中文生物医学信息检索_临床_201408

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李军莲
中国医学科学院医学信息研究所 医学知识组织研究室
教学内容
检索基本原 理与过程 中文资源主要分布 常用文献数据库的使 用 文摘数据库 全文数据库 功能演示 学生实习
学生提问 课程小结
教学目标


了解信息检索的基本原理、过程 了解常用的中文生物医学文献数据库,掌握各数 据库的收录特点; 了解掌握MeSH主题词检索; 掌握文献数据库常用的主要检索功能; 了解CBM、三大全文数据库检索功能上的差异。
作者检索
不仅能够进行“第一著者”检索,而且还能对第一著者的 机构进行限定,可以较好地解决“同名著者”、“同构异 名”的问题。
作者检索
机构检索
机构 知识库
基金检索
基金 知识库
主题检索

点击页面上方的“主题检索”按钮,即进入主题检索页面。 美国国立医学图书馆《医学主题词表(MeSH)》中译本、《中国中 医药学主题词表》是CBM进行主题标引和主题检索的依据。基于主 题概念检索文献,利于提高查全和查准率。
基本检索原则(1)—跨库/单库检索
25
基本检索原则(1)—跨库/单库检索
单库检索:
基本检索原则(2)- 智能检索 跨语言检索
智能检索:
在词表系统支持下,系统自动将用户输入的检索词转换 成表达同一概念的一组词进行查询,是基于自然语言的主
题概念检索。
如:在标题中查找出现“艾滋病”的文献,通过选择 “智能检索”,系统自动检出标题中含“艾滋病”和 “获得性免疫缺陷综合征”的所有文献。
跨语言检索:基于CMeSH,支持中-英双语直接检索。
基本检索原则(3)--布尔检索
辑运算符: AND/OR/NOT
AND:检出记录中同时含有检索词A 和检索词B。 OR: 检出记录中含有检索词A或检 索词B。 NOT:在含检索词A的记录中,去掉 含检索词B的记录。
优先级
优先级的顺序依次为:( ) > NOT > AND > OR 例:(心脏瓣膜疾病 OR 心力衰竭) AND 手术后并发症
MeSH/中国中医药学主题词表
副 主 题 词 治疗类
/治疗; /膳食疗法; /药物疗法; /护理; /预防和控制; /外科学; /康复„
/诊断; /病理学; /放射摄影术; /放射性核素显像; /超声检查
诊断类
….
94个,层级结构
MeSH/中国中医药学主题词表
/解剖学和组织学;
副 主 题 词
解剖类
主题语言

文献的描述包括两个方面:外表特征与内容特征;
是对文献内容特征进行描述的一种规范化语言。


规范内容:词义规范、词类规范、词形规范和同
义规范 。
语言符号具有任意性,不同的地方的人可能用完全不同 的语音或词汇来表示相同的事物或现象。
红果
胭脂果
单车 自行车
脚踏车
马铃薯、土豆、 山药蛋、洋芋、 地蛋、荷兰薯
基本检索原则(5)—精确/模糊检索
精确检索:命中检索字符串与检索词完全等同
模糊检索:亦称包含检索,即命中检索字符串包含检索词
例:检索作者“张明”
的文献,在不勾选“精 确检索”的情况下可检
出作者为“张明”、
“张明满”、“ 张明 凯”等的文献。
如何使用CBM?
检索原则
检索途径
检索结果 处理
检索技巧
快速检索、高级检索、期 刊检索、作者检索:基于 文献外在信息特征的检索。
摘自:阮学平《检索语言与信息组织》
MeSH/中国中医药学主题词表
艾滋病
爱滋病
AIDS
获得性免疫 缺陷综合征
乙肝
MeSH/中国中医药学主题词表
主 题 倒置形式 词 主题树 直接形式
肝疾病 肺肿瘤
δ肝炎, 慢性 肝炎, 乙型
消化系统 胃肠道 肠(+23) 口腔(+11) 咽 下胃肠道(+14) 上胃肠道(+ 20)
中医药数据库检索系统
全文数据库
中国医院知识仓库(CHKD) 维普医药信息资源系统(VIP) 万方数字化期刊:医药信息系统 中国生物医学期刊引文数据库(CMCI/CMCC) 中国科学引文数据库 CBM引文检索与分析 国家科技图书文献中心网络服务系统(NSTL)
引文数据库


SinoMed

数据库概论 使用方法
主题词加权=="肺炎 /DH/DT/NU/PC/RH/RT/SU/TH/AL/QL/ZJ/ ZH/ZD/ZY/全部树"
分类检索
用于按分类号或类目名称检索和显示,具有族性
检索的功能。 《中国图书馆分类法·医学专业分类表》是CBM
分类标引和检索的依据。 分类信息查询入口包括类名和分类号,也可通过 分类导航直接查找 。
检索表达式
评价与修正
11
CBM data
中文生物医学信息源类型、分布

数字资源

数据库: 目录数据库 题录数据库、文摘数据库、全文数据库
图书、期刊、会议文献、学位论文、专利、标准...
载 体 形 式


搜索引擎: 百度、谷歌学术搜索 丁香园、小木虫
印本

期刊\图书\工具书„
中文生物医学信息源类型、分布
在平面上确定一个点
怎样才能在平面上确定一个点呢?
肝 利血平
病理学 治疗应用 免疫学 副作用 外科学 药理学
肝肿瘤 阿斯匹林
在众多文献这一平面上确定一个点
摘自:于双成《文献检索课的技巧》
CBM data


检索入口处选择“中文主题词”。 检索词输入框内输入“肺炎 病毒”。 点击查找按钮,显示查询结果。 从查询结果中选择主题词,点击如图中所示的红框内容。
英文标题、英文摘要和主题词[中/英]的组
合 标题、摘要和关键词的组合 标题、摘要和关键词的组合 标题、摘要和关键词的组合 标题、摘要和关键词的组合 与所选各数据库“常用字段”一致
39
各数据库常用字段含义
期刊检索

指定检索入口后直接进行查询。 通过期刊分类/首字母导航,逐级查找浏览期刊。
解决期刊变更 带来的烦恼!
题词检索、分类检索、第一著者检索、机构 检索、基金检索、文献类型、资助项目和引 文检索等)
临床医学 预防医学… 数据加工规范:主题标引 分类标引 机构规范 基金规范
检索功能完备(限定检索、定题检索、
截词检索、通配符检索)

全文链接获取/直接索取
如何使用CBM?
检索原则
检索途径
检索结果 处理
检索技巧

在检索入口处选择“类名”。 输入“艾滋病”。 点击“查找”按钮,显示分类列表。 在分类列表中选择要检索的内容,点击如图中所示的红框内容。

选择复分号(红框内所示内容); “临床医学复分表”,仅适用疾病大类。 根据需要选择是否“扩展检索”。 根据需要选择逻辑组配后,点击“发送到检索框”。 需要构建复杂主题词检索表达式,则重复上述步骤(图中蓝框所示)。 点击“分类检索”完成检索。
http://www.sinomed.ac.cn
SinoMed
新 版
CBM
主要特点
系统功能

系统数据
年代跨度大:1978年以来 数据总量 :文献822万余篇
良好的兼容性:PubMed 检索功能强大、灵活易用:
检索途径多(
30 多个检索入口,主

1800余种期刊 引文360余万篇
学科范围广:基础医学
主题检索、分类检索:是 基于Hale Waihona Puke Baidu献内容特征的检索, 是CBM的特色检索功能。
限定检索、定题检索、 链接检索:是重要的辅 助检索功能。
36
快速检索
默认在全部字段进行智能检索。 检索式输入框键入检索词或检索式 ——检索词本身可使用通 配符 ,检索词之间还可使用逻辑运算符 。 点击“检索”按钮 。 还可在已有检索结果的范围内进行二次检索 ,键入新的检索
38 在快速检索页面显示检索结果。
数据库
中国生物医学文献数据库(CBM) 中国医学科普文献数据库 北京协和医学院硕博学位论文库
“常用字段”内涵
中文标题、摘要、关键词和主题词的组合 中文标题、摘要、关键词和主题词的组合 中文标题、中文摘要、关键词和主题词的 组合
西文生物医学文献数据库(WBM) 英文会议文摘数据库 俄文生物医学文献数据库 日文生物医学文献数据库 英文文集汇编文摘数据库 跨库检索
37 词,选中“二次检索”前面的复选框,点击“检索”按钮即可 。
高级检索
选择检索入口 ,默认是在常用字段进行智能检索。 检索式输入框键入检索词或检索式 。
检索词本身可使用通配符。
选择逻辑运算符后,点击“发送到检索框”。 可以继续在检索式输入框中键入检索词,构建复杂检索表达式。 编辑完成检索表达式后,点击“检索”按钮 。
基本检索原则(4)--通配符检索

单字通配符 ( ? ): 替代一个字符
如检索式“血?动力”,可检索出含有以下字符串的文献: 血液动力、血流动力等等。

任意通配符 (%/* ): 替代任意个字符
如检索式“肝炎%疫苗”,可检索出含有以下字符串的文献:肝炎疫苗、肝炎病 毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等。

扩展副主题词
一些副主题词之间也存在上下位关系,如副主题词“副作用”的 下位词包括“中毒”和“毒性”, 选择“扩展副主题词”,指对 该副主题词及其下位副主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当 前副主题词“ 副作用 ”。

加权检索
主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的主要内 容。加权主题词用“ * ”表示,如:*肝肿瘤、肝肿瘤/*治疗等。 加权检索表示仅对加星号 (*) 主题词 ( 主要概念主题词 ) 检索,非 加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主 题词)均进行检索。
主题检索
选择主题词要组配的副主题词(图中红框所示)。 根据需要选择进行“加权检索”。 根据需要进行选择 “扩展检索”。 根据需要选择逻辑组配后,点击“发送到检索框”。 需要构建复杂主题词检索表达式,则重复上述步骤(图中蓝框所示)。 点击“主题检索”完成检索。


扩展主题
部分主题词之间存在着上下位关系,如主题词“肺炎”的下位词 包括“肺炎,吸入性”、“肺炎,病毒性”等, 选择“扩展检 索”,指对该主题词及其下位主题词进行检索,非扩展检索则仅 限于当前主题词“ 肺炎 ”。
限定检索
是把年代、文献类型、研究对象、性别等在高
级检索窗口可实现的常用限定条件整合到一个表单 中供用户选择,目标是减少二次检索操作,提高检 索效率。
注:在高级检索界面进行限定设置,不取消限定条
件时,限定设置一直有效。
第一部分
信息检索的基本原理与过程
什么是信息检索?
如何准确查找并有效利用信息。
信息检索基本过程
信息需求 分析 检索结果 评价、反 馈
信息源
选择
检索策略
检索方法
信息检索过程与原理
信息内容 信息需求
检索策略构建
索引
数据库 (Content plus Index) • 外部特征索引: 通过索引建库, 检索 使无序的信息 题名、作者、机构、刊 加工整序 名、书名、出版年等 有序化,从而 支持多途径、 • 内部特征索引: 多角度检索, 结果 主题、分类 提高检索效率。
/血液供给 /细胞学 /病理学 /超微结构 /胚胎学 /畸形 /神经支配
生理类
/生理学;
/遗传学; /生长和发育; /免疫学; /代谢 /生物合成 /血液 /脑脊髓液
为什么要采用
主题词组配副主题词的形式?
什么是主题词? 什么是副主题词? 组配的作用是什么?
电影院里的座位有何特征?
有排、有号
为什么要有排、有号呢?
资 源 内 容
医学文献
• SinoMed/CBM • 同方、万方、维普文献服务系统
科学数据
医学知识 医学术语
• 国家人口与健康科学数据共享服务 平台
• 临床医学知识库 • 临床诊疗知识库
• 中文医学主题词表-(CMeSH)
第二部分
常用中文生物医学文献数据库
常用中文生物医学文献数据库
文摘数据库
中国生物医学文献服务系统SinoMed-CBM


检索结果处理(含获取全文)
检索技巧

1994年,中国医学科学院医学信息研究所/图
书馆开发研制了国内第一个综合性生物医学文献
数据库及其检索系统——CBM 。
CBM WIN CBM WEB

2008年,在整合CBM的基础上开发研制集检索、
开放获取、个性化定题服务、全文传递服务于一
体的生物医学中外文整合文献服务系统SinoMed。
尽管获得信息的方法很多, 仍流传着这样的一 种说法: “ 我们生活在信息的海洋中, 但却忍 受着知识的饥渴”!
信 息 社 会
如何利用信息检索帮助我们的科研过程?
具有信息素养的人能够知道什 么时候需要信息,能够有效地 获取、评价和利用所需要的信 息。
——美国图书馆协会ALA, 1989
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中文生物医学信息资源检索
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