一种鉴别栽培柿品种SNP标记的新方法

一种鉴别栽培柿品种SNP标记的新方法
梁晋军;朱溯远;张宇琴;张鹏飞;温鹏飞;杨运良
【期刊名称】《生物技术通报》
【年(卷),期】2024(40)1
【摘要】【目的】为了鉴别栽培柿品种间的遗传差异,开发一种基于核糖体DNA 内转录间隔区(nrDNA internally transcribed spacer)序列简单、高效的SNP分子标记新方法,为种质的收集、利用及推广应用提供参考。

【方法】以18种六倍体栽培柿品种叶片为试材,对其ITS区进行扩增测序,并分析序列差异,最后用Sau96 I 限制性内切酶对151处杂合位点进行酶切验证。

【结果】18份柿品种ITS长度均为730 bp,共存在6个杂合位点,分别在151、168、205、278、279和622 bp 处。

六倍体柿杂合位点处碱基峰图面积比例存在一定的规律,即C∶T=2∶1、
C∶T=1∶1、C∶T=1∶2和A∶G=1∶1,利用出现的杂合位点及其峰图面积比例规律差异将18份栽培柿品种分成11类。

【结论】151处位点的酶切结果验证了酶切产物浓度与峰图面积比例一致。

这种基于nrDNAITS序列SNP分子标记的新方法能将18份栽培柿品种分成11类。

【总页数】8页(P160-167)
【作者】梁晋军;朱溯远;张宇琴;张鹏飞;温鹏飞;杨运良
【作者单位】山西农业大学园艺学院;山西农业大学棉花研究所
【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
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