western-blot条带分析报告及解决方法
Western blot结果异常原因分析及对策(个人总结)
结果异常
原因
对策
1.假阴性,不出现 ⑴一抗、二抗等不匹配
⑴重新订购试剂,认真选取一抗与组织
蛋白条带或者蛋
种属,并设置内参。
白条带很弱
⑵一抗或/和二抗浓度低
⑵增加抗体浓度,延长孵育时间
⑶封闭剂或无关蛋白与一抗或二抗有交叉反应 ⑶封闭用温和去污剂,如TWEEN 20,
⑷SDS-PAGE 电泳上样 前, 煮沸 10
min,以增强蛋白质解聚变性
⑸蛋白样本降解
⑸新鲜制备标本,使用蛋白酶抑制剂
3. 背 景 非 特 异 染 ⑴封闭不充分
⑴延长封闭时间,更换合适的封闭剂
色过强
(脱脂奶粉,BSA,血清等)
⑵一抗浓度过高
⑵增加一抗稀释倍数
⑶抗体孵育温度过高
⑶4℃孵育
⑷二抗非特异性结合或与封闭剂交叉反应
(无关蛋白中含有与待测抗原结构类似多肽(共 或更换封闭剂(脱脂奶、BSA或明胶)
同抗原表位),与特异抗体发生交叉反应)
⑷一抗不识别目的物种的靶蛋白
⑷检查说明书,或做 ClustalW 比对,
设阳性对照
⑸样本中无靶蛋白或靶蛋白含量过低
⑸模索条件,设置阳性对照,增加标本
(抗原无效)
上样量,样本制备时使用蛋白酶抑制剂,
4. 背景出现不均 匀污点、斑点
5. 转膜不充分
⑴转膜时有气泡或抗体分布不均 ⑵抗体与封闭剂结合 ⑶镊子或玻璃平皿污染 ⑷膜湿润不够 ⑸标记膜采用不规范笔 ⑴膜没有完全均匀湿透 ⑵靶蛋白分子量小于 10,000 ⑶靶蛋白等电点等于或接近转移缓冲 液 pH 值 ⑷甲醇浓度过高 ⑸转移时间不够Thick gel
⑷设置二抗对照(不加一抗),降低二抗
westernblot条带分析
w e s t e r n b l o t条带分析(总6页)-CAL-FENGHAI.-(YICAI)-Company One1-CAL-本页仅作为文档封面,使用请直接删除近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。
特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。
其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。
限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。
Western荧光检测取决于抗原含量—一抗敏感度—二抗敏感度—底物敏感度—显影和定影效率这一系统。
我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。
再无,则压过夜。
共3张片,根据每次结果调整。
其中两张片子的压法如下描述: 先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。
这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。
然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。
取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。
在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。
荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。
现象-- - - - - - - - - - - - - - - - - - --原因 - - - - - - - - - - - - - - - - --- -- -- --- -- ---解决反影(白色条带,黑色背景) ---- -- -1 HRP过高(背景较高) - - - - - - - - ---- - - - 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1显影后膜上条带处变为黄色---- - -2 HRP过高(敏感性太高)- - - - - - - - - ---- -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2信号弱或无---- - - - - - - - - - ---- 3 HRP过高引起底物迅速耗竭- - - - - -- - - -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3--- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --4 抗体-抗原系统敏感性过低- --- - - - - - - 提高抗体浓度/蛋白上样量*注4- - - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --5 转膜不充分/过转- -- -- - - -- - - - - ---- -优化转膜条件*注5-- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - - -6 HRP或底物活性降低---- - - -- - - -- - ----测试活性或选用敏感底物 *注6高背景---- - - - - - - - - - - - - - - -7 HRP过高(背景较高) - -- - - - - - - - - - -- 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7---- - - - - - - - - - - - - - --- - - ----8 封闭时间不足- - - - - - - - - - - -- - - - -- 延长封闭时间4度过夜最好*注8--- - - - - - - - - - - - - - --- - -- -- -9 抗体与封闭液有交叉----- - - - - - - - - - -更换封闭液(如3%BSA的TBST)*注9--- - - - - - - - - - - - - - - -- - -- - -10 TBST洗脱不足 - - - - - - - ---- - --- - - -增加洗脱时间、次数、用量*注10---- - - - - - - - - - - - - - -- - -- - --11 暴光时间过长 - - - - - ---- - - ------ -- --降低暴光时间*注11- - - - - - - - - - - - - - - - -- - - ----12 抗原-抗体浓度过高 - - - - - - -- --- - - - 降低抗体浓度或蛋白上样量*注12条带内无显影的白点----------------13 转膜不良(如有气泡在胶-膜之间) -- --精细操作*注13--- - - - - - - - - - - - - - - -- - - ----14 膜平衡不均/油脂污染- - - - - - - - - - - 按说明书平衡膜/戴手套用平头镊子持膜*注14---- - - - - - - - - - -- ------------ -- 15 膜与X光片间有气泡- -- - - - - - - - - - --显影前去除气泡*注15非特异性条带- - - - - --------- -- - -16 抗体交叉反应- - - - - - - - - - - -- -- - --至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注16- - - - - - - - - - - - - - - --- ---- - - -17 SDS非特异性结合蛋白条带 - - --- - ---使用无SDS转膜液*注17散在小圆斑 - - - - - -- - -- -- - - ---18 封闭液有杂质颗粒- -- - --------- ------- 静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层*注18*注1 其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
western blot条带分析
近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。
特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。
其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。
限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。
Western荧光检测取决于抗原含量—一抗敏感度—二抗敏感度—底物敏感度—显影和定影效率这一系统。
我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。
再无,则压过夜。
共3张片,根据每次结果调整。
其中两张片子的压法如下描述:先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。
这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。
然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。
取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。
在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。
荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。
现象---------------------原因-------------------------------解决反影(白色条带,黑色背景)-------1HRP过高(背景较高)---------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1显影后膜上条带处变为黄色------2HRP过高(敏感性太高)--------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2信号弱或无-----------------3HRP过高引起底物迅速耗竭----------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3-------------------------4抗体-抗原系统敏感性过低----------提高抗体浓度/蛋白上样量*注4------------------------5转膜不充分/过转------------------优化转膜条件*注5------------------------6HRP或底物活性降低-----------------测试活性或选用敏感底物*注6高背景-------------------7HRP过高(背景较高)--------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7--------------------------8封闭时间不足------------------延长封闭时间4度过夜最好*注8-------------------------9抗体与封闭液有交叉---------------更换封闭液(如3%BSA的TBST)*注9------------------------10TBST洗脱不足------------------增加洗脱时间、次数、用量*注10-------------------------11暴光时间过长---------------------降低暴光时间*注11------------------------12抗原-抗体浓度过高--------------降低抗体浓度或蛋白上样量*注12条带内无显影的白点----------------13转膜不良(如有气泡在胶-膜之间)----精细操作*注13-------------------------14膜平衡不均/油脂污染-----------按说明书平衡膜/戴手套用平头镊子持膜*注14-----------------------------15膜与X光片间有气泡--------------显影前去除气泡*注15非特异性条带------------------16抗体交叉反应------------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注16 -------------------------17SDS非特异性结合蛋白条带---------使用无SDS转膜液*注17散在小圆斑-----------------18封闭液有杂质颗粒--------------------静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层*注18*注1其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
Western Blotting 各种问题及解决办法
可能原因 1.抗体浓度过高 2.封闭液选择不当
3.封闭不完全
背景高且均一
4.抗体与封闭液中其他蛋 白发生交叉反应 5.清洗不充分 6.曝光时间过长
7.膜出问题
8.缓冲液污染或长菌 1.抗体浓度过高 2.封闭液选择不当
3.封闭不完全
背景高,且以斑点形式存 在
4.抗体与封闭液中其他蛋 白发生交叉反应
11.剥膜造成影响
12.膜上抗原降解 13.转好的膜存放时间过长 1. 抗体浓度过高 2.SDS造成非特异性结合 3. 二抗试剂的非特异结合 4.一抗特异性差 1.抗体浓度过高 2.上样量过高 抗体浓度过高
转膜不完全
பைடு நூலகம்
可能采取的措施 降低抗体(一抗/二抗)浓度 比较不同封闭液 根据不同的体系优化封闭液 提高封闭物浓度 优化封闭时间和(或)温度,室温下至少1小时或4℃过夜 在封闭液中添加终浓度0.05%的Tween-20 用含终浓度0.05%的Tween-20的封闭液稀释抗体 更换封闭液 avidin-biotin系统避免使用奶粉,奶粉中含有biotin 检测交叉反应:封闭一张干净的不含蛋白的膜,抗体孵育后检测 增加清洗次数及清洗液体积 如果之前未添加Tween-20,可添加Tween-20至终浓度0.05% 缩短曝光时间 确保转膜前,已根据厂商指导将膜彻底浸润 更换新膜 确保膜始终有足够的液体覆盖,避免干掉 避免徒手操作,应配戴手套,使用镊子 每一步孵育都应确保充分 重新配制缓冲液 降低抗体(一抗/二抗)浓度 比较不同封闭液 根据不同的体系优化封闭液 提高封闭物浓度 优化封闭时间和(或)温度,室温下至少1小时或4℃过夜 在封闭液中添加终浓度0.05%的Tween-20 用含终浓度0.05%的Tween-20的封闭液稀释抗体 更换封闭液 avidin-biotin系统避免使用奶粉,奶粉中含有biotin 检测交叉反应:封闭一张干净的不含蛋白的膜,抗体孵育后检测 确保转膜前,已根据厂商建议将膜彻底浸润 避免徒手操作,应配戴手套,使用镊子 更换新膜 确保膜始终有足够的液体覆盖,避免干掉 每一步孵育都应确保充分 膜过多时,应避免相互堆叠 操作时应小心,对膜造成的损伤会产生非特异性反应 使用新的缓冲液 用前过滤 确保转膜仪、杂交仪等仪器清洁无污染 确保转膜后膜上没有残留的胶 转膜结束后,染胶以确定转膜效率 转膜时胶与膜应充分接触 确保转膜时滤纸与膜装配正确 按厂商指导将膜充分浸润
WB中常见问题和解决方法(学术论文)
1.电泳中常出现的一些现象:●︶条带呈笑脸状原因:凝胶不均匀冷却,中间冷却不好;电泳系统温度偏高。
●︵条带呈皱眉状原因:可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全。
●拖尾原因:样品溶解不好。
●纹理(纵向条纹)原因:样品中含有不溶性颗粒。
●条带偏斜原因:电极不平衡或者加样位置偏斜。
●条带两边扩散原因:加样量过多。
2.Western blot结果中背景较高可能的原因及建议:●膜封闭不够延长封闭的时间;选择更加适合的封闭液。
●一抗稀释度不适宜对抗体进行滴度测试,选择最适宜的抗体稀释度。
●一抗孵育的温度偏高建议4℃结合过夜。
●选择的膜容易产生高背景一般硝酸纤维素膜的背景会比PVDF膜低。
●膜在实验过程中干过实验过程中要注意保持膜的湿润。
●检测时曝光时间过长减少曝光时间。
3.Western blot结果中杂带较多可能的原因及建议:●目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点、糖基化位点、乙酰化位点等),本身可以呈现多条带。
查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白实际大小。
●目的蛋白有其它剪切本查阅文献或生物信息学分析可能性。
●样本处理过程中目的蛋白发生降解加入蛋白酶抑制剂;样本处理时在冰上操作。
●上样量过高,太敏感适当减少上样量。
●一抗特异性不高重新选择或制备高特异性的抗体。
●一抗不纯纯化抗体●一抗或者二抗浓度偏高降低抗体浓度。
4.Western blot结果中无信号或显示信号弱可能的原因及建议:●检测样本不表达目的蛋白选择表达量高的细胞作为阳性对照,用于确定检测样本是否为阴性。
●检测样本低表达目的蛋白提高上样量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。
●转移不完全或过转移可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流。
●抗体不能识别测试种属的相关蛋白购买抗体前应当认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白。
WesternBlot结果条带分析
W e s t e r n B l o t结果条带全面分析1.空白原因:比较多,如果单纯一张没有任何显色,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的;解决办法:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题;上面的图片展示的是一点信号都没有,如果是这样大部分情况是抗体加错了;如果中间出现了细微的条带,可能原因是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,显色液失效;另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片;2.高背景原因:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够;解决办法:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数;3.非特异性条带原因:一抗非特异性与蛋白结合解决办法:更换一抗4.条带中出现边缘规则的白圈原因:电转中膜和胶之间存在气泡;解决办法:转膜前去掉膜和胶之间的气泡5.出现黑点和黑斑原因:膜上其他部位与一抗或者二抗非特异性结合解决办法:封闭结束之后要洗;6.条带拖尾原因:蛋白量太大,一抗浓度和时间太长解决办法:根据情况调整蛋白量,同时一抗浓度和时间也可以缩短;7.出现非均一性背景原因:膜可能曾经干过解决办法:在每一步的操作过程中,都需要注意不要让膜干;8.某个条带变形原因:SDSPAGE胶中存在气泡或者某不溶性颗粒解决办法:配胶过程中要小心,使用无杂质的液体;另外配胶用的水,SDS,Tris缓冲液要注意不要有杂质;9.条带呈哑铃状原因:配置胶有问题,胶凝固后不均一解决办法:把胶配好,不合格的胶坚决不用10.最边缘条带弯曲原因:电泳电流不均一解决办法:换用新的电泳槽;不使用两边的两孔其他问题1蛋白分子量偏高或者偏低;可能是胶的浓度与目的蛋白的浓度不对应;2蛋白质降解;蛋白质降解后很可能会在比原来位置低的地方出现主带,然后会出现一些其他带,最主要特点是所有的条带比正常的都低,并且条带模糊不清晰;3所有条带连成一片没有间隔;原因最可能是上样量过多,其次是样品弥散比如电泳长时间停止样品弥散;4整个条带呈“︶”状:凝胶冷却不均一,电泳槽老化;5整个条带呈“︵”:凝胶左右两头没有凝固好6溴酚蓝拖尾:样品溶解不好;7纵向的纹理:上样样品中存在不溶性颗粒8溴酚蓝很粗:浓缩胶浓缩效果不好,可能是浓缩胶太短,或者是浓缩胶配错;9在分离胶中跑不动:Tris-HClPH值不对,或者忘记加SDS;。
原因分析和解决方法在这里!
原因分析和解决方法在这里!
Western Blot虽是实验室最常用的蛋白分析技术,但是由于它步骤繁琐、操作流程长、影响因素多,所以,导致我们在做实验时会遇到各式各样的问题。
今天我们总结了一些WB实验中经常遇到的各种“奇葩”条带问题,并为你推荐了常用的解决方法,希望对大家有所帮助。
一、目标条带没有信号
二. 图片背景过高,难以分辨条带
三、 膜上出现黑点和黑斑
四、 出现非特异性条带
五、条带中出现整条白色空斑
六、条带中出现白圈
七、 条带拖尾
八、条带变形
九、条带呈哑铃装
十、最边缘条带弯曲
十一、背景非均一性
十二、 条带呈“微笑”或“倒微笑”状
十三、其他问题
以上是我们对WB条带出现各种状况及解决方法的一个总结,希望可以对大家有所帮助。
westernblot条带分析
近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。
特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。
其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。
限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。
Western荧光检测取决于抗原含量一一抗敏感度一二抗敏感度一底物敏感度一显影和定影效率这一系统。
我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。
再无,则压过夜。
共3张片,根据每次结果调整。
其中两张片子的压法如下描述:先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2 片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。
这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。
然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。
取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。
在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。
荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。
现象原因解决反影(白色条带,黑色背景) ----- 1 HRP 过高(背景较高) -----------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1显影后膜上条带处变为黄色 ------ 2 HRP过高(敏感性太高) -------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7延长封闭时间4度过夜最好*注8信号弱或无 ------------------ 3 HRP -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3------------------------ 4--- 提高抗体浓度/蛋白上样量*注4------------------------ 5---- 优化转膜条件*注5 ------------------------ 6 HRP-----* 6 过高引起底物迅速耗竭 ------------抗体-抗原系统敏感性过低 ---------- 转膜不充分/过转 --------------或底物活性降低 -------------------------------- 7 HRP过咼(背景较咼) --------------------------------- 8封闭时间不足 ---------------------------------------- 9——更换封闭液(如3%BS的TBST)*注9 ------------------------ 10 TBST----- 增加洗脱时间、次数、用量*注10 ------------------------ 11----降低暴光时间*注11------------------------ 12--- 降低抗体浓度或蛋白上样量*注12抗体与封闭液有交叉 ------------洗脱不足-------------暴光时间过长 ----------------- 抗原-抗体浓度过高--------------条带内无显影的白点 ----------- 13转膜不良(如有气泡在胶-膜之间)---- 精细操作*注13 ------------------------ 14膜平衡不均/油脂污染 ------------ --- 按说明书平衡膜/戴手套用平头镊子持膜*注14非特异性条带 ------------------ 16 抗体交叉反应 ---------------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注16----------------------- 15----显影前去除气泡*注15 膜与X 光片间有气泡 -----------使用无SDS专膜液*注17散在小圆斑-- ----- ----- -----18 封闭液有杂质颗粒--- ----------------- 静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层*注18*注1其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带•形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
Western Blot 结果条带全面分析
Western Blot 结果条带全面分析Q1. 啥也没有[原因]:比较多,如果单纯一张没有任何显色的X光片,最可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。
[解决办法]:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题。
[经验]:上面的图片展示的是一点信号都没有,如果是这样大部分情况是抗体加错了。
如果中间出现了细微的条带,可能原因是蛋白上样量太少,一抗浓度过低,ECL发光液失效。
另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片。
Q2. 高背景[原因]:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够[解决办法]:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。
[经验]:高背景可能是WB中最常见出现的问题,目的条带单一清晰,但是其他地方又弥漫性较为均一的背景(比较连续的)。
其实只要我们注意操作规范,不偷工减料就很容易避免,洗膜按照规定来5min*5次或者10min*3次,不要改成5min*3次,或者10min*2次。
Q3. 非特异性条带[原因]:一抗非特异性与蛋白结合[解决办法]:更换一抗[经验]:此种情况绝大多数是因为一抗不好,你无法判断那一条是目的条带。
如果实在没有更好的抗体,建议采用阴性对照和阳性对照来确定上述哪个条带是目的条带。
当然这种情况下有一种很小几率的可能是一抗浓度太高引起的非特异性结合。
Q4. 条带中出现边缘规则的白圈[原因]:电转中膜和胶之间存在气泡。
[解决办法]:转膜前去掉膜和胶之间的气泡[经验]:我们常常将电转液倒入一个盘子里,倒入的液体不能太多也不能太少,最好的高度是与放上第一层滤纸齐平,然后往滤纸上浇点转膜液,把电泳胶用清水清洗下,将电泳胶平铺到滤纸上,仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡,可以左右前后观察,不同方向观察之后确认无气泡,然后再往胶上面浇点电转液,用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧中间,使膜成U型,然后将U型的底部接触胶的中间,慢慢往两边放下膜,这样一般气泡很少。
western-blot实验报告
一、实验目的1.掌握Western-blot实验原理及方法应用2.巩固SDS-PAGE电泳相关操作3.学习PVDF转膜以及ECL显影技术二、实验原理Western-blot,中文为蛋白免疫印迹,其原理在电场的作用下将电泳分离的多肽从凝胶转移至一种固相支持体,然后用这种多肽的特异抗体来检测。
三、实验材料试剂:纯水、琼脂糖、TEMED、30%丙烯酰胺、pH8.8 Tris-HCl、pH6.8Tris-HCl、10%SDS、10%APS、转膜缓冲液、10×TBS、10×蛋白电泳缓冲液、TBST、脱色液、显色试剂A、B,显影液、定影液器材:台式离心机、玻璃板、微波炉、滤纸、PVDF膜、手套、转膜槽、海绵垫、玻璃棒、保鲜膜、胶片、摇床等。
四、实验步骤1、样品制备取相应组织,加入135 μl 无SDS的匀浆缓冲液,于冰浴中,匀浆器15 秒一次,匀两次,再加入15 μl 10%的SDS。
95°C水浴5分钟。
10000 g离心30分钟,取上清。
每管20 μl 分装。
组织与匀浆液的比例= 1:5-1:102、清洗玻璃板3、灌胶与上样(1)玻璃板对齐后放入夹中卡紧。
然后垂直卡在架子上准备灌胶(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶)。
(2)配12%分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
灌胶时,可用10ml枪吸取5ml胶沿玻璃放出,待胶面升到离玻璃板3cm即可。
然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。
(灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。
操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。
加水液封时要很慢,否则胶会被冲变型)。
(3)当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。
再等20 min使胶充分凝固就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。
(4)按前面方法配5%的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。
灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气泡产生。
western blot条带分析
近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。
特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。
其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。
限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。
Western荧光检测取决于抗原含量—一抗敏感度—二抗敏感度—底物敏感度—显影和定影效率这一系统。
我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。
再无,则压过夜。
共3张片,根据每次结果调整。
其中两张片子的压法如下描述:先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。
这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。
然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。
取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。
在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。
荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。
现象---------------------原因-------------------------------解决反影(白色条带,黑色背景)-------1HRP过高(背景较高)---------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1显影后膜上条带处变为黄色------2HRP过高(敏感性太高)--------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2信号弱或无-----------------3HRP过高引起底物迅速耗竭----------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3-------------------------4抗体-抗原系统敏感性过低----------提高抗体浓度/蛋白上样量*注4------------------------5转膜不充分/过转------------------优化转膜条件*注5------------------------6HRP或底物活性降低-----------------测试活性或选用敏感底物*注6高背景-------------------7HRP过高(背景较高)--------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7--------------------------8封闭时间不足------------------延长封闭时间4度过夜最好*注8-------------------------9抗体与封闭液有交叉---------------更换封闭液(如3%BSA的TBST)*注9------------------------10TBST洗脱不足------------------增加洗脱时间、次数、用量*注10-------------------------11暴光时间过长---------------------降低暴光时间*注11------------------------12抗原-抗体浓度过高--------------降低抗体浓度或蛋白上样量*注12条带内无显影的白点----------------13转膜不良(如有气泡在胶-膜之间)----精细操作*注13-------------------------14膜平衡不均/油脂污染-----------按说明书平衡膜/戴手套用平头镊子持膜*注14-----------------------------15膜与X光片间有气泡--------------显影前去除气泡*注15非特异性条带------------------16抗体交叉反应------------------至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注16 -------------------------17SDS非特异性结合蛋白条带---------使用无SDS转膜液*注17散在小圆斑-----------------18封闭液有杂质颗粒--------------------静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层*注18*注1其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
western blot条带分析
近几天回答了蛋白版几个有关压片和显影的帖子,发现在这一块还没有比较系统的论述。
特贡献了western显影常见问题及解决方案,是我的经验总结,以供大家参考。
其中绝大部分问题是我所遇到过的,其他个别我没遇到过的是参照pierce公司的说明书。
限于字数,语言比较简洁,如对其中内容有疑问或建议可跟帖。
Western荧光检测取决于抗原含量—一抗敏感度—二抗敏感度—底物敏感度—显影和定影效率这一系统。
我的经历认为确保万无一失的做法是如果看到荧光则压10~30s,看不到则同时压两张,10~30min洗一张,如果无则再补一张,1h后洗。
再无,则压过夜。
共3张片,根据每次结果调整。
其中两张片子的压法如下描述: 先剪一张比膜长2~3厘米的片子(以供贴胶带),然后剪2片细小透明胶带贴到片子的左右两边(贴时胶带留一半用于粘到封口膜上),然后将片子压到膜上,并使透明胶带留出的一半粘到封口膜上。
这样就固定了第一张胶片,就不会因为放、取第二张胶片而使第一张移动了。
然后放第二张胶片,与第一张片子贴在一起就行,注意片子要干燥,压片前用纸擦干封口膜,以避免被底物液体污染导致与下面一张粘在一起。
取时用手轻轻拂过就可以把上面片子与下面一张错开了,不要用手抠,否则下面一张也移动了。
在洗下面一张片子时一定要取掉粘在片子上的胶带,否则在胶带的地方会影响显影。
荧光经过下面一张胶片会稍微有些衰减,所以下面一张胶片感光稍微比上面一张强一些。
现象-- - - - - - - - - - - - - - - - - - --原因- - - - - - - - - - - - - - - - --- -- -- --- -- ---解决反影(白色条带,黑色背景) ---- -- -1 HRP过高(背景较高) - - - - - - - - ---- - - - 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注1显影后膜上条带处变为黄色---- - -2 HRP过高(敏感性太高)- - - - - - - - - ---- -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注2信号弱或无---- - - - - - - - - - ---- 3 HRP过高引起底物迅速耗竭- - - - - -- - - -至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注3--- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --4 抗体-抗原系统敏感性过低- --- - - - - - - 提高抗体浓度/蛋白上样量*注4- - - - - - - - - - - - - - - ---- - - - --5 转膜不充分/过转- -- -- - - -- - - - - ---- -优化转膜条件*注5-- - - - - - - - - - - - - - ---- - - - - -6 HRP或底物活性降低---- - - -- - - -- - ----测试活性或选用敏感底物*注6高背景---- - - - - - - - - - - - - - - -7 HRP过高(背景较高) - -- - - - - - - - - - -- 至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注7---- - - - - - - - - - - - - - --- - - ----8 封闭时间不足- - - - - - - - - - - -- - - - -- 延长封闭时间4度过夜最好*注8--- - - - - - - - - - - - - - --- - -- -- -9 抗体与封闭液有交叉----- - - - - - - - - - -更换封闭液(如3%BSA的TBST)*注9--- - - - - - - - - - - - - - - -- - -- - -10 TBST洗脱不足- - - - - - - ---- - --- - - -增加洗脱时间、次数、用量*注10---- - - - - - - - - - - - - - -- - -- - --11 暴光时间过长- - - - - ---- - - ------ -- --降低暴光时间*注11 - - - - - - - - - - - - - - - - -- - - ----12 抗原-抗体浓度过高- - - - - - -- --- - - - 降低抗体浓度或蛋白上样量*注12条带内无显影的白点----------------13 转膜不良(如有气泡在胶-膜之间) -- -- 精细操作*注13 --- - - - - - - - - - - - - - - -- - - ----14 膜平衡不均/油脂污染- - - - - - - - - - - 按说明书平衡膜/戴手套用平头镊子持膜*注14---- - - - - - - - - - -- ------------ -- 15 膜与X光片间有气泡- -- - - - - - - - - - --显影前去除气泡*注15非特异性条带- - - - - --------- -- - -16 抗体交叉反应- - - - - - - - - - - -- -- - --至少成倍稀释一抗/二抗(可4~10倍)*注16- - - - - - - - - - - - - - - --- ---- - - -17 SDS非特异性结合蛋白条带- - --- - ---使用无SDS转膜液*注17散在小圆斑- - - - - -- - -- -- - - ---18 封闭液有杂质颗粒- -- - --------- ------- 静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层*注18*注1 其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
western-blot条带分析及解决方法模板
*注1 其具体问题有二:一是背景较高,二是没有条带.形成机制为条带处HRP很快将底物耗竭,则不发光不使胶片感光而为白色,周围因背景HRP较低而持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
这种常见于高浓度抗体并且封闭/洗脱不好的情况下。
如果没有背景则就是原因3的现象。
在暗室可以看到条带周围荧光而条带处为暗。
如是则要么通过降低抗体解决,要么动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。
也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。
还有另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的现象。
其分析和解决同上。
*注2 其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。
如果没有达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光,是一种良好的状态,是我们所期盼的。
如果压出正常片子而不出现原因1和原因3的现象,可以不予处理。
但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s,甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续压十数张片子而效果良好。
但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目),那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定且能力有限,故很少使用)来解决。
原因1和3若如是则解决也是一样的。
*注3 这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。
Western blot详解及问题分析
Western Blot
不连续电泳:
作用
浓缩胶 分离胶 使蛋白样品浓缩 使蛋白样品分离
缓冲液PH
pH6.8TrisCl pH8.8TrisCl
凝胶浓度
低,2-5% 高,根据蛋 白大小
电泳缓冲液:pH8.3 Tris-甘氨酸系统。
Western Blot
灌制分离胶
隔绝空气
ddH2O 0.1%SDS:<8% 异丁醇:>8%
蛋白质-SDS胶束的特点:
(1)具有相同的形状,形状 像一个长椭圆棒
(2)平均1g 蛋白质结合
1.4g SDS (3)短轴对不同的蛋白质亚 基-SDS胶束基本上是相同的 (4)长轴的长度则与亚基分
子量的大小成正比
Western Blot
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳
不连续的电泳缓冲体系。 SDS—蛋白质复合物在凝胶电泳时,不再受蛋白质电 荷与形状的影响,而只取决于蛋白质分子量的大小。
Western Blot
灌制积层胶
插入梳子
Western Blot
Staking gel
Separating gel
Western Blot
转膜
要将电泳后分离的蛋白质从凝胶中转移到固 相载体(例如NC膜)上,通常有两种方法: 毛细管印迹法和电泳印迹法。 常用的电泳转移方法有湿转和半干转。两者 的原理完全相同,只是用于固定胶/膜叠层和 施加电场的机械装置不同。
蛋白质浓度测定的各种方法汇总:
/thread-23639-1-1.html
Western Blot
蛋白样品的变性
2×SDS-PAGE上样缓冲液:
1M Tris-HCl(pH6.8) 1M DTT SDS 甘油 溴酚蓝 总体积 10 ml 20 ml 4g 20 ml 0.2 g 100ml
Western blot常见14个问题解决
Western blot常见问题解决1. 啥也没有原因:比较多,如果单纯一张没有任何显色的X光片,可能是一抗加成其他抗体,或者二抗种属加错了,比如兔的加成鼠的。
解决办法:仔细检查抗体是否加错,确认转膜没有问题。
经验:上面的图片展示的是一点信号都没有,可能一抗,二抗加错,可能是蛋白浓度太低,上样量太少,一抗浓度过低,ECL发光液失效。
另外如果转膜出现了问题,比如膜放反了,自然是一个白片。
2. 高背景原因:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够解决办法:降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数。
经验:高背景可能是WB中最常见出现的问题,目的条带单一清晰,但是其他地方又弥漫性较为均一的背景(比较连续的)。
其实只要我们注意操作规范,不偷工减料就很容易避免,洗膜按照规定来8min*5次或者10min*4次,不要改成5min*3次,或者10min*2次。
3. 非特异性条带原因:一抗非特异性与蛋白结合解决办法:更换一抗或降低一抗浓度经验:此种情况绝大多数是因为一抗不好,你无法判断那一条是目的条带。
如果实在没有更好的抗体,建议采用阴性对照和阳性对照来确定上述哪个条带是目的条带。
当然这种情况下也有可能是一抗浓度太高引起的非特异性结合。
4. 条带中出现边缘规则的白圈原因:电转中膜和胶之间存在气泡。
解决办法:转膜前去掉膜和胶之间的气泡经验:我们常常将电转液倒入一个盘子里,倒入的液体不能太多也不能太少,最好的高度是与放上第一层滤纸齐平,然后往滤纸上浇点转膜液,把电泳胶用清水清洗下,将电泳胶平铺到滤纸上,仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡,可以左右前后观察,不同方向观察之后确认无气泡,然后再往胶上面浇点电转液,用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧,使膜成U型,然后将U型的底部接触胶的中间,慢慢往两边放下膜,这样一般气泡很少。
然后上层滤纸同样用U型的放置方法,用玻璃棒稍微贴实下,然后盖上海绵。
注意不要来回赶气泡,这样反而会带入气泡。
Western Blot常见问题及解决方法
Western Blot(蛋白质印迹)技术是生物医学研究中常用的蛋白质分析技术之一,可以用于检测蛋白质样品中的特定抗原。
然而,在进行Western Blot实验时,可能会遇到一些问题,下面列举了一些常见问题及解决方法:1.电泳条带不清晰或无条带:解决方法:•检查样品质量,确保待检测样品是可用的,无降解或污染。
•调整电泳参数,如电压、电流和时间等,以优化电泳效果。
•更换抗体,确认抗体的特异性,避免非特异性结合。
2.膜上背景过重:解决方法:•在抗体孵育之前,使用封闭剂封闭膜上的非特异性位点,减少抗体非特异性结合。
•减少一抗和二抗的浓度,减轻非特异性结合。
•增加洗涤次数和时间,以清除未结合的抗体和蛋白质。
3.目的蛋白信号弱或无:解决方法:•调整一抗和二抗的浓度,提高特异性结合的信号强度。
•选择更灵敏的显色方法,如化学发光法等。
•在转膜前,优化样品处理,如提取、纯化和浓缩等步骤。
4.非特异性条带:解决方法:•检查抗体特异性,确认抗体的特异性,更换抗体以减少非特异性结合。
•检查样品处理步骤,避免样品中的杂蛋白干扰。
•增加洗涤次数和时间,以清除未结合的抗体和非特异性结合的蛋白质。
5.显影后膜上条带处变为黄色或白色:解决方法:•可能是由于曝光时间过长或显影液浓度过高导致的,可以降低曝光时间和减少显影液浓度来解决问题。
•在膜清洗时使用甲醇或乙醇等有机溶剂,清除膜上的多余抗体和显色剂。
6.条带内无显影的白点:解决方法:•在转膜前检查是否存在气泡,气泡会影响转膜效果和条带形成。
•增加转膜时间和电流,以促进蛋白质的转移。
•检查显影液是否过期或存在质量问题。
7.存在散在小圆斑:解决方法:•这可能是由于封闭液中的杂质颗粒导致的,可以通过过滤封闭液来清除杂质。
•检查一抗和二抗是否含有杂质抗体或存在抗体污染的情况,更换抗体可以解决问题。
•检查显色液是否存在问题,如过期或存在杂质等,更换显色液可以解决问题。
8.条带变形或不均匀:解决方法:•检查电泳胶的质量和制备过程是否存在问题。
关于westernblot原理和常见故障分析.
关于western blot原理和常见故障分析关于western blot原理:通过电泳区分不同的组分,并转移至固相支持物,通过特异性试剂(抗体作为探针,对靶物质进行检测,蛋白质的Western印迹技术结合了凝胶电泳的高分辨率和固相免疫测定的特异敏感等多种特点,可检测到低至1~5ng(最低可到10-100pg中等大小的靶蛋白。
一、抗原的选择和制备A:样品的制备1组织:组织的处理方法:组织洗涤后加入3倍体积预冷的PBS,0℃研磨,加入5×STOP buffer,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins离心,取上清。
加入β-ME(9.5ml加入0.5ml,溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml煮沸10min,分装后于-20℃保存,用时取出,直接溶解上样。
2细胞:细胞的处理方法:离心收集细胞或者直接往细胞培养瓶内加入5×STOP buffer,收集,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins离心,取上清。
加入β-ME(9.5ml 加入0.5ml,溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml煮沸10min,分装后于-20℃保存,用时取出,直接溶解上样。
3分泌蛋白的提取(特例:直接收集分泌液,加入β-ME、溴酚蓝制样。
B:蛋白的定量方法及影响蛋白定量原因1.双缩脲法:双缩脲法是第一个用比色法测定蛋白质浓度的方法。
在需要快速,但不很准确的测定中,常用此法。
硫铵不干扰显色,这对蛋白质提纯的早期阶段是非常有利的。
双缩脲法的原理是Cu2+与蛋白质的肽键,以及酪氨酸残基络合,形成紫蓝色络合物,此物在540nm波长处有最大吸收。
双缩脲法常用于0.5g/L~10g/L含量的蛋白质溶液测定。
干扰物有硫醇,以及具有肽性质缓冲液,如Tris、Good缓冲液等。
可用沉淀法除去干扰物,即用等体积10%冷的三氯醋酸沉淀蛋白质,然后弃去上清液,再用已知体积的1m NaOH溶解沉淀的蛋白质进行定量测定。
western-blot条带分析报告及解决方法
持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
这种常见于高浓度抗体并且封闭/洗脱不好的情况下。
如果没有背景则就是原因3的现象。
在暗室可以看到文案大全条带周围荧光而条带处为暗。
如是则要么通过降低抗体解决,要么动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。
也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。
还有另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的现象。
其分析和解决同上。
*注2 其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。
如果没有达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光,是一种良好的状态,是我们所期盼的。
如果压出正常片子而不出现原因1和原因3的现象,可以不予处理。
但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s,甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续压十数张片子而效果良好。
但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目),那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定且能力有限,故很少使用)来解决。
原因1和3若如是则解决也是一样的。
*注3 这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。
主要出现在HRP极高的情况下,来不及压片就已耗竭底物,往往伴有原因2的现象。
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持续发光一段时间使胶片感光为黑色。
这种常见于高浓度抗体并且封闭/洗脱不好的情况下。
如果没有背景则就是原因3的现象。
在暗室可以看到文案大全条带周围荧光而条带处为暗。
如是则要么通过降低抗体解决,要么动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。
也可以过一段时间鼿RP稍减后重加底物迅速压片。
还有另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色,原因和上面的一样,主要是条带中心耗竭底物引起的,也可以在暗室看到中空的荧光带,但与上面的区别主要在于特异性要好一些,若继续发展则就是原因3的现象。
其分析和解决同上。
*注2 其原因主要是HRP太高超速催化底物生成的产物使膜发黄,压出的片子可以是正常的或和原因1或原因3的现象同时存在,只是一种现象,在压过的膜可以看出来(只在加底物后一段时间出现,几小时后可能还会消退,有时甚至刚加底物1~2min就可以看出来,所以要把握时机)。
如果没有达到原因1和原因3的程度,那么这种情况一定能够看到很强的荧光,是一种良好的状态,是我们所期盼的。
如果压出正常片子而不出现原因1和原因3的现象,可以不予处理。
但因为荧光太强极易导致条带增粗变大,所以也可以不稀释抗体而通过调整压片时间来解决,一般压10s~30s,甚至可以3~5s,即时根据结果在暗室调整,荧光持续时间长的话都可连续压十数张片子而效果良好。
但也有这种情况,就是由于HRP过强无论怎么减少压片时间条带都依然粗大(如果时间过短如<3s则可因感光不足导致条带太淡,这样就不可取了,但依然是粗大的、非条带的本来面目),那么如果想获得漂亮条带则必须通过降低抗体浓度(减少上样量很不稳定且能力有限,故很少使用)来解决。
原因1和3若如是则解决也是一样的。
*注3 这是与1类似但抗体特异性较好时的一种表现,经常与下面的原因4、5、6混淆,特别需要注意。
主要出现在HRP极高的情况下,来不及压片就已耗竭底物,往往伴有原因2的现象。
可通过加入底物后迅速进入暗室观察荧光确定,也可以根据原因2的现象确定,以区分于原因4、5、6。
除非动作迅速早期未耗竭底物时压片,否则一旦耗竭通过减少压片时间不能解决问题。
也可以过一段时间待HRP稍减后TBST简单洗膜重新加底物压片。
这种情况下一/二抗稀释可高达10倍而依然荧光明显。
*注4 提高抗体上样量以及下述的使用敏感底物/延长压片时间比较简单,在此不赘述,只提醒一下随抗体浓度增高背景和非特异性可能会增加。
关于上样量的极限在此发表我的看法:对于裂解的混合蛋白以上样孔底面积(平方毫米)乘30ug作为极限上样量,而落实到每一个具体条带(同一分子量的所有蛋白或仅做单一蛋白电泳),则以0.3ug/平方毫米底面积作为极限上样量。
(见《抗体技术实验指南》的免疫印迹一章),超过此量可能会导致条带变形。
条带信号弱可以通过加大上样量/提高抗体浓度/使用敏感底物/延长压片时间解决。
但实际上样量的极限并不以我说的极限上样量为准,因为这个极限上样量是确保所有分子量的条带都跑的很漂亮的极限,而上样超量的表现是随量的加大变形的条带由低分子量逐渐往高分子量延伸。
所以western极限上样量的真正操作标准是以目的条带不变形作为极限。
比如对于150kd,完全可以超出我所说的极限上样量的2倍而不变形(此时中低分子量条带早已融合或挤为棒槌形了)文案大全*注5 对于非小分子量尤其是大分子量(>100kd)蛋白而言,一般不会出现过转情况,转膜不充分是主要原因,增加转膜力度无非是加大电压/电流,延长时间。
但对于小分子蛋白(<30kd就要注意了,<15kd尤其要当心)很可能出现过转,丽春红染膜或观察marker有没有穿膜可以确认,没有丽春红也可以考染转膜后的胶,如果是一片空白,则要小心了,可适当降低转膜力度。
对于低分子量一般转膜液不要加SDS以防过转,《抗体技术实验指南》提供的针对中低分子量的湿转缓与高分子量的相比也是不含SDS的。
*注6 测试HRP或底物活性:于暗室EP管加底物A、B液各500ul,加入1ul HRP偶联二抗,若底物立即发出蓝光并于随后数分钟内消失说明HRP和底物尚好。
此外试剂公司还开发一些超级底物,其敏感度可达到pg级,但价格昂贵,对某些表达较低的蛋白效果会好些,而且也超级省抗体(其推荐抗体稀释比高达1:10,000以上)。
我用的是敏感度为ng级的底物,大部分western都还可以,pg级的还放在手里,没舍得用。
*注7 高背景原因是因为HRP偶联二抗结合到膜上,其原因包过直接结合、通过膜上蛋白间接结合、通过一抗(主要指多抗中的杂抗体)间接结合、通过封闭物(与封闭物交叉反应)间接结合、洗脱不彻底等原因造成的。
在稀释抗体降低背景的同时也会降低对目的蛋白的结合效率,意即以牺牲信号强度为代价。
不过在此提出另外一种和稀释抗体恰相反的做法——提高抗体浓度。
这种办法适用于HRP结合到膜上较多而且底物相对极其敏感(如pg级底物,因极其敏感可把结合到膜上的极其微量抗体产生的背景也显示出来,而这种背景在ng级底物即使压片过夜也没有显示),无论如何稀释抗体和加强洗膜都不能消除背景或者条带和背景随稀释呈等比例递减甚至条带递减速度比背景还快,如果稀释抗体则压片时间需延长而背景反而因此更加明显。
这种情况下认为需要提高抗体含量以提高条带显示程度,而背景随抗体浓度提高并不加强的很厉害,如是则可以通过减少压片时间而达到突出条带降低背景的目的(我最近带一个研究生使用pg级超级底物时发现此现象并使用此方法解决背景高的难题,当时一抗稀释为原来的4倍,二抗稀释为原来的10倍,即总稀释为原来的40倍仍然可以看到背景的荧光但条带的荧光却减了许多导致条带和背景都无法区分了,后来回复原来浓度并稍微延长孵育时间则条带荧光明显盖过背景并减少压片时间至5s解决)。
*注8 这一点似乎多数人都不重视,所以有时候会有些意外。
我一般室温2~4h,但4度过夜确实是最好的。
另外在平皿中摇似乎比封口膜更容易掌握并获得较好的效果,对新手似乎更好。
*注9 实际上牛奶对于多数抗体来说还是很好的,但所有二抗也都写着:与牛奶可能有交叉反应。
BSA蛋白单一,可降低因牛奶其他成分引起的背景。
单用TBST也可以,此法虽然减少了交叉,但单就封闭能力而言却也因此而降低文案大全*注10 一般10min*3次就足够了,如果不放心可按自己意志加强时间、次数、洗脱液用量。
*注11 以牺牲敏感度为代价其最低标准是使目的条带能够正常显影,对一切原因有效,但效果局限。
*注12 以牺牲敏感度为代价其最低标准是使目的条带能够正常显影,仅对膜上蛋白和一抗引起的有效。
*注13 主要是气泡在胶-膜之间引起的绝缘区使蛋白无法通过而不能到达膜上,这一步在操作时尤其要小心,我自己犯过,也看到其他人犯过。
我的办法是把胶铺到膜上,先使其一边接触膜的一边,这样就会在胶和膜交界的地方形成一个水相前缘,然后慢慢落下凝胶,这样这个水相前缘就会逐渐推进直至胶膜重合,如是则不会有气泡产生。
把胶铺到膜上而非相反是因为胶是透明的,可以看到水相前缘以及有无气泡产生。
*注14 膜平衡不均或有油脂污染的表现是膜上有疏水的通明色和蛋白几无(丽春红染),这点并不多见。
*注15 这一点我是抄pierce的说明书的,我没遇到过,膜与X光片间有气泡也不影响荧光通过,这个我可以肯定。
似乎不透明的东西才会导致。
*注16 非特异性条带在普通多抗比较多见,纯化多抗会好的多,但单抗也不是绝对没有,我也遇到过。
关于wetern的抗体选择在此提出我的观点:最理想的是混合单抗,其次是纯化多抗,单抗和多抗各有局限和特点,根据个人对特异性需求和蛋白的稳定性而定。
考虑的参数主要是抗原表位和特异性两个因素,不包含每个抗体价格。
混合单抗虽然针对多个表位但代价太高,需购置多个单抗然后混合,很少有人这么做。
纯化多抗基本具有混合多抗的性质和优点,表位多,稳定性好,特异性也不差,我觉得是实际中的首选。
单抗虽然特异性好,但如果其针对的表位在提取蛋白时被破坏则其敏感度为会下降甚至为0,故不稳定。
普通多抗虽然表位多,但因含其他抗体,特异性差了好多,会有很多杂带乃至背景。
实际我做的抗体多数都是普通多抗,只要封闭的好,效果还是很不错的;单抗虽说不稳定,但实际中我都能做出来,尤其是内参,强烈推荐只选单抗。
*注17 此点我根本不知道,完全是拷贝pierce说明书的*注18 主要原因是牛奶里面会有一些不悬浮的大颗粒,这些东西对封闭无益。
我所有的牛奶全是配好后在4度静置(最好放在尖底的管子内),这样那些大颗粒就会沉淀到底部,吸取时不要担心牛奶不均而特意混匀,我只吸上面的,下面的颗粒则不要取。
如是则在也没有遇到这种现象。
不推荐过滤牛奶,因为耗时极长且得率极低。
我用过几次但后来废弃了这种做法。
文案大全注1 另外一种反影现象就是压出条带粗大模糊,但条带中心是空的白色注2但因为荧光太强极易导致条带增粗变大注7高背景注16非特异性条带注18散在小圆斑因为封闭不充分,这3者很容易联合出现,下面是一张典型图,3者均含注16非特异性条带文案大全下面是一张非特异性较高的图,虽有背景但相对较低注13主要是气泡在胶-膜之间引起的绝缘区使蛋白无法通过而不能到达膜上气泡主要是中间一条带的上缘的半圆形缺失.我实际的片子上可以隐约看出是一个圆形的气泡,周围一圈还有个很形象的边界再提供一个如何在western显影图上判断蛋白降解的例子.如下图,与最右边一条带相比,左边3条带显影分子量散落下移(不能有上移,因分子量变小),拖拉一片,即为降解。
在考染胶上判断有无降解一是大分子量是否完全,二是背景是否清晰,三是小分子量区是否模糊。
降解是非均一性的,蛋白会不同程度断裂形成大大小小的片段。
在胶上则降低各条带含量,增加条带间蛋白形成背景,小片段在小分子量区堆积。
在western显影图(我这张图用的是多抗)则体现为分子量递减的一连续片段(就如同一群人有人断胳膊,有人断腿,有人断头,有人断手指,有人什么也没丢,大家断的是随机的,断下来的都坠落在小分子量区,剩下的从统计上来看就是以原分子量为首的一段区域。
我用的是多抗,所以可识别这一群片段,如果是单抗,则只能识别那些表位完整的片段,就不是这种图形了。
没做过,猜测是稍微增长的一段(肯定比多抗短的多),但要淡得多。
文案大全。