07_电子PCR
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• 包含STS标记物上所有的数据, 包括
– 引物序列，产物大小, 定位数据和别名
• 提供对其他的 NCBI 资源的链接, 如
– Entrez, LocusLink 和 MapViewer
• e- PCR 在DNA 序列中搜寻潜在的STS
– 方位和距离正确的子序列 – 用于产生已知STS的PCR 引物
• 用左侧的滑标可 以对图像放大缩 小。
电子 PCR (e-PCR)
• 识别DNA序列中的序列标签位点(STS) 是一个电子 PCR 问题。
• NCBI的电子 PCR(e-PCR)工具, 是 UniSTS 资源的一部份, 用于在有关 的DNA 片段里面寻找STS 标记。
UniSTS
• UniSTS的URL是 (http:// /genome/sts/)
Map Viewer
• 显示图谱
stSG47693 称为 RH92759(粉色)
• Gene Map’99Genebridge 4 标度在左边 (GM99_GB4)
பைடு நூலகம்
Map Viewer
GeneMap’99(GM99)是 国际放射杂交组织使 用一致的RH试剂和 方法建成的
GeneBridge 4 RH panel (GB 4 RH 组 )
• 显示引物、别名 等详细信息
• 提供交叉参考和 超链接
– LocusLink – Unigene – GeneBridge 4
UniSTS
• 页面的下面显示 • 包括该STS的其他
序列
– Contig (连续克隆系) – mRNA – EST
• 点击Mapping Information 中的 Map Viewer
Map Viewer
• 右边的STS标度 显示：
• NCBI用e-PCR 将STS定位到 基因组序列上。
• 灰线连接两个 标度上的标记。
• 红线标出 RH92759 在两个标度上 的标记。
Map Viewer
• 该区共有211个 STS标记，显示 了其中20个的名 称。
• 绿色和黄色的圆 点标出STS定位 的位置。
e-PCR
/ • 在NCBI主页的右栏
选择Electronic PCR
e-PCR
UniSTS
• 在文本框中输入 序列或者编号 AF288398
• 然后提交
UniSTS
• 得到1个STS RH92759
• 点击 UniSTS:92492
UniSTS
– 引物序列，产物大小, 定位数据和别名
• 提供对其他的 NCBI 资源的链接, 如
– Entrez, LocusLink 和 MapViewer
• e- PCR 在DNA 序列中搜寻潜在的STS
– 方位和距离正确的子序列 – 用于产生已知STS的PCR 引物
• 用左侧的滑标可 以对图像放大缩 小。
电子 PCR (e-PCR)
• 识别DNA序列中的序列标签位点(STS) 是一个电子 PCR 问题。
• NCBI的电子 PCR(e-PCR)工具, 是 UniSTS 资源的一部份, 用于在有关 的DNA 片段里面寻找STS 标记。
UniSTS
• UniSTS的URL是 (http:// /genome/sts/)
Map Viewer
• 显示图谱
stSG47693 称为 RH92759(粉色)
• Gene Map’99Genebridge 4 标度在左边 (GM99_GB4)
பைடு நூலகம்
Map Viewer
GeneMap’99(GM99)是 国际放射杂交组织使 用一致的RH试剂和 方法建成的
GeneBridge 4 RH panel (GB 4 RH 组 )
• 显示引物、别名 等详细信息
• 提供交叉参考和 超链接
– LocusLink – Unigene – GeneBridge 4
UniSTS
• 页面的下面显示 • 包括该STS的其他
序列
– Contig (连续克隆系) – mRNA – EST
• 点击Mapping Information 中的 Map Viewer
Map Viewer
• 右边的STS标度 显示：
• NCBI用e-PCR 将STS定位到 基因组序列上。
• 灰线连接两个 标度上的标记。
• 红线标出 RH92759 在两个标度上 的标记。
Map Viewer
• 该区共有211个 STS标记，显示 了其中20个的名 称。
• 绿色和黄色的圆 点标出STS定位 的位置。
e-PCR
/ • 在NCBI主页的右栏
选择Electronic PCR
e-PCR
UniSTS
• 在文本框中输入 序列或者编号 AF288398
• 然后提交
UniSTS
• 得到1个STS RH92759
• 点击 UniSTS:92492
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