最新DNA分子结构的研究进展汇总
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
D N A分子结构的研究
进展
DNA分子结构的研究进展
生物工程二班司送霞 20093957
DNA是遗传物质的物质基础,基因是具有特定生物功能的DNA序列,DNA的结构分为一级结构,二级结构,三级结构
一级结构是指DNA的共价结构和核苷酸序列,二级结构是指一定或全部
核苷酸序列所形成的双螺旋结构,三级结构是指染色体DNA所具有的复杂折叠状态。
1.DNA的一级结构
DNA的一级结构是四种脱氧核苷酸的连接和排列顺序,即由
dAMP,dGMP,dCMP,dTMP四种脱氧核苷酸通过3′,5′磷酸二酯键连接而成的长链连接而成的高分子多聚体为DNA的一级结构。
DNA所具有的物理、化学和生物学功能均源于他的一级结构,碱基的不同序列蕴含了丰富的遗传信息,组成DNA分子的碱基虽然只有4种,他们的配对方式却有A,T和G,C两种,由于碱基可以任意排列,构成了DNA分子的多样性。
2.DNA的二级结构
DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行所盘绕生成的双螺旋结构。碱基间相互作用通过两种非共价键结合方式进行,分别是碱基配对及碱基堆积。碱基配对是一种氢键结合力,也是使核酸链相互缔合的主要作用力。另外通过垂直方向上相邻碱基π电子形成的疏水作用力使DNA分子层层堆积,分子内部形成疏水中心,整个分子结构保持稳定。
1953年Waston和Crick由X射线衍射技术分析而提出了DNA分子的双螺旋结构模型,此模型所描述的是B-DNA在纳盐一定湿度下的结构,其特征如下:
(!)两条多核苷酸是反向平行,一条链是5′到3′,另一条是3′到5′,极性相反,成为双螺旋状。
(2)碱基平面向内延伸与螺旋的轴成直角,两条链的碱基互补配对形成氢键,所以DNA分子的双链是由碱基配对的氢键连接在一起的。
(3)两条多核苷酸连是顺长轴方向向左旋转,每0.34nm有一个核苷酸,核苷
酸间成36°角。
(4)双螺旋的直径为2nm。
双螺旋有大沟和小沟,大沟和小沟由碱基对的空间结构决定的。
DNA结构的多态性
DNA结构分为两大类,一类是右手螺旋,以B-DNA为主,另外还有A-DNA,C-
DNA,D-DNA,E-DNA,另一类是左手螺旋的,即Z-DNA,所有构型均假设为一对平行而反向的多核苷酸链形成的双螺旋,不同的构型之间,螺旋参数不同,此成为DNA分子结构多态性。B-DNA 的主要结构特征①两条脱氧核苷酸链反向平行, 绕同一螺旋轴向右盘绕, 螺旋表面有一条大沟和一条小沟。②双螺旋的直径为2 nm , 螺距为3. 4nm , 含10 对脱氧核苷酸, 碱基对平面约与螺旋轴垂直,与糖
环平面垂直。碱基对平面间距离0. 34 nm。每链相邻脱氧核苷酸旋转36°。③两
链间A 与T、G 与C 配对后碱基对总长约1. 085 nm。A 与T 形成2 个氢键, G与
C 形成3 个氢键。N 2O 原子间,N 2N 原子间形成氢键分别相距0. 284 nm 和0. 292 nm]。
多种类型的右旋DNA 与特殊的左旋DNA
近20 多年来, 科学家发现在转录条件下DNA 由B 型转变为A 型, 之后又先后发现了DNA 的C 型、D 型、E 型结构, 这4 型DNA 与B2DNA 的双螺旋都是向右的, 螺旋沟均一大一小, 但在直径、碱基间距, 每螺旋碱基对数、沟的宽窄深浅等都有不同, 一般比B 型DNA 稍大或稍小些。左旋DNA 是1979 年由美籍华人W ang 等发现的, 命名为Z2DNA。它的双螺旋是向左的, 只有一条极深的小沟, 螺旋直径为1. 8 nm , 每螺旋含12 碱基对,距离为4. 46 nm。
DNA结构的多态性是因为多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单键,从而使键
环可采取不同的折叠方式和苷键的N-苷键也可以转动,从而使糖环和碱基处在不同的空间关系中。
3.三级结构
DNA分子结构进一步扭曲、折叠,形成超螺旋结构,即染色体所具有的复杂折叠状态成为染色体的三级结构,也叫DNA的高级结构,几乎所有的DNA结构,无论是环形的还是线形的,超螺旋结构是他们共有的特征。三股DNA 螺旋
在Wat son 和Crick 提出双螺旋结构模型之前, 著名的化学家Pauling 等就提出过DNA 三股螺旋。至今发现的三链DNA 可分为两类, 即三股螺旋结构和中科院白春礼等用扫描隧道电子显微镜( STM) 观察到的三股发辫结构。三股螺旋结构是在DNA 双螺旋结构的基础上形成的, 三链区的三条链均为同型嘌呤或同型嘧啶, 即整段的碱基均为嘌呤或嘧啶。根据第三条链来源不同, 三股螺旋可分为分子间和分子内两组; 根据三条链的组成及相对位置又可分为Pu - Pu - Py
和Py - Pu -Py 两型( Pu代表嘌呤链, Py 代表嘧啶链) 。在Py -Pu - Py 型( 比较多见) 三链中, 两条为正常的双螺旋, 第三条嘧啶链位于双螺旋的大沟
中, 它与嘌呤链的方向一致, 并随双螺旋结构一起旋转。三链中碱基配对的方
式与双螺旋DNA 相
同
DNA 四联体螺旋
四联体螺旋的研究从1958 年开始的, 最近对d( G4T 4G4) n 重复序列的X -射线
单晶结构解析发现, 该序列的结构为四螺旋。此螺旋的基本结构单位是G - 四
内以氢键环形连接而成。在四联体的中心有一个由4 个带负电荷的羧基氧原子
围成的“口袋”。通过
G - 四联体的堆积。联体( G -quarter) , 它由四个鸟嘌呤在一个正方形平面
可以形成分子内或分子间的右手螺旋, 螺旋每圈含13 个G - 四联体。
B-DNA的多核苷酸链的空间结构是以一组构象参数为征的。它规定B-DNA的每股螺旋共含250bp,它应形成25股螺旋。现在如果切割其骨架中的任一磷酸二酯键,它就会转变为含相同数目的碱基对的线形B-DNA。如果所形成的线形DNA的一端固定,另一端向左放松两圈,然后使其两端重新闭合,由于B-DNA是一种在能量学上稳定的结构,螺旋数的减少就使其转变为一种受力状态,分子所经受的张力可以按两种方式是分子保留一单链区,其余部分仍保留B-DNA状态,另一种方式是形成超螺旋,超螺旋的形成使已放松的的双螺旋分子的碱基接近于B-DNA状态,DNA结构的变化可以用数学式来表示
L=T+W
L称为DNA的连接数,它是DNA的一股链绕另一股链缠绕的次数,在链不发生
断裂时,它是一常数。T为超盘绕数,代表双螺旋轴在空间的转动数。
在活体中,DNA结构不是一成不变的,DNA的各种构象是互变的,动态的。