法呢基焦磷酸_FPP_的生物合成及其分子调控

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1 FPP 的 生 物 合 成 途 径
在 过 去 甲 羟 戊 酸 途 径 被 认 为 是 产 生 IPP 的 通 用 途 径 , 即 : 由 乙 酰 CoA 形 成 3-羟 基-3-甲 基 戊 二 酰 辅 酶 A ( HMGCoA) , 生 成 的 HMGCoA 在 HMGCoA 还 原 酶 ( HMGR) 的 作 用 下 生 成 甲 羟 戊 酸 ( MVA) ; 甲 羟 戊 酸 在 MVA 激 酶 、磷 酸 MVA 激 酶 和 脱 羧 酶 的 作 用 下 形 成 异 戊 烯 焦 磷 酸 ( IPP) 。在 该 途 径 中 , 甲 羟 戊 酸是类异戊二烯化合物生物合成的重要前体。因 此 , 将 该 途 径 称 为 甲 羟 戊 酸 途 径 ( mevalonate pathway) ( 图 1 中 A) , 由 HMGR 催 化 形 成 的 甲 羟 戊 酸是一个不可逆过程, 为该途径的第一个限速酶。
续 缩 合 反 应 , 形 成 15 碳 的 法 呢 基 焦 磷 酸 ( FPP) , [4, 5] 该 系 列 酶 使 碳 正 离 子 作 用 于 IPP 分 子 双 键 上 富 含 电子的碳原子, 这种反应的亲电子特性与发生在其 它生物合成途径的亲核相关, 异戊二烯基转移酶催 化 两 个 底 物 分 子 间 的 C-C 键 形 成 , 也 催 化 立 体 化 学 结构很少变动的化学反应。
2 FPP 的 生 物 学 特 性 及 其 功 能
异戊二烯途径是植物体内一条重要的代谢途 径 , FPS 是 分 离 最 早 , 也 是 了 解 最 透 彻 的 一 个 IPPS, FPP 处 在 许 多 萜 类 合 成 的 分 支 点 上 , 该 酶 促 反 应 被 广 泛 认 为 在 萜 类 合 成 中 是 一 个 限 速 步 骤[18]。廖 志 华 等 报 道 了 第 一 个 裸 子 植 物 红 豆 杉 的 FPS 基 因 , 全 长 为 1 464bp 编 码 1 056bp351 个 氨 基 酸 的 蛋 白 质 , 等 电 点 5.0 左 右 , 植 物 的 典 型 13 个 螺 旋 排 列 在 一 个 中心沟周围催化反应的发生。生物信息学表明 TmFPS1 是 功 能 基 因 , 并 得 到 一 个 缺 失 酵 母 突 变 体 , 为将来研究次生代谢途径的流向调控和分子遗传 提 供 了 帮 助 。20 世 纪 70 ̄80 年 代 , 以 Utah 州 州 立 大 学 的 Laskovics 和 Poultert 为 主 的 许 多 研 究 者 , 用 多 种 传 统 的 生 化 方 法 分 析 了 FPS 的 基 本 催 化 机 制 , 解 决 了 一 些 FPS 的 反 应 动 力 学 问 题 。 在 1994 年 , Miller 等 人 报 告 了 鸟 类 细 胞 的 法 呢 基 焦 鳞 酸 合 成 酶 的 立 体 结 构 , 被 确 定 分 辨 率 是 2.6 埃 , 该 酶 具 有 13 个 螺 旋 组 成 的 折 叠 , 7 个 螺 旋 ( helices) 构 成 1 个 大 的中心沟。活性位点位于中心沟, 而且 2 个保守区 位 于 中 心 沟 的 两 侧 , 同 时 表 明 FPP 合 成 酶 是 一 个 同 源 二 聚 体 , 定 点 突 变 技 术 分 析 ( Site -directed mutation analysis) , 初 步 阐 述 该 保 守 区 在 催 化 功 能 中 的 作 用 。目 前 对 异 戊 烯 焦 磷 酸 合 成 酶 的 研 究 主 要 集中在合成酶如何能正确选择所需碳数的底物进 行 催 化 形 成 更 长 的 碳 链 化 合 物 方 面 [19]。 1996 年 , Wang 等 人 以 X-射 线 分 析 在 有 无 烯 丙 基 底 物 结 合 的 情 况 下 突 变 的 FPP 合 成 酶 的 结 构 。由 正 常 和 突 变 的 FPP 合 成 酶 结 构 比 较 分 析 , 得 出 聚 类 异 戊 二 烯 链
收稿日期: 2006-10-30 作者简介: 陈新( 1980-) , 男, 硕士生, 研究方向: 植物次生代谢及分子调控 通讯作者: 张元湖( 1963-) , 教授, 博导; Tel: 0538-8241749,E-mail:yyhzhang@sdau.edu.cn
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生物技术通报 Biotechnology Bulletin
法呢基焦磷酸合酶作为一种异戊烯基转移酶, 研 究 最 广 泛[6]。 棉 花 的 FPS 三 级 结 构 已 经 被 研 究 报 道 ( Tarshis et al, 1994) 。20 世 纪 90 年 代 以 来 , 人 们 通 过 功 能 互 补 、PCR、筛 选 cDNA 文 库 的 方 法 从 拟 南 芥 菜 [7]、青 蒿 [8]、胡 椒 薄 荷 ( Menthor piperite) [9]、百 羽 扇 豆 ( Lupinu albu) [10]、玉 米 、银 胶 菊 、辣 椒 、和 棉 花 [11] 等 30 余 种 植 物 中 克 隆 出 编 码 法 呢 基 焦 磷 酸 合 酶 的 基因, 使植物内萜类物质代谢调控机制和植物抗病
( 1Shandong Agricultural University, State Key Laboratory of Crop Biology, Taian 271018;2Shandong Institute of Pomology, Taian 271000)
Abs tra ct: In the isoprenoid biosynthesis pathway, farnesyl diphosphate synthase ( FPS, EC2. 5. 1. 1/ EC2. 5. 1. 10) catalyzes two consecutive condensations of isopentenyl diphosphate with dimethylallyl diphosphate, forming geranyl diphosphate ( FPP) which is a common precursor for the biosynthesis of sterols, dolichols, mitochondrial electron transfer chain components, prenylated proteins and a wide range of secondary sesquiterpenoids. R ecently, cDNAs encoding FPS had been isolated from a number of plant species. In the paper, the biosythasis pathway and molecular regulation of farnesyl diphosphate were reviewed, and progress of FPS applied in genetic engineering was also prospected.
近 来 研 究 发 现 质 体 中 缺 乏 HMGR 和 甲 羟 戊 酸 活 化 酶 , 因 此 , 存 在 着 IPP 来 源 的 问 题 。1996 年 , Eisenvaic 等 人 将 13C-葡 萄 糖 和 13C-乙 酸 加 入 到 红 豆 杉 培 养 细 胞 , 发 现 13C 标 记 进 入 紫 杉 烷 中 , 因 此 认 为 紫 杉 醇 是 由 来 源 于 DXP 的 IPP 合 成 的[15], 该 研 究 结 果 导 致 了 类 异 戊 二 烯 另 一 途 径 被 发 现 [16, 17], 称 为 非 甲 羟 戊 酸 途 径 ( nonmevalonate pathway) 或 非 依 赖 性 甲 羟 戊 酸 途 径 , 亦 称 2C-甲 基 4-磷 酸-4D-赤 藓 糖 醇 途 径 ( MEP pathway) 或 丙 酮 酸/3-磷 酸 甘 油 醛 途 径 ( pyruvate/glyceraldehydes 3-phosphate pathway) ( 图 1 中 B) 。该 途 径 以 糖 的 中 间 代 谢 物 丙 酮 酸 和 3- 磷酸甘油醛为前体, 在焦磷酸硫胺素依赖性脱氧木
摘 要: 法呢基焦磷酸合酶作为异戊二烯途径中的重要调节酶, 是许多萜类物质的合成前体。FPS 的 cDNA 克隆在 许多生物体中也已得到了分离并进行了表达特性研究。从 FPP 的生物合成途径入手, 对 FPP 生物学特性、FPS 酶基因调控 的相关信息进行了综述, 同时对 FPS 在基因工程方面的应用进行了展望。
·综 述 与 专 论·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2007 年第 2 期
法呢基焦磷酸( FPP) 的生物合成及其分子调控
陈新 1 李玲玲 1 吕慧贞 1 刘庆忠 2 张元湖 1
( 1 山 东 农 业 大 学 作 物 生 物 学 重 点 实 验 室 , 泰 安 271018; 2 山 东 省 果 树 研 究 所 , 泰 安 271000)
图 1 类异戊二烯途径和 FPP 的生物合成
酮 糖 5-磷 酸 合 成 酶 ( DXS) 的 作 用 下 , 生 成 5-磷 酸 脱 氧 木 酮 糖 ( DXP) 。 下 一 个 步 骤 是 DXP 还 原 异 构 酶 ( DXR) , 通 过 分 子 内 重 排 和 还 原 反 应 将 DXP 转 变 2C-甲 基 4-磷 酸-4D-赤 藓 糖 醇 ( MEP) 。
Ke y words : Farnesyl diphosphate Biological function Mole 戊 二 烯 化 合 物 ( isoprenoid) 是 植 物 代 谢 过 程中重要的次生产物, 在自然界广泛分布, 是天然 物 质 中 种 类 繁 多 、化 学 结 构 较 多 的 一 类 化 合 物 , FPP 处在许多类异戊二烯化合物合成的分支点上, 该中 间物合成的酶促反应被广泛认为在萜类合成中是 一 个 限 速 步 骤[1]。FPP 不 仅 是 许 多 重 要 初 生 代 谢 产 物 如 甾 体 、多 萜 醇 、泛 醌 等 的 合 成 前 体 , 同 时 在 倍 半 萜 环 化 酶 的 作 用 下 , 生 成 包 括 植 保 素 ( phytoalexin) 和挥发油成份在内的倍半萜衍生物, 这些物质在植 物 生 长 发 育 或 抗 病 过 程 中 具 有 重 要 作 用 [2, 3]。 法 呢 基 焦 磷 酸 合 酶 ( Farnesyl diphosphate Synthase, FPS, EC2. 5. 1 / EC2. 5. 1. 10) 是 类 异 戊 二 烯 途 径 中 的 一个关键酶, 它催化五碳原子的异戊烯基焦磷酸 ( IPP) 和 二 甲 丙 烯 基 焦 磷 酸 ( DMAPP) 以 1, 4 头 尾 连
2007 年第 2 期
机 理 研 究 深 入 到 分 子 水 平 。另 外 还 发 现 FPS 不 仅 广 泛 存 在 于 植 物 中 , 在 真 菌 、鸟 肝 [12]、酵 母 [13]、鼠 肝 [14] 中 也 存 在 。 近 几 年 来 , FPP 合 成 的 分 子 机 理 及 其 调 控已成为分子生物学研究的前沿和热点, 为利用基 因工程手段来提高作物品质和产量奠定了基础。
关键词: 法呢基焦磷酸 生物学功能 分子调控
The Biosynthetic Pathway and Molecular Regulation of Far nesyl Diphosphate( FPP)
Chen Xin1 Li Lingling1 Lv Huizhen1 Liu Qingzhong2 Zhang Yuanhu1
类异戊二烯的甲羟戊酸途径和非甲羟戊酸途 径 的 不 同 点 在 于 IPP、DMAPP 的 合 成 过 程 不 同 , 在 以 后 的 代 谢 过 程 两 途 径 基 本 相 同 。IPP 的 生 物 合 成 有 这 两 条 途 径 , 表 明 了 植 物 中 FPP 的 合 成 也 相 应 有 两 条 不 同 的 途 径 : 即 存 在 于 胞 质 中 的 MVA 途 径 和 存 在 于 质 体 的 MEP 途 径 。一 般 认 为 , 甾 体 类 和 倍 半 萜 化 合 物 由 甲 羟 戊 酸 途 径 合 成 , 单 萜 、二 萜 和 多 萜 由非甲羟戊酸途径合成。
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