第十章微生物的分类与鉴定
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《 The fungi 》, Ainsworth, 1973 《Ainsworth and Bisby’s Dictionary of the Fungi》
----7版，1983年，Hawksworth ----8版，1995年， Hawksworth
第十章微生物的分类与鉴定
书355
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
●菌种保藏中心与菌种目录
ATCC：美国典型菌种保藏中心 DSMZ: 德国典型菌种保藏中心 CCTCC：中国典型菌种保藏中心：
下设：CCGMC等6个中心 菌种目录及菌种保藏和购买
第十章微生物的分类与鉴定
二、学名的命名及有关法规
●双名法：Bacillus subtilis（属名＋种名加词）
Vol.2: Proteobacteria(2004) Vol.3: The Low G+C Gram Positives (2000) Vol.4: The High G+C Gram Positives(2000) Vol.5： The Planctomycetes, Spirochetes,
Fusobacteria (2001)
Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus
(三名法)
●学名(科学名):拉丁文,斜体 ●属名第一字母大写 ● 性、数、格一致
第十章微生物的分类与鉴定
●名字的应用：
Bacillus subtilis CMCC 63501 Bacillus subtilis Cohn 1874 Bacillus sp. Bacillus spp. ●缩写：B . Subtilis
Chap.10 微生物的分类和鉴定
1）通用分类单元 2）微生物在生物界的地位 3）各大类微生物的分类系统纲要 4）微生物分类鉴定方法
第十章微生物的分类与鉴定
●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生 物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。
●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给 未知物一个具体的分类位置。
●模式种（type species）： 典型菌株的实体，常保藏于标本室中。
(Type species: CCTCC AB 2011012T )
第十章微生物的分类与鉴定
●亚种：在种内有一个稳定特征不同于模式种 的菌株，为最低等级的分类单元。
●型：非分类单位，种内特征小差异的菌株。
● 菌株：同种的不同个体。
《Bergey’s Manual of Systematic Bacterialogy》1,2版 《Bergey’s Manual of Determinative Bacterialogy 》1-9版
1.古生菌：《系统手册 》（二版）
原核生物: 细菌界; 古生菌界（2门63属208种） 泉古生菌门 广古生菌门
链霉菌
Vol. 4 产孢放线菌 26-33
第十章微生物的分类与鉴定
《系统手册 》（二版，2000~年，共5卷）
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology( 2ed)
Vol.1: The Archaea & the Deeply Branching & Phototrophic Bacteria, ( 2001)
证据：
G-菌外膜与细胞器外膜 相似性；
内共生体如蓝色小体、 真核生物（如蚜虫）与 原核内共生体的发现；
第十章微生物的分类与鉴定
建议读物
第十章ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ生物的分类与鉴定
建议读物
第十章微生物的分类与鉴定
●古细菌生物学特征：
第十章微生物的分类与鉴定
§.3 各大类微生物的分类系统纲要
一、细菌、古生菌分类系统纲要
第十章微生物的分类与鉴定
《系统手册 》（二版）
原核生物：古生菌界、真细菌界 真细菌界：16门
变形杆菌门（Proteobacteria) 厚壁菌门 （Firmicutes) 蓝细菌门 （Cyanobacteria)
…………..
第十章微生物的分类与鉴定
3.真菌（Fungi）的分类系统
●Ainsworth系统
Cavaliner-Smith的6界系统
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
§.4 微生物分类鉴定方法
一、经典分类鉴定方法
第十章微生物的分类与鉴定
◆传统分类的细菌鉴定程序
第十章微生物的分类与鉴定
●细菌自动鉴定系统
API数值鉴定系统 BBL鉴定系统 Biolog鉴定系统
程序： 1、获取辅助特征 2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描
● 学名与俗名
第十章微生物的分类与鉴定
§.2 微生物在生物界的地位
五界系统：
第十章微生物的分类与鉴定
● 三域学说（Woese等）
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
●真核生物起源的内共生学
1）同一祖先 2）古细菌吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核生物？
原始真核生物吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核 生物？ 3）内共生过程线粒体、叶绿体细胞器的进化
第十章微生物的分类与鉴定
1995, Haemophilus influenzae 和Mycoplasma genetalium 最 早被测序
第十章微生物的分类与鉴定
●细菌新种发表的要求 1）在IJSB（IJSEM)等国际刊物上发表 2）国内发表应送副本给IJSB编辑，以获
有效目录公布 3）提供模式种 4）符合命名法规要求 5）符合优先律
第十章微生物的分类与鉴定
●广古生菌门
● 泉古生菌门
第十章微生物的分类与鉴定
2.细菌的分类
●《系统手册 》（一版，1984-1989年，共4卷）
卷 类型 群（Section） 主要代表
Vol. 1 G- 1-11 肠杆菌，假单孢菌，
Vol. 2 G+ 12-17 芽孢杆菌，梭菌，
Vol. 3 古生菌等 18-25 甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌
●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个 新的学名。
第十章微生物的分类与鉴定
§.1 通用分类单元 （一）种的概念
●种：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征 的菌株的集合。
●典型菌株（type strain） : 最具种特征的代表菌株。(Kribbella amoyensis
sp. nov. type strain is XMU 198T )
----7版，1983年，Hawksworth ----8版，1995年， Hawksworth
第十章微生物的分类与鉴定
书355
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
●菌种保藏中心与菌种目录
ATCC：美国典型菌种保藏中心 DSMZ: 德国典型菌种保藏中心 CCTCC：中国典型菌种保藏中心：
下设：CCGMC等6个中心 菌种目录及菌种保藏和购买
第十章微生物的分类与鉴定
二、学名的命名及有关法规
●双名法：Bacillus subtilis（属名＋种名加词）
Vol.2: Proteobacteria(2004) Vol.3: The Low G+C Gram Positives (2000) Vol.4: The High G+C Gram Positives(2000) Vol.5： The Planctomycetes, Spirochetes,
Fusobacteria (2001)
Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus
(三名法)
●学名(科学名):拉丁文,斜体 ●属名第一字母大写 ● 性、数、格一致
第十章微生物的分类与鉴定
●名字的应用：
Bacillus subtilis CMCC 63501 Bacillus subtilis Cohn 1874 Bacillus sp. Bacillus spp. ●缩写：B . Subtilis
Chap.10 微生物的分类和鉴定
1）通用分类单元 2）微生物在生物界的地位 3）各大类微生物的分类系统纲要 4）微生物分类鉴定方法
第十章微生物的分类与鉴定
●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生 物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。
●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给 未知物一个具体的分类位置。
●模式种（type species）： 典型菌株的实体，常保藏于标本室中。
(Type species: CCTCC AB 2011012T )
第十章微生物的分类与鉴定
●亚种：在种内有一个稳定特征不同于模式种 的菌株，为最低等级的分类单元。
●型：非分类单位，种内特征小差异的菌株。
● 菌株：同种的不同个体。
《Bergey’s Manual of Systematic Bacterialogy》1,2版 《Bergey’s Manual of Determinative Bacterialogy 》1-9版
1.古生菌：《系统手册 》（二版）
原核生物: 细菌界; 古生菌界（2门63属208种） 泉古生菌门 广古生菌门
链霉菌
Vol. 4 产孢放线菌 26-33
第十章微生物的分类与鉴定
《系统手册 》（二版，2000~年，共5卷）
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology( 2ed)
Vol.1: The Archaea & the Deeply Branching & Phototrophic Bacteria, ( 2001)
证据：
G-菌外膜与细胞器外膜 相似性；
内共生体如蓝色小体、 真核生物（如蚜虫）与 原核内共生体的发现；
第十章微生物的分类与鉴定
建议读物
第十章ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ生物的分类与鉴定
建议读物
第十章微生物的分类与鉴定
●古细菌生物学特征：
第十章微生物的分类与鉴定
§.3 各大类微生物的分类系统纲要
一、细菌、古生菌分类系统纲要
第十章微生物的分类与鉴定
《系统手册 》（二版）
原核生物：古生菌界、真细菌界 真细菌界：16门
变形杆菌门（Proteobacteria) 厚壁菌门 （Firmicutes) 蓝细菌门 （Cyanobacteria)
…………..
第十章微生物的分类与鉴定
3.真菌（Fungi）的分类系统
●Ainsworth系统
Cavaliner-Smith的6界系统
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
§.4 微生物分类鉴定方法
一、经典分类鉴定方法
第十章微生物的分类与鉴定
◆传统分类的细菌鉴定程序
第十章微生物的分类与鉴定
●细菌自动鉴定系统
API数值鉴定系统 BBL鉴定系统 Biolog鉴定系统
程序： 1、获取辅助特征 2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描
● 学名与俗名
第十章微生物的分类与鉴定
§.2 微生物在生物界的地位
五界系统：
第十章微生物的分类与鉴定
● 三域学说（Woese等）
第十章微生物的分类与鉴定
第十章微生物的分类与鉴定
●真核生物起源的内共生学
1）同一祖先 2）古细菌吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核生物？
原始真核生物吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核 生物？ 3）内共生过程线粒体、叶绿体细胞器的进化
第十章微生物的分类与鉴定
1995, Haemophilus influenzae 和Mycoplasma genetalium 最 早被测序
第十章微生物的分类与鉴定
●细菌新种发表的要求 1）在IJSB（IJSEM)等国际刊物上发表 2）国内发表应送副本给IJSB编辑，以获
有效目录公布 3）提供模式种 4）符合命名法规要求 5）符合优先律
第十章微生物的分类与鉴定
●广古生菌门
● 泉古生菌门
第十章微生物的分类与鉴定
2.细菌的分类
●《系统手册 》（一版，1984-1989年，共4卷）
卷 类型 群（Section） 主要代表
Vol. 1 G- 1-11 肠杆菌，假单孢菌，
Vol. 2 G+ 12-17 芽孢杆菌，梭菌，
Vol. 3 古生菌等 18-25 甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌
●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个 新的学名。
第十章微生物的分类与鉴定
§.1 通用分类单元 （一）种的概念
●种：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征 的菌株的集合。
●典型菌株（type strain） : 最具种特征的代表菌株。(Kribbella amoyensis
sp. nov. type strain is XMU 198T )