菌种分类学拉丁命名
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Abiotrophia defectiva 软弱贫养菌
Achromobacter spp 无色杆菌属某些种
Acinetobacter /Pseudomonas spp 不动杆菌/假单胞菌属某些种Acinetobacter baumannii 鲍氏不动杆菌
Acinetobacter calcoaceticus 醋酸钙不动杆菌
Acinetobacter haemolyticus 溶血不动杆菌
Acinetobacter johnsonii 约氏不动杆菌
Acinetobacter junii 琼氏不动杆菌
Acinetobacter lwoffii 鲁氏不动杆菌
Acinetobacter radioresistens 抗辐射不动杆菌
Acinetobacter spp 不动杆菌属某些种
Acinetobacter spp/Pseudomonas spp 不动杆菌属某些种/假单胞菌属某些种Acinetobacter/Pseudomonas spp 不动杆菌/假单胞菌属某些种Actinobacillus actinomycetemcomitans 伴放线放线杆菌
Actinomyces israelii 衣氏放线菌
Actinomyces meyeri 麦氏放线菌
Actinomyces naeslundii 内氏放线菌
Actinomyces neuii anitratus 纽氏放线菌无硝亚种
Actinomyces neuii neuii 纽氏放线菌纽氏亚种
Actinomyces neuii radingae 纽氏放线菌罗亚种
Actinomyces neuii turicensis 纽氏放线菌图列茨亚种
Actinomyces odontolyticus 龋齿放线菌
Actinomyces viscosus 粘放线菌
Aerococcus viridans 绿浅气球菌
Aeromonas caviae 豚鼠气单胞菌
Aeromonas hydrophila 嗜水气单胞菌
Aeromonas hydrophila gr. 嗜水气单胞菌群
Aeromonas salmonicida achromogenes 杀鲑气单胞菌无色亚种Aeromonas salmonicida masoucida 杀鲑气单胞菌杀日本鲑亚种Aeromonas salmonicida salmonicida 杀鲑气单胞菌杀鲑亚种Aeromonas sobria 温和气单胞菌
Agrobacterium radiobacter 放射形土壤杆菌
Alcaligenes denitrificans 反硝化产碱菌
Alcaligenes faecalis 粪产碱菌
Alcaligenes spp 产碱菌属某些种
Alcaligenes xylosoxidans 木糖氧化产碱菌
Alloiococcus otitis 耳炎差异球菌
Anaerobiospirllum succiniproducens 产琥珀酸厌氧螺菌
Arachnia propionica 丙酸蛛菌
Arcanobacterium bernardiae 伯纳德隐秘杆菌
Arcanobacterium haemolyticum 溶血隐秘杆菌
Arcanobacterium pyogenes 化脓隐秘杆菌
Arcobacter cryaerohoilus 嗜低温弓形杆菌
Arthrobacter spp 节杆菌属某些种
Bacteroides caccae 粪拟杆菌
Bacteroides capillosus 多毛拟杆菌
Bacteroides eggerthii 埃氏拟杆菌
Bacteroides fragilis 脆弱拟杆菌
Bacteroides levii 利氏拟杆菌
Bacteroides merdae 屎拟杆菌
Bacteroides ovatus 卵形拟杆菌
Bacteroides stercoris 粪便拟杆菌
Bacteroides thetaiotaomicron 多形拟杆菌Bacteroides uniformis 单形拟杆菌
Bacteroides ureolyticus 解脲拟杆菌
Bacteroides vulgatus 普通拟杆菌
Bergeyella zoohelcum 动物溃疡伯格菌Bifidobacterium adolescentis 青春双岐杆菌Bifidobacterium bifidum 双岐双岐杆菌Bifidobacterium breve 短双岐杆菌
Bifidobacterium dentium 齿双歧杆菌Bifidobacterium infantis 婴儿双岐杆菌Bifidobacterium spp 双岐杆菌属某些种
Bordetella avium 鸟博德特菌
Bordetella bronchiseptica 支气管炎博德特菌Bordetella spp 博德特菌属某些种
Branhamella catarrhalis 粘膜炎布兰汉球菌Brevendimonas diminuta 缺陷短波单胞菌Brevendimonas vesicularis 泡囊短波单胞菌Brevibacterium casei 乳酪短杆菌
Brevibacterium epidermidis 表皮短杆菌Brevibacterium spp 短杆菌属某些种
Brucella spp 布鲁菌属某些种
Budvicia aquatica 水生布戴约维采菌
Burkholderia cepacia 洋葱伯克霍尔德菌Burkholderia diminuta 洋葱伯克霍尔德菌Burkholderia gladioli 唐菖蒲伯克霍尔德菌Burkholderia pseudomallei 类鼻疽伯克霍尔德菌Buttiauxella agrestis 乡间布丘菌
Campylobacter coli 大肠弯曲杆菌
Campylobacter fetus fetus 胚胎弯曲杆菌胚胎亚种Campylobacter fetus venerealis 胚胎弯曲杆菌性病亚种Campylobacter hyointestinalis 豚肠弯曲杆菌Campylobacter jejuni doylei 空肠弯曲杆菌德莱亚种Campylobacter jejuni jejuni 空肠弯曲杆菌空肠亚种Campylobacter lari 红嘴鸥弯曲杆菌Campylobacter lari UPTC 红嘴鸥弯曲杆菌UPTC变种Campylobacter mucosalis 粘膜弯曲杆菌