表观遗传学专业知识讲座课件
表观遗传学(共20张PPT)
• 近几年来RNAi研究取得了突破性进展,被《Science》杂志评为2001年的十大科 学进展之一,并名列2002年十大科学进展之首。由于使用RNAi技术可以特异性剔 除或关闭特定基因的表达,所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及 恶性肿瘤的基因治疗领域。
表观遗传学 EPIGENETICS
什么是表观遗传学?
表观遗传学是研究除DNA序列 变化外的其他机制引起的细胞表 型和基因表达的可遗传的改变。 表观遗传学调控真核基因表达, 与人类重大疾病,如肿瘤、神经 退行性疾病、自身免疫性疾病等 密切相关。
举两个例子~
在胚胎发育过程中,果蝇存在很多体节。对 Hox 基因来 说,在有些体节中表达,有些中不表达。一开始,这种表 达或不表达经不在了,由原来不 表达(Hox 基因)的细胞衍生的后代呢,这些基因仍然不 表达;表达那些 Hox 基因的细胞衍生的细胞,仍然表达。
• 最常见的DNA甲基化形式是将甲基加到胞嘧啶环的 5‘位置上,形成5’-甲基胞嘧啶。哺乳动物中大约有 5%的胞嘧啶被甲基化,而甲基化与否,基因的转录活 性相差了上百万倍。
• DNA甲基化的作用主要体现于抑制基因转录活性,而具 体的抑制机制还尚未明确
• MeCP1所结合的DNA序列常需要有10个以上的甲基化CpG, 这一蛋白广泛存在于许多组织。
工蜂和蜂王都由同种受精卵发育而来,如 果能吃到蜂王浆,就变成蜂后;吃不到就 变成工蜂。
与工蜂相比,蜂王的成熟期短平均在半
个月左右,而工蜂则需要二十天以上;
寿命长蜂王可以活几年,而工蜂则只有
几十天的寿命;有生殖能力蜂王每天可
蜂王
工蜂
以产下几百枚卵,而工蜂一般终生都不
表观遗传学课件(2024)(2024)
02
RIP-seq
将RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation, RIP)与高通 量测序技术结合,研究特定蛋白质与 非编码RNA的相互作用。
03
CRISPR/Cas9技术
利用CRISPR/Cas9技术对非编码RNA 进行基因编辑,研究非编码RNA在细 胞中的功能和调控机制。
2024/1/28
2024/1/28
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03 表观遗传与基因表达调控
2024/1/28
12
基因印记与X染色体失活
基因印记
一种表观遗传现象,通过亲本来源的特定基因表达模式影响后代性状。涉及 DNA甲基化、组蛋白修饰等机制。
X染色体失活
女性细胞中两条X染色体之一随机失活的现象,以避免X染色体基因产物的过量 表达。失活通过X染色体上的Xist基因介导,导致染色体的紧密包装和基因沉默 。
要点二
组蛋白修饰与自身免 疫性疾病
组蛋白修饰在自身免疫性疾病中也发 挥着重要作用,异常的组蛋白修饰可 以影响免疫细胞的功能和分化。
要点三
非编码RNA与自身免 疫性疾病
非编码RNA在自身免疫性疾病中的研 究逐渐受到关注,它们可以通过调节 基因表达和蛋白质功能来影响疾病的 进程。此外,一些特定的非编码RNA 还可以作为疾病的生物标志物,用于 疾病的诊断和治疗。
20
癌症中的表观遗传异常
DNA甲基化异常
在癌症中,DNA甲基化模式的改变是一个常见的现象,它可以影响基因的表达和稳定
性。
组蛋白修饰异常
组蛋白修饰在癌症中也扮演着重要角色,异常的组蛋白修饰可以影响染色质的结构和功 能,从而影响基因的表达。
2024/1/28
非编码RNA的异常表达
表观遗传学教学课件
04
表观遗传学研究方法
基因组学技术
基因组测序
通过全基因组测序技术,可以检测基因组中的变异和表观遗传修饰,了解基因表达的调 控机制。
甲基化测序
甲基化测序技术可以检测基因组中DNA甲基化的水平,研究甲基化与基因表达的关系。
生物信息学分析
数据挖掘
利用生物信息学方法对大规模基因组 数据进行挖掘,寻找表观遗传修饰与 基因表达之间的关联。
详细描述
非编码RNA在表观遗传学中发挥重要作用, 它们通过与mRNA相互作用,影响基因表达 的转录和转录后水平。非编码RNA的异常表 达与多种疾病的发生和发展密切相关。
组蛋白修饰
总结词
组蛋白修饰是指组蛋白上的化学基团, 如乙酰化、甲基化和磷酸化等。
VS
详细描述
组蛋白修饰能够影响染色质的结构和基因 表达,与细胞分化、发育和肿瘤形成等生 物学过程密切相关。组蛋白修饰的异常与 多种疾病的发生和发展密切相关。
80%
药物研发
表观遗传学研究有助于发现新型 药物靶点,推动药物研发的创新 和进步。
表观遗传学面临的挑战与问题
技术难题
表观遗传学研究涉及多种复杂技 术,如高通量测序、染色质免疫 沉淀等,技术难度较大,需要专 业人员操作。
数据解读与分析
表观遗传学研究产生大量数据, 如何准确解读和分析这些数据是 一个挑战。需要发展新的数据分 析方法和算法。
个体化治疗
表观遗传学研究有助于实现个 体化治疗,即根据患者的表观 遗传学特征,制定个性化的治 疗方案。例如,针对特定基因 的靶向治疗等。
疾病预防
表观遗传学研究还有助于疾病 的预防。例如,通过调整饮食 和生活方式等,可以改变个体 的表观遗传学特征,从而预防 某些疾病的发生。
遗传学第十二章表观遗传学精选课件.ppt
Y
X
XX
X-染色体失活
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(一)X失活中心
• 2019年G.D.Penny等发现X染色体的Xq13.3区 段有一个X失活中心( X-inactivation center,Xic),X失活中心有“记数”和“选 择”的功能。
• 长1Mb,4个已知基因:Xist;Xce;Tsix;
(三)DNA去甲基化作用(不讲)
13
二、组蛋白修饰
14
15
❖组蛋白密码 ❖组蛋白中被修饰氨基酸的种类、位置和修饰
类型被称为组蛋白密码(histone code)。 ❖组蛋白通过乙酰化、甲基化和磷酸化等共价
修饰,使染色质处于转录活性状态或非转录活 性状态,为其他蛋白与DNA的结合产生协同 或拮抗效应,属于一种动态的转录调控成分。 ❖类型:乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化, SUMO化,ADP核糖化,脱氨基化,脯氨酸异 构化。
16
• (一)组蛋白乙酰化作用 组蛋白N末端 Lys 上,组蛋白乙酰化能选择 性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散, 开放某些基因的转录,增强其表达水平 。
• 组蛋白乙酰化转移酶(histone acetyltransferase,HAT) • 组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)
• 第一节 表观遗传学的分子机制
• 1. 遗传编码信息:提供生命必需蛋白质的编码模 板。
• 2. 表观遗传学信息:何时、何地、以何种方式去 应用遗传编码信息。
• DNA和染色质上的表观遗传修饰: • DNA甲基化;组蛋白修饰;RNA相关沉默(非编码
RNA);染色质重塑。
7
2024版年度表观遗传学概论课件
神经系统康复
表观遗传学在神经再生和修复中 发挥作用,相关研究有助于神经 系统康复和功能恢复。
2024/2/3
24
代谢性疾病诊断、治疗和预防中表观遗传学应用
01
代谢性疾病诊断
表观遗传学改变与代谢性疾病的 发生和发展密切相关,检测相关 改变有助于疾病诊断。
02
代谢性疾病治疗
03
代谢性疾病预防
针对表观遗传学改变设计特异性 药物或疗法,为代谢性疾病治疗 提供新选择。
表观遗传学概论课件
2024/2/3
1
目录
2024/2/3
• 表观遗传学概述 • 表观遗传变异类型及机制 • 表观遗传变异与疾病关系 • 表观遗传学实验技术与方法 • 表观遗传学在医学领域应用前景 • 生物伦理、法规及社会问题探讨
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01
表观遗传学概述
2024/2/3
3
表观遗传学定义与特点
2024/2/3
肿瘤预防 通过干预表观遗传学改变,有望降低 肿瘤发生风险或延缓肿瘤进展。
23
神经系统疾病诊断、治疗和康复中表观遗传学应用
神经系统疾病诊断
表观遗传学改变在神经系统疾病 的发生和发展中起重要作用,检 测相关改变有助于疾病诊断。
神经系统疾病治疗
针对表观遗传学改变设计特异性 药物或疗法,为神经系统疾病治 疗提供新思路。
功能
在细胞分化、发育、代谢、应激反 应等生物学过程中发挥重要作用, 与多种疾病的发生和发展密切相关。
10
染色质重塑与核小体定位
2024/2/3
定义 染色质重塑是指染色质结构和位置的动态变化过程,包括 核小体的组装、解离和移动等。
机制
通过染色质重塑复合物(chromatin-remodeling complexes)的催化作用,利用ATP水解产生的能量,改 变核小体的位置和构象。
表观遗传学简述ppt课件.pptx
总结
表观遗传学信息提供了何时、何地、以何种方式去 执行DNA遗传信息的指令,它通过有丝分裂和减数 分裂将遗传信息从上一代传递给下一代。
决定表观遗传学过程的主要因素为DNA的甲基化、 组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA调控,这4个 因素的相互关系以及它们如何共同来调节染色质 结构还有待进一步研究。
甲基转移作用通常发生在 5′-胞嘧啶位置上, 具有调 节基因表达和保护DNA该 位点不受特定限制酶降解 的作用。
2、组蛋白修饰
组蛋白是真核生物染色体的基本结构蛋白,是一类 小分子碱性蛋白质,有5种类型:H1、H2A、H2B、H3、 H4,它们富含带正电荷的碱性氨基酸,能够同DN中带 负电荷的磷酸基团相互作用。
小组成员及分工
谢吕欣:表观遗传学最新研究进展资料查找 陈绪:表观遗传学作用机制资料查找、PPT报告 庞锡泉:表观遗传学前沿方向资料查找 金丽菁:PPT制作、文献资料汇总整理
THANK YOU FOR WATCHING
染色质重塑是指 在能量驱动下核 小体的置换或重 新排列,它改变了 核小体在基因启 动子区的排列,增 加了基础转录装 置和启动子的可 接近性。染色质 重塑主要包括2 种类型:
依赖共 价结合 反应的 化学修
饰
利用ATP水解所产生的能量使核小体 结构发生如下4种突变:(1)核小体在 DNA上的滑动;(2)DNA和核小体的 解离;(3)将组蛋白八聚体从染色 质上去除;(4)组蛋白变异体和经 典组蛋白间的置换
表观遗传学的前沿研究与进展
1.非编码RNA的进展
随着复杂性的增加,非蛋白质编码序列日益成为多细 胞生物的基因组的主导者,其相反与蛋白质编码基因, 相当的稳定。它能够在大多数哺乳动物基因组,甚至 所有真核生物细胞和组织中表达,越来越多的证据表 明,非编码RNA的表达涉及到基因表达的调控。
表观遗传学课件(带目录)
表观遗传学课件一、引言表观遗传学是研究基因表达调控机制的一门学科,它涉及到基因序列不发生变化,但基因表达却发生了可遗传的改变。
这种调控机制对于生物体的生长发育、细胞分化、疾病发生等过程具有重要作用。
本文将对表观遗传学的基本概念、调控机制及其在疾病中的应用进行详细阐述。
二、表观遗传学的基本概念1.基因表达调控:基因表达调控是指生物体通过一系列机制,控制基因在特定时间和空间的表达水平。
基因表达调控是生物体生长发育、细胞分化、环境适应等生命现象的基础。
2.表观遗传修饰:表观遗传修饰是指在基因的DNA序列不发生改变的情况下,通过DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑等机制调控基因表达的过程。
3.表观遗传学的研究内容:表观遗传学主要研究基因表达调控的分子机制,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、非编码RNA调控等。
三、表观遗传学的调控机制1.DNA甲基化:DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的催化下,将甲基基团转移至DNA分子的过程。
DNA甲基化通常发生在基因的启动子区域,抑制基因表达。
2.组蛋白修饰:组蛋白修饰是指在组蛋白分子上发生的一系列化学修饰,如乙酰化、磷酸化、甲基化等。
这些修饰可以改变组蛋白与DNA的结合状态,从而调控基因表达。
3.染色质重塑:染色质重塑是指染色质结构发生变化,使基因的表达状态发生改变的过程。
染色质重塑可以通过改变核小体结构、DNA甲基化、组蛋白修饰等方式实现。
4.非编码RNA调控:非编码RNA是指不具有编码蛋白质功能的RNA分子,包括miRNA、lncRNA、circRNA等。
这些RNA分子可以通过与mRNA结合、调控转录因子活性等方式调控基因表达。
四、表观遗传学在疾病中的应用1.癌症:表观遗传学在癌症研究中的应用主要涉及肿瘤发生、发展和治疗。
研究发现,癌细胞的表观遗传修饰模式发生改变,导致肿瘤相关基因的表达异常。
通过研究这些表观遗传修饰,可以为癌症的早期诊断、预后评估和治疗提供新靶点。
第十一章-表观遗传学PPT课件
二、基因组印迹(genomic imprinting)
概念:依赖于父、母源性的等位基因的差异性 表达,即父亲和母亲的基因组在个体发育中有 着不同的影响,这种现象称基因组印迹。
两个亲本的等位基因差异性甲基化是基因组印 迹现象的基础。
疾病的基础: 15q11-13 微缺失
Prader-Willi syndrome, PWS(父源):肥胖、矮 小, 中度智力低下
2. 表遗传(epigenetic)信息
,提供何时、何地、如何应
用遗传学信息的指令,保证
基因适时启闭
One genome--------multiple epigenome
-
12
一、表观遗传修饰
表达模式的信息标记: DNA特定碱基的修饰:胞嘧啶的甲基化; 染色质构型重塑:如,组蛋白的乙酰化、 甲基化
果蝇中的杂色(眼)位置效应(positioneffect variegation): 野生红眼基因W+(显性) 突变白眼基因w(隐性)
基因定位于X染色体长臂末端
W+
“W+/W+”和“W+/w”均表现正常红眼 意外情况: W+异位至着丝粒附近(异染
色质区), “W+/w”杂合体表现为花斑 眼(杂色),即:部分细胞正常红色, 部分少量红色,部分白色。
设计实验拟解决:“RNA 干扰”是否与转入的RNA 结构有关。
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意外发现:导入双链RNA的产生功能干扰的有效 性远高于导入单链RNA, sense or antisense RNA导入均如此。
仅需少数分子即可产生干扰效应,提示酶促反 应或分子扩增的存在。
-
23
上述现象提示: 1. 存在超越简单反义RNA作用的机理。 2. RNA靶向的作用也不能排除。 3. 同时可能存在RNA与染色质的直接作用,影 响RNA的转录。
遗传学:表观遗传学教学课件
基因表达模式
• 决定细胞类型的不是基因本身,而是基因 表达模式,通过细胞分裂来传递和稳定地 维持具有组织和细胞特异性的基因表达模 式对于整个机体的结构和功能协调是至关 重要的。
• 基因表达模式在细胞世代之间的可遗传性 并不依赖细胞内DNA的序列信息。
• 基因表达模式有表观遗传修饰决定。
Waddington's epigenetics
• CMT3 (CHROMOMETHYLASE3) – 5'-CHG-3' sites
• (H= A, C or T) • Interacts with histone mark
• CMT2 (CHROMOMETHYLASE3) – 5'-CHH-3' sites
DRM 1, DRM 2 (DOMAINS REARRANGED 1 and 2) - 5'-CHH-3' sites
Photo credit: DrL
Mosaicism: An Individual with Two Different Eye Colors
“Diego”
Mosaicism: An Individual Eye with Two Colors
Epigenetic programming in plants helps silence transposons and maintain centromere function
2、衰老
无论DNA甲基化水平增高还是减低,都与人的 衰老过程相关。
3、免疫紊乱 在狼疮病人的T细胞中,甲基转移酶活性降低,DNA
存在异常的低甲基化。 4、神经精神疾病
精神分裂症和情绪障碍与DNMT基因相关。基因高甲 基化抑制脑组织中Reelin蛋白的表达,Reelin蛋白是 维持正常神经传递、大脑信息存储和突触可塑性所必 需的蛋白 。
遗传学第十二章表观遗传学精选课件
探讨染色质重塑与DNA甲基化、组蛋白修饰等表观 遗传调控之间的相互作用及联合用药策略。
THANKS
感谢观看
异常影响
异常的染色质重塑与多种疾病相关,如癌症、神经系统疾病等。同时, 核小体定位的改变也可能导致基因表达的异常和疾病的发生。
03 表观遗传机制探 讨
基因印记与X染色体失活
01 02 03
基因印记定义与特点
基因印记是指来自父方或母方的等位基因在发育过程中产生 专一性的加工修饰,导致后代体细胞中两个等位基因出现不 同的表达特性。这种修饰是稳定和可遗传的,但不涉及DNA 序列的改变。
甲基化特异性PCR 根据甲基化和非甲基化DNA设计特异性引物,通 过PCR扩增来检测特定基因的甲基化状态。
3
甲基化敏感的限制性内切酶法
利用对甲基化敏感的限制性内切酶切割DNA,通 过比较切割前后的DNA片段差异来判断甲基化水 平。
组蛋白修饰检测技术
01
染色质免疫沉淀
利用特异性抗体与组蛋白修饰位点结合,再通过沉淀和洗涤等步骤富集
遗传学第十二章表观遗传学 精选课件
目 录
• 表观遗传学概述 • 表观遗传变异类型 • 表观遗传机制探讨 • 实验方法与技术手段 • 疾病发生发展中作用 • 药物研发及临床应用前景
01 表观遗传学概述
表观遗传学定义与特点
定义
表观遗传学是研究基因表达发生可 遗传变化而不涉及DNA序列改变的 学科。
异常影响
异常的非编码RNA表达与多种疾病相 关,如癌症、心血管疾病等。
作用
非编码RNA能够通过与靶基因结合或 调控转录因子等方式,影响基因表达 和细胞功能。
染色质重塑与核小体定位
定义
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一种结论:个体在发育和 生长过程中获得的环境影 响,被遗传给了后代。 什么决定基因?大自然(环 境)如此丰富多彩、如此变 化不停,很难想象,对于 一个开放的复杂生命系统, 不会打上它的烙印。
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人类同卵双生的孪生子:具有完全相同的基因组,在同样的环境下成 长,俩人的气质和体质应该非常相似。 实际情形:一些孪生子的情况并不符合预期的理论。往往在长大成人 后出现性格、健康方面的很大差异。这种反常现象长期困扰着遗传学 家。 现在科学家们发现:可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修 饰.这种改变不仅可以影响个体的发育,而且还可以遗传下去。
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表观遗传修饰
1. DNA甲基化(DNA methylation)
通 过 甲 基 供 体 ——S- 腺 苷 甲 硫 氨 酸 , 并 在 DNA 甲 基 转 移 酶 (DNA methyltransferase,DNMT)的催化下,CpG二核苷酸中的胞嘧啶环上5’位置 的氢被活性甲基所取代,从而转变成5-甲基胞嘧啶(5-mC) 。
• 表观遗传学(epigenetic):DNA的序列不发生变化、基因表达改变、并且这种
改变可稳定遗传。
• 表观遗传学研究的内容: 基因选择性转录、表达的调控。
1. 基因转录后调控。 2. 基因转录后调控。
表观遗传修饰从多个水平上调控基因表达:
1. DNA水平:DNA甲基化
基因表达的变 化(或性状的 变化)一定是 DNA序列变异 的结果吗?
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二、表遗传学的发展历史
1941年,Hermann J. Muller发现Position effect variegation (PEV) —— 第一种表观遗传学现象。
1942 年 , Waddington 提 出 现 代 Epigenetics 的概念,认为基因型通过一些“偶然的、不 确定的机制”决定了不同的表型。
CH
CH
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DNA复制后甲 基化型的维持
CH
3
DNA
DNA
CH
3
CH
复制
3
酶
甲基 CH
3
转移
CH
3
酶
CH
3
CpG岛(CpG island)
甲基化抑制基因的 表达
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1958年,R.A.Brink发现paramutation现象。
1961年,Mary Lyon发现X染色体 失活现象。
1983年,DNA甲基化的发现。
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近年来,现代分子生物学 认为细胞中信息的表达受两 种因素控制:一种是传统意 义上的遗传调控,另一种是 表观遗传调控—何时、何地、 以何种方式去应用遗传信息 的指令。
全球最大表观遗传学项目启动 2010/09/07
南都讯 记者刘凡 通讯员王静思 昨日,深圳华大基因研究院与伦敦国王学院的知名双胞胎研究团队 TwinsUK共同发起一项专门针对双胞胎的遗传学项目———Epitwin。该项目为 目前全球最大的表观遗传学项目,将对全球5000对双胞胎进行深入研究。 据介绍,这个项目计划对双胞胎中的基因进行分别研究,并且在同卵双胞 胎间进行比较。与以往研究不同的是,此次研究不是寻找相似之处,而是寻找 那些能够解释为什么同卵双胞胎不得同样疾病的差异。这个项目首先将以肥胖、 糖尿病、过敏反应、心脏病、骨质疏松症和长寿等为主要研究对象,但研究方 法可应用于各种常见性状和疾病。
2. 蛋白质水平:组蛋白修饰
3. 染色质水平:染色质重塑
4. RNA水平:miRNA、RNA干扰
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获得性遗传( Inheritance of
acquired characteristics)
Jean-Baptiste Lamarck
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随着对实验动物特别是克隆动物生物学性状的了解以 及人们对众多疾病的深入研究,科学家发现,除了基 因组DNA外,还有基因组之外的大量遗传学信息调控 着基因的表达,表观遗传学(epigenetics)应运而生。
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(1744-1829)
问题 文档仅供参考,不能作为科学依据,请勿模仿;如有不当之处,请联系网站或本人删除。 环境的作用能否改变个体的遗传特性,并传递给下
一代? 这种被称为“拉马克学说”(Lamarckism) 的观点一
直被正统的生物学家拒之门外。
瑞典一个科学家小组的研 究: 对于生于1890- 1920年 的瑞典男人的孙辈而言, 如果其祖父在青少年期间 吃得很好, 那么孙辈因糖 尿病而死亡的概率就很高; 如果其祖父是在饥饿中长 大的.那么孙辈死于心脏 病的机会就很少。也就是 说,祖父辈的饮食状态影 响到了孙辈的健康状态。
DNA高甲基化:基因启动子区的CpG岛在正常状态下一 般是非甲基化的,当发生甲基化时,基因转录沉寂,使一 些重要基因如抑癌基因、DNA修复基因等丧失功能,从而 导致正常细胞的生长分化调控失常以及DNA损伤不能被及 时修复,这与多种肿瘤形成密切相关。
(Human Epigenome Project , HEP) 。
• HEP 的提出和实施,标志着与 人类发育和肿瘤疾病密切相关 的表观遗传学(epigenetic) 和 表观基因组(epigenome) 研究 跨上了一个新的台阶。
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表观遗传学(epigentics) 被认为是遗传学领域中探讨 基因型与表现型之间相互关 系的一个新的研究方向。
• 人类表观基因组和疾病联合会 文档仅供参考,不能作为科学依据,请勿模仿;如有不当之处,请联系网站或本人删除。 于2003 年10月正式宣布开始 投资和实施旨在解析人类全基 因组中表观遗传信息及其与疾 病状态相关的特定表观遗传修 饰的人类表观基因组计划