生物医学信息检索(1)
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
生物医学信息检索(1)
IM—List of Journals Indexed IN Index Medicus，LJI
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
检索途径与方法
1.主题途径：利用主题索引查找文献。基 本步骤如下： 分析检索课题 确定主题概念 转换为 主题词 主题词与副主题词组配 查找 文献题录 查找原文。
3.属分参照：用see under和XU表示。用以表示上下位词之间的 包含、属与种、整体与部分的等级关系。次主题词和主主题 词之间的关系。例：Abortion，eugenic see under Abortion， induced或者Abortion， induced XU Abortion，eugenic
引的权威性工具，也是指导使用自然词语言 转化为规范化语言的辅助工具。它能够保证 标引者和检索者在用词上的一致。
生物医学信息检索(1)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)-MeSH表
主题词变更表
一、组成
字顺表 树状结构表
副主题词表
二、作用 MeSH表的影响力是相当广泛的，它 对其他中外文检索工具都有一定的参考作用。
字顺表(Alphabetic List) 将所有的主题词、副主题词和非主题词按
照字顺排列而成的表，称为字顺表。 主题词(headings)：直接、准确表达主题概念的 词或词组。每个概念只能用一个主题词表达。 副主题词(subheadings)：用于对主题词进一步 限定的词或词组。
主题词与副主题词之间的组配检索，起到 对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专 指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表的等级关系 在每个大类中主题词和非主题词按照等级 隶属关系逐级排列，从上位词到下位词，用逐 级缩排的方式表达等级隶属关系，就象大树的 干、枝、叶一样，是同类主题词成族展示它们 之间并列、隶属等级概念的相互关系。主题词 展开的等级数量关系多可达9级，每一级用“.” 相隔，同一级的词按字顺并齐排列。如下图所 示。
2.著者途径：利用著者索引查找文献。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)—主题途径
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
该篇文献的题录内容详见 IM 2003；31(7)：1915-1922
A novel method of peritoneal resuscitation improves organ perfusion after hemorrhagic shock. Zakaria el R, Hurt RT, Matheson PJ, Garrison RN.Am J Surg. 2003 Nov;186(5):443-8
生物医学信息检索(1)
它是指导我们使用规范化检索语言的工具，沟 通检索者和标引者的桥梁。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
主题词变更表 由两个表反映主题词的变更情况。
1.某年新增主题词表 New Heading 2.某年删除的主题词表 Deleted Heading
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) —字顺表
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
卷索引(Cumulative Index Medicus) 期索引12期出齐后所做的累积，
即按主题索引、著者索引、医学述 评题录部分的分别累积，而形成的 卷索引。作用是方便检索，省时省 力。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
医学主题词表(Medical Subject Headings,MeSH) 是对生物医学文献进行主题词分析和标
生物医学信息检索(1)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
主题词的表达形式
1.单词：neoplasms、heart、smoking、eye等； 2.词组：liver neoplasms等 3.代号：A-23187(卡西霉素 75-90) 4.倒置主题词：abortion,induced
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
何时使用树状结构表? 字顺表中查不到相应的主题词，在主题 索引中又查不到所需的文献。 当所选择的课题为一个广义概念时。
生物医学信息检索(1)
IM—SUBHEADINGS
副主题词表 到目前为止，MeSH表共收录82个副主题 词。但并不是每个副主题词和任何主题词都能 进行组配使用，每个副主题词具有一定的专指 性，其使用范围仅限于它后面括号内的类目。 副主题词也具有动态性，经常随着主题词 表的修订再版也不断变化。 手检时，副主题词不能单独使用，必须和 主题词配合使用；机检时，副主题词可以单独 使用。
Index Medicus,LJI)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)期索引
1.主题索引部分编排原则： (1)整个索引按主题词字顺排列； (2)同一主题词下按副主题词字顺排列； (3)同一副主题词下，按刊名缩写字顺排列； (4)同一主题词或副主题词下，先排英文文献，再
排非英文文献，并且非英文文献用[ ]括起来； (5)归不到任何副主题词的，直接排在主题词下，
姓氏前缀De、La、Van、Von与前缀一起提前， 并且与姓氏间加空格； 表示家族等级的后缀Jr、Sr、Ⅰ、Ⅱ等放在姓 氏的最后。
生物医学信息检索(1)
IM—Author Section
生物医学信息检索(1)
IM—Bibliography of Medical Reviews
生物医学信息检索(1)
• 期索引 分为两个分册，PartⅠ、PartⅡ，分别编排主题 索引(Subject Section)、著者索引(Author Section)、医学述评题录部分(Bibliography of Medical Reviews)。
• 卷索引 • 医学主题词表(Medical Subject Headings,MeSH) • 引用期刊一览表(List of Journals Indexed IN
自创刊以来，刊名、编排体例几经变化。到1960年， 恢复其原刊名。每月出版一期，一年共12期，《医 学主题词表》和《收编期刊一览表》随第一期单独 出版。
以题录形式报道医学期刊中论文、病例报告、 综述、读者来信、通讯、会议文献等。收录80多个 国家和地区、40多种语言文字出版3900多种医学期 刊，其中70%为英文文献，75%带英文摘要。
并按刊名缩写字顺排列； (6)非英文文献先按文种缩写排列，同一文种下按
刊名缩写字顺排列
生物医学信息检索(1)
IM—Subject Section
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
2.著者索引编排原则： (1)仅在第一著者后列出全部文献题录内容 (2)非第一著者只设参见条目, “see” (3)著者的姓在前用全称，名在后用首字母缩写； (4)匿名著者部分，按刊名缩写字顺排列。 注意：
abortion,threatened abortion,habitual abortion,eugenic anemia,aplastic anemia,hemolytic
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
字顺表中词汇的类型 1.主要叙词(Major Descriptors)：包括正式
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表 它将字顺表中所有的主题词和非主题词按
学科性质、词义范围的上下隶属关系，将字顺 表中收录的词归属在15个大类下。15个大类依 次用A-N、Z代表。
它是字顺表中的辅助索引。帮助了解每个 主题词在医学分类体系中的位置。它将字顺表 中互不联系的主题词通过主题词所属学科体系 和逻辑关系，加上一些必要的非主题词组成树 状等级结构。
2.帮助进行扩大和缩小检索范围：如查找有关微量元素与 健康的文献。根据课题的需要来确定检索范围。
3.帮助确定词的专业范围：查找比较新的名词，例Leptin 在未被列为正式主题词前，查找有关信息，可以使用 树状结构表(提示2000年以前的文献，用Proteins进行查 找)。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
置，表示主题词之间的族性关系，每个词至少 有一个树状结构号，由于有些词具有多重属性， 就有多个树状结构号。 2.参照注释：反映词与词之间的关系。 3.历史注释：注明某主题词使用年代的变化情况， 帮助检索者进行回溯检索时，选择准确的主题 词。
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
生物医学信息检索(1)
检索工具的类型
可以分为两大类： 索引类和文摘类 或者称为 题录型和文摘型
生物医学信息检索(1)
检索工具的主要内容
概况及其特点 结构编排 著录格式 检索途径与方法 实例检索
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(Index Medicus，IM)
• 概况 创刊于1879年，由美国国立医学图书馆编辑，
生物医学信息检索(1)
2020/11/26
生物医学信息检索(1)
国外生物医学检索工具
在生命科学领域中常用的检索刊有： 美国《医学索引》(Index Medicus,IM) 荷兰《医学文摘》(Excerpta Medica,EM) 美国《生物学文摘》(Biological Abstracts, BA) 美国《化学文摘》(Chemical Abstracts, CA) 美国《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)
目前的出版形式有：印刷版、光盘版、国际联 机数据库、网络版。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
特点： • 收录范围广，内容全面； • 编辑力量强，标引质量高； • 报道速度快，时差短； • 编制简单，查找方便。
生物医学信息检索(1)
Biblioteka Baidu
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)结构编排
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
参照系统
1.用代参照：用see和X表示，款目词参见正式主题词，具有等 同关系、近义关系，格式为：Cancer see Neoplasms或者 Neoplasms X Cancer
2.相关参照：用see related和XR表示，用以处理两个或两个以 上主题词在概念上彼此之间有某种联系或依赖的相关关系。 其作用是扩大检索范围。例：Neoplasms，HormoneDependent see related Antineoplastic Agents，Hormonal或者 Antineoplastic Agents，Hormonal XR Neoplasms，HormoneDependent
字顺表与树状结构表的关系
字顺表反映主题词之间的横向关系， 树状结构表揭示词和词之间的纵向隶属 关系。两者是MeSH的重要组成部分，它 们并不是两个孤立的部分。将两者结合 起来使用，才能保证文献的查全率和查 准率。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
何时使用字顺表?
所使用的检索词是否为规范主题词。 当用专指词检索所需特定文献时，需要 查字顺表中的直接上位词进行检索 扩大检索某课题研究范围。 进行族性检索。
主题词、地理主题词、特征词和非主题 词。 2.次要叙词(Minor Descriptors) 3.款目词(Entry Terms)：主题词的同义词或 近义词。 4.副主题词(Subheadings)
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
在字顺表中有三种注释： 1.树状结构号注释：反映该词在学科体系中的位
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表的作用
1.帮助从学科体系中选择主题词：如查找兔唇的有关文献。 首先找该词的主题词，如果没有，那么就从该词所属 的学科分类中找。在Tree中找疾病C大类，它的下位类 找到Neonateol Diseases and Abnormalities C16，逐级往 下找Mouth Abnormalities，ClieftLip (唇裂)。
IM—List of Journals Indexed IN Index Medicus，LJI
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
检索途径与方法
1.主题途径：利用主题索引查找文献。基 本步骤如下： 分析检索课题 确定主题概念 转换为 主题词 主题词与副主题词组配 查找 文献题录 查找原文。
3.属分参照：用see under和XU表示。用以表示上下位词之间的 包含、属与种、整体与部分的等级关系。次主题词和主主题 词之间的关系。例：Abortion，eugenic see under Abortion， induced或者Abortion， induced XU Abortion，eugenic
引的权威性工具，也是指导使用自然词语言 转化为规范化语言的辅助工具。它能够保证 标引者和检索者在用词上的一致。
生物医学信息检索(1)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)-MeSH表
主题词变更表
一、组成
字顺表 树状结构表
副主题词表
二、作用 MeSH表的影响力是相当广泛的，它 对其他中外文检索工具都有一定的参考作用。
字顺表(Alphabetic List) 将所有的主题词、副主题词和非主题词按
照字顺排列而成的表，称为字顺表。 主题词(headings)：直接、准确表达主题概念的 词或词组。每个概念只能用一个主题词表达。 副主题词(subheadings)：用于对主题词进一步 限定的词或词组。
主题词与副主题词之间的组配检索，起到 对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专 指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表的等级关系 在每个大类中主题词和非主题词按照等级 隶属关系逐级排列，从上位词到下位词，用逐 级缩排的方式表达等级隶属关系，就象大树的 干、枝、叶一样，是同类主题词成族展示它们 之间并列、隶属等级概念的相互关系。主题词 展开的等级数量关系多可达9级，每一级用“.” 相隔，同一级的词按字顺并齐排列。如下图所 示。
2.著者途径：利用著者索引查找文献。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)—主题途径
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
该篇文献的题录内容详见 IM 2003；31(7)：1915-1922
A novel method of peritoneal resuscitation improves organ perfusion after hemorrhagic shock. Zakaria el R, Hurt RT, Matheson PJ, Garrison RN.Am J Surg. 2003 Nov;186(5):443-8
生物医学信息检索(1)
它是指导我们使用规范化检索语言的工具，沟 通检索者和标引者的桥梁。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
主题词变更表 由两个表反映主题词的变更情况。
1.某年新增主题词表 New Heading 2.某年删除的主题词表 Deleted Heading
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) —字顺表
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
卷索引(Cumulative Index Medicus) 期索引12期出齐后所做的累积，
即按主题索引、著者索引、医学述 评题录部分的分别累积，而形成的 卷索引。作用是方便检索，省时省 力。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
医学主题词表(Medical Subject Headings,MeSH) 是对生物医学文献进行主题词分析和标
生物医学信息检索(1)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
主题词的表达形式
1.单词：neoplasms、heart、smoking、eye等； 2.词组：liver neoplasms等 3.代号：A-23187(卡西霉素 75-90) 4.倒置主题词：abortion,induced
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
何时使用树状结构表? 字顺表中查不到相应的主题词，在主题 索引中又查不到所需的文献。 当所选择的课题为一个广义概念时。
生物医学信息检索(1)
IM—SUBHEADINGS
副主题词表 到目前为止，MeSH表共收录82个副主题 词。但并不是每个副主题词和任何主题词都能 进行组配使用，每个副主题词具有一定的专指 性，其使用范围仅限于它后面括号内的类目。 副主题词也具有动态性，经常随着主题词 表的修订再版也不断变化。 手检时，副主题词不能单独使用，必须和 主题词配合使用；机检时，副主题词可以单独 使用。
Index Medicus,LJI)
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)期索引
1.主题索引部分编排原则： (1)整个索引按主题词字顺排列； (2)同一主题词下按副主题词字顺排列； (3)同一副主题词下，按刊名缩写字顺排列； (4)同一主题词或副主题词下，先排英文文献，再
排非英文文献，并且非英文文献用[ ]括起来； (5)归不到任何副主题词的，直接排在主题词下，
姓氏前缀De、La、Van、Von与前缀一起提前， 并且与姓氏间加空格； 表示家族等级的后缀Jr、Sr、Ⅰ、Ⅱ等放在姓 氏的最后。
生物医学信息检索(1)
IM—Author Section
生物医学信息检索(1)
IM—Bibliography of Medical Reviews
生物医学信息检索(1)
• 期索引 分为两个分册，PartⅠ、PartⅡ，分别编排主题 索引(Subject Section)、著者索引(Author Section)、医学述评题录部分(Bibliography of Medical Reviews)。
• 卷索引 • 医学主题词表(Medical Subject Headings,MeSH) • 引用期刊一览表(List of Journals Indexed IN
自创刊以来，刊名、编排体例几经变化。到1960年， 恢复其原刊名。每月出版一期，一年共12期，《医 学主题词表》和《收编期刊一览表》随第一期单独 出版。
以题录形式报道医学期刊中论文、病例报告、 综述、读者来信、通讯、会议文献等。收录80多个 国家和地区、40多种语言文字出版3900多种医学期 刊，其中70%为英文文献，75%带英文摘要。
并按刊名缩写字顺排列； (6)非英文文献先按文种缩写排列，同一文种下按
刊名缩写字顺排列
生物医学信息检索(1)
IM—Subject Section
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
2.著者索引编排原则： (1)仅在第一著者后列出全部文献题录内容 (2)非第一著者只设参见条目, “see” (3)著者的姓在前用全称，名在后用首字母缩写； (4)匿名著者部分，按刊名缩写字顺排列。 注意：
abortion,threatened abortion,habitual abortion,eugenic anemia,aplastic anemia,hemolytic
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
字顺表中词汇的类型 1.主要叙词(Major Descriptors)：包括正式
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表 它将字顺表中所有的主题词和非主题词按
学科性质、词义范围的上下隶属关系，将字顺 表中收录的词归属在15个大类下。15个大类依 次用A-N、Z代表。
它是字顺表中的辅助索引。帮助了解每个 主题词在医学分类体系中的位置。它将字顺表 中互不联系的主题词通过主题词所属学科体系 和逻辑关系，加上一些必要的非主题词组成树 状等级结构。
2.帮助进行扩大和缩小检索范围：如查找有关微量元素与 健康的文献。根据课题的需要来确定检索范围。
3.帮助确定词的专业范围：查找比较新的名词，例Leptin 在未被列为正式主题词前，查找有关信息，可以使用 树状结构表(提示2000年以前的文献，用Proteins进行查 找)。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
置，表示主题词之间的族性关系，每个词至少 有一个树状结构号，由于有些词具有多重属性， 就有多个树状结构号。 2.参照注释：反映词与词之间的关系。 3.历史注释：注明某主题词使用年代的变化情况， 帮助检索者进行回溯检索时，选择准确的主题 词。
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
生物医学信息检索(1)
检索工具的类型
可以分为两大类： 索引类和文摘类 或者称为 题录型和文摘型
生物医学信息检索(1)
检索工具的主要内容
概况及其特点 结构编排 著录格式 检索途径与方法 实例检索
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(Index Medicus，IM)
• 概况 创刊于1879年，由美国国立医学图书馆编辑，
生物医学信息检索(1)
2020/11/26
生物医学信息检索(1)
国外生物医学检索工具
在生命科学领域中常用的检索刊有： 美国《医学索引》(Index Medicus,IM) 荷兰《医学文摘》(Excerpta Medica,EM) 美国《生物学文摘》(Biological Abstracts, BA) 美国《化学文摘》(Chemical Abstracts, CA) 美国《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)
目前的出版形式有：印刷版、光盘版、国际联 机数据库、网络版。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)
特点： • 收录范围广，内容全面； • 编辑力量强，标引质量高； • 报道速度快，时差短； • 编制简单，查找方便。
生物医学信息检索(1)
Biblioteka Baidu
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM)结构编排
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
参照系统
1.用代参照：用see和X表示，款目词参见正式主题词，具有等 同关系、近义关系，格式为：Cancer see Neoplasms或者 Neoplasms X Cancer
2.相关参照：用see related和XR表示，用以处理两个或两个以 上主题词在概念上彼此之间有某种联系或依赖的相关关系。 其作用是扩大检索范围。例：Neoplasms，HormoneDependent see related Antineoplastic Agents，Hormonal或者 Antineoplastic Agents，Hormonal XR Neoplasms，HormoneDependent
字顺表与树状结构表的关系
字顺表反映主题词之间的横向关系， 树状结构表揭示词和词之间的纵向隶属 关系。两者是MeSH的重要组成部分，它 们并不是两个孤立的部分。将两者结合 起来使用，才能保证文献的查全率和查 准率。
生物医学信息检索(1)
美国《医学索引》(IM) -MeSH表
何时使用字顺表?
所使用的检索词是否为规范主题词。 当用专指词检索所需特定文献时，需要 查字顺表中的直接上位词进行检索 扩大检索某课题研究范围。 进行族性检索。
主题词、地理主题词、特征词和非主题 词。 2.次要叙词(Minor Descriptors) 3.款目词(Entry Terms)：主题词的同义词或 近义词。 4.副主题词(Subheadings)
生物医学信息检索(1)
IM—ALPHABETIC LIST
在字顺表中有三种注释： 1.树状结构号注释：反映该词在学科体系中的位
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
生物医学信息检索(1)
IM —Tree Structure
树状结构表的作用
1.帮助从学科体系中选择主题词：如查找兔唇的有关文献。 首先找该词的主题词，如果没有，那么就从该词所属 的学科分类中找。在Tree中找疾病C大类，它的下位类 找到Neonateol Diseases and Abnormalities C16，逐级往 下找Mouth Abnormalities，ClieftLip (唇裂)。