酵母人工染色体
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细胞工程酵母人工染色体
一、酵母人工染色体(YAC)的基本元件
酵母染色体DNA自主复制序列(ARS)
酵母染色体的着丝粒序列(CEN)
酵母染色体的端粒序列(TEL)
选择标记:用于重组克隆的筛选
如:pYAC4是一个大肠杆菌穿梭质粒,含有Amp大肠杆菌筛选标记。
二、YAC克隆系统的特点
YAC作为可提供大片段DNA的方法,简化了构建染色体延伸区域图谱和分离完整基因的过程(200~500kb,甚至1000kb)。
用酵母为宿主重新构建大的人类基因区段,可将小的重叠的YAC 变成一个大的YAC。
酵母作为一种真核生物,为其它真核的DNA提供了更合适的环境。
三、YAC的构建
酵母人工染色体的构建程序
完整的染色体DNA的提取
基因组DNA酶切大片段的获取
✓用于脉冲电泳(PFGE)的高分子量标记的制备
✓目的DNA的酶切最适条件(控制内切酶量实现)
✓最适DNA大片段回收
YAC载体臂的制备
YAC臂与目的DNA大片段的连接
YAC重组体对酵母的转化
YAC基因库的保存
YAC基因库的鉴定
随机挑取100个YAC转化子,制备完整DNA,脉冲电泳分离,Southern转移,标记探针,预杂交。
目的基因YAC克隆的筛选
PCR法对YAC克隆进行筛选,菌落原位杂交作为辅助手段进行筛选
目的基因YAC克隆的鉴定
用目的基因的序列、pBR322和PCR产物微探针进行杂交鉴定
四、YAC的主要用途
◆YAC克隆重叠群是物理图谱的主要框架。
◆用YAC克隆构建的物理图谱在复杂的生物基因组分析和
DNA测序中发挥着重要作用。
◆在基因功能研究中,基因嵌入及转基因技术都可采用YAC
克隆系统。
五、YAC的缺点
◆插入片段大,稳定性较差,不易操作;
◆插入的大片段常发生缺失,使文库不完整;
◆YAC与酵母天然染色体分子结构相似,分离时难与天然染色体
分开;
◆文库中的嵌合现象严重;
◆因插入片段大,往往发生序列重排,造成序列错乱。
思考题
1. 酵母人工染色体有什么作用?
2. 酵母人工染色体的构建程序是什么?
3. 酵母人工染色体有什么优缺点?