常用的量化计算软件

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Gamess;
Gaussian 03
Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究: 1. 分子能量和结构; 2. 过渡态的能量和结构化学键以及反应能量,反应路径; 3. 分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷和电势,振动频率; 4. 红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率; 热力学性质; 5. 计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态; 6. 还可以对周期边界体系进行计算 Gaussian是研究诸如取代效应,反应机理,势能面和激发态能量的有力工具。
1. 几何优化,过渡态,反应路径及谱学性质(IR, Raman, 紫外/可见,极化率,CD,NMR) 的表征及计算 2. 分子性能测试的分析与表征。 3.分子ADF程序能应用于模拟分子在气相,溶液和蛋白质及其他物化环境内的性质。 4. 强大的的图形用户界面 5. 利用BAND进行聚合物,异类催化剂及大量结晶等周期性体系的研究
CPMD
CPMD是基于平面波展开/赝势处理密度泛函理论的并行程序,用于第一性原 理分子动力学模拟计算。 功能: 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 孤立体系和周期边界体系的计算。 对分子和晶体使用对称性。 波函优化; 几何优化与过渡态寻找。 恒定能量,恒温,恒压的分子动力学。 路径积分分子动力学; 激发态的分子动力学; 线性响应函数计算,NMR,Raman和IR。 TDDFT计算激发态; 多电子特性 周期体系的偶极矩。 QM/MM方法。
仅可在Linux下使用,不同于大多数软件使用高斯基组,它使用Slater型基组
VASP
VASP是使用赝势和平面波基组,进行从头量子力学分子动力学计算的软件, 因 此基组尺寸非常小,描述材料一般需要每原子不超过100个平面波,大多数情 况下甚至每原子50个平面波就能得到可靠结果; VASP可用于直到4000个价电 子的体系。 主要功能
Molpro
国际上广泛使用的专业级电子结构量化计算软件 不同于其它的量子化学软件包,MOLPRO的重点是高精度计算,通过多参考CI, 耦合簇和有关的方法,广泛处理电子相关问题。程序的核心是MCSCF,MR-CI, 和耦合簇程序,以及一系列附加功能。 功能:多组态自恰场 ;自动计算振动频率,强度和热动力学特性;EOM-CCSD 计算激发态;MCSCF和MRCI波函的单电子跃迁特性,包括自旋-轨道耦合; MCSCF波函的一些双电子跃迁特性;多种单电子特性等等。
常用量子化学计算软件
• 业界最流行的量化计算软件:Gaussian 03; • 化学家通用的密度泛函程序:ADF • 基于第一原理的分子动力学计算的软件包:
VASP,CPMD
• 高精度量化计算软件: Molpro • 其 他 : Turbomole; HyperChem;
NWChem; Q-Chem;Jaguar; 等
可实现多核并行计算;可在Windows,Linux下使用 存在的困难及解决方案: 1. 硬件上,计算尤是频率计算对内存的需求很大,并行数越多内存要求越高; 2. 研究体系相对偏小,尤其是在计算频率、激发态、溶剂效应方面计算体系局 限性较大,一方面有待软件本身算法的改进,另一方面实现GPU技术在 Gaussian中的应用。
ADF
应用密度泛函理论(DFT)进行电子结构的计算。广泛应用于医药化学,材料学 等研究及应用领域。特别应用于无机化学,重元素化学,光谱性质,均相和非 均相催化以及生物化学领域。 包括分子ADF,周期结构BAND和图形用户界面程序ADF-GUI.
特别适合过渡金属化合物。DFT方法较传统的从头算方法(HF, MP2等)能够精确 处理含有几百个原子在内的体系(QM/MM方法能够处理几千原子的大体系)。 功能:
能计算出电子组态的详细信息,适合用于研究多电子激发、反应路径跟踪等性质 缺点:计算体系较小,仅限于研究几个原子的分子体系。
Biblioteka Baidu
Turbomole
在标准的量子化学计算(HF,DFT,MP2)中,Turbomole是最快最稳定的代码之一。不 像其它把主要注意力放在新方法和新功能上的代码,Turbomole着重解决如何用尽量短 的时间和尽量少的内存需求,快速稳定地处理工业应用型的分子。特别是独有的RIDFT方法,可以较其它大多数量子力学程序节省10倍的CPU时间。由于它使用了辅助函 数(单位元分解近似)使得TURBOMOL非常适合于计算大分子或重复计算中等分子。 Turbomole支持串行和并行两种计算模式。并行效率较高。
1. 采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、 晶体、准晶和无定性材料,以及表面体系和固体 2. 计算材料的结构参数(键长,键角,晶格常数,原子位置等)和构型 3. 计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数) 4. 计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF) 5. 计算材料的光学、磁学、晶格动力学性质(声子谱等) 6. 表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟) 7. 从头分子动力学模拟 8. 计算材料的激发态(GW准粒子修正)
能快速计算得到大分子体系的能量、激发态、极化率等性质
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