟。 6. 快速将上清吸入另一预冷的干净离心管,即可得到真菌总蛋白。 7. 将上述蛋白提取物定量②后分装于-80℃冰箱保存备用或直接用于下游实验③。
真菌蛋白提取试剂盒
产品组成:
产品组成 规格
真菌蛋白提取液 蛋白稳定剂
蛋白酶抑制剂混合物
BB-31ul
BB-3127-2 100T 50ml 400ul 200ul
一种真菌总蛋白的提取方法[发明专利]
(10)申请公布号 (43)申请公布日 2013.09.25C N 103319566 A (21)申请号 201310258614.5(22)申请日 2013.06.26C07K 1/14(2006.01)(71)申请人昆明理工大学地址650093 云南省昆明市五华区学府路253号(72)发明人张琦 胡彬彬 何仕武 魏云林林连兵 季秀玲(54)发明名称一种真菌总蛋白的提取方法(57)摘要本发明提供了一种真菌总蛋白的提取方法,本发明采用简单易行的方法,克服了真菌细胞壁厚而坚韧,胞内蛋白释放困难的特点,成功提取到质量较高的真菌蛋白质组。
提取液成分简单,其中提取液Ⅰ包含7~8M 尿素、2~2.5M 硫脲、1~2mMEDTA(乙二胺四乙酸)、10mMTris-HCL (三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、pH7.4)、10ul 蛋白酶抑制剂混合物,提取液Ⅱ包含2~4%CHAPS (3-[3-(胆酰氨丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐)、0.5%SDS(十二烷基硫酸钠)、2~4%DTT (二硫苏糖醇),本方法简便快速,对设备要求不高,并且总蛋白的提取过程可以在三个小时内完成提取过程,可以获得大量的总蛋白用于蛋白质组分析,具有较大的实际应用价值。
(51)Int.Cl.权利要求书1页 说明书7页 附图2页(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请权利要求书1页 说明书7页 附图2页(10)申请公布号CN 103319566 A*CN103319566A*1/1页1.一种真菌总蛋白的提取方法,包括以下步骤:(1)将培养好的真菌菌体进行抽滤收集,用PBS 缓冲液洗涤后再收集菌体,或先离心收集菌体,然后用PBS 洗涤菌体,再离心收集菌体;(2)将收集到的菌体置于液氮预冷的研钵中,用液氮充分研磨,将菌体研磨为粉末状;(3)按每800μl 提取液Ⅰ中加入研磨后菌体粉末100-150mg 的比例,将研磨后菌体粉末置于提取液Ⅰ中,充分混匀后置于冰上孵育30-60min ,孵育期间每隔5-7min 混匀一次,其中提取液Ⅰ是指含有7~8M 尿素、2~2.5M 硫脲、1~2mM 乙二胺四乙酸、10mM Tris-HCL 、10ul 蛋白酶抑制剂混合物的溶液;(4)按每800μl 提取液Ⅰ添加200μl 的提取液Ⅱ的比例在步骤(3)孵育后的溶液中加入提取液Ⅱ,颠倒混匀后再置于冰上孵育20-30min ,孵育期间每隔3-5min 混匀一次,其中提取液Ⅱ为含有2~4% 3-[3-(胆酰氨丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐、0.5%十二烷基硫酸钠、2~4%二硫苏糖醇的溶液;(5)将步骤(4)处理后的液体置于离心管中于低温高速冷冻机中离心处理;(6)取上清弃沉淀,上清即为提取到的真菌总蛋白;(7)将提取到的总蛋白分装,置于冰箱中冷冻保存或进行下一步的实验。
全菌体蛋白提取方法
1.取单菌落至液体或固体培养基过夜培养
2.取一接种环细菌至1.5mL EP管(可用2mL管子好超声),液体培养基视菌液浓度确定使
用体积(菌量大致为1*10^9个)
3.使用冰浴预冷的低盐PBS清洗细菌3遍
离心条件:6000rpm,4℃,5min
PBS尽量用枪头吸净
4.每管加入1mL冰浴预冷的裂解液重悬细菌
5.冰浴超声
40%振幅,超2s停2s,超声4min
注意避免气泡或泡沫产生
6.14000rpm,4℃,离心30min,取上清
7.加DNase、RNase消化残留核酸
DNase使用的是Turbo DNase每100μL加入1μL
RNase 10mg/mL每100μL加入2μL
室温孵育30min
10000rpm,4℃离心,3min,取上清
8.Bradford法测蛋白浓度
各取50μL加入200μL考马斯亮蓝(1:4),室温孵育10min
再各取混合液100μL至96孔板,酶标仪测量595nm吸光度,绘制标准曲线
样品使用同样的方法测量吸光度,通过标准曲线计算蛋白浓度。
丝状真菌蛋白质组分析方法的建立
丝状真菌蛋白质组分析方法的建立李锐;贺亮;吴俐勤【摘要】旨在建立丝状真菌蛋白质组的分析方法,对丝状真菌蛋质白学进行初步探索。
使用液氮冷冻研磨、蜗牛酶消化、尿素裂解、硫酸铵沉淀预分级和二维液相色谱分离相结合的蛋白质组研究方法进行丝状真菌的蛋白质组分析;建立的丝状真菌蛋白提取分级分离方法有效的提高了蛋白的分离效率和提取数量,可以应用在丝状真菌蛋白质组研究中,共鉴定了396个蛋白,包括了参与各种细胞生理过程的蛋白,为进一步开展丝状真菌蛋白质组的研究打下了良好的基础。
研究中建立的蜗牛酶消化破壁、尿素裂解的蛋白提取方法,可以显著提高丝状真菌胞浆蛋白的鉴定数量,特别是对于那些功能重要但丰度低的蛋白,适合于丝状真菌蛋白质组的研究。
【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2012(027)B12【总页数】4页(P93-96)【关键词】丝状真菌;蜗牛酶;尿素裂解;蛋白质组【作者】李锐;贺亮;吴俐勤【作者单位】;;;【正文语种】中文【中图分类】S855.4真菌,细菌和病毒都是人类和动物感染性疾病的重要病因。
然而,与细菌和病毒相比,真菌的研究整体来说还比较落后[1],丝状真菌(Filamentous fungi) 通常指那些菌丝体比较发达而又不产生大型子实体的真菌,某些丝状真菌与人类和动物的健康密切相关,由曲霉、毛霉、镰刀菌、青霉等丝状真菌引起的人类和动物感染日益多见[2]。
在众多的致病性丝状真菌中,红色毛癣菌(Trichophton rubrum )是其中重要的一类,也是一种最常见的致病性皮肤癣菌,世界性广泛分布,人类60% 以上的浅部真菌病感染为红色毛癣菌所致,也是我国最常见的一种皮肤癣菌[3],它主要侵犯皮肤、指甲(趾甲),偶可侵犯毛发,引起脓癣、脓肿和肉芽肿等深部感染[4],所致癣病病程持久,且难治愈,易复发,同时还容易导致人和宠物之间的相互传播[5]。
红色毛癣菌的广泛流行,使其成为研究病源性丝状真菌的代表性菌株。
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[文章编号] 1671-587Ⅹ(2012)03-0590-05[收稿日期] 2011-08-15[基金项目] 国家自然科学基金资助课题(30910103903,30770120)[作者简介] 王 爽(1976-),女,吉林省长春市人,主治医师,医学博士,主要从事真菌分子学鉴定及耐药机制的研究。
[通信作者] 王 丽(Tel:0431-85619486,E-mail:wli99@jlu.edu.cn)真菌胞内蛋白质提取方法的建立王 爽1,2,姜兰香1,张 宇2,3,贺 丹2,田 庄2,高 嵩2,横山耕治4,王 丽2(1.吉林大学第二医院皮肤科,吉林长春130041;2.吉林大学白求恩医学院病原生物学系,吉林长春130021;3.吉林大学第二医院检验科,吉林长春130041;4.日本千叶大学真菌研究中心,日本千叶260-8673)[摘 要] 目的:研究不同的提取方法对白假丝酵母和茄病镰刀菌胞内蛋白质浓度、种类及数量的影响,为建立一种稳定可靠的真菌胞内蛋白质提取方法提供依据。
方法:分别以白假丝酵母菌和茄病镰刀菌为研究对象,培养时间为36、48和72h,超声波工作时间为20s、3min、5min,10min,超声波功率为332.5和475.0W,通过蛋白质浓度检测和SDS-PAGE蛋白质电泳分析,比较不同条件下提取的蛋白质浓度、种类及数量,观察不同因素对蛋白质提取效果的影响。
结果:2株真菌均在培养36h时提取胞内蛋白质的浓度最大,白假丝酵母在功率332.5W、超声3min时得到胞内蛋白质的数量和种类最多,茄病镰刀菌在功率332.5W、超声10min时得到蛋白质的数量和种类最多。
结论:使用超声波法与玻璃珠研磨法结合提取胞内蛋白质,从菌株的培养时间、超声波工作时间和功率3方面建立了真菌胞内蛋白质的最佳提取方法。
[关键词] 白假丝酵母;茄病镰刀菌;超声波;培养时间[中图分类号] R379.2 [文献标志码] AEstablishment of intracellular protein extractionmethods from fungusWANG Shuang1,2,JING Lan-xiang1,ZHANG Yu2,3,HE Dan2,TIAN Zhuang2,GAO Song2,KOJI Yokoyama4,WANG Li 2(1.Department of Dermatology,Second Hospital,Jilin University,Changchun 130041,China;2.Department of Pathogen Biology,Norman Bethune College of Medicine,Jilin University,Changchun130021,China;3.Department of Laboratory,Second Hospital,Jilin University,Changchun130041,China;4.Medical Mycology Research Center,Chiber University,Chiba 260-8673,Japan)Abstract:Objective To study the effect of different cultivate time,ultrasonic time and ultrasonic power on theconcentration,type and quantity of the intracellular protein from Candida albicans and Fusarium solina and toprovide the theoretical basis for establishing a reliable and stable extraction method for intracellular protein fromfungus.Methods Candida albicans and Fusarium solina were cultured.The different parameters included theculture time(36,48,and 72h),ultrasonic time(20s,3min,5min,and 10min)and ultrasonic power(332.5Wand 475.0W).The concentrations,species and quantities of protein under different factors were detected by theprotein concentration detection and SDS-PAGE electrophoresis analysis.Results Both strains got the most quantityof protein when cultivated for 36h.The most quantity and species of Candida albicans were obtained when theultrasonic power was 332.5Wand ultrasonic time was 3min,but as to Fusarium solina,the correspondingparameters were 332.5Wand 10min,respectively.Conclusion The intracellular protein is extracted bycompositely using ultrasonic method and glass bead transformation method.The optimal extraction method of095第38卷 第3期2012年5月吉 林 大 学 学 报 (医 学 版)Journal of Jilin University(Medicine Edition)Vol.38No.3 May 2012intracellular protein from fungus is developed from the aspects of culture time,ultrasonic power and ultrasonicworking time of strains.Key words:Candida albicans;Fusarium solani;ultrasound;culture time 随着免疫力低下或免疫缺陷患者等易感人群的不断增加,条件致病性真菌感染的发生率呈上升趋势,严重威胁患者的健康和生命[1-2],真菌致病和耐药机制的研究已成为当前研究的热点问题。
真菌感染性疾病的发生发展和抗真菌药物的作用,多数是在蛋白质水平上进行的[3]。
因此,在蛋白质水平上研究真菌的致病机制和耐药机制具有重大意义。
在真菌蛋白质组学研究中,获取相关胞内蛋白质是研究的首要问题。
真菌的细胞壁坚韧、不易被破碎,胞内蛋白质难以被释放,在破碎细胞壁的同时,如何减少胞内蛋白质损失非常关键。
目前,国内外常用的真菌破壁方法有超声波法、液氮冷冻研磨法和玻璃珠法等,其中超声波破壁操作简便,但是真菌破壁时间较长,超声工作时产生热量易引起蛋白质降解;液氮冷冻研磨在真菌的DNA和蛋白质提取中均可应用,但液氮极易挥发,操作困难;而单纯玻璃珠研磨很难将菌丝体打散使细胞有效裂解。
也有部分研究者[4-6]制备原生质体提取蛋白质,但是其制备过程繁琐,得到数量很少,很难满足蛋白质研究需要。
本研究以2种较为常见的病原真菌白假丝酵母和茄病镰刀菌作为研究对象,联合使用几种破壁方法,在改变菌体培养时间、超声波功率以及工作时间3个条件下,比较不同提取条件下得到的胞内蛋白质浓度、种类及数量,旨在建立一种稳定、可靠的真菌胞内蛋白质提取方法。
1 材料与方法1.1 菌株、试剂与仪器 白假丝酵母JLC 30699和茄病镰刀菌JLC 30879均为临床分离株,由吉林大学真菌研究中心保藏。
HZQ全温震荡培养箱购自哈尔滨市东联电子技术开发有限公司;冷冻高速离心机(Heraeus Biofuge Primor)购自力康生物发展有限公司;电子分析天平(AB204-N)购自梅特勒-托利多仪器上海有限公司;超声波细胞粉碎机(SCIENTZ IID)购自宁波新芝生物科技股份有限公司;紫外分光光度计(Beckman DU 600)购自美国Beckman Coulter公司;马铃薯葡萄糖琼脂培养基(potato dextrose agar,PDA)、马铃薯葡萄糖液体培养基(potato dextrose broth,PDB)购自美国Difco公司;尿素、硫脲、二硫苏糖醇(DTT)、3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐(CHAPS)、苯甲基磺酰氟(PMSF)、蛋白纯化试剂盒Clean-upkit等试剂购自美国Amersham-Pharmacia公司。
1.2 菌株的培养 白假丝酵母在PDA斜面培养基上37℃培养24~48h,茄病镰刀菌在PDA斜面培养基上28℃培养3~5d。
用无菌的生理盐水将其制备成浓度为1×107 CFU·mL-1的菌悬液。
各取30μL分别接种于30mL PDB液体培养基中,分别在37℃和28℃振荡培养36~72h。
1.3 胞内蛋白质的提取 分别于培养36、48和72h后,以3 000r·min-1离心10min收集菌体。
无菌蒸馏水洗涤菌体3次,3 000r·min-1离心10min,弃上清。
每200mg菌体(湿重)加100μL蛋白质提取液Ⅰ(7.5mol·L-1尿素、2.5mol·L-1硫脲、20.0mmol·L-1 PMSF、1.5mmol·L-1EDTA、10.0mmol·L-1 Tris、20.0mg·L-1Dnase、5.0mg·L-1 Rnase,pH 7.4),室温作用20min后;降温至0℃后,以332.5W功率超声5min,得到混合液。
再加入300mg酸洗玻璃珠(玻璃珠直径≥0.5mm),充分研磨10min后,1 800r·min-1涡旋振荡10min;然后加入25μL蛋白质提取液Ⅱ(2%CHAPS,1%DTT,pH 9.0),涡旋振荡30s后,置于冰上1min,该步骤重复6次。
14 000r·min-1离心10min,留取上清。