DNA提取方法(一)
提取dna的方法及原理
提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA提取是生物学和遗传学研究中的一项基础操作,它是获取DNA样本的过程。
DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。
1. 高盐法高盐法是一种简单且常用的DNA提取方法。
其原理是利用高盐溶液中DNA与其他细胞组分(如蛋白质)之间的亲和性差异。
在高盐环境下,DNA更容易溶解而不与蛋白质结合,从而实现DNA的提取。
具体步骤包括细胞破碎、加入高盐溶液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的DNA提取方法。
其原理是利用酚和氯仿两种溶剂的密度差异,将DNA从细胞中分离出来。
具体步骤包括细胞破碎、加入酚/氯仿混合液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法。
其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性差异。
DNA样本在经过一系列处理后,通过硅胶柱,DNA能够与硅胶颗粒结合,而杂质则被洗脱。
最后,通过洗脱DNA,即可获得高纯度的DNA。
硅胶柱法的优点是提取纯度高、操作简单,适用于分子生物学研究和临床诊断。
4. 磁珠法磁珠法是一种高效、快速的DNA提取方法。
其原理是利用带有亲和基团的磁珠与DNA之间的亲和性,实现DNA的选择性吸附和洗脱。
具体步骤包括磁珠悬浮液制备、样本加入、磁珠与DNA结合、磁珠分离、洗脱DNA等。
除了上述常用的DNA提取方法外,还有其他一些特殊的DNA提取方法,如酶解法、离心法、凝胶切割法等。
这些方法在不同的实验和应用中具有各自的特点和优势。
总结起来,DNA提取的方法多种多样,选择适合的方法取决于实验目的、样本类型和实验条件等。
无论采用哪种方法,都需要严格控制实验操作,以确保提取到高质量的DNA样本。
DNA提取的成功与否直接影响到后续的实验结果,因此在进行DNA提取时,需要注意样本的保存、细胞破碎的方式、溶解液的选择等因素,以获得可靠且高纯度的DNA。
DNA和RNA提取方法及原理
DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法及原理:1.酚/氯仿法:酚/氯仿法是最常用的DNA提取方法之一、其原理是通过酚类物质将细胞质膜破坏,使DNA从细胞内溶解出来,然后利用氯仿的重度稠化剂作用,将DNA上层的蛋白质、脂类等杂质与下层的DNA分离。
2.盐溶液法:盐溶液法是一种温和的DNA提取方法,适用于多种植物和动物样品。
其原理是将样品细胞裂解后,加入高浓度盐溶液中,通过离心分离出DNA上层液相。
3.硅胶柱法:硅胶柱法是一种高效纯化DNA的方法,可去除杂质并提高DNA的纯度。
该方法利用硅胶柱对DNA进行吸附,去除杂质,然后通过洗脱得到纯净的DNA。
这种方法常用于分离较小的DNA片段。
4.酶解法:酶解法是一种特异性较高的DNA提取方法,通过特定的酶切酶对细胞膜进行消化,将DNA释放出来。
常用的酶解酶有蛋白酶K和蛋白酶E等。
RNA提取方法及原理:1.酚酸法:酚酸法是最常用的RNA提取方法之一、它基于RNA和DNA的相对稳定性差异,利用酚酸破坏细胞膜、沉淀RNA,然后利用酚酸与蛋白质和DNA 形成复合物,分离RNA。
2.硅胶柱法:硅胶柱法也适用于RNA提取。
与DNA的硅胶柱法不同的是,RNA在硅胶柱上结合后会进行一系列的洗脱步骤,除去污染物。
该方法能有效去除DNA、蛋白质、盐和其他杂质。
3.离心收集法:离心收集法是一种简便、快速的RNA提取方法。
根据RNA在水相中的溶解性,通过离心将细胞裂解液中的RNA分离出来,然后加入酒精沉淀纯化。
4.硅酸盐法:硅酸盐法是一种特异性较高的RNA提取方法,通过利用试剂中的硅酸盐吸附RNA,并在洗涤步骤中去除杂质,从而得到纯净的RNA。
DNA的提取方法
DNA的提取方法DNA提取是在分子生物学研究和临床诊断中非常重要的步骤。
DNA提取的目的是获取足够纯净的DNA样本,以供后续实验和分析使用。
这篇文章将介绍几种常用的DNA提取方法。
1.高盐法:高盐法是最常用的DNA提取方法之一、它通过加入高盐浓度的缓冲液来破坏细胞膜并释放DNA。
首先,待提取的细胞或组织样本被收集并转移到离心管中。
接下来,加入裂解缓冲液,通常含有高浓度的盐并对抗离子泵,从而使细胞膜破裂并释放DNA。
裂解后,使用酒精或酚/氯仿萃取法来分离DNA与其他细胞组分。
最后,通过旋转沉淀法或乙醇沉淀法从溶液中提取DNA。
2.CTAB法:CTAB法是一种适用于植物和真菌等高纤维、低DNA含量的样品提取方法。
CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)作为一种阴离子表面活性剂,可以结合在DNA和脂质上,并形成沉淀,从而使DNA分离出来。
首先,样本被粉碎并浸泡在CTAB缓冲液中,含有CTAB、盐和EDTA等。
接下来,DNA与其他细胞组分一起沉淀,通过聚乙二醇进行沉淀,并通过离心分离。
然后,洗涤DNA沉淀并通过乙醇沉淀法或旋转沉淀法提取DNA。
3.柱式纯化法:柱式纯化法是一种用于高质量DNA提取和纯化的流程。
该方法基于DNA与硅胶膜吸附和洗脱的原理。
首先,细胞或组织样品经过裂解后,溶液经过去蛋白酶和去RNA酶处理。
然后,将样品通过柱子,DNA与硅胶膜相互作用,并形成强烈的结合,同时其他细胞组分被清除。
接着,使用洗涤缓冲液去除杂质,最后使用低盐缓冲液来释放DNA。
这种方法可以提供高纯度的DNA样本,适用于大规模DNA提取和高通量分子生物学实验。
4.磁珠法:磁珠法是一种基于磁性珠子的DNA提取方法。
该方法使用特定大小和表面修饰的磁性珠子将DNA选择性地吸附到表面上。
首先,待提取的细胞或组织样本被裂解,并加入磁珠和DNA结合缓冲液。
接下来,通过磁力将磁珠与DNA结合物分离出来,并洗涤去除杂质。
最后,通过低盐缓冲液将DNA释放出来并收集。
提取dna的方法
提取dna的方法提取DNA的方法是从一种物质中检索出DNA分子的过程,包括酶切、基因工程等。
DNA提取方法有核酸沉淀法、缓冲溶液法、植物提取法、实验室提取法等。
下面将对这些方法进行详细介绍。
1、核酸沉淀法:核酸沉淀法是一种常用的DNA提取方法,它的原理是通过pH调节使DNA沉淀,然后将DNA从溶液中收集。
步骤如下:首先,将样品用盐水或蛋白酶/胰蛋白酶消化;其次,加入超纯水、EDTA缓冲液和NaCl,调节pH至5.5;然后,加入乙醇,溶解DNA并沉淀;最后,在0℃-4℃维持1小时,收集沉淀的DNA。
2、缓冲溶液法:缓冲溶液法是通过改变溶液的pH值来提取DNA的一种方法,它利用DNA的结合能力和电性作用力,将DNA结合到某种特定的溶剂上,然后从溶剂中提取出来。
步骤如下:首先,将样品加入缓冲溶液,消化;其次,加入非离子表面活性剂,使DNA脱水;然后,加入离子表面活性剂,将DNA与其他组分分离;最后,用低温冷藏保存,以便收集DNA。
3、植物提取法:植物提取法是通过一系列物理和化学步骤,从植物细胞中提取DNA的一种方法。
步骤如下:首先,将植物细胞磨碎,用盐水悬浮;其次,加入碱性溶液,使细胞膜脱落;然后,加入非离子表面活性剂,溶解脱落的细胞膜,将DNA沉淀;最后,加入乙醇,将DNA沉淀,冷却保存,然后收集DNA。
4、实验室提取法:实验室提取法是一种基于细菌的实验室方法,它利用发酵的细菌细胞中的DNA进行提取。
步骤如下:首先,将细菌细胞加入特定的溶剂液中,使细胞膜脱落;其次,加入特定的酶和蛋白酶,将细胞内的DNA 溶解;然后,加入非离子表面活性剂,将溶解的DNA沉淀;最后,用乙醇沉淀DNA,将沉淀的DNA精细收集。
以上就是提取DNA的方法,主要有核酸沉淀法、缓冲溶液法、植物提取法和实验室提取法四种方法,它们都具有不同的优点和缺点,因此,在实际应用中,应该根据样品的不同,选择适当的提取方法。
各种DNA提取方法
各种DNA提取方法提取方法提取方法提取方法一,基因组DNA提取方法制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。
主要是CTAB方法,其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。
2化学方式:异硫氰酸胍法碱裂解法3生物方式:酶法。
根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等试验步骤:1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。
试验步骤2再重新作一边。
3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/%SDS)混匀。
4、加入25ul 蛋白酶K使终浓度达到100ug/ml 混匀,50℃水浴3h 5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。
加入等体积的5mol/L的LiCL混匀,冰浴,10min.。
7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。
加入等体积的异丙醇。
室温10min。
2500rpm离心10min。
弃上清。
8、加入倍体积3mol/L乙酸钠与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min室温离心5min。
弃上清。
将DNA 溶于适量TE中。
二,外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm 离心10min。
2、小心吸取上层血浆,分装到3个离心管中。
3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。
4、2500rpm离心10min,弃上清。
5、加入10ml 溶血液,摇匀,冰浴15min。
6、3000rpm离心10min,弃上清。
7、倒置离心管,去掉残液。
8、得白细胞,-80℃冻存。
真菌DNA的提取
真菌DNA的提取(方法一)1.取真菌菌丝0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉2.加入4mL提取液,快速振荡混匀3.加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3~5min(此处是粗提没有加酚,可以节约成本的哟!)4.1000rpm,4℃,5min5.上清用体积的氯仿:异戊醇(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃离心5 min)6.取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇或2.5倍体积的无水乙醇沉淀, 混匀, 静置约30 minulTE中μ7.用毛细玻棒挑出絮状沉淀, 用75%乙醇反复漂洗数次, 再用无水乙醇漂洗1次, 吹干,重悬于5008.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃处理1 hr9.用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V体积的无水乙醇, -70℃沉淀30 min以上11.沉淀用75%乙醇漂洗,风干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存备用DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,3M NaAcTE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)氯仿:异戊醇(24:1)异丙醇无水乙醇75%乙醇RNaseA真菌DNA的提取(方法二)1.真菌菌丝0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉2.加入3 mL 65℃预热的DNA提取缓冲液,快速振荡混匀65℃水浴30 min, 期间混匀2-3次3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min4.等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)5.取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇, 混匀, 静置约30 minL TE中μ6.用毛细玻棒挑出絮状沉淀, 用75%乙醇反复漂洗数次, 再用无水乙醇漂洗1次, 吹干,重悬于5007.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃处理1 hr8.用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃离心5 min)9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V体积的无水乙醇, -70℃沉淀30 min以上10.沉淀用75%乙醇漂洗,风干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存备用。
提取dna的方法及原理
提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA是生物体中的遗传物质,它携带着生物体的遗传信息。
提取DNA是研究基因组学、遗传学等领域的重要基础工作。
本文将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。
1. CTAB法CTAB法是一种经典的DNA提取方法。
其原理是利用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)与DNA结合形成离子对,然后通过盐溶液的浓度差异,使DNA从溶液中沉淀出来。
该方法适用于提取植物细胞中的DNA。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种常用的DNA提取方法。
其原理是利用DNA在酚相中溶解,而其他细胞组分则在氯仿相中溶解,通过酚/氯仿两相的分离,从而将DNA分离出来。
该方法适用于提取动物细胞和细菌等样品中的DNA。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高效、纯化度较高的DNA提取方法。
其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性,将DNA吸附在硅胶颗粒上,然后通过洗涤、离心等步骤,将DNA从硅胶颗粒上洗脱下来。
该方法适用于提取各种样品中的DNA。
4. 磁珠法磁珠法是一种基于磁性颗粒的DNA提取方法。
其原理是将带有亲和基团的磁性颗粒与DNA结合,然后通过磁力的作用,将颗粒和DNA一起沉淀下来,最后通过洗涤等步骤,将DNA从颗粒上洗脱下来。
该方法具有快速、高效的特点,适用于高通量的DNA提取。
以上是几种常用的DNA提取方法及其原理。
不同的方法适用于不同类型的样品和实验需求。
在实际操作中,可以根据具体情况选择合适的方法进行DNA提取。
同时,为了保证提取到的DNA质量和纯度,还需要注意提取过程中的一些关键步骤,如细胞破碎、蛋白质酶处理、DNA沉淀等。
DNA的提取是基因研究和遗传学研究的重要步骤,通过合适的提取方法可以获取到高质量的DNA样品,为后续的实验和分析提供可靠的基础。
随着技术的不断进步,提取方法也在不断改进和优化,为科学研究提供更多的可能性。
DNA提取方法和步骤
DNA提取方法和步骤一、常见的DNA提取方法:1. 酚/氯仿法(Phenol/Chloroform Extraction):通过使用酚/氯仿等有机溶剂来分离DNA分子。
2. 盐水法(Salting out):通过使用高盐浓度来析出DNA分子。
3. 硅胶柱法(Silica-based purification):通过与硅胶矩阵相互作用,从混合溶液中纯化DNA。
4. 高盐法(High salt method):通过使用高盐浓度来沉淀DNA。
5. CTAB法(Cetyltrimethylammonium bromide method):通过使用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)来分离DNA。
二、通用的DNA提取步骤:1.样本收集:从所需生物体(如植物组织、动物组织、血液等)中收集样本。
样本的品质对提取后的DNA质量影响很大,因此需要保证样本的新鲜度和完整性。
2.细胞破碎:将收集到的样本进行细胞破碎,使DNA从细胞的内部释放出来。
这可以通过机械方法(搅拌、刮擦等)、溶解酶或离心等方法来实现。
3. 除去蛋白质和RNA:加入蛋白酶等酶解蛋白质,使其降解分解。
同时,也可以加入RNase酶降解RNA,以免在提取过程中受到污染。
4.DNA沉淀:加入盐溶液以增加DNA的溶解性,然后加入酒精来沉淀DNA分子。
酒精的加入可以调节盐溶液中Na+和DNA的酒精沉淀剂(如异丙醇或乙醇)的比例,从而沉淀出DNA。
5.洗涤:将沉淀下的DNA溶于适当的缓冲液中,以去除沉淀剂、盐等杂质。
6. 保存:最后,将DNA保存在适当的缓冲液中,如TE缓冲液(Tris-EDTA),并在低温下存储。
三、酚/氯仿法DNA提取步骤:1.细胞破碎:将细胞或组织加入到含有裂解缓冲液的试管中,使用机械方法(高速离心、搅拌等)或酶解来破碎细胞膜。
2.调整pH值:加入适量的酚/氯仿溶液,并快速倒转试管数次,使试管中的溶液充分混合。
酚会与细胞残渣中的蛋白质结合形成亲水性复合物,而氯仿可以帮助去除蛋白质。
dna分离纯化方法及原理
dna分离纯化方法及原理
1. 酚-氯仿抽提法:这是一种传统的 DNA 提取方法。
原理是利用酚和氯仿的混合物来溶解细胞膜和蛋白质,使 DNA 与其他细胞成分分离开来。
然后通过离心和有机溶剂的萃取,将 DNA 从混合物中提取出来。
2. 硅胶柱层析法:该方法基于 DNA 与硅胶柱子之间的吸附和解吸作用。
将待提取的样本加载到硅胶柱上,通过柱子的吸附作用,使 DNA 与其他杂质分离开来。
然后用适当的洗脱缓冲液将 DNA 从柱子上洗脱下来。
3. 磁珠法:这是一种利用磁性颗粒结合 DNA 的方法。
将磁珠与样本混合,使 DNA 与磁珠结合。
通过外部磁场的作用,可以将磁珠与结合的 DNA 分离开来,从而实现 DNA 的纯化。
4. 质粒抽提法:这种方法适用于提取质粒 DNA。
通过碱处理破坏细菌细胞壁和细胞膜,使质粒 DNA 从细菌细胞中释放出来。
然后通过离心和沉淀等步骤,将质粒 DNA 与其他杂质分离开来。
5. 超声波法:利用超声波的能量,将细胞破碎,使 DNA 释放到溶液中。
然后通过离心和沉淀等步骤,将 DNA 与其他杂质分离开来。
这些方法的原理基于不同的物理、化学或生物学原理,旨在从复杂的生物样本中选择性地分离和纯化 DNA。
选择合适的方法取决于样本类型、纯度要求和实验目的等因素。
在 DNA 分离纯化过程中,还需要注意操作规范、防止污染,并进行质量控制和检测,以确保获得高质量的 DNA 用于后续的分析和实验。
DNA提取的几种方法
DNA提取的几种方法DNA提取的几种方法(1).浓盐法利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用1M氯纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA钠盐沉淀出来.也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.以稀盐酸溶液提取DNA时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA的分离。
在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.(2).阴离子去污剂法:用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA.由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.(3).苯酚抽提法:苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA。
此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。
此法的特点是使提取的DNA保持天然状态.(4).水抽提法:利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66%٠;80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.提取DNA主要有SDS和CTAB法,其实提取效果的好坏主要看提取的对象是什么样的材料,在提取之前一定要好好分析材料的特性,然后在设计实验步骤。
常见的dna提取方法及优缺点
常见的DNA提取方法及优缺点1. 概述DNA提取是分子生物学和遗传学研究中的一个重要步骤。
通过提取DNA,可以进一步研究细胞或生物个体的基因组组成和遗传信息。
本文将介绍三种常见的DNA提取方法,并分析它们的优缺点。
2. 酚-氯仿法(Phenol-Chloroform Extraction)酚-氯仿法是DNA提取的传统方法之一。
其主要步骤包括细胞或组织的裂解、DNA与酚-氯仿混合、离心分离DNA上层水相、以异丙醇沉淀DNA等。
优点•能够提取高质量的DNA,适用于进一步的分子生物学实验和定量分析。
•可以从各种生物样品(如细胞、组织、血液等)中提取DNA。
•提取的DNA可以长期保存,并可用于构建DNA文库。
•操作复杂,需要多个步骤和化学试剂。
•酚-氯仿是一种有毒物质,对操作人员和环境有一定的危害。
•提取时间较长,通常需要几小时。
3. 硅胶柱法(Silica Membrane DNA Extraction)硅胶柱法是一种快速和高效的DNA提取方法,使用了硅胶膜作为DNA的吸附载体。
其主要步骤包括裂解细胞或组织、与硅胶柱上的硅胶膜相互作用、洗脱纯化DNA等。
优点•提供高品质和高纯度的DNA,适用于PCR、测序等高灵敏度实验。
•操作简便,减少了操作步骤和所需的化学试剂。
•提取时间短,通常只需要几十分钟。
•对于某些样品,如血液、组织较多的样品,硅胶柱法可能会出现DNA吸附容量不足的问题。
•需要购买硅胶柱等专业设备和试剂。
4. 盐溶液法(Salt Precipitation)盐溶液法是一种简单和经济的DNA提取方法,利用高盐溶液沉淀DNA。
其主要步骤包括细胞或组织裂解、加入盐溶液、离心沉淀DNA、洗脱纯化DNA等。
优点•操作简单,只需要少量的化学试剂和设备。
•节约时间,通常只需要30分钟左右。
•适用于小规模和初级实验室。
缺点•提取的DNA质量和纯度较低,不适用于一些高灵敏度的实验。
•不适用于样品量较大的情况,容易出现沉淀量不足的问题。
(一)细菌基因组DNA的提取
(一)细菌基因组DNA的提取1.试剂1)CTAB/NaCl溶液:4.1g NaCl溶解于80mL H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100mL。
2)其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白酶K (20mg/mL或粉剂),5mol/L NaCl。
2.操作步骤:1)100mL 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
2)加9.5mL TE悬浮沉淀, 并加0.5 mL 10% SDS, 50 μL 20mg/mL(或1mg干粉)蛋白酶K, 混匀, 37℃保温1小时。
3)加1.5mL 5mol/L NaCl, 混匀。
4)加1.5mL CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
5)用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
6)用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
7)加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟,沉淀DNA。
8)用玻棒捞出DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1mL TE, -20℃保存。
如DNA沉淀无法捞出,可5000rpm离心, 使DNA沉淀。
(二)细胞基因组DNA的提取Each sample + TNES buffer 500 μL +proteinase K 25 μL → 55 °C, 750 rpm, 2hr →+150 μL 6M NaCl, vortex → spin 5 min, Max, romm temperature (RT) →isolate supernatant + 600 μL cold ethanol (95%), vortex → spin 5 min, Max, RT→ precipitation + 75% ethanol, RT, Vortex → spin 5 min, Max, RT →precipitation+50 μL TE buffer (10× stock solution), keep in 4 °C.(三)Chelex法抽提DNA1.用无菌棉签取双侧颊粘膜拭子,室温下自然干燥过夜,在无菌容器中保存。
DNA和RNA提取方法及原理
DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法:1.酚/氯仿方法:这是最早应用的DNA提取方法之一,适用于绝大多数生物样本。
原理是利用酚酸抽提DNA,酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,而DNA在酚相沉淀。
然后用氯仿提取,分离DNA与酚相中的蛋白质和RNA。
最后通过乙醇沉淀纯化DNA。
这种方法可以得到高质量的DNA,但操作过程相对繁琐。
2.硅胶基质法:硅胶基质可吸附DNA,该方法使用硅胶膜或硅胶粉末来固定DNA,通过洗涤去除杂质,最后用洗脱液从硅胶上洗脱DNA。
这种方法具有简便和高纯度的优点,适用于大规模提取DNA。
3.盐酸法:盐酸法以酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物的原理,通过加入盐酸将DNA沉淀下来,然后经过洗涤和乙醇沉淀纯化。
这种方法适用于提取纯度要求不高的DNA。
RNA提取方法:1.酚酸提取法:这是最常用的RNA提取方法之一、原理类似于DNA的酚/氯仿法,通过酚酸将核酸与蛋白质和其他杂质分离。
然后通过氯仿脱脂,去除酚相中的蛋白质,并且获得RNA水相。
最后通过乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于大多数样品,得到的RNA纯度较高。
2.硅胶基质法:与DNA提取类似,它也适用于RNA的提取。
通过硅胶膜或硅胶粉末结合RNA并洗脱,用洗脱液分离RNA与杂质。
这种方法适用于大规模提取RNA。
3.氯仿法:这是一种较为简便的RNA提取方法,它通过氯仿脱脂去除脂质和其他杂质,并且能够同时去除DNA。
最后用乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于需要较快速提取RNA的情况。
DNA和RNA提取的基本原理都是通过分离和纯化DNA或RNA与其他杂质的物质。
酚酸提取法和硅胶基质法同属于酚酸法,都是通过酚酸和氯仿来分离DNA或RNA与蛋白质和其他杂质。
其中酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,并且DNA或RNA在酚相中沉淀,而蛋白质和RNA在氯仿相中溶解。
然后通过洗脱和纯化步骤,从酚酸相中提取DNA或RNA。
盐酸法与酚酸法不同,它是通过酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物来分离DNA与其他杂质。
dna提取方法
dna提取方法DNA提取方法。
DNA提取是分子生物学实验中的一项重要步骤,它是从生物样本中分离出DNA分子的过程。
DNA提取的目的是为了获得足够纯度和浓度的DNA样本,以便进行后续的实验操作,比如PCR扩增、测序等。
在实际操作中,DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法。
1. 酚/氯仿提取法。
酚/氯仿提取法是最早的DNA提取方法之一,它利用酚和氯仿两种有机溶剂的密度差异来分离DNA。
首先,将生物样本经过细胞裂解,然后加入酚/氯仿混合溶液,混合均匀后离心,DNA会在上清液中,而蛋白质和其他杂质则会沉淀在底部。
接着将上清液转移到新的离心管中,加入等体积的异丙醇,再次离心,DNA会沉淀在离心管底部。
最后将上清液倒掉,用70%乙醇洗涤DNA沉淀,最后溶解于适量的缓冲液中。
酚/氯仿提取法简单易行,适用于各种类型的生物样本。
2. 离心柱法。
离心柱法是一种基于硅胶膜或硅胶颗粒的DNA提取方法,它利用DNA与硅胶的亲和性来实现DNA的分离纯化。
首先,将样本加入裂解缓冲液,然后加入蛋白酶和蛋白酶K进行细胞裂解。
接着将裂解液加入离心柱中,经过离心后,DNA会在离心柱上残留,而其他杂质则会通过离心柱底部的滤膜排除。
然后用洗涤缓冲液洗涤离心柱,最后用去离子水或低盐缓冲液洗脱DNA。
离心柱法操作简便,能够快速、高效地获得纯度较高的DNA样本。
3. 硝酸盐法。
硝酸盐法是一种利用硝酸盐沉淀DNA的提取方法。
首先,将生物样本进行细胞裂解,然后加入等体积的乙醇和适量的硝酸盐溶液,混合后DNA会沉淀出来。
接着用乙醇洗涤DNA沉淀,最后溶解于适量的缓冲液中。
硝酸盐法操作简单,适用于大规模DNA提取。
4. 磁珠法。
磁珠法是一种利用磁珠颗粒与DNA的亲和性来实现DNA的分离纯化的方法。
首先,将生物样本进行细胞裂解,然后加入磁珠颗粒,DNA会在磁场的作用下与磁珠结合,然后用磁场将DNA与磁珠分离出来。
接着用洗涤缓冲液洗涤磁珠,最后用去离子水或低盐缓冲液洗脱DNA。
提取dna的方法
提取dna的方法提取DNA的方法。
DNA提取是分子生物学和遗传学研究中的一项基础工作,它是分析DNA序列、进行PCR扩增、测序等实验的前提。
本文将介绍几种常用的DNA提取方法,希望能为科研工作者提供一些参考。
首先,我们来介绍化学法提取DNA的方法。
化学法是最常用的DNA提取方法之一,其原理是利用蛋白酶K和盐酸胍等试剂破坏细胞膜和蛋白质,使DNA从细胞中释放出来。
具体操作步骤为,首先,将待提取的细胞样品加入含有蛋白酶K 的溶液中,经过一定时间的消化后,再加入盐酸胍等试剂,使DNA沉淀出来。
最后,用乙醇洗涤和溶解,即可得到纯净的DNA。
其次,机械法也是一种常用的DNA提取方法。
机械法主要利用机械力破碎细胞壁,释放DNA。
常用的机械法包括玻璃珠研磨法和超声波破碎法。
玻璃珠研磨法是将样品和玻璃珠一起加入管中,通过高速震荡使细胞破碎,释放DNA。
超声波破碎法则是利用超声波的高能量震荡作用,破坏细胞壁,释放DNA。
这两种方法操作简单,适用于大批量的样品提取。
另外,磁珠法也是一种高效的DNA提取方法。
磁珠法利用表面修饰的磁珠与DNA的亲和性,通过磁力场控制DNA的分离和纯化。
操作步骤为,首先,将待提取的细胞样品与表面修饰的磁珠混合,使DNA与磁珠结合;然后,通过磁力场的作用,将磁珠与结合的DNA沉淀到管底;最后,去除上清液,用洗涤缓冲液洗涤,即可得到纯净的DNA。
最后,有机溶剂法也是一种常用的DNA提取方法。
有机溶剂法利用有机溶剂与DNA的亲和性,将DNA从细胞溶液中提取出来。
操作步骤为,首先,将待提取的细胞样品加入有机溶剂中,使DNA与有机相结合;然后,通过离心将DNA沉淀到管底;最后,去除上清液,用洗涤缓冲液洗涤,即可得到纯净的DNA。
综上所述,化学法、机械法、磁珠法和有机溶剂法是常用的DNA提取方法,每种方法都有其适用的场合和特点。
在实际操作中,可以根据实验需要和样品性质选择合适的提取方法。
希望本文对DNA提取方法有所帮助,谢谢阅读!。
dna提取方法
dna提取方法
DNA提取是分离和纯化细胞内的DNA分子的过程。
以下是常用的DNA提取方法:
1. 经典的酚-氯仿提取法:将细胞裂解并溶于酚-氯仿溶液中,通过离心分离DNA上清液和蛋白质/ RNA/酚相,然后分别用异丙醇沉淀和洗涤 DNA,最后用缓冲液溶解 DNA。
2. 盐溶解法:将细胞裂解并使用盐水缓冲溶解 DNA,然后离心去除蛋白质和碎细胞碎片。
最后,通过异丙醇沉淀 DNA,洗涤和溶解 DNA。
3. 磁珠法:利用表面修饰的磁珠、离心和磁场来分离和纯化DNA。
磁珠上会吸附 DNA,然后用缓冲液洗涤和溶解 DNA。
4. 硅胶柱法:利用硅胶膜在碱性条件下与 DNA 结合,然后用缓冲液洗涤和溶解 DNA。
5. 腐蚀酶法:通过腐蚀细胞壁和细胞膜来释放细胞内 DNA,然后离心去除细胞渣。
最后,通过异丙醇沉淀 DNA,洗涤并溶解 DNA。
这些方法都可以从不同来源(如细菌、动植物组织和血液)中提取 DNA,以便分析、克隆或测序。
提取的 DNA 可用于分子生物学研究、犯罪鉴定、基因组学研究等各种应用。
提取dna的方法及步骤
提取dna的方法及步骤提取DNA的方法及步骤DNA(脱氧核糖核酸)是构成生物遗传信息的基本单位,因此,准确提取DNA样本是进行遗传研究、基因工程和犯罪侦查等领域的重要步骤。
以下将介绍几种常见的DNA提取方法及其步骤。
方法一:酚氯仿法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其步骤如下:1. 收集样本:可以是人体组织、血液、细胞培养物等。
确保样本新鲜,并避免受到污染。
2. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
3. 酚氯仿提取:将沉淀加入酚氯仿混合液中,轻轻混匀,并离心以分离DNA。
4. 沉淀DNA:将上清液转移到新的离心管中,加入冷乙醇沉淀DNA。
5. 洗涤:用70%乙醇洗涤沉淀的DNA,以去除杂质。
6. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法二:盐析法盐析法是一种简单易行的DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
2. 盐析提取:加入高盐缓冲液使DNA与其他核酸和蛋白质分离。
3. 沉淀DNA:将上清液转移到新的离心管中,加入冷乙醇沉淀DNA。
4. 洗涤:用70%乙醇洗涤沉淀的DNA,以去除杂质。
5. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法三:硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
2. 硅胶柱处理:将细胞沉淀加入硅胶柱中,经过洗涤和离心,将DNA吸附在硅胶柱上。
3. 洗涤:用洗涤缓冲液洗涤硅胶柱,以去除杂质。
4. DNA洗脱:加入低盐缓冲液,使DNA从硅胶柱上洗脱出来。
5. 洗涤:用70%乙醇洗涤洗脱后的DNA,以去除杂质。
6. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法四:酶解法酶解法是一种特异性较高的DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
1.高盐法:
高盐法是最常用的基因组DNA提取方法之一、该方法利用高浓度盐水(如NaCl)沉淀DNA,同时去除蛋白质和其他污染物。
步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀和DNA沉淀。
此方法简便、廉价,适用于大多数细胞类型。
2.酚酚氯仿提取法:
酚酚氯仿提取法是另一个常用的基因组DNA提取方法。
该方法利用酚
酚提取细胞组织中的DNA,并通过氯仿的添加分离DNA和蛋白质。
此方法
适用于多样的生物标本,如细菌、真菌、植物等。
3.环硅酸盐法:
环硅酸盐法基于DNA与硅颗粒间的结合原理。
在此方法中,细胞裂解后,DNA与硅颗粒结合形成复合物,复合物通过离心和洗涤步骤获得纯化
的DNA。
该方法适用于基因组DNA的高通量纯化。
4.硅基附着法:
硅基附着法也是一种利用硅颗粒的DNA分离纯化方法。
此方法常利用
硅基膜滤板或硅颗粒填充的柱子,使DNA与硅基结合,然后通过洗涤和离
心步骤分离纯化DNA。
该方法适用于小样本量或少量目标DNA的纯化。
5.磁珠吸附法:
磁珠吸附法是一种快速高效的DNA提取方法。
通过特定的磁珠与DNA
的结合,可将DNA快速提取纯化。
该方法通常结合磁力分离和洗涤步骤,
使DNA与磁珠结合,然后通过磁力将DNA分离。
此方法适用于高通量或高
效率DNA提取。
基因组dna的提取
基因组dna的提取基因组DNA提取是指从生物体中分离出基因组DNA序列的过程。
提取基因组DNA的方法有多种,常用的有:一、离心法1、吸取法:利用某种化学溶剂,将原始细胞迅速破解,使细胞内的大部分物质溶解,然后将细胞中的染色体离心收集;2、膜破碎法:将原始细胞置于某种膜系统(如绝对乙醇或蛋白酶体系)中,使细胞形变造成破碎,膜系统可以有效提取出细胞内的染色体;3、超音速冲击法:利用超音速脉冲对细胞外的水进行冲击,使水的光圈扩散,从而使细胞瞬间破碎,将染色体释放到溶液之中。
二、连锁反应法1、PCR法:利用复性DNA引物,连同重复序列的特异性引物,在反转录试剂的有序作用下,可以将外源DNA 装入原核细胞内;2、QPCR法:利用反转录酶作用反转录得到DNA 并与特定序列特异性引物结合,由此凝聚出一个碱基序列,可以在任何体系里广泛检测基因;3、单核苷酸多态性(SNP)分析法:利用基因序列中碱基位点多态性突变进行基因组DNA 提取分析。
三、物理力学方法1、电精提法:通过外加电场,使基因组DNA在液体中电性扩散,最终达到提取的目的;2、毛细管电泳法:将基因组DNA 溶解后,将溶质加入到毛细管内,产生电力场在毛细管内运动,由此实现基因组DNA 的提取。
四、免疫原性法1、免疫原性抗体提取法:使用具有特定抗原性的免疫原性抗体将细胞中抗原性蛋白结合起来,再通过离心法收集;2、竞争抗体抗体提取法:先在细胞中抗原性蛋白与竞争抗体(未指定抗原性)结合,然后再进行离心收集,从而获得的抗原性蛋白;3、抗体标记抗体提取法:先将抗原性蛋白结合抗体标记抗体,然后通过离心法获取抗原性蛋白。
以上就是基因组DNA提取的常见方法。
基因组DNA提取在基因研究、生物学研究等领域有着重要的作用,所以不能忽视其重要性。
DNA实验室常用的DNA提取方法有哪些?
DNA实验室常用的DNA提取方法有哪些?DNA实验室常用的DNA提取方法有Chelex100法、有机法、磁珠法、盐析法、NaOH法等,本文详细介绍这些方法。
(一)Chelex100法原理:Chelex100是一种螯合树脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成,含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,起着螯合基团作用,对多价金属离子有极强亲和力。
在低离子强度、碱性及100℃煮沸条件下,可以使细胞膜裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离。
检材基质中一般含有大量金属离子,在低离子强度及加热条件下,金属离子可以辅助脱氧核糖核酸酶降解DNA,也可以抑制PCR 反应,所以在提取DNA时,加入Chelex100,螯合了金属离子,防止了DNA降解,提高了PCR扩增成功率。
方法:剪取适量血斑、精斑、汗斑、鼻涕斑、指甲、毛根、软组织等等生物检材,置于0.5ml离心管内,加入适量纯水,室温浸泡,13,000rpm离心5min,上清丢弃,管底留约20μl左右液体及检材基质,加入100-200μl 5%Chelex100(有时需加适量PK)56℃15min至数10小时不等,100℃8min,13,000rpm离心5mim,上清备用。
(二)有机法原理:有机法提取DNA一般是指用平衡酚(又叫饱和酚)、氯仿等按不同比例混合,采用不同方法提取DNA。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂,蛋白质分子表面带有亲水性基因,很容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能够顺利地进入到水溶液中,形成稳定的胶体溶液。
在有机溶剂存在的情况下,破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性,使蛋白质变性沉淀,离心后,有机溶剂于试管底层(有机相),DNA继续稳定的存在于上层水相,蛋白质沉淀存在于两相之间。
水相中的DNA在大量冷无水乙醇及单价阳离子存在的情况下,水会溶于乙醇中,而DNA从水相中析出,沉淀,通过离心回收。
方法:剪取适量检材,置于0.5ml离心管内,清洗方法同用Chelex100法提取DNA,加入适量纯水及终浓度为100μg/ml PK,37℃-56℃孵育15min至数10小时,有时间隔一段时间补加适量PK →13,000rpm 5min → 吸上清于另一管 → 加入等体积平衡酚 → 振荡或颠倒彻底混匀 → 13,000rpm5min →吸上清水相于另一管,加入等体积1:1混合平衡酚:氯仿 → 振荡或颠倒彻底混匀 →13,000rpm 5min → 吸上清水相于另一管 →加入等体积氯仿 → 振荡或颠倒彻底混匀 →13,000rpm 5min → 吸上清水相于另一管 →加入2.5倍体积冷无水乙醇冷冻保存10min以上 →13,000rpm 5-10min → 弃上清 → 室温凉干或100℃ 5min烤干 → 加入10-20μl纯水 → 室温溶解或100℃5min帮助溶解 → 离心上清备用(三)磁珠法原理:(异)硫氰酸胍(GuSCN)是强烈蛋白变性剂,不破坏蛋白质一级结构,能破坏细胞膜及核膜蛋白,并使核酸酶失活,释放DNA。
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各种DNA提取方法一,基因组DNA提取方法制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。
主要是CTAB方法,其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。
2化学方式:异硫氰酸胍法碱裂解法3生物方式:酶法。
根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等试验步骤:1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。
试验步骤2再重新作一边。
3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/%SDS)混匀。
4、加入25ul 蛋白酶K使终浓度达到100ug/ml 混匀,50℃水浴3h5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。
加入等体积的5mol/L的LiCL 混匀,冰浴,10min.。
7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。
加入等体积的异丙醇。
室温10min。
2500rpm离心10min。
弃上清。
8、加入倍体积3mol/L乙酸钠与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min室温离心5min。
弃上清。
将DNA溶于适量TE中。
二,外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm离心10min。
2、小心吸取上层血浆,分装到3个离心管中。
3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。
4、2500rpm离心10min,弃上清。
5、加入10ml 溶血液,摇匀,冰浴15min。
6、3000rpm离心10min,弃上清。
7、倒置离心管,去掉残液。
8、得白细胞,-80℃冻存。
试验要求:血至分离白细胞之间隔时间在室温下放置不超过2h,4℃放置不超过5h,以防白细胞自溶。
三,氯仿法抽提外周血白细胞基因组DNA:试验试剂:Ligsisbuffer:7.12g30.071g;最后加灭菌去离子水至1000ml,高压灭菌。
ACD 抗凝剂:__________柠檬酸1.68g柠檬酸钠4.62g葡萄糖5.15g;最后加灭菌去离子水至350ml,高压灭菌。
提取缓冲液(Extractionbuffer):10mMTrisCl(PH=(PH=(PH=(PH=%SDS10%;最后加灭去离子水至100ml,高压灭菌试验步骤:1、在500μl抗凝血中加入ligsisbuffer1000μl,充分颠混至清亮。
以4000rpm,离心5min。
弃上清液。
2、沉淀中加入ligsisbuffer1500μl,充分匀浆。
以6000rpm,离心5min。
3、彻底弃去上清,加入extractionbuffer500μl(裂解细胞),混匀置于37℃,水溶1h。
4、加入8μl 的蛋白酶K,颠混,37℃过夜(或55℃,3h,但是37℃效果要好些)。
5、每管加入450μl 饱和酚(取溶液下层)缓慢摇晃10min,以5500rpm,离心15min。
6、取上清,每管加入250μl 饱和酚和250μl氯仿-异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。
7、取上清,每管加入500μl 氯仿-异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。
8、取上清,每管加50μl 的3M的NaAC+,适量无水乙醇(预冷)至满,摇匀放入-20℃保存2h以上。
9、以12000rpm,离心20min。
去上清,加入70%乙醇500μl,以12000rpm,离心5min,去上清,50-60℃干燥。
10、加入50μl 灭菌去离子水,转弹,混匀。
四,NaI提取法提取外周血白细胞基因组:实验步骤:1、取外周抗凝血(全血)100ul 于eppendorf管中,12000rpm离心12min。
2、弃上清,加双蒸水200ul 溶解,摇匀20s。
3、混匀后加6MNaI溶液200ul,摇匀20s。
4、加入氯仿/异戊醇(24:1)400ul,边加边摇,摇匀20s,12000rpm 离心12min。
5、取上层液350ul,加入另一新eppendorf管中,加倍体积异丙醇,摇匀20s,室温放置15min,静置后的反应体系15000rpm离心12min,使沉淀紧贴eppendorf管壁。
6、弃异丙醇,加70%乙醇1ml(不振动),以15000rpm离心12min。
7、弃乙醇,敞开eppendorf管盖,烘干(37℃恒温箱)后,加1xTE 溶液30ul,溶解DNA>12h以上,制成的DNA液-20℃冰箱保存备用。
五,常用的外周血白细胞基因提取方法:试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用岘_Q______酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA 从核蛋白中游离出来。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。
蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。
当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。
离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。
酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。
抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl 存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
试验步骤:1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml 离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min倾去含裂解红细胞的上清。
重复一次。
用提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。
2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml 蛋白酶至终浓度为100-200ug/ml 上下转动混匀,液体变粘稠。
50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。
保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。
3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。
5000rpm 离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复酚抽提一次。
加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复一次。
4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。
用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,转入另一离心管中,加70%乙醇,以5000rpm 离心5min。
洗涤DNA,弃上清,去除残留的盐。
重复一次。
室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。
加TE液20ul 溶解DNA 置于摇床平台缓慢摇动,DNA完全溶解通常需12-24h。
制成的DNA 液-20℃冰箱保存备用。
六,真核细胞DNA的制备一般真核细胞基因组DNA 有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。
这一方法获得的DNA不仅经酶切后可用于Southern分析,还可用于PCR的模板、文库构建等实验。
根据材料来源不同,采取不同的材料处理方法,而后的DNA提取方法大体类似,但都应考虑以下两个原则:1、防止和抑制DNase对DNA的降解。
2、尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。
试剂准备:1、TE:10mMTris-HCl;1mMEDTA。
2、TBS:25mMTris-HCl;200mMNaCl;5mMKCl。
3、裂解缓冲液:250mMSDS;使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。
4、20%SDS5、2mg/ml 蛋白酶K6、Tris饱和酚()、酚/氯仿(酚∶氯仿=1∶1)、氯仿7、无水乙醇、75%乙醇试验步骤:材料处理:1、新鲜或冰冻组织处理:1)取组织块-0.5cm剪碎,加,转移到匀浆器中匀浆。
2)将匀浆液转移到离心管中。
3)加20%SDS25ml,蛋白酶K(2mg/ml)25ml,混匀。
4)60 C水浴1-3hr。
2、培养细胞处理:1)将培养细胞悬浮后,用TBS洗涤一次。
2)离心4000g 5min,去除上清液。
3)加10倍体积的裂解缓冲液。
4)50-55 C水浴1-2hr。
DNA提取:1、加等体积饱和酚至上述样品处理液中,温和、充分混匀3min。
2、离心5000g 10min,取上层水相到另一离心管中。
3、加等体积饱和酚,混匀,离心5000g 10min,取上层水相到另一管中。
4、加等体积酚/氯仿,轻轻混匀,离心5000g 10min,取上层水相到另一管中。
如水相仍不澄清,可重复此步骤数次。
5、加等体积氯仿,轻轻混匀,离心5000g 10min,取上层水相到另一管中。
6、加1/10体积的3M醋酸钠()和倍体积的无水乙醇,轻轻倒置混匀。
7、待絮状物出现后,离心5000g 5min,弃上清液。
8、沉淀用75%乙醇洗涤,离心5000g 3min,弃上清液。
9、室温下挥发乙醇,待沉淀将近透明后加50-100mlTE溶解过夜。