同源建模工具easymodeller4.0 操作说明
Voxler4.0中文教程北冥出品
北冥有鱼，其名为鲲。
鲲之大，不知其几千里也；化而为鸟，其名为鹏。
--庄子《逍遥游》 Voxler®4.0中文教程本译文为使用Voxler4.0过程中的的一个中间产物，主要是对Voxler4.0的英文帮助文档进行了一个粗糙的翻译，同时在翻译过程中对有些概念和功能进行了比较系统的梳理和理解。
现分享给大家，希望对大家有用。
Voxler4.0是Golden Software有限责任公司出品的一款卓越的商业三维可视化软件，希望大家在法律法规的框架内使用该软件，尊重软件著作权。
您可以自由传播此文档，可以进行修改、勘误，但建议仅限于学习与研究之用而勿利用此文档进行盈利性的活动，本文档用于纯粹的商业用户是禁止的。
受译者水平和时间限制，译文肯定存在很多很多很多问题，请大家在使用此文档时，自行进行甄别，给予勘误,万分感谢。
译者：目录VOXLER用户界面概览 (4)VOXLER用户界面 (5)改变视窗布局 (6)工作表文档 (6)工作表命令 (7)标签视图 (7)工作表文档 (7)工作表窗口 (8)教程介绍 (10)高级教程 (11)关于文档的一个备注 (11)使用演示版本的教程 (11)开始VOXLER–教程 (11)课程1-装载数据-教程 (12)课程2–创建图形输出模块-教程 (14)2.1-创建一个散射图-教程 (14)2.2–添加一个边界框-教程 (15)课程 3–更改属性-教程 (17)3.1–改变符号颜色-教程 (17)3.2–显示标签–教程 (19)3.3–改变边框盒属性-教程 (19)3.4–旋转图形-教程 (20)课程 4–编辑工作表中的连接数据 (22)课程 5–使用计算模块–教程 (24)5.1–网格化数据-教程 (24)5.2–创建一个等值面-教程 (25)5.3–更改等值面属性-教程 (26)5.4–关于透明度的一个标注-教程 (28)5.5–过滤数据–教程 (28)课程 6–连接多个模块-教程 (32)6.1–添加等值线-教程 (32)6.2–改变透明度-教程 (34)课程 7-保存信息-教程 (35)7.1–保存一个项目-教程 (35)7.2–保存数据–教程 (36)7.3–保存图形–教程 (36)7.4–拷贝一个快照-教程 (36)7.5–捕获视频-教程 (37)课程 8–导入井体数据 (38)8.1–导入井口位置数据 (38)8.2–导入轨迹数据 (39)8.3–井的显示 (40)8.4–导入测井L OG数据 (40)8.5–在井体上面显示测井数据 (41)高级教程导引 (42)高程场-高级建议 (42)方法1 (42)方法2 (43)数学模块–高级建议 (45)Voxler 用户界面概览Voxler 使用多线程来保持用户界面反应灵敏，甚至对计算量较大的后台任务也反应灵敏。
EasyMock使用手册
EasyMock使用简明手册在实际编写unit test的过程中，很多情况下我们会需要使用其他的组件（如和数据库相关的测试）。
当我们是使用第三方提供的组件时，这并不是太大的问题，因为我们可以假设他们是无错的。
但是一旦这些组件是我们自己的组件时，问题就暴露出来了。
“单元测试出错了，但到底是谁的错。
我的？他的？”，这种情况显然违反了测试的独立性原则。
出现这种情况使得这个测试无法确切的指出是那个单元出现了问题，照成了排错的困难，而且也浪费了时间。
同时，过分的将单元的测试代码依赖于其他单元，也照成了其他一些很现实的问题：- 在所依赖的单元完成之前，无法顺利的编写单元测试。
- 产生环境的依赖性，如运行一个HttpServletRequest处理器的测试代码必须启动一个servlet容器。
所有这些问题，都可以使用Mock Object来解决。
使用它的前提是，所依赖单元的接口必须定义清楚。
而EasyMock正是为了这一目的而产生的。
使用目的通过模拟unit test所需要的组件，已达到隔离各个unit test的目的。
目前的版本1.1，它所需要的环境是jdk1.3.1以上和junit3.8.1以上。
可以从/projects/easymock/处下载。
用法1. EasyMock采用“记录-----回放”的工作模式，基本使用步骤：- 创建Mock对象的控制对象Control。
- 从控制对象中获取所需要的Mock对象。
- 记录测试方法中所使用到的方法和返回值。
- 设置Control对象到“回放”模式。
- 进行测试。
- 在测试完毕后，确认Mock对象已经执行了刚才定义的所有操作。
2. 使用举例：假设需要测试的对象是RequestUtil，所需要测试的方法为getBoolean。
此时我们需要模拟一个HttpServletRequest对象。
public void testGetStringHttpServletRequestString(){public void testGetBoolean(){//创建Mock对象的控制器MockControl control= MockControl.createControl( HttpServletRequest.class);//获取Mock对象HttpServletRequest mock= (HttpServletRequest)control.getMock();//设置getBoolean中要使用的方法和返回值control.expectAndReturn( mock.getParameter( "test"), null);//设置控制器为replay模式control.replay();//执行测试assertNull( RequestUtil.getString( mock, "test")); //确认control.verify();}}通过EasyMock，执行这段测试代码完全不需要启动一个servlet容器，在命令行的方式下即可完成，非常的方便。
VEX-easy-v4-编程软件使用教程
系统集成与部署
系统集成概述
系统集成是将多个软件或硬 件设备集成在一起，以实现
特定的功能或业务流程。
系统集成流程
系统集成需要遵循一定的流 程，包括需求分析、设计、
实施和测试等步骤。
系统集成工具
为了方便系统集成，vexeasy-v4提供了丰富的系统集 成工具和文档，包括系统集 成API、系统集成开发指南等 。
自定义UI组件
UI组件概述
自定义UI组件流程
自定义UI组件工具
UI组件是软件界面中可重用的界面元 素，通过自定义UI组件，用户可以更 加灵活地定制软件的界面和功能。
自定义UI组件需要遵循一定的流程， 包括设计、编码、测试和发布等步骤 。
为了方便自定义UI组件，vex-easyv4提供了丰富的UI组件开发工具和文 档，包括UI组件API、UI组件开发指 南等。
vex-easy-v4-编程 软件使用教程
目 录
• 软件介绍 • 编程基础 • 高级编程技巧 • 实战案例 • 软件进阶 • 软件常见问题与解决方案
01
CATALOGUE
软件介绍
产品特点
01
易学易用
vex-easy-v4为初学者提供了直 观的图形界面，使得编程变得简 单易懂。
功能强大
02
03
实时模拟
机器人模拟区
机器人模拟区用于展示机器人 的运动和行为，方便用户进行 实时模拟和调试。
02
CATALOGUE
编程基础
变量与数据类型
变量
在编程中，变量用于存储数据，以便 在程序运行期间使用。变量具有名称 和数据类型，通过声明来创建。
数据类型
数据类型定义了变量可以持有的值的 范围和类型。常见的数据类型包括整 数、浮点数、布尔值、字符串等。
第11讲 蛋白质高级结构预测
蛋白质结构分类数据库
SCOP (Structural Classification of Proteins) CATH (Class, Architecture, Topology,
Homology)
Number of folds is limited. Currently ~700，Total: 1,000 ~10,000
CATH的结构层次
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
有限的蛋白质折叠类型
258 种类型 165 种类型 141 种类型
334 种类型 50 种类型
90% of new structures submitted to PDB in the past three years have similar structural folds in PDB
If we can solve the above problem, then • Given a sequence, we can try each known fold,
the structure most compatible with the sequence
Concept of Threading
Thread (align or place) a query protein sequence
onto a template structure in “optimal” way Good alignment gives approximate backbone
Description
3D-JIGSAW
Fragment assembly
Automated webserver
RaptorX
remote homology detection, protein 3D modeling, binding site prediction
EASE4.0快速入门
EASE4在声学建筑设计中的重要性
• EASE做为建筑电声计算机辅助设计软件，能 使声学顾问、建筑师、音响工程师、建筑装修 设计师可以预计建筑的声学、扩声系统包括扬 声器布置方案等特性，通过EASE模拟设计可 以直观的看到所设计项目的厅堂扩声系统预期 的声学特性效果图，了解厅堂建筑内所采用的 吸声材料、扬声器型号、摆放位置、角度、以 及扬声器的相关数据，对实际的建设项目具有 良好的指导作用。
• 半径范围
第三章手动绘制房间数据模型
（文件F）菜单下的目录
• 1、2、3….N表示已经保存过的工程文件 记录，直接点击可打开相应的文件，功 能同打开文件（ Ctar+o）操作相同。 • 退出X ：表示退出EASE4.0主程序。
（编辑E）菜单下的子目录
• 工程数据P：打开工程数据编辑器，调用 一个项目数据并可以对数据进行修改。 • 检查数据C （快捷键 F5）对设计的房间 模型数据进行自动检测。
内部教学专用
EASE4.0快速入门
中国传媒大学信息工程学院 2006年5月
第一章EASE4.0简介
• EASE的英文全称Electro Acoustic Simulator Fro Engineers是由英文单词组 合而来，意为电声工程模拟设计软件， 该计算机辅助设计软件由德国DAD公司 出品。
房间建模编辑模块界面房间建模编辑工具条图标详解房间建模编辑模块中共有70个可用工具图标房间建模编辑界面工具条图标从这里打开一个工程不必首先打开编辑e中的工程程序ease40房间数据编辑程序配置选项f9发送当前页面到ease编辑页面房间建模编辑界面工具条图标光靶用于确定绘图坐标的位置房间建模编辑界面工具条图标缩小工具房间建模编辑界面工具条图标沿着y轴观看房间视图端面视图房间建模编辑界面工具条图标从扬声器的位置观看建模房间建模编辑界面工具条图标察看建模数据的边线房间建模编辑界面工具条图标观察听众座位测试点房间建模编辑界面工具条图标观察插入面的标号房间建模编辑界面工具条图标观察灯泡的标号房间建模编辑界面工具条图标显示扬声器的信息列表房间建模编辑界面工具条图标新增图形项目房间建模编辑界面工具条图标移动选项工具房间建模编辑界面工具条图标反转一个面房间建模编辑界面工具条图标房间建模编辑操作界面窗口显示位置右上左上右下左下居中层叠房间建模编辑界面工具条图标插入扬声器房间建模编辑界面工具条图标插入正方形房间建模编辑界面工具条图标插入3d空间ease40二维绘图模块工具图标二维绘图数据编辑界面ease40二维绘图模块工具图标打开选项窗口ease40二维绘图模块工具图标打开房间ease40二维绘图模块工具图标开启传统房间的3d视图ease40二维绘图模块工具图标拖拽工具可将绘制画面随意放置ease40二维绘图模块工具图标插入试听测试点房间建模编辑界面工具条图标房间建模编辑操作界面窗口显示位置右上左上右下左下居中层叠ease40二维绘图模块工具图标打开临界ease40二维绘图模块工具图标以ms显示第一声波阵面到达听声面不同位置的时间到达初始时间差先是最先的两个声音的时间差计算直达声和混响声总声压级ease40二维绘图模块工具图标清晰度测量表示能划分点在7ms前后直达声与混响声能量之比的db值清晰度测量表示能划分点在50ms前后直达声与混响声能量之比的db值清晰度测量表示能划分点在80ms前后直达声与混响声能量之比的db值清晰度测量表示能划分点在t前后直达声与混响声能量之比的db值ease40二维绘图模块工具图标声压级db表示在7ms内直达声与混响声能量之和声压级db表示在50ms内直达声与混响声能量之和声压级db表示在80ms内直达声与混响声能量之和声压级db表示在t内直达声与混响声能量之和ease40二维绘图模块工具图标以栅格形式显
modelio手册
modelio手册
Modelio是一个开源的建模工具，它支持UML和其他标准建模
语言，如BPMN和SysML。
Modelio的手册是一个很重要的资源，它
包含了关于软件的安装、配置、使用和定制的详细说明。
首先，Modelio手册提供了关于软件安装和配置的详细指导。
这包括了关于操作系统的要求，安装过程的步骤以及可能遇到的常
见问题的解决方法。
手册中还会介绍如何配置Modelio以适应特定
的建模需求，包括插件的安装和集成。
其次，Modelio手册会详细介绍软件的使用方法。
这包括了如
何创建和管理UML、BPMN和SysML模型，如何进行建模元素之间的
关联和继承，以及如何进行模型的分析和验证。
手册中还会介绍如
何使用Modelio进行版本控制和团队协作，以及如何生成各种类型
的文档和报告。
此外，Modelio手册还会提供关于软件定制和扩展的信息。
这
包括了如何编写自定义插件和模型转换器，以及如何进行软件界面
的定制和本地化。
手册中还会介绍如何进行Modelio的集成和扩展，以满足特定的建模需求和工作流程。
总之，Modelio手册是一个非常重要的资源，它提供了关于软件安装、配置、使用和定制的详细说明，帮助用户更好地理解和利用这个强大的建模工具。
希望这些信息能够帮助你更好地使用Modelio进行建模工作。
EasyLad使用手册范本
一个给用户提供自由扩展空间的PLC 一个用户可自己设计外围模块的PLC使用手册易达自动化研究所在使用本手册前，必须确认已仔细研究过YFO/YFOA系列可编程控制器的使用手册。
若有对本手册不理解的地方，请与我们联系，我们将给您详尽的解释。
第1章概述. (1)1.1 系统配置要求. (1)1.2 EasyLad 的主界面. (1)1.3 画梯形图的几点注意事项. (1)1.4 画梯形图的几点建议. (2)第2章梯形图编程. (4)2.1 梯形图编程环境的典型界面. (4)2.2 如何移动光标、插入和删除元件. (4)2.3 如何快速修改一个元件. (4)2.4 如何快速修改一个标号. (5)2.5 如何在梯形图中放置注释. (5)2.6 文件菜单的使用. (7)2.7 编辑菜单的使用. (8)2.8 视图菜单. (10)2.9 放置菜单. (11)2.10 编程菜单. (12)2.11 工具菜单. (12)2.12 窗口菜单. (16)第3章监控和调试程序. (18)3.1 监控环境的典型界面. (18)3.2 控制菜单的使用. (18)3.3 如何改变PLC部的元件的值 (19)3.4 十进制和十六进制的显示切换 (20)3.5 在程序中放置断点 (20)3.6 设置程序以单扫描周期方式运行 (21)3.7 如何使定时器的定时或计数器的计数提前完成 (21)第4章YFO/YFOACo m通讯控件说明 (22)4.1 概述 (22)4.2 属性 (22)4.3 方法 (32)4.4 事件 (39)第5章YFOANe通讯控件说明 (40)4.1 概述 (40)4.2 属性 (40)4.3 方法 (52)4.4 事件 (59)4.5 应用例子 (59)第1章概述EasyLad 是为YF 系列PLC 设计的梯形图编辑与监控环境，它采用全中文核的 基于WINDOWS 作系统的多文档界面，具有易学易用，操作方便，梯形图编辑功 能强大等优点，可显著地提高编程效率。
易普拉格 操作手册
易普拉格操作手册（最新版）目录一、软件简介二、功能详解1.功能一2.功能二3.功能三三、操作步骤1.步骤一2.步骤二3.步骤三四、常见问题与解答五、附录正文【软件简介】易普拉格是一款集多种功能于一身的软件，适用于个人和企业用户。
该软件凭借其强大的功能和简洁的界面，深受广大用户的喜爱。
易普拉格致力于为用户提供高效的工作方式，帮助用户轻松应对各种工作挑战。
【功能详解】易普拉格软件主要包括以下三个功能模块：1.功能一：文件管理文件管理功能可以让用户方便地创建、编辑、保存和共享各种格式的文档。
此外，该功能还支持云端存储，让用户随时随地访问文件。
2.功能二：日程管理日程管理功能可以帮助用户合理安排工作、学习和生活，提高时间利用率。
用户可以设置任务、提醒和日历，确保重要事项不会遗漏。
3.功能三：团队协作团队协作功能支持多人实时在线编辑文档，提高团队工作效率。
用户还可以通过该功能分配任务、交流想法和共享资源，实现高效协同工作。
【操作步骤】以下是使用易普拉格软件的具体操作步骤：1.步骤一：安装与登录首先，用户需要在官方网站下载并安装易普拉格软件。
安装完成后，使用注册邮箱和密码登录。
2.步骤二：功能选择与操作登录后，用户可以根据需求选择不同的功能模块。
例如，点击“文件管理”进入文件管理界面，选择“日程管理”进入日程管理界面等。
3.步骤三：设置与帮助在软件界面的右上角，用户可以找到设置和帮助按钮。
通过设置，用户可以调整软件的一些参数，如界面语言、备份选项等。
帮助按钮则提供了详细的操作指南和常见问题解答。
【常见问题与解答】1.问：断网后，我在易普拉格创建的文档还能保存吗？答：可以。
易普拉格支持离线创建和编辑文档，只要联网后，文档会被自动同步到云端。
2.问：如何邀请团队成员加入协作？答：在团队协作功能界面，点击“邀请成员”按钮，输入被邀请人的邮箱地址即可。
被邀请人收到邮件后，点击链接即可加入团队。
Protege4.0使用说明
Protege4.0使用说明OWL-Lite∙它是OWL中句法最简单的一种子语言。
∙对于简单的继承或者约束，它就显得非常适用。
∙一般用于合并同类字典和简单继承。
∙l ite是清淡的意思OWL-DL∙O WL-DL较之OWL-Lite，它的表达能力加强了。
是基于描述逻辑的(Description Logics)，所以以DL后缀。
∙正是因为有了描述逻辑，使自动推理成为了可能。
∙凡是遵循OWL-DL规范的本体都有可能自动计算类的继承性和检测本体之间的矛盾。
因此一般用于要推理本体之间的某种关系或者验证本体是否存在矛盾性，比OWL-Lite更进了一步。
∙这个教程就是基于OWL-DL的。
OWL-Full∙O WL-Full是最具有表达能力的子语言了。
∙它适用于高表达性的场合，如果要把一个事物完整的、精确的、力求无二义性地表达出来，它就非常适用。
∙但正因为它把约束定义太死，所以已经不适合做推理了，一旦推理，会出现大量的矛盾，也不适合进行合并工作，因为它很难与别的本体兼容。
如何选择你需要的子语言∙以下2个建议你可以参考下∙选择Lite还是DL，在于你觉得用Lite来创建本体，是否已经够用。
∙选择DL还是Full，在于你觉得是自动推理更重要，还是精确表达更重要。
DL使建模更灵活，Full使建模更完整更精确、表达力更强。
∙注意：Protégé 4在编辑DL和Full的时候并没有什么明显区别，尺度把握在你自己心目中。
OWL本体的重要组成部分在早期的Protégé版本中，你们会发现这样的术语，Protégé frames Instances, Slots and Classes，3个重要的部分是：Instances、Slots、Classes，其实就对应OWL本体中的如下三个部分，它们是：Individuals个体。
代表一个领域里面的对象。
可以理解成一个类的实例（instances of classes）。
easymock技术手册
EasyMock使用说明Mock 方法是单元测试中常见的一种技术，它的主要作用是模拟一些在应用中不容易构造或者比较复杂的对象，从而把测试与测试边界以外的对象隔离开。
编写自定义的Mock 对象需要额外的编码工作，同时也可能引入错误。
EasyMock 提供了根据指定接口动态构建Mock 对象的方法，避免了手工编写Mock 对象。
本文将向您展示如何使用EasyMock 进行单元测试，并对EasyMock 的原理进行分析。
1.Mock 对象与 EasyMock 简介1.1.单元测试与 Mock 方法单元测试是对应用中的某一个模块的功能进行验证。
在单元测试中，我们常遇到的问题是应用中其它的协同模块尚未开发完成，或者被测试模块需要和一些不容易构造、比较复杂的对象进行交互。
另外，由于不能肯定其它模块的正确性，我们也无法确定测试中发现的问题是由哪个模块引起的。
Mock 对象能够模拟其它协同模块的行为，被测试模块通过与Mock 对象协作，可以获得一个孤立的测试环境。
此外，使用Mock 对象还可以模拟在应用中不容易构造（如HttpServletRequest 必须在Servlet 容器中才能构造出来）和比较复杂的对象（如JDBC 中的ResultSet 对象），从而使测试顺利进行。
1.2.EasyMock 简介手动的构造 Mock 对象会给开发人员带来额外的编码量，而且这些为创建 Mock 对象而编写的代码很有可能引入错误。
目前，有许多开源项目对动态构建 Mock 对象提供了支持，这些项目能够根据现有的接口或类动态生成，这样不仅能避免额外的编码工作，同时也降低了引入错误的可能。
EasyMock 是一套用于通过简单的方法对于给定的接口生成 Mock 对象的类库。
它提供对接口的模拟，能够通过录制、回放、检查三步来完成大体的测试过程，可以验证方法的调用种类、次数、顺序，可以令 Mock 对象返回指定的值或抛出指定异常。
通过 EasyMock，我们可以方便的构造 Mock 对象从而使单元测试顺利进行。
Easysoft 用户手册
Analysis with the Easysoft Easysoft 数据分析软件使用方法Printing Status印刷出版状况Revision 版本号Month/Year 出版月/年Version 软件版本1××Edition 1 05/06 1.1Easysoft数据分析方法Ⅰ.样品数据Sample Data (4)1.运行一次扫描Run One Scan (4)2.运行自动测量Run Automatic Measurements (4)2.1.中断测量Abort Measurements (5)2.2.谱图profiles (5)2.3.隐藏/显示谱图Hide/Show profiles (6)3.保存文件Save a file (6)3.1.缺省目录Default Directory (6)3.2.保存Save As (7)3.3.关闭文件Close File (7)4.参比模式Reference Mode (8)5.弯月形液面的设定Meniscus Setting (8)6.样品池底部位置的设定Setting of the bottom of the cell (8)7.动态变化值计算Compute Kinetics (9)7.1.平滑动态变化值曲线Smooth the Kinetics (9)Ⅱ.比较Comparison (10)1.打开样品数据分析Open Sample Analysis (10)2.样品比较Sample Comparison (10)2.1.动态变化值计算Kinetics Calculation (10)2.2.平滑动态变化值曲线Smooth the kinetics (11)2.3.Turbiscan稳定性参数（TSI） (11)2.4.表格Table (12)2.5.警告限Warning Level (12)Ⅲ. 附件Appendices (13)1.显示数据点Display Data Points (13)2.放大Zoom (13)3.打印选项Print Option (13)4. 复制图表和表格Copy Graphs and Table (13)4.1. 复制单个图表Copy Individual Graphs (13)4.2.复制所见景象Copy View (14)4.3.复制表格Copy Table (14)5.测量设置Measurement setup (14)6.Turbisoft文件转换Turbisoft files conversion (14)Ⅰ.样品数据Sample Data1.运行一次扫描Run One Scan1．鼠标左键单击“Sample data”键2．鼠标左键单击绿色开始按钮3．出现一个对话框显示“Acquire a single scan(获得一次扫描)”a．如果你想要做一次扫描请单击Yesb．如果你想要做更多次数的扫描请单击No，参照接下来的章节进行2.运行自动测量Run Automatic Measurements1．鼠标左键单击“Sample data”键2．在“Duration(持续时间)”一栏中输入总的分析持续时间3．在“Interval(时间间隔)”一栏中输入两次扫描之间的时间间隔4．鼠标左键单击绿色开始按钮图1.自动测量2.1.中断测量Abort Measurements1． 停止扫描过程请单击红色按钮 2． 出现一个对话框显示：“Really stop the acquisitions?真的要停止数据收集?”a ． 如果你想要停止数据收集请单击Yesb ． 如果你想要继续数据收集请单击No图2.中止测量注意――――只要单击“Yes ”或者“No ”而不是单击测量继续2.2.谱图 profiles在BST 中显示谱图，在同一个图表中包括了透射光（以T 为标记）和背散射光(BS) 注意――――当T>0.2％时，T 的值才在图表中显示，当T<0.2％时只显示BS 。
ivtools包用法 -回复
ivtools包用法-回复文章标题：ivtools包使用指南：掌握精美矢量图形绘制的利器引言：ivtools是一个功能强大的开源工具包，用于创建和编辑矢量图形。
其提供了丰富的绘图工具和交互式界面，使得用户可以轻松地绘制各种复杂的图形，包括曲线、多边形、文本等。
本文将一步一步为您介绍ivtools的使用方法，帮助您从菜鸟到专家，掌握这一精美矢量图形绘制的利器。
第一步：安装和配置ivtools包1. 下载ivtools包：您可以从项目的官方网站或GitHub页面上下载最新版本的ivtools包。
2. 解压下载文件：将下载的压缩包解压至您希望安装ivtools的目录中。
3. 配置环境变量：将ivtools的可执行文件目录添加到您的系统环境变量中，以便在任何位置都能够运行ivtools。
第二步：启动ivtools绘图界面1. 打开终端或命令行窗口：在您的操作系统中找到合适的终端或命令行工具，以便执行ivtools命令。
2. 进入ivtools目录：在终端中使用cd命令进入您解压的ivtools目录。
3. 运行ivtools：输入ivtools命令，按下回车键，将启动ivtools的图形用户界面。
第三步：绘制基本图形1. 选择绘图工具：在ivtools界面中，您可以看到各种绘图工具的按钮，如画笔、橡皮擦、直线等。
点击相应的按钮以选择您要使用的绘图工具。
2. 绘制图形：根据您选择的绘图工具和需要的形状，点击界面上的绘图区域，开始绘制图形。
例如，如果您选择了直线工具，则可以在点击两个点之间绘制一条直线。
3. 调整图形属性：ivtools允许您修改绘制图形的属性，如颜色、线条粗细、填充等。
通过界面上的属性面板，您可以轻松地调整这些属性，使得绘制出的图形更加美观。
第四步：编辑和修改图形1. 选择图形选择工具：ivtools提供了用于选择和编辑已绘制图形的工具。
点击界面上的“选择”按钮，选择图形选择工具。
2. 选择要编辑的图形：在界面上点击您想要选择编辑的图形，该图形将被选中并显示出编辑手柄。
easyfeature 操作手册
《easyfeature 操作手册》一、easyfeature 操作手册简介easyfeature 是一款功能强大的软件，能够帮助用户快速、高效地完成各种任务。
在本操作手册中，我们将深入探讨 easyfeature 的功能和操作方法，为您提供全面的指导。
二、easyfeature 的基本功能easyfeature 拥有多种功能，包括但不限于：1. 数据导入和导出：easyfeature 支持多种数据格式的导入和导出，方便用户进行数据交换和整合。
2. 数据处理和分析：easyfeature 提供丰富的数据处理和分析功能，可以帮助用户快速获取并分析数据。
3. 自定义功能：easyfeature 允许用户根据自己的需求进行功能定制，提供个性化的操作体验。
4. 任务调度和监控：easyfeature 能够帮助用户进行任务调度和监控，确保任务的顺利进行。
5. 其他功能：除了以上功能外，easyfeature 还拥有许多其他实用的功能，让用户能够更便捷地完成工作。
三、使用 easyfeature 的操作方法1. 数据导入和导出：在 easyfeature 中，数据导入和导出非常简单。
用户只需点击“导入”或“导出”按钮，选择相应的文件或目录，即可完成数据的导入和导出操作。
2. 数据处理和分析：easyfeature 提供了丰富的数据处理和分析工具，包括数据清洗、变量筛选、模型建立等功能。
用户可以根据自己的需求，选择相应的工具进行操作。
3. 自定义功能：easyfeature 允许用户根据自己的需求进行功能定制。
用户可以通过简单的配置，完成相应功能的定制化操作。
4. 任务调度和监控：用户可以通过 easyfeature 的任务调度和监控功能，轻松管理和监控任务的运行情况。
通过界面的直观展示，用户可以及时了解任务的进度和状态。
四、easyfeature 的个人观点和理解在我看来，easyfeature 是一款非常实用的软件。
easyfeature 用户手册
《easyfeature 用户手册》在这篇文章中，我将向您介绍 easyfeature 评台的使用方法和注意事项，帮助您更好地利用这一工具来进行产品开发和管理。
这篇文章将从易到难地介绍 easyfeature 的基本概念、功能和操作方法，希望能够让您对这一工具有一个深入的理解。
第一部分：easyfeature 的基本概念1. 什么是 easyfeature？easyfeature 是一个产品开发和管理工具，它可以帮助团队更好地管理产品需求、迭代和发布。
它拥有一套强大的功能和灵活的操作方式，适用于各种不同规模的团队和项目。
2. easyfeature 的优势和价值easyfeature 提供了一站式的解决方案，能够帮助团队快速高效地进行产品开发和管理。
它能够帮助团队更好地理解用户需求，有效地进行需求评估和迭代优化。
第二部分：使用 easyfeature 的方法和技巧3. 如何使用 easyfeature？在使用 easyfeature 之前，您需要注册账号并创建项目。
接下来，您可以创建特性、添加用户故事和进行迭代计划。
在开发过程中，您可以使用 easyfeature 进行需求跟踪和版本控制。
4. 如何合理规划和管理需求？在使用 easyfeature 进行需求管理时，您需要合理规划和管理特性、用户故事和迭代计划。
您可以利用 easyfeature 提供的统计和报表功能进行数据分析和决策支持。
第三部分：个人对 easyfeature 的观点和理解5. 我对 easyfeature 的看法作为一名产品经理，我个人非常喜欢使用 easyfeature 进行产品需求管理和迭代规划。
它的简洁易用和灵活多样的功能让我能够更好地管理项目，并且能够根据实际情况进行动态调整。
总结回顾：easyfeature 用户手册在本文中，我向您介绍了 easyfeature 的基本概念、使用方法和个人观点。
希望这篇文章能够帮助您更好地使用这一工具，提高产品开发和管理的效率。
easyC v4使用说明4.0
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放大 ：增大流程图显示的比例尺寸 缩小 ：减小流程图显示的比例尺寸 缩放：缩放比例显示
Network Optimization Expert Team
1.4、编程区
每一个新的程序都会有一个I/O定义模块，变量定义模块（Globales、Variables），开始模块(BEGIN)和结 束模块(END)。 I/O模块和变量定义模块应当在开始编程之前定义。 在每一个程序里，开始模块标识程序模块代码的第一个模块；结束模块标识程序模块代码的最后一个模块。 你必须放置所有的模块在这两个模块之间。 插入模块：在模块区用鼠标左键点住相应模块，拖动到编程区的开始和结束模块之间，放开鼠标，然后只要设 置好模块的属性就行了。 编辑模块（Edit）：左键双击修改，也可单击右键，选择Edit Block。 复制模块（Copy）：单击右键，选择copy；或者按住ctrl键，拖拽模块。将复制的模块放到你需要放置它的位 置。 剪切模块（Cut）：单击右键，选择cut。 粘贴（Paste） ：单击右键，选择Paste。 删除模块（Delete）：选定需要删除的模块单击右键选择Delete。
2.选
择变 量运 算符 号
Network Optimization Expert Team
2.2.2当循环While Loop
当循环模块编程范例1：
以编碰撞开关为例： 右边每一个模块的属性在后面的注 释里面都有说明 首先在变量定义模块（Variables） 里面定义了一个变量a，然后拖入一 个碰撞检测模块，再拖入当循环模 块，条件里面设置a=1，表示碰撞 开关处在断开的状态，在当循环里 面拖入一个马达模块设置为运转， 再拖入一个碰撞检测模块，属性和 当循环外面的碰撞检测模块的属性 一样，； 在当循环外面拖入一个马达模块设 置为停止； 那么这个程序的功能为：当碰撞开 关没碰到时马达到家转，直到碰撞 开关碰到时，马达才停止
Erime操作教程
一，E-Prime组成部分1.实验组成10部分：1.Instruction指导语：“无限时间”，按键消失（注：不要用轻易按到的键），格式为图片（易于排版）。
操作性原则：说明先出现什么，后出现什么，被试如何反应。
范例：2.Fixation注视点：呈现时间500~800 ms，自动消失，大小30字号以上。
3.Stimulus刺激界面：4.Probecueing探测线索：出现在探测界面前面，用于去习惯化和让被试做好准备。
5.Probe探测界面：6.Feedback反馈界面：对被试反应作出正确或错误的反应。
时间：1000~2000ms7.ISI ，SOA，Interval刺激间隔：ISI：上一个刺激终点~下一个刺激起点。
SOA：前一刺激起点~下一个刺激起点)。
两者的关系SOA=ISI+DurationInterval：刺激与目标，目标和其他界面的间隔时间。
8.Buffer Interval 实验缓冲：500~1200ms。
被试作反应后推迟下一个Trial的呈现。
反馈界面也起到缓冲的效果。
9.Mask 掩蔽界面：400~1000ms，常用于启动效应实验和记忆实验。
在记忆实验中，消除刺激的感觉记忆。
10.Exp End 结语界面：1000~1500ms，如，“实验完毕，谢谢您的参与！”2.实验程序控制5要素Duration呈现时间：固定时间，变化时间（设置变量或数组），无限时间（“-1”，“infinite”）Mode呈现方式（=消失方式）：自动（不需要设置），按键（无限时间+设置按键在刺激界面），反应（无限时间+反应键在探测界面），自动+反应（固定时间+反应键）Format呈现格式：刺激物属性：字符（字体，大小，前景颜色？，背景颜色，下划线），图片（尺寸大小，文件大小，亮度，色调？，饱和度?，灰度？，对比度）；位置；边框（大小，颜色）Response反应方式：键盘反应（字母，数字，功能键）；语音反应；外接反应键；脚踏板反应Data logging数据收集：反应时Response Time ；RT ，正误Accuracy；ACC，反应Response；RESP，实验流程示意图3.实验过程Procedure：Session Procedure全过程；CEP Core Experimental Procedure（运行一次是一次Trial，一个Block=指导语+CEP+结束语）4.实验设计的4模式：Paralleling并联模式：（图B）完成CEP1再完成CEP2。
同源建模详细讲解-整理版
除SAVES外，Molprobity也是一个常用的在线模型分析工具，其 网址为：/index.php
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PROCHECK: 以PDB中高分辨的晶体结构参数为参考，给出提交模 型的一系列立体化学参数（主链）。其输出的结果包括：拉氏图， 主链的键长与键角，二级结构图，平面侧链与水平面之间的背离程 度等。 WHATCHECK:包含大量的检测项，可以针对提交的蛋白结构与正 常结构之间的差异，产生一个非常长而且详细的报告。 ERRAT: 计算0.35 nm范围之内，不同原子类型对之间形成的非键 相互作用的数目（侧链）。原子按照C、N、O/S进行分类，所以 有六种不同的相互作用类型：CC、CN、CO、 NN、 NO、 OO。 得分＞85比较好。
Verify_3D
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78.74% of the residues had an averaged 3D-1D score > 0.2
ERRAT
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Overall quality factor值越高越好，一般高解析度的晶体结构该值 可以达到95，而对于解析度一般的来说该值只能到91左右。本例 中的ERRAT值为68.280, 还需要继续优化改进。
绘制模型的能量图
DOPE(Discrete Optimized Protein Energy) Energy
模型质量检验
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模型提交SAVES服务器（Structural Analysis and Verification Server）进行检验
PROCHECK
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PROCHECK：本部分主要需要的是拉氏图（Ramachandran Plot） ，可下载ps格式、PDF格式以及JPG格式。落在核心区+允许区+最 大允许区的碱基百分比大于95%的模型质量很好。
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⑤点击，align模板
⑥点击，align模板 和目标序列
⑦点击，生成模型
⑧选中生成的模型， 进行预览
⑨对模型显示进行 设置
点击，选择 （可多选）
点在蓝色区域内大于 90%时该模型才算好 模型
EasyModeller 4.0 使用说明
----By Xm 中科院昆明动物研究所 2014.3.11
Before using
需要安装的软件：
• Python(2.5,2.6,2.7系列均可，3系列不可)
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Modeller（） Easymodeller 4.0 RasMol (windows版 ) Office Excel
*以上软件都能在官网或网站上下载，软件需要安装在C盘默 认路径下，easymodeller 需安装在modeller目录下，所有 安装路径中都不要出现中文！！
பைடு நூலகம் 同源建模的基本步骤
1、模板蛋白搜索：
PDB数据库、BLAST(或PSI-BLAST) 、获取模板（一个或多个）
2、比对结果的校正 3、主链生成 4、环区建模 5、模型优化 6、合理性检测
模板.pdb文件准备
选择align结果中的蛋白， 就可以找到相应的蛋白3D 结构，下载pdb文件即可
同源度，>30% 时方可用 与目标蛋白 序列同源的 蛋白
Start using
右击，win7或vista系统下 选择“以管理员身份运行”
出来的界面
①目标氨 基酸序列， 无空格， 需全部大 写 ②导入模 板PDB文 件 ③勾选需 要比对的 模板 ④点击开始比 对选中的模板