长链非编码RNA的作用机制及其研究方法_夏天
分析长链非编码RNA在生物体内的作用和作用机制
分析长链非编码RNA在生物体内的作用和作用机制在生物体内，长链非编码RNA（lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸的RNA分子，不编码蛋白质，但在细胞生命过程中扮演着重要的调节和调控作用。
本文将重点探讨lncRNA的生物学功能和作用机制，以期增加人们对这个重要分子的了解。
一、调节基因表达lncRNA作为一种新兴的基因调节分子，在基因表达调控方面发挥着重要的作用。
研究表明，lncRNA可以通过基因转录、剪接、核移位、DNA甲基化、染色质重构等调节方式，对基因表达进行直接或间接的调控。
例如，lncRNA XIST在性染色体不活性化中发挥着重要的作用，通过将X染色体整体包裹起来，阻止基因的转录和表达，从而实现对性染色体的不活性化。
二、调控细胞生命活动在调节细胞生命活动方面，lncRNA同样扮演着重要的角色。
在细胞凋亡、细胞分化、细胞增殖、免疫应答等细胞生命活动过程中，lncRNA通过调控信号通路的激活或抑制，改变细胞的功能和特性。
例如，在肿瘤形成和发展中，lncRNA HOTAIR可以通过调节组蛋白修饰和表观遗传方式，促进肿瘤细胞的增殖和迁移。
三、参与疾病发生lncRNA在疾病发生和发展中也有一定的参与作用。
研究表明，lncRNA参与了多种疾病的发生和进展，如肿瘤、心血管疾病、神经系统疾病等等。
在肿瘤方面，lncRNA参与了调节癌基因和抑癌基因的表达，细胞的增殖、迁移、凋亡等生理活动，具有重要的肿瘤诊断和治疗应用前景。
四、作用机制lncRNA在调节基因表达、细胞生命活动、疾病发生等方面的作用机制十分复杂，目前仍在探索中。
一般认为，lncRNA通过以下方式影响基因表达：1.竞争性结合：lncRNA和mRNA等RNA分子竞争同一下游基因的结合位点，从而影响基因的转录和表达。
2.调节蛋白质的翻译：lncRNA可以和核糖体、多肽链等蛋白质结合，影响翻译或调节蛋白质的功能和位置。
3.染色质重构：lncRNA可以通过调节组蛋白修饰、DNA甲基化等方式影响基因染色质的结构和功能。
长链非编码RNA的调控机制及其在疾病中的作用
长链非编码RNA的调控机制及其在疾病中的作用近年来，随着RNA研究的深入，非编码RNA的重要性引起了越来越多的关注。
其中，长链非编码RNA（lncRNA）的研究尤为发展。
lncRNA具有多样化的调控机制，以及在多种生物学过程和疾病中发挥着重要的作用。
本文将介绍lncRNA的调控机制及其在疾病中的作用，为lncRNA的深入研究提供一些思路与启示。
一、lncRNA的调控机制1、转录调控：lncRNA参与基因的转录和表达调控。
具体来讲，lncRNA通过转录介导结构形成或实现顺反式基因转录，参与基因启动子或调节因子的招募、染色体修饰和基因表达的抑制或促进等多个步骤。
2、转译调控：虽然lncRNA大多数不参与转译过程，但个别lncRNA具有转译能力，且可以调节其他基因的转录和翻译，从而影响细胞功能。
3、miRNA竞争性抑制：lncRNA表现出与miRNA具有互补结构，因此它们可以通过吸附miRNA或抑制miRNA的结合，影响miRNA与mRNA之间的键合，从而调节靶向基因的表达。
4、蛋白互作：lncRNA可以与蛋白相互作用，并影响其功能。
这种互作可涉及DNA修复、转录调节、表观修饰等多个基础细胞过程。
5、废旧纠正效应：lncRNA参与细胞衰老和细胞分裂的过程中，通过废旧纠正效应参与细胞内容物的降解。
综上所述，lncRNA具有多方面的调控机制，涉及多种生物学过程和基础细胞功能。
二、lncRNA在疾病中的作用1、癌症：lncRNA在癌症的发展过程中发挥重要作用。
例如，HOTAIR通过miRNA竞争性抑制的方式增加靶向基因的表达，从而促进癌症的细胞迁移和转移；LincRNA-p21和UCA1在转化过程中则有被抑制表达的功能，抑制细胞的癌症进程。
2、糖尿病：lncRNA在糖尿病的起病和发展过程中发挥重要作用。
例如，let-7和miR-34a可以调节GLUT4，在代谢通路和能量生成过程中发挥作用；长链lncRNA GAS5则可以调节胰岛素的表达和促进胰岛素分泌。
长链非编码RNA在肿瘤中的作用及机制
长链非编码RNA在肿瘤中的作用及机制随着基因测序技术的不断进步，人们对于长链非编码RNA逐渐产生了兴趣。
长链非编码RNA是一类没有翻译成蛋白质的RNA，它们在细胞内具有非常重要的生物学功能。
随着对长链非编码RNA的研究不断深入，人们发现它们在肿瘤中起着关键的作用。
下面，我们就来讲一下长链非编码RNA在肿瘤中的作用及机制。
首先，长链非编码RNA可以作为肿瘤标志物。
一些研究表明，肿瘤组织中的长链非编码RNA的表达模式与健康组织有很大的差异。
通过监测这些长链非编码RNA的表达水平，可以很好地判断患者是否患有肿瘤。
这些长链非编码RNA的表达水平还可以反映患者的疾病程度，对于肿瘤早期诊断和治疗具有重要的意义。
其次，长链非编码RNA还参与了肿瘤细胞的增殖和凋亡。
某些长链非编码RNA的表达水平与肿瘤细胞的增殖和凋亡相关。
例如，某些长链非编码RNA的表达水平与肿瘤细胞的增殖有关，这些长链非编码RNA参与了肿瘤细胞的周期调控和增殖信号途径。
而另一些长链非编码RNA则与肿瘤细胞的凋亡有关，这些长链非编码RNA可以调节凋亡相关蛋白的表达，从而影响肿瘤细胞的生长。
长链非编码RNA还可以参与肿瘤的转移和侵袭。
肿瘤的转移和侵袭是肿瘤治疗中非常棘手的问题。
研究表明，某些长链非编码RNA可以影响肿瘤细胞的转移和侵袭能力。
这些长链非编码RNA可以通过调节转录因子的表达、信号途径的活性等机制来影响肿瘤细胞的转移和侵袭。
长链非编码RNA与肿瘤的关系非常复杂，其中的具体机制也不尽相同。
在这里，我们简单谈谈目前已经发现的长链非编码RNA参与肿瘤的机制。
首先，长链非编码RNA可以通过与蛋白质相互作用来调节基因表达。
长链非编码RNA可以与蛋白质结合，形成复合物。
这样做的目的是通过改变复合物的结构和功能来调节某些基因的表达。
这种调节机制叫做“调节型RNA”。
在肿瘤中，长链非编码RNA可以调节多种关键基因的表达，以影响肿瘤的生长和发展。
其次，长链非编码RNA也可以直接参与转录调控。
长链非编码RNA的功能及机制研究
长链非编码RNA的功能及机制研究在生命的基本单位——细胞中，存在着大量的DNA序列，而这些序列并不全都编码蛋白质。
其中，90%以上的DNA被认为是人类基因组中的“垃圾”DNA，也就是我们常说的非编码DNA。
然而，我们现在已经明确地知道，在非编码DNA序列中，还存在着一种称为长链非编码RNA的分子，它在调控细胞生物学过程中起到了重要的作用。
长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是指那些长度超过200个核苷酸的RNA分子，它们既不被翻译成蛋白质，也不参与到基因转录后的RNA翻译中去。
可以说，lncRNA是细胞内维持正常生理状态中必不可少的调控分子。
虽然lncRNA不具备编码蛋白质的能力，但其化学特性与功能多样性使其在细胞调控中显得异常重要。
相较于编码RNA(mRNA)的调控机理，lncRNA研究尚属于相对年轻的领域，其功能和作用机理也仍然存在许多未解之谜。
但在近十年的研究中，人们逐渐揭示了lncRNA的复杂性，发现它在调控基因表达和细胞生物学过程中发挥着重要的作用，并与一系列疾病的发生和发展密切相关，如肝癌、胃癌、肺癌和心血管疾病等。
因此，对lncRNA的研究不仅有助于我们更完整地了解基因表达调控机制，还有助于我们对各种疾病的产生及其机制有一个更深刻的认识。
lncRNA调控基因表达的机制复杂多样。
一方面，lncRNA与DNA形成三维结构，影响染色质的可读性和开放程度，从而调控基因转录；另一方面，lncRNA通过与RNA、蛋白质相互作用，影响RNA的剪切、稳定或降解，进而调控基因表达。
值得注意的是，lncRNA的作用往往是更加复杂的，一个lncRNA可能与多个互相关联的分子相互作用、调节多个基因的表达，进而影响整个细胞的生物学特性，甚至影响整个生物体的生长和发育。
研究表明，lncRNA作为起部组织基因表达的分子开关具有重要的意义。
在细胞分化过程中，lncRNA可以通过不同的机制调节转录因子的表达，从而影响组织特异性基因的表达和分化。
非编码RNA的生物学功能及其研究方法
非编码RNA的生物学功能及其研究方法RNA是生命体中的重要分子，作为基因的转录产物，在生物进化的过程中发挥着重要的作用。
随着生物学研究的深入，人们逐渐认识到RNA的作用不仅仅停留在基因的转录与翻译过程，更广泛地涉及到包括基因调控、信号传递以及细胞增殖、分化和凋亡等重要生物学过程。
其中，非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA) 成为了研究的热点之一。
非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA分子，具有多样性、表达量较大而且高度保守。
目前已经鉴定出的非编码RNA主要包括长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA) 、小核RNA (small nuclear RNA, snRNA) 、小核仁RNA (small nucleolar RNA, snoRNA) 、microRNA (miRNA) 、piwiRNA等。
这些RNA在生物体内的功能千差万别，但是总体而言，它们均有着非常重要的生物学功能。
其中，长链非编码RNA近年来备受关注。
lncRNA通常指在转录后长度大于200nt的RNA，同样也不编码蛋白质。
lncRNA通过多种方式参与调控基因表达，从而影响胚胎发育、免疫应答、炎症反应、细胞分化、代谢调控和疾病发生等重要生物学过程。
另一方面，microRNA的作用也被广泛研究。
目前，人们已经鉴定到了超过3000个human microRNA，这些RNA参与到许多生物学过程中，包括细胞分化、增殖、凋亡、血液循环、胚胎发育以及人类疾病的发生等等。
例如，miR-21和miR-155被认为是炎症及肿瘤微环境中的重要调控因子，而miR-29的缺失则与心肌纤维化的发生有关。
了解非编码RNA分子生物学功能对于揭示生命体内生物学过程机制，以及疾病的发生和治疗具有重要意义。
下面我们将简要介绍非编码RNA的研究方法。
非编码RNA的研究方法随着生物学研究的深入，人们对非编码RNA的研究方法也越来越多样化。
长链非编码RNA的功能和机制研究
长链非编码RNA的功能和机制研究RNA分为编码RNA和非编码RNA两类。
编码RNA主要参与蛋白质合成，而非编码RNA则没有这一功能，但二者在细胞内的调控作用是不可替代的。
长链非编码RNA (lncRNA)是近年来受到广泛研究的一个领域，它们在调节基因表达、细胞发育、疾病发生等方面发挥着重要作用。
lncRNA的功能机制lncRNA是一种长度超过200个核苷酸的非编码RNA，其功能机制复杂多样。
lncRNA可以通过与蛋白质相互作用，形成复合物从而调节基因表达、转录、剪接等生物学过程。
此外，lncRNA还可以作为miRNA的“海绵”扮演重要角色。
它们能够与miRNA竞争结合，从而抑制miRNA在靶基因上的作用，进而影响基因的表达。
另外，lncRNA还可以自身参与转录调控和基因剪接，通过与蛋白质相互作用形成复合物，直接干预基因的转录与剪接过程。
比如，lncRNA Xist是一种影响X染色体失活的RNA分子，在胚胎发育早期，Xist RNA可以干扰整个染色体的转录，引发周围基因的沉默。
在疾病的发生过程中，lncRNA也发挥着至关重要的作用。
许多lncRNA与癌症、神经退行性疾病等常见疾病相关联，例如，生长耗竭相关RNA（GAS5）参与癌细胞增殖和凋亡过程。
肝细胞癌细胞上调化四联蛋白A2前体RNA (HULC)政府还可以通过调节miR-200a促进恶性肿瘤的发生。
lncRNA的研究方法lncRNA在功能上的多样性、动态性和低表达量等特点，使得其的研究方法与研究中的困难相对应。
目前，研究lncRNA主要采取以下方法：1. 将RNA转录成cDNA后，通过定量PCR的方法检测其表达水平。
2. 采用RNA组测序技术，得到高通量的RNA测序数据，进而鉴定出新的lncRNA。
3. 通过RNA FISH技术观察lncRNA在细胞内分布位置和表达量的变化。
4. 利用下游分析工具，进行不同基因表达谱之间的比较，寻找与lncRNA共表达的基因和通路。
长链非编码RNA的作用机制及其研究方法
Ａｂ ｓ ｔ ｒ ａ ｃ ｔ ： Ｌ ｏ ｎ ｇ ｎ ｏ ｎ － ｃ ｏ ｄ ｉ ｎ ｇ Ｒ ＮＡｓ （ １ ｎ ｃ Ｒ ＮＡｓ ） ｐ ｌ ａ ｙ ｂ ｉ ｏ ｌ ｏ ｇ ｉ ｃ ａ ｌ ｒ ｏ ｌ ｅ ｓ ｔ ｈ ｒ ｏ ｕ ｇ ｈ ａ ｖ ａ ｒ ｉ ｅ ｔ ｙ ｏ ｆ ｍｅ ｃ ｈ ａ ｎ ｉ ｓ ｍｓ ， ｉ ｎ ｃ ｌ ｕ ｄ ｉ ｎ ｇ ｇ ｅ ｎ ｅ ｔ ｉ ｃ
综 述
长链非编码 Ｒ Ｎ Ａ 的作用机制及其研究方法
夏 天，肖丙 秀， 郭俊明
宁 波 大 学 医学 院生 物 化 学 与分 子 生 物 学 研 究 所 ，浙 江省 病 理 生 理 学 技 术 研 究 重 点 实验 室，宁波 ３ １ ５ ２ １ １
摘 要 ：长链非编码 Ｒ Ｎ Ａ （ Ｌ ｏ ｎ ｇ ｎ ｏ ｎ ． ｃ ｏ ｄ ｉ ｎ ｇ Ｒ Ｎ Ａ ， ｌ ｎ ｃ因
Ｌｎ ｃ ＲＮＡｓ ａ ｒ ｅ ｉ ｎ ｖ ｏ ｌ ｖ ｅ ｄ ｉ ｎ ｔ ｈ ｅ ｒ ｅ ｕｌ ｇ ａ ｔ ｉ ｏ ｎ ｏ ｆ ｇ ｅ ｎ ｅ ｅ ｘ ｐ ｒ ｅ ｓ ｓ ｉ ｏ ｎ ｔ ｈ ｒ ｏ ｕ ｇ ｈ ｔ ｈ ｅ ａ ｂ ｏ ｖ ｅ ｍｅ ｃ ｈ ｎｉ ａ ｓ ｍｓ ｉ ｎ ｄ ｉ ｆｅ ｒ ｅ ｎ ｔ ｌ ｅ ｖ ｅ ｌ ｓ ． Ｅ ｓ ｔ ａ ｂ ｌ ｉ ｓ ｈ － ｍｅ ｎ ｔ ｎｄ ａ ａ ｐ ｐ ｌ ｉ ｃ ａ ｔ ｉ ｏ ｎ ｏ ｆ ｒ ｅ ｓ ｅ ｒｃ ａ ｈ ｔ ｅ ｃ ｈ ｎ ｏ ｌ ｏ ｇ ｉ ｅ ｓ ｒｅ ａ ｉ ｍｐ ｏ ｒ ｔ ａ ｎ ｔ ｉ ｎ ｕ ｎ ｄ ｅ ｒ ｓ ｔ ａ ｎ ｄ ｉ ｎ ｇ ｏ ｆ ｌ ｎ ｃ ＲＮＡｓ ｆ ｕ ｎ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ ｓ ． Ｍｉ ｃ ｒ ｏ ａ ｒ ｒ ａ ｙ ， Ｒ ＮＡ ｓ ｅ － ｑ ｕ ｅ ｎ ｃ ｉ ｎ ｇ ，Ｎｏ ｒ ｔ ｈ ｅ ｎ ｒ ｂ ｌ ｏ ｔ ， ｒ ｅ ａ ｌ ｔ ｉ ｍｅ ｑ ｕ ｎｔ ａ ｉ ｔ ａ ｔ ｉ ｖ ｅ ｒ ｅ ｖ ｅ ｒ ｓ ｅ ｔ ｒ ａ ｎ ｓ ｃ ｒ ｉ ｐ ｔ ｉ ｏ ｎ － ｐ ｏ ｌ ｙ ｍｅ ｒ ａ ｓ ｅ ｃ ｈ ａ ｉ ｎ ｒ ｅ ａ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ ，ｆ ｌ ｕ ｏ ｒ ｅ ｓ ｃ ｅ ｎ ｃ ｅ ｉ ｎ ｓ ｉ ｔ ｕ ｈ ｙ —
长链非编码RNA的功能和应用
长链非编码RNA的功能和应用长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）是指长度超过200nt且不具备翻译成蛋白质的能力的RNA分子。
在过去的几十年中，研究人员主要关注RNA的翻译作用，然而，大量的研究表明，lncRNA在基因调控、细胞分化、发育和免疫调节等生物学过程中扮演着重要的角色。
本文旨在介绍lncRNA的功能和应用，并展望其在未来的发展方向。
一、lncRNA的功能1.1 起调节作用lncRNA是在转录后水平对基因表达进行调节的，其中一些lncRNA可以与DNA分子相互作用，从而在影响基因转录中起到调节作用。
例如，一些lncRNA可以与转录因子相互作用，这种相互作用可以在转录时帮助转录物与DNA结合，从而激活或抑制基因表达。
此外，lncRNA可以结合RNA结合蛋白和其他RNA分子形成复合物，从而影响mRNA的稳定性、转运和翻译。
1.2 参与染色体重塑lncRNA在染色体重塑中扮演着重要角色，尤其是在X染色体失活中。
在X染色体失活过程中，一些特定的lncRNA可以结合到一些RNA结合蛋白上，使其定位到X染色体上，从而调控该染色体的失活。
此外，一些lncRNA还能够影响染色体结构和组装，并参与到调控细胞分化和生长发育的过程中。
1.3 作为小RNA的反义物一些lncRNA具有与小RNA相对应的序列，因此它们可以与小RNA形成反义RNA。
反义RNA能够通过两种方式来调控小RNA 的功能，即通过与小RNA形成双链RNA，或者与RNA结合蛋白形成复合物，从而抑制小RNA的结合和功能。
近年来，反义RNA的调控作用已经成为了一个研究热点。
二、lncRNA在疾病中的应用随着对lncRNA的研究逐渐深入，人们已经开始探索lncRNA 在疾病治疗中的应用价值。
在癌症治疗方面，lncRNA已经成为了一个研究热点。
例如，一些研究已经发现，lncRNA HOTAIR在肿瘤的发生和发展中起到了重要作用，因此，该lncRNA被认为可能成为治疗肿瘤的一个有潜力的靶标。
长链非编码RNA功能
长链非编码RNA功能一、引言随着科学技术的不断发展，人们对于基因的研究也变得越来越深入。
在以往的研究中，科学家们主要关注的是编码蛋白质的基因，而对于非编码基因的研究则相对较少。
但是随着近年来生物学研究的深入，非编码基因逐渐成为了研究热点之一。
本文将着重探讨长链非编码RNA的功能。
二、长链非编码RNA与基因调控长链非编码RNA（lncRNA）是一种长度超过200个碱基的RNA分子，与传统的小分子RNA不同。
它既不是编码蛋白质的基因，也不具有自主翻译的功能，但是它可以通过多种方式参与到基因调控中。
lncRNA可以调节基因表达，影响DNA的稳定性，参与染色质修饰等，从而影响细胞的生命活动。
lncRNA具有以下几种基因调控方式：1. 诱导基因表达。
一些lncRNA可以通过结合靶基因DNA上的启动子或增强子的方式，调节基因表达。
如lncRNA-xist和HOTAIR能够靶向性地与X染色体基因或HOXD基因家族中的DNA序列结合，从而激活或抑制区域内的基因表达。
2. 转录后调节。
lncRNA转录后可以与蛋白质结合，影响蛋白质功能，从而调节基因表达。
如NEAT1能够结合转录因子SP1，调节其活性，影响基因转录。
3. 剪切调节。
一些lncRNA还可以通过转录剪切方式，控制靶基因表达。
如Malat1和MEG3通过剪切调节靶基因的选择性剪切，影响基因的转录和翻译。
三、lncRNA的生物学功能1. 转录调节。
lncRNA可以通过转录调节来影响基因表达，如MALAT1的缺失可以导致部分基因表达下调，从而抑制细胞生长和增殖。
HOTAIR则参与了转录抑制细胞周期基因的过程。
2. 海绵RNA的作用。
某些lncRNA可与miRNA结合，降低miRNA的互补靶向效应，形成miRNA 物质吸附基质，并调节细胞功能和信号通路。
例如，lncRNA HULC可通过海绵RNA作用，降低miR-372的表达，从而影响细胞生长。
3. 染色质调节作用。
长链非编码RNA的调控机制与功能分析
长链非编码RNA的调控机制与功能分析随着生物学领域的不断发展，越来越多的研究表明：非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）是一个独特而强大的调节机制。
它们通常不翻译成蛋白质，但可以发挥各种不同的功能。
其中最重要的是长链非编码RNA（Long Non-Coding RNA，lncRNA）。
事实上，lncRNA在基因调控、细胞分化、肿瘤发生等各种生物学过程中起着关键作用。
因此，研究lncRNA的调节机制和功能分析具有重要意义。
一、lncRNA的调节机制1.1 转录调节一个基因的转录可以受到许多层次的调节，lncRNA在其中扮演着至关重要的角色。
它们可能直接或间接地影响转录的开始、终止、速率和选择性。
例如，一些lncRNA能够促进或抑制RNA聚合酶的招募和释放，调节基因的转录起始。
其他lncRNA则可以减缓基因转录的速率，从而影响它们的表达水平。
最近，“超级增强子”lncRNA的发现，也表明lncRNA可以调节基因表达的选择性。
1.2 剪接调节在细胞核内，prRNA通过剪接来去除其内含子，只保留可翻译为蛋白质的外显子。
然而，在一些lncRNA中，含有多个剪接形式，这些剪接变化可以产生不同种类、不同长度的lncRNA分子，以达到调节生物体的目的。
例如，HOTAIRlncRNA剪接体可以参与转录因子复合物的组装或拆卸，从而影响基因诱导。
1.3 RNA互作最近，越来越多的证据表明，lncRNA通过与其他RNA分子形成复合物，产生特异性靶向，调节基因的表达水平。
这种互作方式已经在不同的bichemical和biophysical实验中展示出来。
它可以是lncRNA与microRNA互作，也可以是与mRNA成双重“嵌合”，从而增加mRNA稳定性。
此外，lncRNA与多个RNA-binding protein（RBP）能否以特定的方式发生互作，然后调节其活性和位置，从而实现lncRNA的功能调控。
长链非编码RNA在疾病中的作用
长链非编码RNA在疾病中的作用最近研究表明，长链非编码RNA对于疾病的发生和发展起着非常重要的作用。
长链非编码RNA是指一种长序列的RNA，它们不编码蛋白质，但可以调节基因的表达，从而影响细胞的生理和病理过程。
本文将着重探讨长链非编码RNA在疾病中的作用。
1. 长链非编码RNA在心血管疾病中的作用心血管疾病是全球范围内的主要死因之一。
研究发现，长链非编码RNA在心血管疾病的病理机制中起着重要作用。
例如，某些长链非编码RNA可以对心脏细胞中的成纤维细胞转化成心肌细胞起到控制作用。
同时，长链非编码RNA还可以调节血管内皮细胞的生长和分化，从而影响血管内膜的结构和功能，进而造成心脏病。
2. 长链非编码RNA在肿瘤中的作用长链非编码RNA在肿瘤中也起着非常重要的调节作用。
例如，一些长链非编码RNA可以抑制基因的表达，从而影响肿瘤细胞的增殖和转移。
另外，长链非编码RNA还可以影响肿瘤细胞的凋亡和自噬，从而影响肿瘤的生长和发展。
此外，研究发现，某些长链非编码RNA还可以对肿瘤免疫细胞的识别和清除起到调节作用。
3. 长链非编码RNA在神经系统疾病中的作用神经系统疾病是一类严重的疾病，如阿尔茨海默病、帕金森病等。
研究发现，长链非编码RNA在神经系统疾病中起着很重要的作用，尤其是在神经元的表达和功能调节中。
例如，一些长链非编码RNA可以调节神经元的轴突生长和分支，从而影响神经元的连接和功能。
同时，长链非编码RNA还可以调节神经元的表达和蛋白质合成，进而影响神经元的功能和细胞死亡。
4. 长链非编码RNA在代谢性疾病中的作用代谢性疾病是一类由代谢紊乱引起的疾病，如糖尿病、肥胖症等。
研究发现，长链非编码RNA在代谢性疾病中也扮演着重要的调节作用。
例如，一些长链非编码RNA可以调节胰岛素的分泌和敏感性，影响糖代谢和胰岛素抵抗。
同时，某些长链非编码RNA还可以调节脂质代谢和胰岛素受体的表达，从而影响脂肪的分布和代谢。
总之，长链非编码RNA在疾病中起着非常重要的调节作用，这也为治疗疾病提供了新的思路和方法。
长链非编码RNA的生物学功能及其与疾病的关联
长链非编码RNA的生物学功能及其与疾病的关联前言随着转录组测序技术的不断发展，越来越多的非编码RNA (ncRNA) 被发现。
长链非编码RNA (lncRNA) 是一类长度超过200个碱基的ncRNA，其在多种生物学过程中具有重要作用，尤其是在转录调控和表观遗传学方面。
然而，近年来的研究表明，lncRNA在人类疾病的发生中也发挥着关键作用。
一、长链非编码RNA的功能1. 转录调控lncRNA通过下调或上调靶基因的转录调控来影响基因表达。
一些lncRNA与染色质重塑复合物相互作用，从而调节基因剪切、细胞周期控制、细胞分化和细胞凋亡等。
例如，人类受精卵和早期胚胎中最早被表达的人类胚胎干细胞表达的LINC00861可通过直接结合到重编程基因OCT4上来调节其表达。
2. 基因表达后期调控除了对转录的控制外，lncRNA在基因表达的后期控制中也发挥作用。
例如，Kcnq1ot1在细胞质中被处理成siRNA，这种处理形成一个重要的负反馈回路，能够调节其自身的表达。
3. RNA剪切RNA剪切是影响基因表达和功能的另一种方式。
越来越多的lncRNA被发现介入mRNA剪切过程，其中多数是通过与剪接因子相互作用来调节剪切过程。
例如，Malat1可通过调节剪接因子SR族蛋白的活性来调节上游基因的剪切选择，从而控制表型。
4. 表观遗传学lncRNA在挖掘表观遗传学特征和调节表观遗传学的过程中也起重要作用。
研究表明，lncRNA能够介导DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑，从而调节基因的表达。
例如，Xist被认为是异染色体的关闭因子，其通过重塑染色质来介导上万个基因的沉默。
二、长链非编码RNA与疾病的关联1. 癌症lncRNA在多种癌症中被发现异常表达。
lncRNA可以通过各种机制影响癌症的增殖、转移和药物耐受性。
例如，malat1在多种肿瘤中被发现异常表达，其促进了肿瘤细胞的增殖和侵袭。
2. 神经系统疾病越来越多的研究表明，lncRNA在神经系统疾病的形成中发挥了关键作用，包括神经退行性疾病、神经发育异常和精神障碍。
长链非编码RNA在调控基因表达中的作用和机制研究
长链非编码RNA在调控基因表达中的作用和机制研究随着生物学研究的深入，人们对非编码RNA越来越感兴趣。
非编码RNA指的是那些不被翻译成蛋白质的RNA分子。
其中，长链非编码RNA是一类较为特殊的RNA分子，这些RNA序列通常超过200个核苷酸，且在真核生物中具有广泛的存在。
长链非编码RNA在维持正常的生理过程中发挥着重要的调控作用。
这些RNA 分子可以通过多种机制调控基因表达，包括依赖或不依赖蛋白质的参与。
最近的研究表明，长链非编码RNA在癌症、免疫系统和神经系统等多种疾病中扮演着重要的角色。
因此，研究长链非编码RNA的机制和功能对于深入了解疾病的发生和发展具有重要的意义。
在调控基因表达中，长链非编码RNA主要通过两种方式发挥作用：一是在转录水平上通过转录调控元件（TREs）影响基因表达，二是与核蛋白质间接相互作用。
在第一种机制中，长链非编码RNA与DNA序列特异性结合，形成RNA-DNA三联体或招募某些转录因子来直接调控基因的转录水平。
这些RNA分子可以作为激活子或抑制子来影响细胞内基因的表达。
在第二种机制中，长链非编码RNA在转录后程中与转录后修饰因子或塑形蛋白质等结合。
这种结合能够进一步改变染色质构象，从而影响基因的表达。
还有一些研究表明，长链非编码RNA在转录后修饰作用上也有其独特性。
例如，长链非编码RNA可以诱导DNA甲基化或去甲基化，进而影响染色体的可读性。
此外，长链非编码RNA还可以参与RNA加工、核移位和蛋白质的运输等过程。
研究长链非编码RNA的具体机制和功能是非常复杂的。
一方面，需要广泛的实验验证，包括杂交、RNA免疫沉淀和CRISPR/Cas9基因编辑等技术。
这些实验可以有效地验证长链非编码RNA的作用机制以及它与其它基因调控因子之间的相互作用。
另一方面，还需要探索新的计算方法来解析高通量数据，并开发新的微生物体系来验证这些研究结果。
这些举措将有助于更好地理解长链非编码RNA在细胞中的作用。
长链非编码RNA及其在人类疾病中的作用机制研究
长链非编码RNA及其在人类疾病中的作用机制研究在细胞内，RNA分为编码RNA和非编码RNA两种类型。
编码RNA（mRNA）是遗传信息的传递者，将DNA基因信息翻译成蛋白质。
而非编码RNA则不直接编码蛋白质，主要扮演调节基因表达的角色。
长链非编码RNA（lncRNA）是一种特殊的非编码RNA，其序列长于200个核苷酸，已被证明在人类疾病中发挥着重要的作用。
lncRNA的功能多样，如参与基因转录调控、组蛋白修饰、RNA剪接等，与实现进化及生殖过程密切相关。
然而，当lncRNA的表达和功能出现问题时，就有可能导致人类疾病的发生。
现已有多项研究发现，lncRNA与包括心血管疾病、肿瘤等在内的许多疾病密切相关。
近几年，随着技术的发展和研究的深入，越来越多的lncRNA被发现，并且越来越多的作用机制被揭示。
比如，在胃癌中，lncRNA H19被证实促进肿瘤细胞增殖并抑制肿瘤细胞凋亡。
而在脂肪细胞分化中，lncRNA lnc-ob1的表达则可以影响脂肪细胞的分化和成熟程度。
此外，lncRNA在心血管疾病中的作用也引起了广泛关注。
在心肌梗死后，lncRNA-ATB（长链非编码RNA转录的抗原ATB）的表达明显上升，这种上升与心力衰竭、再次心肌梗死和死亡风险的增加有关。
此外，在心肌损伤恢复过程中也有lncRNA调控信号通路的存在。
lncRNA MIAT（人类心肌不稳定性相关因子）表达水平的升高会导致心肌细胞凋亡增加和血管内皮细胞增殖下降，从而进一步引发心血管疾病。
此外，近年来还有一些lncRNA和自身免疫性疾病的发生发展有密切的关系。
例如，在系统性红斑狼疮（SLE）患者中表达上调的lncRNA Gm16319会引起B细胞自身抗体的产生，促进自身免疫反应。
由于lncRNA具有多样的作用机制和参与多个生理和疾病过程，因此其研究对于深入认识人类疾病的发生和发展机制，以及探索特定靶点的治疗手段具有重要的意义。
虽然对于lncRNA的研究尚处于起步阶段，但随着技术的不断提高和研究的深入，相信会逐渐揭示更多的lncRNA以及其在人类疾病中的作用机制，为疾病的治疗提供更多的思路和手段。
长链非编码RNA的分子机制和功能调节
长链非编码RNA的分子机制和功能调节近年来，研究人员对长链非编码RNA（lncRNA）的兴趣越来越浓厚。
lncRNA是基因表达的重要调节因子，它在转录水平上调节基因表达，并参与了生物过程的调控。
lncRNA的分子机制和功能调节一直是生命科学领域的研究热点。
1. 长链非编码RNA的分子机制lncRNA属于长链RNA，其长度大于200个核苷酸，且不具有编码蛋白质的能力。
lncRNA的转录和调控机制与mRNA类似，都能被转录因子和RNA聚合酶II所识别和转录。
lncRNA主要存在于细胞核中，并与染色质结合，调控基因表达。
目前，研究表明，lncRNA的分子机制主要包括以下几个方面。
（1）lncRNA可以作为调控基因表达的“桥梁”。
lncRNA与转录因子或RNA聚合酶II结合，进而影响基因转录，从而调控基因表达。
（2）lncRNA可以与染色质发生相互作用。
染色质由DNA和一系列蛋白质复合物组成，lncRNA与这些复合物相互作用，可以改变染色质结构和染色质状态，从而影响基因表达。
（3）lncRNA可以在转录后水平上调节基因表达。
lncRNA可以结合到mRNA或蛋白质上，从而改变它们的稳定性、翻译或功能状态，达到调节基因表达的目的。
2. 长链非编码RNA的功能调节lncRNA与基因表达紧密相关，它能够通过多种方式调节基因表达，参与了生物过程的调控。
下面将从转录、转录后、不同结构域等方面，介绍lncRNA的功能调节。
（1）转录调节lncRNA在转录调节方面具有非常重要的作用。
lncRNA可以与转录因子结合，促进或抑制基因转录，在细胞分化、发育等过程中发挥重要作用。
例如-DeltaNp63是一种lncRNA，它可以与转录因子p63结合，共同调节上皮细胞分化的过程。
（2）转录后调节lncRNA在转录后调节方面表现出了独特的功能。
它们可以通过结合到靶蛋白上，直接调节靶蛋白的活性或者稳定性。
例如，MALAT1是一种lncRNA，它通过与转录因子SR结合，促进SR进入核糖体，从而促进转录后的剪接调节。
细胞生物学研究长链非编码RNA的功能与途径
细胞生物学研究长链非编码RNA的功能与途径近年来，长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）的研究受到广泛关注。
相对于编码蛋白质的mRNA，lncRNA不具备翻译成蛋白质的能力，而在细胞中扮演着调节基因表达和参与细胞生理生化过程的重要角色。
lncRNA在不同细胞和组织中具有差异性表达，其细胞定位也不尽相同，这表明lncRNA在不同的细胞类型和细胞状态下可能具有不同的功能。
在细胞内，lncRNA可以通过多种途径发挥其生物学功能，包括染色质修饰、RNA剪切、转录后调控等方面。
一、染色质修饰一部分lncRNA通过与染色质修饰相关酶结合调控基因表达。
例如，lncRNA Xist可以通过与多种修饰染色质特征的酶相互作用，实现对雌性胚胎中X染色体的沉默。
另外，lncRNA也可以通过参与修饰转录因子和核小体组装的过程，调控基因表达。
例如lncRNA HOTAIR通过与多种转录因子结合参与组织胚层来源转录因子（PRC2）介导的组蛋白甲基转移酶动态修饰基因，从而影响转录后调控和异染色质沉默。
二、RNA剪切RNA剪切是调控基因表达的重要方式之一，lncRNA的剪切也可以通过转录后特定的RNA剪接机制，实现对基因表达的调节。
例如lncRNA MALAT1的某些剪接产物可以参与细胞核和质的搬运；而在肿瘤形成过程中，MALAT1通过特定的剪接事件获得另一种产物，具有促进肿瘤生长和转移的功能。
三、转录后调控lncRNA在转录后调控中的作用也备受关注。
lncRNA和mRNA一样也可以与RNA结合蛋白形成复合物，参与转录后调控。
例如，lncRNA H19可以与多种RNA结合蛋白，影响母源破裂、移植和基因表达程度等多方面生物水平，参与调控活动细胞的生理代谢。
在这个过程中，lncRNA与DNA、RNA和蛋白质之间的相互作用，共同参与基因表达和调节阶段。
同时，在转录后调控中，lncRNA的表达水平和在细胞核和质中的定位是影响其生物学功能的关键因素。
长链非编码 RNA 的功能及调节机制研究
长链非编码 RNA 的功能及调节机制研究随着RNA研究的深入，非编码RNA（non-coding RNA）逐渐被人们重视。
其中，长链非编码RNA（long non-coding RNA，简称lncRNA）因其在基因表达、转录、翻译等方面起到了重要作用，备受关注。
本文将介绍lncRNA的功能及其调节机制的研究进展。
一、lncRNA的概念及分类在细胞中，RNA分为两大类：编码RNA和非编码RNA。
编码RNA是由DNA 转录而来，可被翻译成蛋白质。
而非编码RNA则不参与蛋白质的合成，包括转移RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）和微小RNA（miRNA）等。
lncRNA也属于非编码RNA的一种。
lncRNA是指长度大于200个碱基、不具有翻译能力的RNA分子，其长度可达数百到数万个碱基。
lncRNA可分为两类：一类是调节基因表达的，另一类是调节基因结构的。
二、lncRNA的功能1.调节基因表达lncRNA参与细胞的调控网络，特别是基因表达的调节。
它可以通过影响转录启动复合物（transcriptional complex）的形成、酵素的活性或基因组DNA的组织方式等多种方式，影响RNA的转录过程。
此外，lncRNA还可通过调控RNA的剪接、外显子组合或RNA的稳定性等方式，影响RNA的后续行为，从而对基因表达产生影响。
2.调节细胞周期和细胞凋亡lncRNA可通过多种方式，调控细胞周期和细胞凋亡。
例如，lncRNA MEG3，在细胞周期的G1期中表达较高，而在S期和G2期表达下降，其过度表达可阻止细胞周期，从而抑制了肿瘤细胞增殖。
又如，lncRNA PANDA，在细胞受到外部刺激，如化疗药物刺激时，可抑制细胞凋亡，从而让肿瘤细胞摆脱治疗的影响，继续增殖。
3.参与蛋白质的翻译和修饰近年来的研究表明，lncRNA也可能作为调节因子影响蛋白质翻译和修饰。
例如，研究者发现，lncRNA DD3能够作为一个小核RNA（small nuclear RNA，简称snRNA）结合到转录后的mRNA上，使mRNA得到稳定，并借助miRNA调控蛋白质的表达。
长链非编码RNA的生物学功能研究
长链非编码RNA的生物学功能研究非编码RNA作为一种特殊的RNA分子，长期以来一直被认为是一种“废物RNA”，没有明确的功能。
然而，随着技术的进步，越来越多的关于长链非编码RNA的生物学功能被揭示出来。
在本文中，我们将探讨关于长链非编码RNA的生物学功能研究的最新进展。
1. 什么是长链非编码RNA？在介绍长链非编码RNA的生物学功能之前，让我们先来了解一下长链非编码RNA是什么。
长链非编码RNA与DNA和蛋白质一样是细胞质中的一种分子，它的长度通常在200个核苷酸以上，并且不具有编码蛋白的功能。
长链非编码RNA通常被分类为不同的亚型，包括长非编码RNA（lncRNA）、调控RNA、长剪切RNA（lncRNA-S）、顺反RNA、天然RNA干扰素（iRNA）等。
2. 长链非编码RNA的生物学功能长链非编码RNA已经在许多生物过程中发挥着重要的功能，这些生物过程包括细胞周期、基因调控、细胞增殖和凋亡、信号转导、免疫调节、病毒感染等等。
以下是几个关于长链非编码RNA生物学功能的例子：2.1 基因表达调控长链非编码RNA通过多种机制调节基因表达。
例如，一些长链非编码RNA可以通过与RNA聚合酶和转录因子相互作用来控制基因的转录。
此外，一些长链非编码RNA还可以与mRNA相互作用，调节其翻译或降解。
2.2 细胞周期调控长链非编码RNA对细胞周期的控制过程中也发挥着关键的作用。
例如，一些lncRNA可以调控细胞周期的不同阶段或其转变。
这些长链非编码RNA通过对细胞周期相关的基因的表达进行调节，使细胞保持在特定的细胞周期状态。
2.3 细胞增殖和凋亡长链非编码RNA对细胞增殖和凋亡也发挥着调节作用。
一些研究表明，某些长链非编码RNA在肿瘤细胞中过度表达，从而促进了肿瘤细胞的生长和增殖。
另外一些长链非编码RNA则在细胞凋亡过程中发挥着保护作用。
2.4 免疫调节长链非编码RNA也在免疫调节中发挥着关键的作用。
例如，在免疫细胞中，一些长链非编码RNA通过调节免疫相关基因的表达来影响免疫细胞的分化和功能。
长链非编码RNA在人类疾病发生机制中的作用与调控
长链非编码RNA在人类疾病发生机制中的作用与调控长链非编码RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类长度超过200个核苷酸的RNA分子，它们在人类疾病的发生机制中扮演着重要的角色。
本文将从功能、调控、与人类疾病的关系等方面，对长链非编码RNA在人类疾病发生机制中的作用与调控进行详细阐述。
第一章：长链非编码RNA的功能在过去的几十年里，科学界一直将RNA视为传递DNA信息的中介分子。
然而，随着基因组测序技术的进步，发现了大量的不编码蛋白质的RNA。
这些非编码RNA被发现在细胞核和细胞质中广泛存在，并参与了众多细胞生物学过程，如基因表达的调控、染色质重塑和细胞分化等。
长链非编码RNA是其中最重要的一类，它们介导了许多重要的分子相互作用，进而调控基因表达水平。
第二章：长链非编码RNA的调控机制长链非编码RNA通过多种机制调控基因表达。
首先，它们可以通过与染色质相互作用，影响染色质的结构和功能。
例如，某些长链非编码RNA可以与染色质修饰酶相互作用，改变染色质的乙酰化、甲基化等修饰模式，从而影响基因的转录。
其次，长链非编码RNA还可以作为“海绵”吸附其他调控蛋白，影响它们在细胞内的浓度和活性。
最后，长链非编码RNA还可通过和其他RNA分子相互作用，调控它们的表达水平或功能。
第三章：长链非编码RNA与人类疾病的关系越来越多的研究表明，长链非编码RNA与人类疾病之间存在密切联系。
它们在多个疾病的发生和发展中发挥关键作用，如癌症、心血管疾病、神经系统疾病等。
以癌症为例，长链非编码RNA可以调控癌基因和抑癌基因的表达，从而影响细胞的增殖、凋亡和转移等生物学过程。
此外，近年来的研究还发现，某些长链非编码RNA在肿瘤的诊断和预后评估中具有潜在的临床应用价值。
第四章：长链非编码RNA的研究进展随着高通量测序技术的发展，人们对长链非编码RNA的研究进展迅速增加。
通过RNA甲基化、修饰酶的高通量筛选以及基因敲除等方法，揭示了长链非编码RNA的调控机制和功能。
长链非编码RNA的生物功能与应用研究
长链非编码RNA的生物功能与应用研究长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一种长度大于200 nt的RNA分子，不参与蛋白质编码，但在调控基因表达、细胞命运决定、疾病进展等方面扮演重要角色。
近年来，对lncRNA的研究日益深入，其生物功能和应用前景备受关注。
一、lncRNA的生物功能lncRNA具有复杂的结构和多种生物学功能。
其中一些lncRNA优先存在于细胞核内，参与染色质结构和功能的调控，例如XIST、HOTAIR；另一些lncRNA主要分布于细胞质内，参与基因转录和翻译的调控，例如MALAT1、NEAT1。
lncRNA还可以通过维持基因去活化、促进转录后修饰和剪接等机制调节基因表达。
例如，lncRNA-SNHG14、lncRNA-NR2F1-AS1等参与着细胞增殖、分化和凋亡的调控。
二、lncRNA在疾病中的作用随着对lncRNA功能的深入研究，越来越多的证据表明，lncRNA在疾病中发挥着关键作用。
例如，多种癌症中表达上调的MALAT1、HOTAIR等lncRNA已被证实参与癌细胞的增殖、转移和侵袭，是癌症发生和进展的关键因素。
另外，一些lncRNA与心血管疾病、神经退行性疾病、免疫相关疾病等的发生和发展也有密切的关系。
三、lncRNA的应用前景除了在基础生物学研究中发挥重要作用外，lncRNA还具有广泛的应用前景，包括癌症治疗、疾病诊断、药物靶点筛选等。
例如，利用lncRNA扮演的调控角色，可以设计和开发针对癌症和疾病特异性lncRNA靶向治疗药物，避免传统化疗方法的副作用。
此外，lncRNA还可以作为疾病诊断的生物标志物，根据lncRNA表达模式和水平的变化实现快速、准确的疾病诊断。
此外，lncRNA 在药物靶点筛选和药物毒性评估方面也有潜在应用。
四、研究进展及展望近年来，随着高通量测序和生物信息学技术的发展，lncRNA 研究水平也不断提高。
越来越多的lncRNA被鉴定出来，并揭示了新的生物学功能和作用机制，为治疗和预防疾病提供了新思路。
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2.1
lncRNA 在基因印记中的作用 哺乳动物为二倍体生物 , 每个基因都是双拷贝 ,
一些基因的表达取决于来自父本还是母本 , 这种现 象称为基因印记 [35], 该现象涉及基因表达调控的遗 传。 H19[36]、 X 染色体特异性失活转录物(X inactivationspecific transcription, Xist)[37]等多种 lncRNA 参与了 基因印记。 H19 基因和邻近的胰岛素样生长因子 2(Insulinlike growth factor 2, IGF2)基因均位于 11p15.5, 两个 基因间相距仅 90 kb[36, 38]。 H19 在脊椎动物胚胎发育 期是高表达的 , 但出生后大多数组织中的 H19 表达 迅速下调 [38]。IGF2 是一种重要的生长因子 , 在脊椎
HEREDITAS (Beijing) 2013 年 3 月 , 35(3): 269― 280 ISSN 0253-9772
综 述
DOI: 10.3724/SP.J.1005.2013.00269
长链非编码 RNA 的作用机制及其研究方法
夏天 , 肖丙秀, 郭俊明
11] [8] [9] [7] [1]
(Decoy molecule)、引导分子 (Guide molecule)和骨架 分子 (Scaffold molecule)等 4 类分子 [14]。 为了便于研究和学术交流, 相关研究人员已经建 立了多个 lncRNA 数据库(表 1)。 这些数据库[15~20]所收 录的 lncRNA 数据来自 GenBank 和已发表的论文。 最近 , 研究者开始从全基因组角度关注 lncRNA[21]。 Khalil 等 [22] 的研究表明 , 哺乳动物基因组编码上千 种长链基因间非编码 RNA(Large intergenic non-coding RNA, lincRNA)。 这些 lincRNA 属于 lncRNA 成员中 的一大类 , 参与细胞周期调控、免疫监视、胚胎干细 胞多能性分化等多种生物学过程 [22] 。 Chu 等[23] 通过 RNA 纯化的染色质分离 (Chromatin isolation by RNA purification, ChIRP)技术获得了许多 lncRNA 在全基 因组范围内的高分辨率定位图谱 , 并发现 lncRNA 大量聚集于特定的 DNA 结合基序上。 Cabili 等 [24] 综合了已经注释其功能的 lincRNA 数据和他们实验 室收集的转录组测序 (即 RNA 测序 (RNA sequencing, RNA-seq))数据 , 发现 4 662 种 lincRNA 中的大多数 具有高度的组织特异性 , 说明它们在疾病诊断上具 有较好的应用前景。
宁波大学医学院生物化学与分子生物学研究所 , 浙江省病理生理学技术研究重点实验室 , 宁波 315211
摘要: 长链非编码 RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能 , 这些机制包括基因
印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、 mRNA 降解和翻译调控等。 lncRNA 通过这些作用机制在不同 水平进行基因表达调控。在研究 lncRNA 功能的过程中 , 研究方法的建立和应用起着非常重要的作用。目前用 于 lncRNA 研究的主要方法有：微阵列、转录组测序、Northern 印迹、实时荧光定量逆转录 -聚合酶链反应、荧 光原位杂交、RNA 干扰和 RNA 结合蛋白免疫沉淀等。文章着重介绍了 3 种前沿方法 , 即：在线快速预测 RNA 与蛋白质相互作用的 catRAPID、 RNA 纯化的染色质分离 (Chromatin isolation by RNA purification, ChIRP)以及 非编码 RNA 沉默与定位分析技术 (Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs, c-KLAN)。
等。本文将概述 lncRNA 发挥生物学功能的
作用机制 , 并介绍开展 lncRNA 研究的前沿方法。
1
lncRNA 的分类和相关数据库
lncRNA 具有类型多、作用模式多和数量多的
“三多”特点 [12]。根据 lncRNA 与蛋白质编码基因 的位置关系 , 可将它们分为重叠型、顺式反义型、 双向型和内含子型等 [13]; 而根据 lncRNA 的功能 , 则可将其分为信号分子 (Signal molecule)、诱饵分子
Keywords: long non-coding RNAs (lncRNAs); acting mechanisms; gene expression regulation; research methods
收稿日期 : 20120808; 修回日期 : 20120920 基 金 项 目 : 国 家 自 然 科 学 基 金 项 目 ( 编 号 ： 81171660), 宁 波 市 自 然 科 学 基 金 项 目 ( 编 号 ： 2012A610207), 宁 波 市 科 技 创 新 团 队 项 目 ( 编 号 ： 2011B82014), 宁波市重点学科项目 (编号： XKL11D2127)和宁波大学优秀学位论文培育基金项目 ( 编号： PY2012004)资助 作者简介 : 夏天 , 硕士研究生 , 专业方向：肿瘤分子生物学。 Tel: 0574-87600758; E-mail: summer_wo@ 通讯作者 : 郭俊明 , 教授 , 博士 , 研究方向：肿瘤分子生物学。 E-mail: junmingguo@ 网络出版时间 : 2012-12-21 13:33:08 URL: /kcms/detail/11.1913.R.20121221.1333.001.html
参考 文献 [25] [26] [27] [11] [28] [29] [30] [31] [32] [32] [33] [8] [34]
数据库名称 Noncoding RNA database fRNAdb NRED lncRNAdb ncFANs NONCODE
270
HEREDITAS (Beijing)
2013
第 35 卷
长链非编码 RNA(Long non-coding RNA, lncRNA) 是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA 。研究表 明 , lncRNA 在剂量补偿效应 (Dosage compensation effect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调 控等众多生命活动中发挥重要作用 [2~6]。 lncRNA 相关论文发表量近年来成倍增加 (图 1); 我国国家自然科学基金资助的 lncRNA 相关课题从 2010 年的 3 项 , 到 2011 年的 25 项 , 再到 2012 年的 70 多项 ( 科学基金网络信息系统 http://159.226.244. 22/portal/proj_search.asp), 这 些 数 据 表 明 国 内 外 研 究者对该领域的关注度日益增高。正因如此 , 我们 对 lncRNA 的了解也越来越深入——它们具有丰富 多样的生物学功能：参与 X 染色体的失活 , 调控 mRNA 的降解 , 构成细胞核亚结构的结构骨架 , 作 为 染 色 质 重 塑 (Chromatin remodeling) 的 调 控 因 子 [10,
Abstract: Long non-coding RNAs (lncRNAs) play biological roles through a variety of mechanisms, including genetic imprinting, chromatin remodeling, cell cycle control, splicing regulation, mRNA decay, and translational regulation. LncRNAs are involved in the regulation of gene expression through the above mechanisms in different levels. Establishment and application of research technologies are important in understanding of lncRNAs functions. Microarray, RNA sequencing, Northern blot, real time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, fluorescence in situ hybridization, RNA interference, and RNA-binding protein immunoprecipitation are major tools of exploring biological functions of lncRNAs. Here, we highlighted three advanced methods, i.e., fast predictions of RNA and protein interactions and domains (catRAPID), chromatin isolation by RNA purification (ChIRP), and combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs (c-KLAN).
第3期
夏天等 : 长链非编码 RNA 的作用机制及其研究方法
271
期调控、 剪接调控、 mRNA 降解和翻译调控等[8, 11, 25~34] (表 2)。
表1 lncRNA 相关数据库
网址 http://biobases.ibch.poznan.pl/ncRNA/ /frnadb/ .au/nred/ cgi-bin/ncrnadb.pl / /ncFANs/ /NONCODERv3/ 参考 文献 [15] [16] [17] [18] [19]制