《Gaussian入门》
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Water
01 O H 1 R1 H 1 R1 2 a1
R1=1.04 a1=104.0
% Section： 行首以%开始，段后无空行 Route Section：行首以#开始，段后加空行 title：作业的简要描述，段后加空行 Molecular Specification：
分子说明部分，段后通常加空行
16
有效核势基组（Effective Core Potential BS）
整理课件
17
基组
整理课件
18
半经验方法
整理课件
19
半经验方法的局限性
整理课件
20
Hartree-Fock理论的局限性
整理课件
21
电子相关和后SCF方法
整理课件
22
电子相关和后SCF方法
整理课件
23
密度泛函理论（DFT）方法
ADMP&BOMP Force Stable Volume
Density=CheckPoint
Guess=Only
ReArchive
动力学计算 计算核的受力 波函数稳定性测试 计算分子体积 仅计算布居分析 仅作分子轨道初猜 从.chk文件中提取存档
➢ Route Section采用自由格式，大小写不敏感
整理课件
24
不同理论方法的资源消耗
整理课件
25
Gaussian 程序的结构
Gaussian
L0 Overlay0 L001
L101 L102 Overlay1
L122
link0: 初始化程序，控制overlay
link1: 读入并处理Route Section， 建立要执行的link列表
link9999: 终止计算
Preferences: 对Gaussian程序进行初 始化设置
➢自定义外部文字编辑器，用来打开.out文件 ➢link.exe所在的文件夹 ➢临时文件存放文件夹
Gaussian 图形工具栏
批处理专用
开始作业 暂停当前作业 当前link后暂停 恢复当前作业 终止当前作业
终止当前作业和批处理 在当前作业完成后终止批处理 编辑或建立批处理
Route Section
➢ Route Section以# 开始，# 控制作业的输出
✓ #N 正常输出；默认 (没有计算时间的信息) ✓ #P 输出更多信息。包括每一执行模块在开始和结束时与计算机系统有关的各种
信息 (包括执行时间数据，以及SCF计算的收敛信息) ✓ #T 精简输出：只打印重要的信息和结果。
Gaussian程序入门
Guassian程序功能
整理课件
2
模型化学
整理课件
3
模型化学的构成
整理课件
4
闭壳层和开壳层
整理课件
5
闭壳层和开壳层
整理课件
6
闭壳层和开壳层
整理课件
7
闭壳层和开壳层
整理课件
8
基组（Basis Set）
整理课件
9
基组（Basis Set <BS>）
整理课件
10
基组类型
% Section(link 0)
➢ 定义计算过程中的临时文件
%chk=name.chk
.chk文件在计算中记录分子几何构型，分子轨道，力常数矩阵等信息
%rwf=name.rwf
.rwf文件主要在作业重起时使用，当计算量比较大时，.rwf文件通常会非常大，此时需要将 之分割保存
%int=name.int, %d2e=name.d2e
整理课件
11
基组类型
整理课件
12
最小基组（Minimal Basis Set）
整理课件
13
分裂价基组（Split Valence Basis Set）
整理课件
14
弥散函数（Diffuse Function）
整理课件
15
高角动量基组（High Anglar Momenture BS）
整理课件
打开外部编辑器
编辑输出文件
Gaussian 程序工具
将.chk文件转换为.fch文件，这种 文件可以使用图形软件打开
将.fch文件还原为.chk文件
从指定.chk文件中显示作业的 route section和title
将.chk文件转换成文本格式
将以前版本的Gaussian产生的 .chk文件转换为G03的.chk文件
➢ Route Section主要由方法，基组，任务类型三部分组成
✓ 方法与基组 ✓ Gaussian程序能完成的任务类型：
wk.baidu.com
Sp Opt Freq Irc IrcMax Scan Polar
单点能量计算（默认任务类型） 分子几何结构优化 振动分析 反应途径计算 在指定反应途径上找能量最大值 势能面扫描 极化率和超极化率计算
Overlay9,10,11,99
Overlay99 L9999
整理课件
26
定制内存和硬盘
-M- 2MW -#- MaxDisk=400MB Gaussian程序使用的内存单位W 是双精度字，相当于8字节
2MW=16MB
设置方法：
将Default.r1文件改成default.rou
Gaussian 程序界面
✓ 同一行不同项之间可以使用空格，逗号和“/”连接； 例：#p hf/6-31g scfcyc=230 scfcon=8 #p,hf/6-31g,scfcyc=230,scfcon=8
✓ 关键词可以通过 keyword =option,keyword(option), keyword=(option1, option2, ...)，keyword( option1, option2, ...)指定
% Section 设定作业运行的环境变量 Route Section 设定作业的控制项 Title 作业题目 电荷与自旋多重度 Molecule Specification 分子说明
Gaussian作业的格式
%chk=water.chk %rwf=water.rwf #p hf/6-31g scfcyc=250 scfcon=8
.int文件在计算过程中存储双电子积分, .d2e文件在计算过程中存储双电子积分的二阶导数
➢ 内存使用控制
%mem=n
控制运行过程中使用内存的大小,可以以W或者MB，GB为单位 default：6000000W＝48MB 综合考虑到计算的需要和硬件水平，内存并非给得越多越好，最有效率的方法是 根据作业类型估算所需要内存的大小
Gaussian 程序工具
编辑批处理作业文件
转换不同格式的分子结构文件
读取.fch文件中的数据并生成 三维空间网格图
利用.chk文件中的分子轨道， 生成电子密度和静电势的空间 分布网格图
从.chk文件中打印出频率 和热化学数据
Gaussian 程序工具
NewZmat工具界面
Gaussian程序的输入文件
01 O H 1 R1 H 1 R1 2 a1
R1=1.04 a1=104.0
% Section： 行首以%开始，段后无空行 Route Section：行首以#开始，段后加空行 title：作业的简要描述，段后加空行 Molecular Specification：
分子说明部分，段后通常加空行
16
有效核势基组（Effective Core Potential BS）
整理课件
17
基组
整理课件
18
半经验方法
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19
半经验方法的局限性
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20
Hartree-Fock理论的局限性
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21
电子相关和后SCF方法
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22
电子相关和后SCF方法
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23
密度泛函理论（DFT）方法
ADMP&BOMP Force Stable Volume
Density=CheckPoint
Guess=Only
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动力学计算 计算核的受力 波函数稳定性测试 计算分子体积 仅计算布居分析 仅作分子轨道初猜 从.chk文件中提取存档
➢ Route Section采用自由格式，大小写不敏感
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24
不同理论方法的资源消耗
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25
Gaussian 程序的结构
Gaussian
L0 Overlay0 L001
L101 L102 Overlay1
L122
link0: 初始化程序，控制overlay
link1: 读入并处理Route Section， 建立要执行的link列表
link9999: 终止计算
Preferences: 对Gaussian程序进行初 始化设置
➢自定义外部文字编辑器，用来打开.out文件 ➢link.exe所在的文件夹 ➢临时文件存放文件夹
Gaussian 图形工具栏
批处理专用
开始作业 暂停当前作业 当前link后暂停 恢复当前作业 终止当前作业
终止当前作业和批处理 在当前作业完成后终止批处理 编辑或建立批处理
Route Section
➢ Route Section以# 开始，# 控制作业的输出
✓ #N 正常输出；默认 (没有计算时间的信息) ✓ #P 输出更多信息。包括每一执行模块在开始和结束时与计算机系统有关的各种
信息 (包括执行时间数据，以及SCF计算的收敛信息) ✓ #T 精简输出：只打印重要的信息和结果。
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2
模型化学
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3
模型化学的构成
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4
闭壳层和开壳层
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5
闭壳层和开壳层
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6
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闭壳层和开壳层
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8
基组（Basis Set）
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9
基组（Basis Set <BS>）
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10
基组类型
% Section(link 0)
➢ 定义计算过程中的临时文件
%chk=name.chk
.chk文件在计算中记录分子几何构型，分子轨道，力常数矩阵等信息
%rwf=name.rwf
.rwf文件主要在作业重起时使用，当计算量比较大时，.rwf文件通常会非常大，此时需要将 之分割保存
%int=name.int, %d2e=name.d2e
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11
基组类型
整理课件
12
最小基组（Minimal Basis Set）
整理课件
13
分裂价基组（Split Valence Basis Set）
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14
弥散函数（Diffuse Function）
整理课件
15
高角动量基组（High Anglar Momenture BS）
整理课件
打开外部编辑器
编辑输出文件
Gaussian 程序工具
将.chk文件转换为.fch文件，这种 文件可以使用图形软件打开
将.fch文件还原为.chk文件
从指定.chk文件中显示作业的 route section和title
将.chk文件转换成文本格式
将以前版本的Gaussian产生的 .chk文件转换为G03的.chk文件
➢ Route Section主要由方法，基组，任务类型三部分组成
✓ 方法与基组 ✓ Gaussian程序能完成的任务类型：
wk.baidu.com
Sp Opt Freq Irc IrcMax Scan Polar
单点能量计算（默认任务类型） 分子几何结构优化 振动分析 反应途径计算 在指定反应途径上找能量最大值 势能面扫描 极化率和超极化率计算
Overlay9,10,11,99
Overlay99 L9999
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26
定制内存和硬盘
-M- 2MW -#- MaxDisk=400MB Gaussian程序使用的内存单位W 是双精度字，相当于8字节
2MW=16MB
设置方法：
将Default.r1文件改成default.rou
Gaussian 程序界面
✓ 同一行不同项之间可以使用空格，逗号和“/”连接； 例：#p hf/6-31g scfcyc=230 scfcon=8 #p,hf/6-31g,scfcyc=230,scfcon=8
✓ 关键词可以通过 keyword =option,keyword(option), keyword=(option1, option2, ...)，keyword( option1, option2, ...)指定
% Section 设定作业运行的环境变量 Route Section 设定作业的控制项 Title 作业题目 电荷与自旋多重度 Molecule Specification 分子说明
Gaussian作业的格式
%chk=water.chk %rwf=water.rwf #p hf/6-31g scfcyc=250 scfcon=8
.int文件在计算过程中存储双电子积分, .d2e文件在计算过程中存储双电子积分的二阶导数
➢ 内存使用控制
%mem=n
控制运行过程中使用内存的大小,可以以W或者MB，GB为单位 default：6000000W＝48MB 综合考虑到计算的需要和硬件水平，内存并非给得越多越好，最有效率的方法是 根据作业类型估算所需要内存的大小
Gaussian 程序工具
编辑批处理作业文件
转换不同格式的分子结构文件
读取.fch文件中的数据并生成 三维空间网格图
利用.chk文件中的分子轨道， 生成电子密度和静电势的空间 分布网格图
从.chk文件中打印出频率 和热化学数据
Gaussian 程序工具
NewZmat工具界面
Gaussian程序的输入文件