WATERS公司的UPLC-TQD培训资料 MS_10_数据处理
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数据处理
数据处理
色谱图的显示与处理 ApexTrack™ 色谱峰积分算法 色谱峰的积分与编辑 信噪比（Signal-to-Noise） 质谱图的显示与处理
2
打开一张色谱图
3
Information Layout
File Text
数据类型以及离子模式 Scan, MRM, SIR, PAR, NTL
放大的结果
5
从离子色谱图中提取数据 Ion Chromatograms
6
选择通道的结果Channel Selection Results
Ch 1 Ch 2 Ch 3 TIC
7
删除一个色谱图
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
2.50
3.00
Time
Figure 2
8
改变图谱顺序
Figure 3
Figure 4
9
恢复TIC的全视图
10
显示来自于不同进样的色谱图
11
放大色谱图
选择区域
放大 页眉 (by 2)
0.96 24391
1.40 36185
1.12 258
1.80 35412
2.06 16198
2.27 7114
2.82 19175
1.00
1.50
2.00
2.50
3.00
3.61 76571
3.90 12464
3.50
4.00
4.48 4.68 3069 796
4.50
5.00
5.32 1215 5.71
放大 页眉 (by 82)
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
5pg/ml std
ASSAY07
100
x2
MRM of 3 Channels AP+
ZQTest059b 100
3.61 1305003
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 101074
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
57
查找切线
Extract, East 10 fold dilution
41
峰的曲率
高斯峰
1
0.8 曲率最大
0.6
0.4
0.2
0
0
0
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
曲率为零
42
完全的二阶导数
1 0.8 0.6 0.4 0.2
0 -10 -8
0.5
0
0
-6
-4
0
高斯峰
-2
0
2
二阶导数
-0.5
-1
-10 -8
-6
-4
-2
0
2
0
4
6
0
4
6
8
10
8
10
43
Apex 检测
288.1 > 58
3.03e3
0
Scan
90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
18
模拟数据（Analog Data）
Prepared standard. '100'
STANDRD5
100
%
1.03 3.70
0 STANDRD5 100
ZQTest059b 100
3.61 1842028
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 193809
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
60
查找切线
二级导数的估算
— 自动检测峰宽 — 自动检测顶点检测阈值
峰顶点的检测
— 拐点的识别
44
双峰
x 105 3.4 3.3 3.2 3.1
3 2.9 2.8 2.7 2.6 2.5
7
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
APCI, ESI, (+/-)
文件名
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.81
TIC
2.09e4
色谱类型
100% 刻度的强度
相对强度
保留时间
0
Time
1.00 2.00 3.00 4.00
时间 (minutes)
4
缩放功能
点击左键，并拖 拽扩展
28
色谱图平滑
29
色谱图积分
30
色谱图积分
31
色谱图积分
32
色谱图积分
33
色谱图积分
34
色谱图积分
35
色谱图积分
36
色谱图积分
37
色谱图积分
38
ApexTrack 积分算法
主要的优势
— 通过曲率检测峰顶点 — 峰顶点的检测独立于基线的检测 — 可靠的肩峰检测 — 调整基线的判定标准
12
精确调整放大
放大的标识
5pg/ml std
ASSAY07
100
x2
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
放大的结果
5pg/ml std
ASSAY07
100
x70
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
%
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
5pg/ml std
ASSAY07
100
x82
1.16 %
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0
Time
0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
3 2.9 2.8 2.7 2.6 2.5
7
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
%
0 2.00
MRM of 3 Channels AP+
2.81
294.1 > 64
5.65e3
MRM of 3 Channels AP+
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
MRM of 3 Channels AP+
39
峰的曲率
高斯峰
1
0.8
0.6 0.4
0.2
0
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
二阶导数
0.5
0
0
0
-0.5
-1
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
40
峰的曲率
高斯峰
1
0.8 曲率最大
0.6
0.4
0.2
0
-10 -8 -6 -4 -2
0
2
4
6
8 10
顶点的曲率最大 。 拐点的曲率为零
上坡点/下坡点曲率最大。 基线区域，曲率为零。
2.81
TIC
2.09e4
2.50
3.00
Time
Figure 1
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 2.00
MRM of 3 Channels AP+
2.81
294.1 > 64
5.65e3
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0
0.50
1.00
1.50
2.00
2.50
3.00
Time
13
色谱图时间补偿
14
改变显示的属性
15
锁定纵坐标
5pg/ml std
ASSAY19 100
%
0 ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+ 288.1 > 58 1.46e4
ZQTest059b 100
3.61 1627701
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 193809
0TBiblioteka me3.203.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
59
查找切线
Extract, East 10 fold dilution
%
MRM of 3 Channels AP+
2.84
288.1 > 58
3.03e3
0
Time
1.50 1.75 2.00 2.25 2.50 2.75 3.00 3.25 3.50 3.75 4.00
Rat sample 07
ASSAY19 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.84
46
二阶导数
2000
12-Oct-2000 13:51:31 D1028DAT
1500
1000
500
0
-500
-1000
7
8
9
10
11
12
13
47
二阶导数放大
Peak Apex
Inflection Points
Zero Curvature Baseline Noise
48
自动峰宽
AutoWidth
9291
5.50
6.00
6.50
Time
54
顶点与拐点
设置为 0.0 ，可以查看到所有的峰 设置为 100% 可以看到拐点
55
基线检测
连接拐点
— 拐点定义初始的基线 — 最终的基线符合“% slope“ 参数设置
形成簇基线
— 从临近峰处
识别肩峰 计算峰高，面积，保留时间
56
最初的基线
Extract, East 10 fold dilution
45
基线放大
AU
x 105
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
2.499
2.498
2.497
2.496
2.495
2.494
2.493
7
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
49
自动阈值
AutoThreshold AutoWidth
50
顶点检测
Apex Detection AutoThreshold
AutoWidth
51
拐点的识别
Apex Detection AutoThreshold
AutoWidth Inflection points
52
标记色谱图
x 105 3.4 3.3 3.2 3.1
%
2.85
0
2.00
4.00
12.55
245nm An1 226
14.90
7.14 8.57
10.27
SIR of 2 Channels ES+
11.63
TIC
9.98
1.18e5
12.58
Time
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
19
添加页眉信息
20
添加页眉信息
21
添加页眉信息
22
5pg/ml std
ASSAY07
100
2.84
MRM of 3 Channels AP+
%
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.81
288.1 > 58
1.46e4
0
Time
1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00
0
Time
1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00
ZQTest059b 100
3.61 1461120
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 116448
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
数据处理
色谱图的显示与处理 ApexTrack™ 色谱峰积分算法 色谱峰的积分与编辑 信噪比（Signal-to-Noise） 质谱图的显示与处理
2
打开一张色谱图
3
Information Layout
File Text
数据类型以及离子模式 Scan, MRM, SIR, PAR, NTL
放大的结果
5
从离子色谱图中提取数据 Ion Chromatograms
6
选择通道的结果Channel Selection Results
Ch 1 Ch 2 Ch 3 TIC
7
删除一个色谱图
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
2.50
3.00
Time
Figure 2
8
改变图谱顺序
Figure 3
Figure 4
9
恢复TIC的全视图
10
显示来自于不同进样的色谱图
11
放大色谱图
选择区域
放大 页眉 (by 2)
0.96 24391
1.40 36185
1.12 258
1.80 35412
2.06 16198
2.27 7114
2.82 19175
1.00
1.50
2.00
2.50
3.00
3.61 76571
3.90 12464
3.50
4.00
4.48 4.68 3069 796
4.50
5.00
5.32 1215 5.71
放大 页眉 (by 82)
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
5pg/ml std
ASSAY07
100
x2
MRM of 3 Channels AP+
ZQTest059b 100
3.61 1305003
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 101074
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
57
查找切线
Extract, East 10 fold dilution
41
峰的曲率
高斯峰
1
0.8 曲率最大
0.6
0.4
0.2
0
0
0
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
曲率为零
42
完全的二阶导数
1 0.8 0.6 0.4 0.2
0 -10 -8
0.5
0
0
-6
-4
0
高斯峰
-2
0
2
二阶导数
-0.5
-1
-10 -8
-6
-4
-2
0
2
0
4
6
0
4
6
8
10
8
10
43
Apex 检测
288.1 > 58
3.03e3
0
Scan
90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
18
模拟数据（Analog Data）
Prepared standard. '100'
STANDRD5
100
%
1.03 3.70
0 STANDRD5 100
ZQTest059b 100
3.61 1842028
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 193809
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
60
查找切线
二级导数的估算
— 自动检测峰宽 — 自动检测顶点检测阈值
峰顶点的检测
— 拐点的识别
44
双峰
x 105 3.4 3.3 3.2 3.1
3 2.9 2.8 2.7 2.6 2.5
7
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
APCI, ESI, (+/-)
文件名
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.81
TIC
2.09e4
色谱类型
100% 刻度的强度
相对强度
保留时间
0
Time
1.00 2.00 3.00 4.00
时间 (minutes)
4
缩放功能
点击左键，并拖 拽扩展
28
色谱图平滑
29
色谱图积分
30
色谱图积分
31
色谱图积分
32
色谱图积分
33
色谱图积分
34
色谱图积分
35
色谱图积分
36
色谱图积分
37
色谱图积分
38
ApexTrack 积分算法
主要的优势
— 通过曲率检测峰顶点 — 峰顶点的检测独立于基线的检测 — 可靠的肩峰检测 — 调整基线的判定标准
12
精确调整放大
放大的标识
5pg/ml std
ASSAY07
100
x2
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
放大的结果
5pg/ml std
ASSAY07
100
x70
%
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
%
0 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
Time
5pg/ml std
ASSAY07
100
x82
1.16 %
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0
Time
0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00
3 2.9 2.8 2.7 2.6 2.5
7
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
%
0 2.00
MRM of 3 Channels AP+
2.81
294.1 > 64
5.65e3
MRM of 3 Channels AP+
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
MRM of 3 Channels AP+
39
峰的曲率
高斯峰
1
0.8
0.6 0.4
0.2
0
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
二阶导数
0.5
0
0
0
-0.5
-1
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
10
40
峰的曲率
高斯峰
1
0.8 曲率最大
0.6
0.4
0.2
0
-10 -8 -6 -4 -2
0
2
4
6
8 10
顶点的曲率最大 。 拐点的曲率为零
上坡点/下坡点曲率最大。 基线区域，曲率为零。
2.81
TIC
2.09e4
2.50
3.00
Time
Figure 1
5pg/ml std
ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 ASSAY07 100
%
0 2.00
MRM of 3 Channels AP+
2.81
294.1 > 64
5.65e3
MRM of 3 Channels AP+
2.65
274.1 > 182.1
7.85e3
0
0.50
1.00
1.50
2.00
2.50
3.00
Time
13
色谱图时间补偿
14
改变显示的属性
15
锁定纵坐标
5pg/ml std
ASSAY19 100
%
0 ASSAY07 100
%
MRM of 3 Channels AP+ 288.1 > 58 1.46e4
ZQTest059b 100
3.61 1627701
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 193809
0TBiblioteka me3.203.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00
4.10
4.20
4.30
59
查找切线
Extract, East 10 fold dilution
%
MRM of 3 Channels AP+
2.84
288.1 > 58
3.03e3
0
Time
1.50 1.75 2.00 2.25 2.50 2.75 3.00 3.25 3.50 3.75 4.00
Rat sample 07
ASSAY19 100
%
MRM of 3 Channels AP+
2.84
46
二阶导数
2000
12-Oct-2000 13:51:31 D1028DAT
1500
1000
500
0
-500
-1000
7
8
9
10
11
12
13
47
二阶导数放大
Peak Apex
Inflection Points
Zero Curvature Baseline Noise
48
自动峰宽
AutoWidth
9291
5.50
6.00
6.50
Time
54
顶点与拐点
设置为 0.0 ，可以查看到所有的峰 设置为 100% 可以看到拐点
55
基线检测
连接拐点
— 拐点定义初始的基线 — 最终的基线符合“% slope“ 参数设置
形成簇基线
— 从临近峰处
识别肩峰 计算峰高，面积，保留时间
56
最初的基线
Extract, East 10 fold dilution
45
基线放大
AU
x 105
12-Oct-2000 13:47:31 D1028DAT
2.499
2.498
2.497
2.496
2.495
2.494
2.493
7
8
9
10
11
12
13
Minutes. Measured Chrom Peak Width: 36.00 sec, Threshold: 3.70e+000 µV/sec, Number of Apices: 13
49
自动阈值
AutoThreshold AutoWidth
50
顶点检测
Apex Detection AutoThreshold
AutoWidth
51
拐点的识别
Apex Detection AutoThreshold
AutoWidth Inflection points
52
标记色谱图
x 105 3.4 3.3 3.2 3.1
%
2.85
0
2.00
4.00
12.55
245nm An1 226
14.90
7.14 8.57
10.27
SIR of 2 Channels ES+
11.63
TIC
9.98
1.18e5
12.58
Time
6.00
8.00
10.00
12.00
14.00
19
添加页眉信息
20
添加页眉信息
21
添加页眉信息
22
5pg/ml std
ASSAY07
100
2.84
MRM of 3 Channels AP+
%
2.81
288.1 > 58
1.46e4
MRM of 3 Channels AP+
2.81
288.1 > 58
1.46e4
0
Time
1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00
0
Time
1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00
ZQTest059b 100
3.61 1461120
1: SIR of 5 Channels ES+ 271
2.27e6 Height
%
3.90 116448
0
Time
3.20
3.30
3.40
3.50
3.60
3.70
3.80
3.90
4.00