2.1 核酸的化学组成
核酸的基本化学组成
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核酸的基本化学组成
核酸是一类复杂的有机分子,它们通常由氮元素、碳元素和氧元
素构成。
它们负责传递特定信息,并促进特定生物过程,例如遗传信
息和表达。
核酸最基本的单位是碱基(也称为核苷酸),它们以双螺旋的形
式耦合在一起,形成一种叫做核苷酸链的结构。
碱基由四种基本的分
子构成,包括腺烷酸(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(G)和尿嘧啶(C)。
它们都含有独特的结构,其中腺烷酸(A)和胸腺嘧啶(T)是
同构体,而胞嘧啶(G)和尿嘧啶(C)是异构体。
碱基之间是通过磷酸作为“桥梁”而联系在一起的,因此在化学
方面,核酸结构也叫做磷酸核苷酸链(DNA)或糖磷酸核苷酸链(RNA)。
碱基的序列决定了核酸的结构和功能,因此它们极其重要。
此外,核酸还可以含有其他类型的分子,例如核苷酸类似物、核
糖体和蛋白质等。
比如,DNA含有糖磷酸核苷酸及其他类似物,称为核
糖体;而RNA 则通常含有蛋白质,叫做核糖体和去甲肽环(ribosome)。
因此,总的来说,核酸是一种由碱基(如腺烷酸、胸腺嘧啶、胞
嘧啶和尿嘧啶)、磷酸和其他分子(如核糖体、蛋白质和去甲肽环)
组成的复杂有机分子,是生物过程的重要调节因子,也是生命的基础。
核酸的化学元素
![核酸的化学元素](https://img.taocdn.com/s3/m/adef2c8eb9f67c1cfad6195f312b3169a451ea3b.png)
核酸的化学元素《核酸的化学元素》同学们,今天咱们来聊聊核酸这个神奇的东西,不过呢,在这之前咱们得先把一些化学基础知识搞清楚,就像盖房子得先准备好砖头一样。
咱们先说说化学元素。
化学元素就像是构建化学世界的基本字母。
核酸主要是由碳(C)、氢(H)、氧(O)、氮(N)、磷(P)这些元素组成的。
这就好比一个篮球队,每个元素都有自己独特的作用,少了谁都不行。
那这些元素是怎么组合在一起形成核酸的呢?这就涉及到化学键啦。
化学键就像是原子之间的小钩子。
比如说离子键吧,它就像带正电和负电的原子像超强磁铁般吸在一起。
打个比方,就像冬天的时候,你穿的毛衣和头发之间,因为静电就会有那种吸附的感觉,这有点像离子键的作用。
而共价键呢,是原子共用小钩子连接。
这就好比两个人一起拉一个东西,大家都出点力,通过这个东西就连接在一起了。
核酸是个大分子,它的形成过程其实就像搭积木一样,通过这些化学键把不同的原子组合起来。
在这个过程中,还有一个概念叫化学平衡。
化学平衡就像是拔河比赛,反应物和生成物就像两队人。
在反应开始的时候,反应物这边人多力量大,就不断地向生成物那边转化。
但是呢,随着生成物越来越多,它也会有一股力量想变回反应物。
最后达到正逆反应速率相等、浓度不再变化的状态,这就像是拔河比赛两边都拉不动了,就保持在一个相对稳定的状态。
核酸分子还有个特性叫分子的极性。
这个怎么理解呢?咱们可以把分子想象成小磁针。
比如说水是极性分子,氧一端就像磁针南极带负电,氢一端就像北极带正电。
而二氧化碳是直线对称的非极性分子,就像一个两边完全一样的东西,没有那种一端带正电一端带负电的情况,就像一根笔直的没有磁性的小棍。
在化学里,还有配位化合物这个概念。
这个可以类比成一个聚会,中心离子就像是聚会的主角,配体就是那些提供孤对电子共享的小伙伴。
大家凑在一起,形成了一种特殊的组合。
核酸的合成和一些反应过程中还涉及到氧化还原反应中的电子转移。
这就像做生意一样,是一种交易。
Chapter 2 核酸的结构与功能教学教材
![Chapter 2 核酸的结构与功能教学教材](https://img.taocdn.com/s3/m/16dcc40a854769eae009581b6bd97f192279bf47.png)
核酸的结构与功能
Structures and Functions of Nucleic Acids
内容
2.1 核酸的种类与分布 2.2 核苷酸 2.3 DNA的分子结构 2.4 核酸与蛋白质的复合体 2.5 RNA的分子结构 2.6 核酸的理化性质
2
2.1 核酸(Nucleic acid) 的种类与分布
48
(四)DNA双螺旋结构的多样性
49
双螺旋DNA的类型及相关参数
类型 螺旋方向
存在条件
螺距 碱基数/螺旋 碱基倾角
A-DNA 右手
相对湿度75% 2.53 nm
11
19°
B-DNA 右手
相对湿度92% 3.54 nm
10.4
1°
Z-DNA 左手 嘌呤-嘧啶二核 4.56 nm
12
苷酸为重复单位
N=A/U/G/C
同样,dNDP、dNTP, N=A/T/G/C
腺嘌呤 腺苷
16
核苷多磷酸的生物学功能:
§NTP和dNTP分别是RNA和DNA的直接前体。 §ATP分子的最显著特点是含有两个高能磷酸键。水
解时, ATP可以释放出大量自由能,推动生物体内 各种需能的生化反应。 §UDP、ADP、GDP在多糖合成中,可作为携带葡 萄糖基的载体;CDP在磷脂合成中可作为携带胆 碱的载体。 §GTP、CTP、UTP在某些生化反应中也具有传递能 量的作用。
11
稀 有 碱 基
大多甲基化碱基,tRNA含量丰富 (高达10%) 12
2.2.3 戊糖
β-D-核糖
β-D-脱氧核糖
13
2.2.4 核苷
碱基和核糖(或脱氧核糖)通过C-N 糖苷 键连接形成核苷(或脱氧核苷)。
02 核酸的结构与功能(标注重点的一定要记,其他的也要看)
![02 核酸的结构与功能(标注重点的一定要记,其他的也要看)](https://img.taocdn.com/s3/m/9725bcfc0975f46527d3e1c4.png)
DNA含G,C多则Tm值高,反之则低。
二、【DNA复性】(重点)
定义 DNA变性后,在去除变性因素后 如条件适宜,DNA恢复双螺旋结构。 DNA热变性后,在适宜条件下的复性过程 叫退火。
三、分子杂交原理
【分子杂交】:异源单链DNA或DNA与RNA 之间经退火形成的杂代双链。(重点)
分类:(重点) mRNA 蛋白质合成模板
tRNA
rRNA HnRNA
转运氨基酸
核蛋白体组成成分 成熟mRNA的前体
一、信使RNA的结构与功能 (重点)
mRNA : 是不稳定的 RNA ,含量最小, 占细胞内 RNA的2.5%,是合成蛋白质的 模板。 mRNA的前体为HnRNA。
DNA变性
2、DNA热变性与增色效应
变性后的核酸因碱基暴露,对260nm波长的光 吸收增强,称为【增色效应】。(重点)
பைடு நூலகம்
当核苷酸摩尔数相同时 A260 :单核苷酸>单链 DNA>双链 DNA,这种 关系叫【减色效应】。(重点)
加热(80—100OC几分钟)使DNA变性,称热 变性。
【 解 链 温 度 】 ( Tm ) : 通 常 把 50 %DNA 变性时的温度称为解链温度(融 解温度)。(重点) DNA变性,紫外吸收增高;当紫外吸收 值达到最大值的50%时的温度叫Tm.
第三章 核酸的结构与功能
1.核酸的化学组成
2.核酸的一级结构
3.DNA的空间结构与功能(重点) 4.RNA的空间结构与功能 5.核酸的理化性质及其应用
分类
DNA
RNA
核酸的结构和功能Structureandfunctionofnucleicacid-生物化学
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人DNA 2.9 109bp 9.9 108nm
方向
RNA易降解
核酸链示意图(线条式)
核酸的文字表述方式
5’pApCpTpTpGpApApCpG3’ DNA 5’pApCpUpUpGpApApCpC3’ RNA
简化为:
5’pACTTGAACG3’ DNA
5’pACUUGAACG3’RNA
一级结构的基本特征
由四种脱氧核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连成不分枝的多
碱基不参于主链而是
向外伸出形成侧链, 主链单调重复,侧链千变万化。
一级结构中重要的是核苷酸的组成(数量)和排列顺序
(碱基序列)。不同的DNA有不同的碱基组成和排列 顺序,这是构成DNA作为遗传物质的关键因素。
核酸的结构和功能
Structure and function of nucleic acid
1. 2. 3.
核酸的化学组成 核酸的分子结构 核酸的理化性质及应用
1 核酸的种类分布和化学组成
1.1 核酸的发现及其生物学功能 1.2 核酸的种类和分布
1.3 核酸的化学组成
1.1 核酸的发现及其生物学功能
结论:
在加热杀死的ⅢS型肺炎双球菌中有较耐高温的转化物质能够
进入ⅡR型
IIR型转变为ⅢS型
无毒转变为有毒。
1.1.2
A.D.Hershey
M.Chase (1952年)
1952年A.D.Hershey和
M.Chase用35S和32P分别标
记T2噬菌体的蛋白质和核酸,
感染大肠杆菌的实验进一步
证明了DNA是遗传物质
(A+T) /(G+C)
1.01 1.21 1.21 1.43 1.079
第三章 核酸化学
![第三章 核酸化学](https://img.taocdn.com/s3/m/8d0f0a15ba1aa8114431d9f1.png)
rRNA的功能 参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。
思考题:
体内有哪些重要的核苷酸?各有何作用?
DNA和RNA在化学组成、分子结构和生理功能有何异同? 利用核酸的理化性质在临床实践中有何应用?
N O O
-
NH2 N N OCH2
-
O O
-
O O
-
N H H
P O
-
P O
-
P O
O
H H
OH OH 三磷酸腺苷 (AT P )
多磷酸核苷酸
5′-磷酯键
N N O -O O O O O
NH 2
N
N
P O-
P O-
P O-
O
CH 2 H H OH
O H H H
脱氧腺嘌呤核苷 脱氧腺嘌呤一磷酸 (dAMP) 脱氧腺嘌呤二磷酸 (dADP) 脱氧腺嘌呤三磷酸 (dATP)
NH
核苷
N N
2 N 9 N
糖苷键
CH O H O 2 1'
H H OH H 2' O H H
嘌呤N-9或嘧啶N-1与核糖C-1通过β-N-糖苷 键相连形成核苷。
核苷酸(ribonucleotide)
NH2
酯键
O
N N O
N
9 N
糖苷键
HO P O CH 2 O
-
H
H
OH
' 1 H H 2'
* tRNA的二级结构
——三叶草形
氨基酸臂 DHU环 反密码环
额外环
生物化学第三章核酸
![生物化学第三章核酸](https://img.taocdn.com/s3/m/e8b7cdf6c8d376eeaeaa3188.png)
第三节 RNA的结构与功能
Structure and Function of RNA
• DNA和RNA的区别
不同点 戊糖 碱基 二级结构 碱基互补配对 种类 RNA 核糖 G C A U 单链 忠实性较低 多 (mRNA,rRNA, tRNA 等) DNA 脱氧核糖 G C A T 双链 忠实性高 少
碱基互补配对: 腺嘌呤/胸腺嘧啶(A-T)
4.双螺旋表面存在大沟和小沟
小沟
大沟
(二) DNA二级结构的多样性
• 三种DNA构型的比较
螺距 旋向 (nm) 每圈碱 基数 螺旋直径 (nm) 骨架 走行
存在条件
A型 右手 B型 右手
2.3 3.54
11 10.5
2.5 2.4
平滑 平滑
体外脱水 生理条件
(二)碱基
碱基(base)是含氮的杂环化合物。
腺嘌呤
嘌呤 碱基 嘧啶 鸟嘌呤 存在于DNA和RNA中
胞嘧啶
尿嘧啶 胸腺嘧啶 仅存在于RNA中 仅存在于DNA中
NH2
嘌呤(purine,Pu)
N 7 8 9 NH
N
N
NH
5 4
6 3 N
1N 2
腺嘌呤(adenine, A)
O N
N
NH
NH
鸟嘌呤(guanine, G)
(二) 原核生物DNA的环状超螺旋结构
原核生物DNA多为环状,以负超螺旋的形 式存在,平均每200碱基就有一个超螺旋形成。
DNA超螺旋结构的电镜图象
(三) DNA在真核生物细胞核内的组装
真核生物染色体由DNA和蛋白质构成
基本单位是核小体
DNA染色质呈现出的串珠样结构。 染色质的基本单位是核小体(nucleosome)。
核酸的种类和分布及化学组成
![核酸的种类和分布及化学组成](https://img.taocdn.com/s3/m/35bd29925ebfc77da26925c52cc58bd6318693f8.png)
核酸的化学组成
碱基
碱基是核酸分子中的信息携带者。DNA中 的碱基有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶 (C)和胸腺嘧啶(T);RNA中的碱基有腺嘌 呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶 (U)。这些碱基通过氢键相互配对,形成 稳定的核酸结构。在DNA中,A与T配对,G 与C配对;在RNA中,A与U配对,G与C配对 。这些配对原则保证了核酸分子中的遗传 信息能够准确地进行复制和转录
RNA
核糖核酸(RNA)在生物体内起着多种多样 的作用。它可以是遗传信息的传递者,也 可以是蛋白质的合成者。RNA通常以单链 的形式存在,也可以形成一些复杂的结构 ,如tRNA和rRNA。RNA中的核苷酸由磷酸 、核糖和四种不同的碱基组成:腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)
2
核酸的种类和分布 及化学组成
-
目录
CONTENTS
1
2
3
4
核酸的种类
核酸的分布 核酸的化学组成
总结
1
核酸的种类
4
核酸的种类
核酸分为两种基本类型:脱氧核糖核酸 (DNA)和核糖核酸(RNA)
• 编辑母版文本样式
• 第二级 • 第三级 • 第四级
• 第五级
这两种核酸都是由许多核苷酸通过磷酸 二酯键连接而成的长链
核酸的分布
DNA
DNA主要分布在生物 体的细胞核中,这里 是遗传信息的储存地 。然而,在线粒体和 叶绿体等细胞器中, 也发现了DNA的存在
核酸的分布
核酸的分布
RNA
RNA在细胞中的分布比DNA更为广泛。除了在细胞核中, RNA还在细胞质、线粒体和叶绿体中发挥作用。其中, mRNA和tRNA是在翻译过程中起到关键作用的两种RNA
核酸分子生物学基础
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AMP
戊 糖
HO CH2 5´ O OH HO CH2 O OH
4´ 3´
OH
1´
2´
OH OH
核糖(ribose) (构成RNA)
脱氧核糖(deoxyribose) (构成DNA)
Hale Waihona Puke • 戊糖DNA,RNA中主要的碱基、核苷
戊糖
RNA
D-核糖
碱基
A G C U A G C T
核苷
四、变性与复性
(一) 变性(denaturation) 1、核酸的变性与增色效应
核酸的变性是指核酸双螺旋区的氢键断裂,变成单链结 构的过程。 变性:不涉及共价键3’,5’-磷酸二酯键的断裂,所以它 的一级结构(碱基顺序)保持不变 降解:多核苷酸骨架上共价键断裂,引起相对分子质量 降低
核酸分子细长,溶液的粘度很大,且DNA溶液的粘 度比RNA的大得多。发生变性或降解时,它们的粘 度降低。
二、两性解离
核酸是两性电解质(含有磷酸和氨基),可发 生两性解离。 核酸的解离状态与溶液的pH有关,当核酸溶液 在某一pH时,核酸分子内的酸性解离与碱性解 离相等,所带的正负电荷相等,净电荷为零, 此时核酸溶液的pH称为核酸的等电点(pI)。 由于磷酸酸性较强,而碱基(氨基)是弱碱, 所以核酸的等电点较低。DNA的等电点为4~ 4.5,RNA的等电点为2~2.5。
2、分布
真核细胞
细胞核(95%): 线型双链,一般与组蛋白结合 成染色体 线粒体、叶绿体(5%):环 状双链 细胞质(75%) 线粒体、叶绿体(15%) 细胞核(10%)
原核细胞
环状双链 主要集中于核区
核酸化学知识点总结
![核酸化学知识点总结](https://img.taocdn.com/s3/m/0a5ae78b59f5f61fb7360b4c2e3f5727a5e924ad.png)
核酸化学知识点总结一、核酸的化学结构1. 核酸的基本结构核酸是由核苷酸组成的,核苷酸又由碱基、糖和磷酸组成。
碱基分为嘌呤和嘧啶两类,嘌呤包括腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G),嘧啶包括胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。
糖分为核糖和脱氧核糖,其中RNA中的糖为核糖,DNA中的糖为脱氧核糖。
核苷酸是由碱基和糖组成的核苷,再与磷酸结合形成核苷酸。
2. 核酸的二级结构核酸的二级结构是指单条核酸链上碱基序列所具有的空间结构。
DNA分子具有双螺旋结构,由两条互补的DNA链通过氢键相互缠绕形成。
RNA分子没有固定的二级结构,但在一些情况下也可以形成双链结构。
3. 核酸的三级结构核酸的三级结构是指单条核酸链在立体空间上所呈现的结构。
DNA分子呈现出右旋的螺旋结构,RNA分子则可以形成各种复杂的结构。
4. 核酸的四级结构核酸的四级结构是指多条核酸链相互作用所形成的更为复杂的结构。
在一些特定情况下,核酸分子可以形成四级结构,并参与到一些生物学过程中。
二、核酸的功能1. 遗传信息的储存与传递核酸是生物体内遗传信息的携带者,DNA分子储存着生物体的遗传信息,RNA分子则在转录和翻译过程中参与到遗传信息的传递和表达中。
2. 蛋白质合成核酸通过转录和翻译的过程,参与到蛋白质的合成过程中。
DNA分子在转录过程中产生mRNA,mRNA再通过翻译过程将基因信息翻译成蛋白质。
3. 调节基因表达在一些生物学过程中,核酸可以通过转录调控、剪接调控和甲基化调控等方式来参与到基因的表达调节中。
4. 氧化磷酸化核酸分子参与到细胞内氧化磷酸化过程中,通过释放出磷酸来提供细胞内化学能量,并维持细胞内正常生理活动。
三、核酸的合成1. DNA的合成(DNA合成)DNA的合成是DNA聚合酶在DNA模板的引导下,将合适的脱氧核苷酸三磷酸酶与新合成的核甙核苷酸通过磷酸二酯键连接,使DNA链不断延长的过程。
DNA合成是细胞分裂前的准备工作,也是基因工程和分子生物学研究中的重要技术手段。
生物化学第三章核酸化学
![生物化学第三章核酸化学](https://img.taocdn.com/s3/m/ddd90f757e21af45b307a8be.png)
核糖核酸酶类
牛胰核糖核酸酶:存在于牛胰中,简称为 RNaseⅠ,只作用于RNA,十分耐热,是具 有极高专一性的内切酶。 核糖核酸酶T1:从米曲霉中获得的,耐热, 耐酸,专一性更强。 核糖核酸酶T2:来源同T1,核酸酶:也叫做DNaseⅠ, 需要镁离子参与,切断双链DNA或者单链 DNA为寡聚核苷酸,平均长度为4个核苷酸。 ② 牛脾脱氧核糖核酸酶:也叫做DNaseⅡ, 需要钠离子激活,镁离子抑制活性。 ③ 限制性内切酶:主要降解外源性DNA,目 前发现有数千种,是基因工程最重要的工 具酶。
RNA功能的多样性
① ② ③ ④ ⑤ 控制蛋白质的生物合成; 作用于RNA转录后的加工与修饰; 基因表达与细胞功能调节; 生物催化与其他的细胞功能 遗传信息的加工与进化
第三节
核酸的分子结构
一. 核酸中核苷酸的连 接方式 二. DNA的分子结构 三. RNA的分子结构
核酸中核苷酸的连接方式
1. 核苷酸可以被酸、碱 和酶水解,水解后产 生寡核苷酸、核苷酸、 核苷和碱基。 2. 实验证明,核苷酸是 通过磷酸二酯键彼此 相连,并且形成的是 3’-5’磷酸二酯键(后 面核酸降解中详细说 明)。
tRNA的一级结构特点
① 一般由73-78个核苷酸组成; ② 碱基中有较多的稀有碱基; ③ 3’末端均有CCA-OH结构,用以携带氨基 酸,5’多为pG或者pC。
tRNA的二级结构特点
① 氨基酸臂,由3’和5’末端的7对互补碱基构 成,携带氨基酸,富含G,形成双螺旋; ② 二氢尿嘧啶环,8-12个核苷酸组成,由34对碱基构成双螺旋; ③ 反密码子环,7个核苷酸组成,其中3个组 成反密码子环; ④ 额外环,是tRNA分类的重要标志 ⑤ TψC环,是tRNA中起连接作用的。
核酸化学2011
![核酸化学2011](https://img.taocdn.com/s3/m/efd238c2f8c75fbfc77db2fe.png)
基本碱基结构和命名
嘌呤
嘧啶
Adenine
(A)
Guanine
(G)
Cytosine
(C)
Uracil Thymine
(U) (T)
OD260的应用
1. DNA或RNA的定量 OD260=1.0相当于 50μg/ml双链DNA 40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸
2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8 RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0
例:变性引起紫外吸收值的改变
DNA的紫外吸收光谱 增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。
热变性
解链曲线:如果在连续加热DNA的过程中以
温度对A260(absorbance,A,A260代表溶液在 260nm处的吸光率)值作图,所得的曲线称为解 链曲线。
Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成, 在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的 50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解 温 度 (melting temperature, Tm) 。 其 大 小 与 G+C含量成正比。
碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖
NH2
苷键连接形成核苷(脱氧核苷)。
N
核苷:AR, GR, UR, CR
1
HO CH2 O N O
1´
脱氧核苷:dAR, dGR, dTR, dCR OH OH
核苷酸(ribonucleotide)的结构与命名
核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键
连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。
二、DNA的变性(denaturation)
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开 成两条单链的过程。
核酸的化学组成以及一级结构
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脱氧核苷一磷酸
脱氧腺苷一磷酸 (deoxyadenosine monophosphate, dAMP)
脱氧鸟苷一磷酸 (deoxyguanosine monophosphate, dGMP)
脱氧胞苷一磷酸 (deoxycytidine monophosphate, dCMP)
脱氧胸苷一磷酸 (deoxythymidine monophosphate, dTMP)
磷酯键
5’
H
脱氧腺苷三磷酸 (dATP)
核苷酸衍生物
5’
3´,5´-环腺苷酸 (cyclic AMP, cAMP)
3’
碱基
腺嘌呤 (adenine,A)
鸟嘌呤 (guanine,G)
胞嘧啶 (cytosine,C)
尿嘧啶 (uracil,U)
RNA的分子组成
核苷
腺苷 (adenosine)
鸟苷 (guanosine)
b-N-糖苷键 胞苷 碱基和戊糖环处在反式构象
9 1’
b-N-糖苷键 脱氧腺苷
核苷酸(nucleotide)
磷酯键
5’
H
脱氧腺苷
核苷酸(nucleotide)
磷酯键
5’
H
脱氧腺苷一磷酸 (dAMP)
核苷酸(nucleotide)
磷酯键
5’
H
脱氧腺苷二磷酸 (dADP)
核苷酸(nucleotide)
5’
三、RNA是核糖核苷酸通过3´,5´-磷酸二脂键链接 形成的线性大分子
虽然C2´原子也有羟基,磷酸二脂键只能在C3´和C5´间形成。 RNA也具有5´→3´的方向性。 RNA的核糖而不是脱氧核糖。 RNA的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶,没有胸腺嘧啶。
华中农业大学生物化学考研试题库附答案核酸化学
![华中农业大学生物化学考研试题库附答案核酸化学](https://img.taocdn.com/s3/m/224dae952af90242a895e5f9.png)
第5章核酸化学一、学大纲基本要求DNA、RNA的结构和性质以及研究技术。
核酸的化学结构,碱基、核苷、核苷酸,DNA的结构,DNA 的一级结构, DNA的二级结构, DNA结构的不均一性和多形性, 环状DNA, 染色体的结构。
RNA的结构, RNA的类型和结构特点,tRNA的结构和功能, mRNA的结构和功能, rRNA的结构和功能。
核酸的性质, 解离性质, 水解性质, 光吸收性质, 沉降特性,变性、复性及杂交。
核酸研究技术,核酸的分离纯化,限制性核酸内切酶,DNA物理图谱,分子杂交,DNA序列分析,DNA的化学合成,DNA 聚合酶链式反应—PCR。
二、本章知识要点(一) 核酸的化学组成1.元素组成核酸分子主要由碳、氢、氧、氮和磷等元素组成。
与蛋白质相比较,核酸的元素组成中一般不含有硫,而磷的含量较为稳定,占核酸9%~10%。
可通过测定磷含量来估计样品中核酸的含量。
2.物质组成核酸在核酸酶的作用下水解为核苷酸,核苷酸完全水解可释放出等摩尔量的含N碱(碱基Base)、戊糖和磷酸。
因此构成核酸的物质成分有三类:包括磷酸、戊糖和碱基。
戊糖可分为核糖和脱氧核糖,碱基又分为嘌呤碱和嘧啶碱两类,DNA中的戊糖和碱基与RNA有所不同。
DNA分子中的戊糖是β-D-2-脱氧核糖,RNA中的戊糖是β-D-核糖。
DNA分子中存在的碱基主要有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。
RNA分子中除含有A,G,C外,还含有尿嘧啶(U),而不含有T。
因此,DNA和RNA的碱基组成上,嘧啶的组成有所不同。
在DNA和RNA分子中尚含有少量的不常见的其他碱基,称为稀有碱基,它们大多数是常见碱基的甲基化衍生物。
3.核酸的基本单位——核苷酸组成DNA的核苷酸(nucleotide)称为脱氧核糖核苷酸,组成RNA的核苷酸称为核糖核苷酸。
核苷酸则是由磷酸、戊糖、碱基组成。
碱基和核糖或脱氧核糖之间脱水通过糖苷键(glycosidic bond)缩合形成核苷或脱氧核苷,戊糖的第1位碳原子与嘌呤的第9位氮原子相连构成l,9—糖苷键,而与嘧啶的第l位氮原子相连构成1,1-糖苷键。
核酸的结构
![核酸的结构](https://img.taocdn.com/s3/m/b29e5f10b7360b4c2e3f647e.png)
Z 细长 左手 1.84nm 0.38nm 60º 12 4.56nm 9º
College of Life Sciences, CNU
A, B, Z-DNA的比较
College of Life Sciences, CNU
(四) DNA的三级结构
• 定义:
在双螺旋的基础上进一步螺旋化,形成超螺旋DNA (Supercoiled DNA)。
2. 嘌呤碱 (Purine )
College of Life Sciences, CNU
• 其它嘌呤衍生物
7 1 3
次黄嘌呤( I )
黄嘌呤(X)
尿酸
茶叶碱(1,3-二甲基黄嘌呤) 可可碱( 3,7-二甲基黄嘌呤) 咖啡碱( 1,3,7-三甲基黄嘌呤)
College of Life Sciences, CNU
5′
3′
Watson-Crick DNA双螺旋模型
(2) 在螺旋的外侧,脱氧核糖 与Pi交替排列,彼此以3, 5-磷 酸二酯键相连,构成 DNA分 子的骨架,糖环平面与纵轴平 行。
由于磷酸基团带负电荷,两条 多核苷酸链将可能因为静电斥力而 相互分开,DNA分子是如何维持其 稳定性呢?
DNA骨架
H
5´-dNMP
College of Life Sciences, CNU
脱氧腺苷酸
脱氧鸟苷酸
(5´-dAMP)
(5 ´-dGMP)
脱氧胸苷酸
脱氧胞苷酸
(5´-dTMP)
( 5´-dCMP)
3. 多磷酸核苷酸
College of Life Sciences, CNU
核糖系列
(5´-核苷单磷酸)
(5´-核苷二磷酸) (5´-核苷三磷酸)
生物化学第一节 核酸的化学组成以及一级结构
![生物化学第一节 核酸的化学组成以及一级结构](https://img.taocdn.com/s3/m/b3689015de80d4d8d15a4f4a.png)
第一节核酸的化学组成以及一级结构2015-07-06 71573 0第二章核酸的结构与功能核酸( nucleic acid)是以核苷酸为基本组成单位的生物信息大分子,具有复杂的结构和重要的生物学功能。
核酸可以分为脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)两类。
真核生物DNA存在于细胞核和线粒体内,携带遗传信息,并通过复制的方式将遗传信息进行传代。
细胞以及个体的基因型( genotype)是由这种遗传信息组成的。
在绝大多数生物中,RNA是DNA的转录产物,参与遗传信息的复制和表达。
真核生物RNA 存在于细胞质、细胞核和线粒体内。
在某些病毒中,RNA也可以作为遗传信息的载体。
第一节核酸的化学组成以及一级结构核酸在核酸酶作用下水解成核苷酸( nucleotide),而核苷酸完全水解后可释放出等摩尔的碱基、戊糖和磷酸。
这表明构成核酸的基本组分之间具有一定的对应关系。
DNA的基本组成单位是脱氧核糖核苷酸( deoxyribonucleotide),而RNA的基本组成单位是核糖核苷酸(ribonucleoti- de)。
一、核苷酸是构成核酸的基本组成单位碱基( base)是构成核苷酸的基本组分之一。
碱基是含氮的杂环化合物,可分为嘌呤( purine)和嘧啶(pyrimidine)两类(图2-1)。
常见的嘌呤包括腺嘌呤(adenine,A)和鸟嘌呤(gua- mne,G),常见的嘧啶包括尿嘧啶(uracil,U)、胸腺嘧啶(thymine,T)和胞嘧啶(cytosine,C)。
DNA 中的碱基有A、G、C 和T;而RNA中的碱基有A、G、C和U。
碱基的各个原子分别加以编号以便于区分。
这五种碱基的酮基或氨基受所处环境pH的影响可以形成酮-烯醇(keto-enol)互变异构体或氨基-亚氨基(amino-imino)互变异构体,这为碱基之间形成氢键提供了结构基础(图2-2)。
核酸的化学组成知识点归纳
![核酸的化学组成知识点归纳](https://img.taocdn.com/s3/m/1fa76b3ddc36a32d7375a417866fb84ae45cc364.png)
核酸的化学组成知识点归纳核酸的化学组成知识点归纳天然存在的核酸有两类,即脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)。
DNA分子是生物体的遗传信息库,分布在原核细胞的核区,真核细胞的核和细胞器以及病毒中;RNA分子参与遗传信息表达的一些过程,主要存在于细胞质。
一、核酸的基本组成单位核酸是一种多聚核苷酸,用不同的降解法得到其组成单位——核苷酸。
而核苷酸又由碱基、戊糖和磷酸组成。
(一)戊糖DNA含β—D—2—脱氧核糖,RNA含β—D—核糖。
这是核酸分类的依据。
核糖中的C记为1'……5'。
(二)碱基(base)核酸中的碱基有两类:嘌呤碱和嘧啶碱。
有5种基本的碱基外,还有一些含量甚少的稀DNA和RNA中常见的两种嘌呤碱是腺嘌呤(adenine,A)、鸟嘌呤(guanine,G)。
有碱基。
而嘧啶碱有所不同:RNA主要含胞嘧啶(cytosine,C)、尿嘧啶(uracil,U),DNA主要含胞嘧啶、胸腺嘧啶(thymine,T)。
tRNA中含有较多的稀有碱基(修饰碱基),多为甲基化的。
(三)核苷是碱基和戊糖生成的糖苷。
通过C1'— N9或C1'—N1糖苷键连接,用单字符表示,脱氧核苷则在单字符前加d。
常见的修饰核苷有:次黄苷或肌苷为I、黄嘌呤核苷X、二氢尿嘧啶核苷D、假尿苷Ψ等。
注意符号的意义,如m5dC。
(四)核苷酸是核苷的磷酸酯。
生物体内游离存在的多是5'—核苷酸(如pA、pdG等)。
常见的核苷酸为AMP、GMA、CMP、UMP。
常见的脱氧核苷酸有dAMP、dGMA、dCMP、dTMP。
AMP是一些重要辅酶的结构成分(如NAD+、NADP+、FAD等);环化核苷酸(cAMP/cGMP)是细胞功能的调节分子和信号分子。
ATP在能量代谢中起重要作用。
核苷酸是两性电解质,有等电点。
核苷酸有互变异构和紫外吸收。
(含氧的碱基有酮式和烯醇式两种互变异构体,在生理pH条件下主要以酮式存在)二、核苷酸的连接方式RNA和DNA链都有方向性,从5'→ 3'。
生物化学第二章 核酸的结构
![生物化学第二章 核酸的结构](https://img.taocdn.com/s3/m/183be43a4b35eefdc9d3330c.png)
Na+,K+, Cs+ 窄深
宽深
Na+低盐
Li+
Na+, Mg++高 盐
宽中等 深 宽中等 深 平浅
窄中 等深 窄中 等深 窄深
• 真核生物染色体DNA是线型双链DNA。
• • 细胞器DNA、原核生物的染色体DNA、 质粒DNA都是环状双链
补充知识:
(一)三链DNA(triple helix DNA)
脱氧鸟嘌呤核苷酸(dGMP) 脱氧胞嘧啶核苷酸(dCMP) 脱氧胸腺嘧啶核苷酸(dTMP)
多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP
N O
HO P O CH2O N
OH
AMP OH OH
NH2 N
N
N
O
O
HO P O P O CH2O N OH OH
ADP
OH OH
N
O
O
O
HO P O P O P O CH2O N OH OH OH
7)碱基环氮原子的烷基化反应
8)环外氨基的反应
9)环外氧的烷基化反应
(二)戊 糖
(三) 磷酸:
(四)核苷酸
1. 核苷(ribonucleoside)
碱基和核糖(脱氧核糖) 糖苷键
N-9 C-1'
N-1
NH 2
N
N
N
N
HOCH 2
9
O
1
HO
OH
NH2
N
O N1 HOCH2
O
1
OH H
• 核苷:腺苷,鸟苷 • 脱氧核苷:
定义: 核酸中核苷酸的排列顺序, 也称为碱基序列。
核苷酸的连接 以3',5'–磷酸二酯键连接
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2.1
核酸的化学组成
目录
核酸(nucleic acid)
是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。
核酸的分类及分布
存在于细胞核和线粒体、叶绿体、
质粒
分布于细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体(deoxyribonucleic acid, DNA)(ribonucleic acid,
RNA)脱氧核糖核酸核糖核酸携带遗传信息,并通过复制传递给下一代。
是DNA 转录的产物,参与遗传信
息的复制与表达。
某些病毒RNA
也可作为遗传信息的载体
第一节
核酸的化学组成以及一级结构The Chemical Component and Primary
Structure of Nucleic Acid
目录
核酸的元素组成:
C 、H 、O 、N 、P (9~10%)目录
核酸(DNA 和RNA )
核苷酸
核苷和脱氧核苷
磷酸戊糖碱基
嘌呤嘧啶
核糖脱氧核糖 核酸组成
DNA 的组成单位是脱氧核糖核苷酸(deoxyribonucleotide )RNA 的组成单位是核糖核苷酸(ribonucleotide )。
⏹分子组成
碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱
戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖
磷酸(phosphate)
一、核苷酸是构成核酸的基本组成单位目录
碱基(base)是含氮的杂环化合物。
碱基嘌呤嘧啶腺嘌呤
鸟嘌呤尿嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶
存在于DNA 和RNA 中
仅存在于RNA 中
仅存在于DNA 中
⏹碱基
嘌呤(purine ,Pu) N
N NH N 1234
56789N
N
NH N NH 2
腺嘌呤(adenine, A)
N NH
NH
N NH 2
O
鸟嘌呤(guanine, G)N NH 132
456嘧啶(pyrimidine ,Py)胞嘧啶(cytosine, C)N NH NH 2O 尿嘧啶(uracil, U)
NH NH
O
O
胸腺嘧啶(thymine, T)
NH NH
O
O
C
H 3
目录
碱基的互变异构体
HN HN C NH 2+O
+HN NH 2N NH 2
亚氨式氨式
+ H +
N C OH N C O -+ H +
酮式烯醇式目录
N NH NH N N O CH 3CH 3N N
NH N N H CH 2CH C CH 3CH 3
NH NH
O
O H
H H H NH NH S
O N,N 二甲基鸟嘌呤N 6-异戊烯腺嘌呤双氢尿嘧啶
4-巯尿嘧啶
稀有碱基
⏹戊糖
(构成RNA )1´
2´
3´4´5´OH O CH 2O H OH OH β-D-核糖(ribose)(构成DNA )
OH
O
CH
2O H OH
β-D-2′脱氧核糖(deoxyribose)目录
⏹脱氧核苷
嘌呤N-9与脱氧核糖C-1 通过β-N-糖苷键相连
形成脱氧核苷(deoxyribonucleoside)。
H OH O
H
H H
HOH 2C
H N N N N NH 2O H OH H H H HOH 2C H N N N
N
NH 2
糖苷键反式脱氧腺苷顺式脱氧腺苷
目录
嘧啶N -1与核糖C-1 通过β-N -糖苷键相连形成
核苷(ribonucleoside)。
⏹核苷O H O CH 2OH
OH N
N NH 2
O
1´
1目录
核苷或脱氧核苷与磷酸通过酯键结合构成核苷酸(ribonucleotide)或脱氧核苷酸(deoxyribonucleotide)。
⏹核苷酸(ribonucleotide)
N N N
N 9NH 2
O
O H
O H H H H
C H 2H 1'
2'O P O -
H O O 糖苷键
酯键
目录
⏹构成RNA 的碱基、核苷以及核苷酸
碱基核苷核苷酸
A 腺苷adenosine 腺苷一磷酸
adenosine monophosphate, AMP
G 鸟苷guanosine 鸟苷一磷酸
guanosine monophosphate, GMP
C 胞苷cytidine 胞苷一磷酸
cytidine monophosphate, CMP
U 尿苷uridine 尿苷一磷酸
uridine monophosphate, UMP 目录
⏹构成DNA 的碱基、核苷、核苷酸
碱基脱氧核苷脱氧核苷酸
A 脱氧腺苷deoxyadenosine 脱氧腺苷一磷酸
deoxyadenosine monophosphate,
dAMP
G 脱氧鸟苷deoxyguanosine 脱氧鸟苷一磷酸
deoxyguanosine monophosphate,
dGMP
C 脱氧胞苷deoxycytidine 脱氧胞苷一磷酸
deoxycytidine monophosphate,
dCMP
T 脱氧胸苷deoxythymidine 或thymidine 脱氧胸苷一磷酸
deoxythymidine monophosphate,
dTMP
目录
体内重要的游离核苷酸及其衍生物●含核苷酸的生物活性物质:NAD +、NADP +、CoA-SH 、FAD 等都含有AMP ●多磷酸核苷酸:NMP ,NDP ,NTP ●环化核苷酸: cAMP ,cGMP N
O CH 2O OH OH N N
N NH 2P O OH O H AMP N O CH 2O OH OH N N N NH 2P O OH O P O OH O H ADP N O CH 2O OH OH N
N N
NH 2P O OH O P O OH O P O OH O H ATP N O CH 2O OH
O N N
N NH 2
P O OH cAMP
NADP +
NAD +目录
P -O O-O N
N N
N NH 2
O
H
OH H
H H CH 2H O P O O-O P O O-O 5′-磷酯键αβγ脱氧腺嘌呤二磷酸 (dADP )
脱氧腺嘌呤三磷酸 (dATP )
脱氧腺嘌呤核苷
脱氧腺嘌呤一磷酸 (dAMP )
⏹多磷酸核苷酸
目录
环化核苷酸:cAMP 、cGMP ,是细胞信号转导中的第二信使。
N
O
CH 2
O
OH
O
N
N
N
NH 2
P O
OH
cAMP
核苷酸衍生物
目录
生物氧化体系的重要成分,在传递质子或电子的过程中具有重要的作用。
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,nicotinamide adenine dinucleotide, NAD+),
二、DNA 是脱氧核苷酸通过3',5'-磷酸二酯键
连接形成的大分子
一个脱氧核苷酸3'的羟基与另一个核苷酸5'的α-磷酸基团缩合形成磷酸二酯键(phosphodiester bond)。
多个脱氧核苷酸通过磷酸二酯键构成了具有方向性的线性分子,称为多聚脱氧核苷酸(polydeoxynucleotide),即DNA 链。
目录
5´-末端
3´-末端
C
G
A
磷酸二酯键
磷酸二酯键
目录
5´-磷酸基团
3´,5´-磷酸二酯键碱基
碱基
碱基
3´-羟基
O-P O
O-O
O
H O
H H H
H CH 2P O
O-O
O
H O
H H
H
CH 2
H P O O-
O
O H H H H
H
CH 2
O P O O-
O O
H OH
H H H
H CH 2碱基
核酸方向
交替的磷酸基团和戊糖构成了DNA 的骨架(backbone)。
DNA 链的方向是5'→3'
目录
三、RNA 也是具有3', 5'-磷酸二酯键
的线性大分子
RNA 也是多个核苷酸分子通过3',5'-磷酸二酯键连接形成的线性大分子,也具有5'→3'方向性;
RNA 的戊糖是核糖;
RNA 的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶。
构成RNA 的四种基本核苷酸是AMP 、GMP 、CMP 和UMP 。
⏹定义
核酸中核苷酸的排列顺序。
由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。
5'端
3'端
C
G
A
四、核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
目录
A
G
P 5'P
T
P G
P C
P T
P
OH 3'
⏹
核酸的一级结构
5'p A p C p T p G p C p T -OH 3'
5'A C T G C T 3'
A C T G C T。