血液RNA提取

合集下载
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

血液RNA提取
完全可以,我曾经全血标本6个小时后分离白细胞提RNA,结果很好.因为你提的是白细胞内的RNA,因而在细胞没破损前,一般情况下不会出现RNA的降解,当你开始加TIIZOL时,你的所有器材的处理尤其重要,因而放心的做吧,
本人长期从事白血病融合基因的检测,曾经使用4度保存3天的血液进行RNA提取,效果同样非常满意,目前使用的一次性耗材基本上不用DEPC水处理,只要注意规范操作,按TIIZOL说明书操作,提取的RNA 质量同样非常的高。

附上本试验室的简易操作程序:1.外周血及骨髓(抗凝)利用淋巴细胞分离液分离单个核细胞
(1)外周血送检需5-10ml抗凝血,骨髓需1-3ml抗凝,常温送检(样本量根据单个核细胞的数量来确定,一般需要5x106单个核细胞以上)。

(2)加入等体积无菌PBS于外周血及骨髓中充分混合,形成细胞悬液;
(3)加入5ml淋巴细胞分离液于另一离心管。

(4)吸取5ml细胞悬液沿管壁轻轻加入到淋巴细胞分离液表面(注意勿与淋巴细胞分离液混合)。

离心1500rpm 20min。

(5)用吸管轻轻吸出界面层(白膜)中的MNC入另一离心管中。

无菌冷PBS洗2次,最后1次洗涤可以将细胞悬液移入EP管中,离心去上清直接或加入TRIzol混匀后-70℃冻存,或直接提取RNA(可以先进行细胞计数以保证细胞数)。

2.利用Trizol的方法提取细胞总RNA(参照Invitrogen公司Trizol说明书)
以下步骤要严格防止RNA酶降解RNA,所使用的离心管和枪头要用0.1% DEPC水处理24h,然后高压灭菌并烤干。

尽量快地进行操作,减少RNA降解。

(1)先加1ml Trizol于1×107细胞中,若冻存细胞直接加入Trizol,不需解冻,吹打裂解后室温静置
5-10min。

(可-70℃,1月)
(2)加入0.2ml氯仿(三氯甲脘),剧烈震荡(vigorously)15s,室温静置2-3min。

(3)在4℃下1,2000g离心15min。

(4)小心吸出上清水相约500μl移入另一离心管(注意不要抽到蛋白层),加入500μl异丙醇(专用),颠倒混匀(不要太剧烈),室温静置10min(RNA沉到底部)。

(5)4℃1,2000g离心10min,倒去上清液,底部可见针尖大小白色物质(RNA)。

(6)加入1ml 70%乙醇旋转洗涤,清洗异丙醇。

(7)4℃7500 g离心5min,去除乙醇(尽量用枪头吸干净)后晾5-10min,不要太干,否则难以溶解。

RNA可以在70%乙醇中-80℃保存1年。

最新血液RNA提取
1、血液收集:最好用肝素抗凝,因为EDTA可能会对后续的pcr 有影响,因为EDTA会螯合pcr 反应中的Mg2+,也可以根据实验的具体要求看选择怎么样的抗凝。

2、白细胞的分离:一般选择1.5ML新鲜的血液,或选取冷冻的5ML的血液(冷冻血液的保存:先液氮速冻,再置于-80°保存),或隔天的5ML的血液,就可以分离到比较多的白细胞了。

可以选择溶红素(BD公司的)或红细胞裂解液按一定的比例(1:3或1:5)分离白细胞,一般在3500转离心6分钟即可,效果不好的话,可以重新裂解一次。

分离得到的白细胞,立刻用质量好的TRIZOL裂解白细胞,如果不能马上提取的话,可以置于-20或-80°保存,过后抽提。

3、RNA抽提:选择一般的组织或细胞的RNA抽提试剂盒即可。

本方法简单,省钱,经过大量的实验表明是可行的,并且本人用进口的血液RNA抽提试剂盒都不能跟上述方法比
在用血液标本进行基因表达研究时,需要及时把新鲜血液中有核细胞的RNA提取出来。

全血还不能直接放到-80℃保存,即使在-80℃保存,全血中的RNA也容易发生降解。

传统的提取新鲜全血RNA方
法是把先把有核细胞从全血中分离出来,需要加白细胞分离液、离心等步骤,比较繁琐,在临床医院往往难以实施。

作为RNA提取的领先公司,北京艾德莱的研发人员在05年国内首家研发成功液体样本RNA 提取试剂RN01 TRIpure LS(LS 意思是Liquid Sample。

可以直接裂解全血提取RNA,避免了先裂解白细胞可能导致的RNA降解,也大大简化了操作步骤。

操作时间比普通方法节约至少三分之一。

在临床上采血时,可以先把TRI pure LS Reagent分装750ul到1.5ml的离心管中。

血液样本可以先抗凝处理(EDTA抗凝或者其他抗凝方式都可),然后取250ul全血样品加入到750ul的TRI pure LS Reagent中,用移液枪反复抽打并振荡混匀,在室温裂解5min-10min,直至血细胞充分发生裂解。

然后可把此裂解液保存在-20℃下可达2个月,-80℃可达半年。

在此期间,可以把该裂解液运输到北京艾德莱生物公司进行RNA的抽提,运输过程可以4℃1天,-20℃一周。

在全血RNA提取试剂直接裂解全血的基础上面,北京艾德莱又进一步简化了操作,增加了离心柱操作,推出了RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA 提取试剂盒。

点此详见。

经过离心柱子吸附漂洗,除了进一步简化了操作步骤外,更适合临床高通量操作外,还极大的提高了RNA的纯度。

除了一般常见的RT PCR 或者荧光定量PCR外,RNA纯度可以满足最严格的实验要求比如基因表达谱芯片要求,1ml的全血可以得到10μg左右的total RNA,足够满足芯片分析的需要
需要准备的试剂氯仿、异丙醇、75%乙醇(用RNase-free水配制)、RNase-free 的水
1.匀浆处理(Homogenization)
直接取新鲜的血液,加入3倍体积红细胞裂解液,混匀后室温放置10分钟,10,000 rpm离心1分钟。

彻底吸弃上清,收集白细胞沉淀。

每100-200μl血液收集的白细胞沉淀加入1ml TRIzol。

2.分层(Phase Separation)
a. 样品加入TRIzol后,室温放置5min,使样品充分裂解。

注:
如不进行下一步操作,样品可放入-70℃长期保存。

可选步骤:4℃ 12,000 rpm 离心10分钟,取上清。

如果样品中含有较多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物结节部分等,可离心去除。

处理脂肪组织样品时,上层是大量油脂,应除去。

取澄清的匀浆溶液进行下一步操作。

b. 每1ml TRIzol加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀后室温放置3-5 min使其自然分相。

3.RNA沉淀(RNA Precipitation)
a. 4℃ 12,000rpm离心10-15min。

样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(通常可吸取550μl)转移到新管中。

注:小心吸取水相,千万不要吸取中间界面,否则将导致RNA样品中有DNA 污染。

b. 在上清中加入等体积冰冷的异丙醇,室温放置10-20min。

4℃ 12,000 rpm 离心10min,弃上清,RNA沉淀于管底。

4.RNA漂洗(RNA Wash)
a. RNA沉淀中加入1ml 75%乙醇(用RNase-free水配制),温和振荡离心管,悬浮沉淀。

每1ml TRIzol加入1ml 75%乙醇。

b. 4℃ 5,000-8,000 rpm离心1-2min,弃上清;短暂快速离心,用移液器小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。

室温放置1-2分钟晾干沉淀。

注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。

5.溶解RNA(Redissolving the RNA)
沉淀中加入50-100μl RNase-free水,轻弹管壁,以充分溶解RNA,-70℃保存。

注意事项
1. 经常更换手套。

因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。

2. RNA在TRIzol试剂中不会被RNase污染,但在氯仿分相后的上清中已经没有了RNase的抑制剂,所以分相后的所有操作要特别小心,保证使用的离心管和枪头都是RNase-free的。

3. RNase-free水的配制方法:将水加入干净的玻璃瓶中,加入
DEPC至终浓度0.1%(v/v),放置过夜,高压灭菌;RNase-free的塑料和玻璃器皿处理方法:玻璃器皿可在150℃烘烤4小时;塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10分钟,然后用DEPC水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。

6. 不同组织或细胞中提取RNA预期得率血液(3-5 μg/ml人全血).
RNA纯度及浓度检测
完整性RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:1.2%胶;
0.5×TBE电泳缓冲液;150v,15分钟)检测完整性。

由于细胞中70-80%的RNA为rRNA,电泳后UV 下应能看到非常明显的rRNA条带。

动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18S rRNA;植物叶片中由于含有大量的叶绿体RNA,可见4条或更多rRNA;细菌rRNA大小分别约为4kb和2kb,分别相当于细菌23S和16S rRNA。

RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否则表示RNA样品的降解。

出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。

纯度 OD
260/OD
280
比值是衡量RNA样品中蛋白质污染程度的指标。

高质量的RNA
样品,OD
260/OD
280
值(10mM Tris, pH7.5)在2.0左右。

OD
260
/OD
280
读数受测定所
用溶液的pH值影响。

同一个RNA样品,假定在10mM Tris,pH7.5溶液中测出的
OD
260/OD
280
读数在1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9之间,但
这并不表示RNA不纯。

浓度取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀释n倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD
260
测定,按照以下公式进行RNA浓度的计
算:终浓度(ng/μl)=OD
260
×n (稀释倍数)×40。

相关文档
最新文档