植物信息系统的设计与应用

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基 金项 目 :科 技 创 新 能 力 与 条件 建 设 项 目 : 建 规 范化 的 广 西 植 物 资 源信 息共 享平 台 , 同号 : 科 能 0 10 162 广 西 植 物 研 究所 基 本 业 构 合 桂 8 5 1-— : 务 费 项 目( 植 业 0 0 2) 桂 90
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询 的话 , 需要 其 中 的 7个 字 段 。 只 1 信 息 检 索 体 系 结 构 . 3 分 布 式 信 息 检 索 的体 系 结 构如 图 1 示 ,一 个 具 体 的 查 所
用的软件功能交叉、 复, 重 数据多是重复采集 , 因而一致性差 ; 3 各标本馆 的实时数据 查询不 能展现在一个 界面上 , 、 因而科 研 人员很难看到数据全貌 ; 、全 国各地标本馆之间数据资源 4 不能共享。 利用 网络技术、 b ev e技术、 We Sri c 分布式技术, 以 可 解决数据孤 岛问题 , 满足科研 需求 。
过 We evc 协 议 通 信 , 全 国各 标 本 馆 各 自的植 物 标 本 信 bS rie 把
息资源有效地 、 快捷地整合起来 , 用分布式系统能在节 点数 利
较 多 的 情 况 下 高 效 工 作 。植 物 信 息 系统 目前 参 与 测 试 并采 用 这 种 方 式 接 入 的单 位 有 2 O个 , 检 索 总 数 据 量 约 2 0多万 条 可 5
回给用户, 从而完成一次分布式检索的过程[ 5 ] 。
1 系 统 安 全 性 设 计 . 4
记录[]这二十家 单位 的植 物标本数 据 已经实现 分布式集 成 8, 检索, 各单位 使用的操作系统和数据库不完全相 同, 他们使用
的 数 据 库 类 型有 : Q evr0 0 MSA cs 和 MY S L S LSre 0 、 ces 2 Q 。但 是 各 单 位 的 整 合 数 据 库 运 行 情 况 良好 , 目前 系 统 运 行 稳 定 , 查
1 .植 物 信 息 系 统 的 设计
询 过程 可以描述 如下: 用户从客户端发 出查询 , 经过分 发服 务
11 数据 来源 . 数 据 来 源 主 要 是 广 西 植 物 标 本 馆 的标 本 数 据 和 图 片 (0 2 万 份 植 物 数 据 和 图 片) 多 年 野 外 拍 摄 的活 体 植 物 照 片 ( 括 、 包
_ 卜
! 机
… ・
结果 合并
一I I I 备 I 器
一 1 日
GP S定位 信息) 文 献资料 ( 、 以广西 植物志为 主) 经济植 物资 、
源( 以药 用 植 物 为 主 ) 物 种 名 称 ( 、 以广 西 植 物 名 录 为基 础 , 共
3 9 、0 属、 1 8 ( 0 科 21 1 9 6 种 含种下等级) 的名称和区 内的空间分 布信息 f 等 ; 了上 述基 本数 据外 , 于一 些需要 补充 的数 3 ] 除 ) 对 据, 还可 以从 全国级的数据平 台中获取 , C H( 如 V 中国数字植 物 标本 馆) 的标 本数据 , H Bi iesyH raeLbay 上 B L( o v rt ei g irr, d i t
严 重 制 约 了信 息 化 的 进 一 步 发 展 ,影 响 了植 物 标 本 管 理 和 服
务水平的提高[ 2 1 。大家能够感觉到 问题主要有 以下几个方面 :
1 不 同 的 标 本 馆 之 间 数 据 不 能 互 相 调 用 , 法 形 成 数 据 之 间 、 无 逻辑正确性校验 , 因而 跨 系 统平 台运 行 能 力 差 ;、 标 本 馆 所 2各
通 用 户 只 能 浏 览 查 询 数 据 库 数 据 , 不 能进 行 数 据 库 数 据 的 删 除和 备 份 等 重 要 操 作 ; 地 标 本 馆 数 据 库 管 理 员 为 高 级 用 户 , 本
询速度快而准 , 可扩 展性强 , 易维护 。其信息检 索界面如 图 2
可 以给予最大 的本地实 时标本数据库 操作权限 ,但这种权 限

个 可扩 展 性 强 的 分 布 式植 物 标 本 信 息 系统
[ 关键 词 ] 分 布 式 ; 息 系统 ; 物 ; 源共 享 信 植 资
随着计算机应用 的普及和 网络技术 的发展 , 以数字化 、 网 络化和信息化 的计算机技术正在席卷全球 , 二十世纪 6 0年代 末, 数据 库技术问世以后, 计算机技术在 生物 学研 究中的应用 产生 了一次大 的飞跃 , 成为数据 资料 科学管理的工具 , 特别是 对数量十分庞大 的植物标本信息系统意义更大 ,建立植物标 信息系统 ,构建绿色信息共享平 台成 了植物 学界的重要研究
T as r omafr o ncG re ln R crs ) rnf r to t i ad n at eod ,用 于 在 eF B a P V2
植物标本信息化发展到今天 , 得 了巨大的成就 , 也 出 取 但
现 了几个 比较 明显的 问题 ,数据孤 岛” “ 就是其中之一 , 已经 它
植 物园之 间交换文件标 识数据 、 引种数据 、 植物名称 、 定数 鉴
据 、 地 数 据 、 数据 和其 他 数 据 等 7个 方 面 的数 据 。 完 整 的 产 源
IF2允许 7 T 3个标准字段 ,但是一般 并不是每个植物 园都需 要 这么多字 段, 因此 , 官方文档推 荐使用简 化后只有 2 3个 字 段集 的交换格式 。 而如果需要将植物园名录提交给 B I GC 供查
要求不高, 因此采用 C S结构来进行设 计 比较合理 , / 整个系统
的功 能 特 点 如 下 : () 标 本 馆 负 责 本 馆 植 物 标 本 数 据 的 采 集 、 理 和 录 入 1各 整 工作 ;
3 结 束语 .
图 2 数 据 检 索 界 面
() 2 各标 本馆只能处理 自己馆 的数据 , 没有 建立与其它馆 数据库的任务联系;
生 物 多 样 性 遗 产 图书 馆 ) 中 国 节 点 上 描 述 和 文 献 数 据 、 P C PB
客户机 n 卜 + 一
网络・ , Βιβλιοθήκη Baidu
网络



图 1 分 布 式 信 息 检 索 的体 系 结构
作者 简介 :沈 晓 琳 , ( )广 西 全 州 人 , 士 , 女黎 , 硕 工程 师 。主 要 研 究 方 向 : 物 资 源 网络 数 据 库 信 息 管 理 。 植
3 -— 4 - —
器 对 用 户 的检 索 进 行 集 合选 择 , 择 最 适 合 查 询 , 询 的 数 据 选 查 集 合 进 行 检 索 ,用 户 的 查询 请 求 被 发 送 到 相 应 的检 索 服 务 器 上 进 行 并 发 结 果 再 经 过 结 果 合 并 过 程 , 把 最 终 的检 索 结 果 返
议 题 [ ” 。
( 中国植物图像库) 上的图像数据等闱 。
1 数 据 标 准 . 2
植物信 息系 统的物种 、 文献 、 图片、 标本等 扩展数据 , 都有
对 应 的 数据 标准 , 针 对 形 态 描 述 数 据 的 S D(t c rdDe 如 D Sr t e — uu
S邱t e a , C i t 结构化描述数据) v Da 标准 、 针对标本数据的 D r n awi C r 标准 、 oe 针对文献数据的 D bnC r u l oe标准 等。但是其核心 i 数据还 是植 物引种数据, 引种工作涉及 的方 面非常多 , 而 如果 没有一个统一的标准 , 势必会使信息共享工作 变得非常 困难 。 植 物 园物 种 记 录 国际 交换 格 式 ( F2全称 是 Itrai a I T nent n l o
() 4 分布 式检 索主程序通过异步调用各节 点的 W B服务 E
来 实现 对 异构 数 据 库 的整 合 , 是 用 户所 面对 的检 索 界面 。 也
2 .实 现 技 术 及 应 用 情 况
库。
1 功 能特 点 . 5 分 布 式 植 物 信 息 系 统 的 功 能 目标 是 根 据 网 络 环 境 下 构 建 分 布 式 植 物 信 息 系 统 的 实 际需 要 , 完 成 分 布 式 植 物 标 本 信 为 息系 统的各模 块功 能, 现系统 内部包括各 查询机 构的资源 实 共 享 及 不 同用 户权 限 的 控 制 。考 虑 到 系 统 数 据 收 集 的 实 时性
植物信息 系统 的设计与应用
沈 晓 琳 刘 演 许哲平 z
桂林 5 10 ; 406 1 09 ) 0 0 3 (. 1 广西壮族 自治区中国科学院广西植物研究所, 广西
2 中国科学 院植物研究所生物多样 性信 息学重点实验室, . 北京
[ 摘 要 ] 本 文 将 分 布 式数 据 库 技 术 与 网络技 术相 结合 , 并将 分布 式技 术 引入 植 物标 本数 据库 网络 查 询 系统 . 用 We e. 采 bS r vc 技 术及 异 步 调 用 方 法 实现 分布 式数 据 检 索 , ie 不仅 能方 便 it nt网络 用 户 查 询 植 物 标 本 数 据 , ne e r 而且 可提 高 标 本 数据 的 利 用 率 . 有 利 于 实现 资源 共 享 ; 用 It n t 运 ne e 网络技 术 、 P技 术 以及 数 据 库技 术将 植 物 标 本 馆 进 行 数 字 化 , 标 本 及 其 各 种 属 性 得 到 永 久 r AS 使 性 保 存 ; 了 弥补 集 中式 数 据 库 系统 在 覆 盖 率 、 新 率 、 问权 限控 制 、 业 性 及 网络 负载 等 方 面存 在 的缺 陷, 文设 计 并 实现 了 为 更 访 专 本
系统安全性设计采用 了如下 3 方法, 种 分别在数据库层 、
网 络 协 议 底 层 及 应 用 层 上 对 数 据 库 访 问进 行 了 安 全 访 问 限 制 , 好 地 解 决 了数 据 库 系 统 存 在 的 安 全 问题 。 较
数据 库用户分为普通用户 、 高级用户和特权 用户 , 其中普
() 加 分 布 式 检 索 系 统 的标 本 馆 需 要 提 供 数 据 检 索 的 3参 W E 服 务 , 主 程 序 调 用 并 整 合 数 据 , 现 一 致 的 对 外 服 务 B 由 实
窗 口:
分布式植物信息系统 的出现 ,更能有效地利用企业现 有
资 源 和 网络 资 源 。分 布 式 植 物 信 息系 统 是 一 个 面 向地 理 上 分 布 而 在 管 理 上 需 要 不 同程 度 集 中 的 处 理 系 统 ,主 要 解 决 在 计 算 机 网络 上 如 何 进 行 数 据 的分 布 和 处 理 。 通 过 对 植 物 信 息 网 络 数 据 库 的建 立 ,将 为 从 事 植 物 方面 研 究 及 相 关 领 域 研 究 的 人员提供一个简便 、 快捷 的 查 阅 植 物 信 息 的 技 术 平 台 , 分 有 充 效地开发和利用植物标本信息资源 ,同时能有效地保护馆藏 的实物标本 , 因此 , 布 式 植 物 信 息系 统 可 以广 泛 地 应 用 于 大 分 企业 , 种行业 及军事 国防等领域 , 多 这对 建 立 集 约 型 社 会 , 加
只 能 针对 本 地 实 时 标 本 数 据 库 , 不 能 访 问 主 标 本 馆 的历 史 标 本 数 据 库 ; 权 用 户 为 系 统 管 理 员 , 是 整 个 标 本 资 料 数 据 库 特 它
硬软件 的管理者和设计者 , 其帐号唯一 , 负责管理维护整个 数 据库 系统 所有资源和用户帐号 ,包括 实时数据库和历史数 据
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