第三章 核酸的结构与功能
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第三章
核酸的结构和功能
Structure and Function of Nucleic Acid
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
1
第三章
核酸的结构和功能
核酸 (nucleic acid):
单位组成的生
物大分子。是
由单核苷酸为基本
生物遗传的
物质基础。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
2
第三章
—— 倒L形
* tRNA的功能
搬运氨基酸到
核糖体和识别密码 子,参与蛋白质的 翻译。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
33
第三章
核酸的结构和功能
三、核蛋白体RNA的结构与功能
* rRNA的结构 * rRNA的功能 参与组成核 蛋白体,作为蛋 白质生物合成的 场所。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
39
第三章
核酸的结构和功能
二、DNA的变性(denaturation)
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链 解开成两条单链的过程。
方法:过量酸,碱,加热,变性试剂如尿素、 酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮 等。
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目录
40
DNA变性的本质是双链间氢键的断裂
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
4
第三章
核酸的结构和功能
一、核酸的化学组成
1. 元素组成
C、H、O、N、P(9~10%)
2. 分子组成
碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱
戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖
磷酸(phosphate)
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
5
第三章
核酸的结构和功能
目录
24
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
第三章
核酸的结构和功能
第三节 RNA的结构与功能
Structure and Function of RNA
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
25
第三章
核酸的结构和功能
RNA的种类、分布、功能
细胞核和胞液 核蛋白体RNA 信使RNA 转运RNA 核内不均一RNA 核内小RNA 核仁小RNA 胞浆小RNA rRNA mRNA tRNA HnRNA SnRNA SnoRNA scRNA/7SL-RNA 线粒体 mt rRNA 功 能 核蛋白体组分 转运氨基酸 成熟mRNA的前体 参与hnRNA的剪接、转运 rRNA的加工、修饰 蛋白质内质网定位合成 的信号识别体的组分
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目录
百度文库
30
稀有碱基
第三章
核酸的结构和功能
氨基酸臂
2. tRNA的二级结构 ——三叶草形
氨基酸臂
DHU环
5'
TΨC环 DHU环
额外环
反密码环
额外环
环
反密码环
反密码子
目录
32
TΨC环
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第三章
核酸的结构和功能
3. tRNA的三级结构
目录
21
第三章
核酸的结构和功能
(三)DNA在真核生物细胞核内的组装 真核生物染色 体由DNA和蛋白质
构成,其基本单
位是 核小体
(nucleosome)。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
22
核小体的构成
核心颗粒
第三章
核酸的结构和功能
核小体
连接区
DNA(约146 bp) 组蛋白八聚体
连接区DNA(约60bp) H1
(一)DNA的超螺旋结构
超螺旋结构(superhelix 或supercoil) DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。
正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方同相同
负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反
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变性引起紫外吸收值的改变
增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。
D N A 的 紫 外 吸 收 光 谱
解链曲线:
如果在连续加热 DNA的过程中以温度对 A260(absorbance, A,A260代表溶液在 260nm处的吸光率)值 作图,所得的曲线称 为解链曲线。
Tm:
变性是在一个相当窄 的温度范围内完成,在 这一范围内,紫外光吸 收值达到最大值的50%时 的温度称为DNA的解链温 度,又称融解温度 (melting temperature, Tm)。其大小与G+C含量 成正比。
目录
18
第三章
核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
氢键维持双链横向稳 定性,碱基堆积力维 持双链纵向稳定性。
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目录
19
第三章
核酸的结构和功能
(三)DNA双螺旋结构的多样性
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
20
第三章
核酸的结构和功能
二、DNA的超螺旋结构及其在染色质中组装
真核生物
(以小鼠肝为例) 40S
rRNA 蛋白质
16S 21种
1542个核苷酸 占总重量的40%
18S 33种
1874个核苷酸 占总重量的 50%
60S 4718个核苷酸 160个核苷酸 120个核苷酸 占总重量的 35% 目 录
大亚基 rRNA
23S 5S 31种
50S 2940个核苷酸 120个核苷酸 占总重量的30%
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目录
45
第三章
核酸的结构和功能
核酸的结构和功能
核酸的分类
脱氧核糖核酸(DNA)
核酸
核糖核酸(RNA)
mRNA tRNA rRNA
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目录
3
第三章
核酸的结构和功能
第一节 核酸的化学组成及其一级结构
The Chemical Component and Primary Structure
of Nucleic Acid
O H3C
NH2 N
NH
NH
O
NH
O
胞嘧啶(cytosine, C)
胸腺嘧啶(thymine, T)
第三章
核酸的结构和功能
(二)戊糖
HO CH2 5´ O OH HO CH2 O OH
4´ 3´
OH
1´ 2´
OH OH
核糖(ribose) (构成RNA)
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脱氧核糖(deoxyribose) (构成DNA)
核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸 酯键连接形成核苷 酸(脱氧核苷酸)。 核苷酸:AMP, GMP, UMP,CMP dGMP, dTMP, dCMP
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NH2 O P OH OH OH
目录
10
N O CH 2 O N O
HO
脱氧核苷酸:dAMP,
第三章
核酸的结构和功能
重要的核苷酸衍生物
目录
8
第三章
核酸的结构和功能
(三)核苷
核苷(ribonucleoside)的形成 碱基和核糖(脱 氧核糖)通过糖 苷键连接形成核 苷(脱氧核苷)
核苷:AR, GR UR, CR 脱氧核苷: dAR, dGR,dTR, dCR
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目录
9
第三章
核酸的结构和功能
(四)核苷酸(ribonucleotide)
原核细胞
外显子
细胞核
内含子
DNA
DNA
hnRNA
转录
转录
mRNA
翻译
蛋白
mRNA
转录后剪接 转运
翻译
蛋白
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29
第三章
核酸的结构和功能
二、转运RNA的结构与功能
1. tRNA分子含有较多的稀有碱基
含 10-20% 稀有碱基,如 DHU 3´末端为 — CCA-OH
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目录
17
第三章
核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
碱基垂直螺旋轴居双螺 旋内側,与对側碱基形 成氢键配对 (互补配对 形式:A=T; GC) 。 相邻碱基平面距离 0.34nm,螺旋一圈螺距 3.4nm,一圈10对碱基。
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第三章
核酸的结构和功能
C
A
G 3′端
目录
12
书写方法
A G T G C T
5 P
P
P
P
P
P
OH 3
5 pApCpTpGpCpT-OH 3
5 A C T G C T 3
第三章
核酸的结构和功能
第二节 DNA的空间结构与功能
Dimensional Structure and Function of DNA
(一)碱基
嘌呤(purine)
N 7 8 9 NH 5 4 6 3 N 1N 2
N
NH2 N
NH
腺嘌呤(adenine, A)
O N
N
NH
NH
鸟嘌呤(guanine, G)
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N
NH2
目录
6
O
嘧啶 (pyrimidine)
5
4
6 1 NH
3 2
N
NH
NH
O
尿嘧啶(uracil, U)
核心颗粒:由长146bp的双螺旋DNA以超螺旋方式 缠绕组蛋白八聚体1.8圈组成。 连接区:由连接区 DNA 和组蛋白H1组成 连接区DNA:连接相邻两个核心颗粒
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目录
23
第三章
核酸的结构和功能
组 蛋 白(histone)
组蛋白种类:
H1、H2A、H2B、H3、H4 组蛋白八聚体(核心组蛋白):由各 二分子H2A、H2B、H3、H4 组成八聚体 H1 :位于连接区
目录
34
第三章
核酸的结构和功能
* rRNA的种类(根据沉降系数)
真核生物
5S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA
28S rRNA
5.8S rRNA
18S rRNA
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目录
35
第三章
核酸的结构和功能
核蛋白体的组成
原核生物
小亚基 (以大肠杆菌为例) 30S
mt mRNA 蛋白质合成模板 mt tRNA
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目录
26
第三章
核酸的结构和功能
一 、信使RNA的结构与功能
* mRNA结构特点 1. 大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一 个7-甲基鸟苷,同时第一个核苷酸的C´2也是 甲基化,形成帽子结构:m7GpppNm-。
第三章
核酸的结构和功能
三、DNA的复性与分子杂交
DNA复性(renaturation)的定义 在适当条件下,变性DNA的两条互补 链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称 为复性。
热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,
这一过程称为退火(annealing) 。
减色效应 DNA复性时,其溶液OD260降低。
多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP
NH2 N
O OH
O O CH2 N O N
N
HO P O P
OH
ADP
OH OH
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目录
11
二、核酸的一级结构 5′端 定义:核酸中核苷酸的排
列顺序。
由于核苷酸间的差异 主要是碱基不同,所以也 称为碱基序列。 核苷酸之间以磷酸二酯键连 接形成多核苷酸链。
2.
大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸 (polyA)结构,称为多聚A尾。
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目录
27
真核生物mRNA的帽子结构
5'
5'
第三章
核酸的结构和功能
mRNA的功能
转录核内DNA遗传信息的碱基排列顺序, 并携带至细胞质,指导蛋白质合成中的氨基 酸排列顺序。 真核细胞 细胞质
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
14
第三章
核酸的结构和功能
一、 DNA的二级结构 ——双螺旋结构
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
15
第三章
核酸的结构和功能
(一)DNA双螺旋结构的研究背景
碱基组成分析 Chargaff 规则:[A] = [T] [G] [C] 碱基的理化数据分析 A-T、G-C以氢键配对较合理 DNA纤维的X-线衍射图谱分析
蛋白质
28S 5.8S 5S 49种
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36
第三章
核酸的结构和功能
第四节 核酸的理化性质
The Physical and Chemical Characters of Nucleic Acid
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目录
37
第三章
核酸的结构和功能
一、核酸的一般理化性质
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目录
16
第三章
核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
DNA分子由两条相互平行但 走向相反的脱氧多核苷酸 链组成,两链以-脱氧核糖 -磷酸-为骨架,以右手螺 旋方式绕同一公共轴盘。 螺旋直径为2nm,形成大沟 (major groove) 及 小 沟 (minor groove)相间。
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目录
38
第三章
核酸的结构和功能
OD260的应用
1. DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于
50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸 2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8 RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0
核酸的结构和功能
Structure and Function of Nucleic Acid
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1
第三章
核酸的结构和功能
核酸 (nucleic acid):
单位组成的生
物大分子。是
由单核苷酸为基本
生物遗传的
物质基础。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
2
第三章
—— 倒L形
* tRNA的功能
搬运氨基酸到
核糖体和识别密码 子,参与蛋白质的 翻译。
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33
第三章
核酸的结构和功能
三、核蛋白体RNA的结构与功能
* rRNA的结构 * rRNA的功能 参与组成核 蛋白体,作为蛋 白质生物合成的 场所。
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39
第三章
核酸的结构和功能
二、DNA的变性(denaturation)
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链 解开成两条单链的过程。
方法:过量酸,碱,加热,变性试剂如尿素、 酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮 等。
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40
DNA变性的本质是双链间氢键的断裂
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目录
4
第三章
核酸的结构和功能
一、核酸的化学组成
1. 元素组成
C、H、O、N、P(9~10%)
2. 分子组成
碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱
戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖
磷酸(phosphate)
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
5
第三章
核酸的结构和功能
目录
24
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第三章
核酸的结构和功能
第三节 RNA的结构与功能
Structure and Function of RNA
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
25
第三章
核酸的结构和功能
RNA的种类、分布、功能
细胞核和胞液 核蛋白体RNA 信使RNA 转运RNA 核内不均一RNA 核内小RNA 核仁小RNA 胞浆小RNA rRNA mRNA tRNA HnRNA SnRNA SnoRNA scRNA/7SL-RNA 线粒体 mt rRNA 功 能 核蛋白体组分 转运氨基酸 成熟mRNA的前体 参与hnRNA的剪接、转运 rRNA的加工、修饰 蛋白质内质网定位合成 的信号识别体的组分
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30
稀有碱基
第三章
核酸的结构和功能
氨基酸臂
2. tRNA的二级结构 ——三叶草形
氨基酸臂
DHU环
5'
TΨC环 DHU环
额外环
反密码环
额外环
环
反密码环
反密码子
目录
32
TΨC环
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第三章
核酸的结构和功能
3. tRNA的三级结构
目录
21
第三章
核酸的结构和功能
(三)DNA在真核生物细胞核内的组装 真核生物染色 体由DNA和蛋白质
构成,其基本单
位是 核小体
(nucleosome)。
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22
核小体的构成
核心颗粒
第三章
核酸的结构和功能
核小体
连接区
DNA(约146 bp) 组蛋白八聚体
连接区DNA(约60bp) H1
(一)DNA的超螺旋结构
超螺旋结构(superhelix 或supercoil) DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。
正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方同相同
负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反
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变性引起紫外吸收值的改变
增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。
D N A 的 紫 外 吸 收 光 谱
解链曲线:
如果在连续加热 DNA的过程中以温度对 A260(absorbance, A,A260代表溶液在 260nm处的吸光率)值 作图,所得的曲线称 为解链曲线。
Tm:
变性是在一个相当窄 的温度范围内完成,在 这一范围内,紫外光吸 收值达到最大值的50%时 的温度称为DNA的解链温 度,又称融解温度 (melting temperature, Tm)。其大小与G+C含量 成正比。
目录
18
第三章
核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
氢键维持双链横向稳 定性,碱基堆积力维 持双链纵向稳定性。
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19
第三章
核酸的结构和功能
(三)DNA双螺旋结构的多样性
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20
第三章
核酸的结构和功能
二、DNA的超螺旋结构及其在染色质中组装
真核生物
(以小鼠肝为例) 40S
rRNA 蛋白质
16S 21种
1542个核苷酸 占总重量的40%
18S 33种
1874个核苷酸 占总重量的 50%
60S 4718个核苷酸 160个核苷酸 120个核苷酸 占总重量的 35% 目 录
大亚基 rRNA
23S 5S 31种
50S 2940个核苷酸 120个核苷酸 占总重量的30%
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45
第三章
核酸的结构和功能
核酸的结构和功能
核酸的分类
脱氧核糖核酸(DNA)
核酸
核糖核酸(RNA)
mRNA tRNA rRNA
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3
第三章
核酸的结构和功能
第一节 核酸的化学组成及其一级结构
The Chemical Component and Primary Structure
of Nucleic Acid
O H3C
NH2 N
NH
NH
O
NH
O
胞嘧啶(cytosine, C)
胸腺嘧啶(thymine, T)
第三章
核酸的结构和功能
(二)戊糖
HO CH2 5´ O OH HO CH2 O OH
4´ 3´
OH
1´ 2´
OH OH
核糖(ribose) (构成RNA)
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脱氧核糖(deoxyribose) (构成DNA)
核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸 酯键连接形成核苷 酸(脱氧核苷酸)。 核苷酸:AMP, GMP, UMP,CMP dGMP, dTMP, dCMP
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NH2 O P OH OH OH
目录
10
N O CH 2 O N O
HO
脱氧核苷酸:dAMP,
第三章
核酸的结构和功能
重要的核苷酸衍生物
目录
8
第三章
核酸的结构和功能
(三)核苷
核苷(ribonucleoside)的形成 碱基和核糖(脱 氧核糖)通过糖 苷键连接形成核 苷(脱氧核苷)
核苷:AR, GR UR, CR 脱氧核苷: dAR, dGR,dTR, dCR
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核酸的结构和功能
(四)核苷酸(ribonucleotide)
原核细胞
外显子
细胞核
内含子
DNA
DNA
hnRNA
转录
转录
mRNA
翻译
蛋白
mRNA
转录后剪接 转运
翻译
蛋白
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第三章
核酸的结构和功能
二、转运RNA的结构与功能
1. tRNA分子含有较多的稀有碱基
含 10-20% 稀有碱基,如 DHU 3´末端为 — CCA-OH
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核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
碱基垂直螺旋轴居双螺 旋内側,与对側碱基形 成氢键配对 (互补配对 形式:A=T; GC) 。 相邻碱基平面距离 0.34nm,螺旋一圈螺距 3.4nm,一圈10对碱基。
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核酸的结构和功能
C
A
G 3′端
目录
12
书写方法
A G T G C T
5 P
P
P
P
P
P
OH 3
5 pApCpTpGpCpT-OH 3
5 A C T G C T 3
第三章
核酸的结构和功能
第二节 DNA的空间结构与功能
Dimensional Structure and Function of DNA
(一)碱基
嘌呤(purine)
N 7 8 9 NH 5 4 6 3 N 1N 2
N
NH2 N
NH
腺嘌呤(adenine, A)
O N
N
NH
NH
鸟嘌呤(guanine, G)
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N
NH2
目录
6
O
嘧啶 (pyrimidine)
5
4
6 1 NH
3 2
N
NH
NH
O
尿嘧啶(uracil, U)
核心颗粒:由长146bp的双螺旋DNA以超螺旋方式 缠绕组蛋白八聚体1.8圈组成。 连接区:由连接区 DNA 和组蛋白H1组成 连接区DNA:连接相邻两个核心颗粒
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核酸的结构和功能
组 蛋 白(histone)
组蛋白种类:
H1、H2A、H2B、H3、H4 组蛋白八聚体(核心组蛋白):由各 二分子H2A、H2B、H3、H4 组成八聚体 H1 :位于连接区
目录
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第三章
核酸的结构和功能
* rRNA的种类(根据沉降系数)
真核生物
5S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA
28S rRNA
5.8S rRNA
18S rRNA
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第三章
核酸的结构和功能
核蛋白体的组成
原核生物
小亚基 (以大肠杆菌为例) 30S
mt mRNA 蛋白质合成模板 mt tRNA
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第三章
核酸的结构和功能
一 、信使RNA的结构与功能
* mRNA结构特点 1. 大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一 个7-甲基鸟苷,同时第一个核苷酸的C´2也是 甲基化,形成帽子结构:m7GpppNm-。
第三章
核酸的结构和功能
三、DNA的复性与分子杂交
DNA复性(renaturation)的定义 在适当条件下,变性DNA的两条互补 链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称 为复性。
热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,
这一过程称为退火(annealing) 。
减色效应 DNA复性时,其溶液OD260降低。
多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP
NH2 N
O OH
O O CH2 N O N
N
HO P O P
OH
ADP
OH OH
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11
二、核酸的一级结构 5′端 定义:核酸中核苷酸的排
列顺序。
由于核苷酸间的差异 主要是碱基不同,所以也 称为碱基序列。 核苷酸之间以磷酸二酯键连 接形成多核苷酸链。
2.
大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸 (polyA)结构,称为多聚A尾。
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真核生物mRNA的帽子结构
5'
5'
第三章
核酸的结构和功能
mRNA的功能
转录核内DNA遗传信息的碱基排列顺序, 并携带至细胞质,指导蛋白质合成中的氨基 酸排列顺序。 真核细胞 细胞质
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第三章
核酸的结构和功能
一、 DNA的二级结构 ——双螺旋结构
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第三章
核酸的结构和功能
(一)DNA双螺旋结构的研究背景
碱基组成分析 Chargaff 规则:[A] = [T] [G] [C] 碱基的理化数据分析 A-T、G-C以氢键配对较合理 DNA纤维的X-线衍射图谱分析
蛋白质
28S 5.8S 5S 49种
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核酸的结构和功能
第四节 核酸的理化性质
The Physical and Chemical Characters of Nucleic Acid
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一、核酸的一般理化性质
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核酸的结构和功能
(二) DNA双螺旋结构模型要点
DNA分子由两条相互平行但 走向相反的脱氧多核苷酸 链组成,两链以-脱氧核糖 -磷酸-为骨架,以右手螺 旋方式绕同一公共轴盘。 螺旋直径为2nm,形成大沟 (major groove) 及 小 沟 (minor groove)相间。
科学出版社案例式教材《生物化学》课件
目录
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第三章
核酸的结构和功能
OD260的应用
1. DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于
50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸 2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8 RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0