郏县红牛Y染色体基因组遗传多样性与父系起源研究

郏县红牛Y染色体基因组遗传多样性与父系起源研究
常振华;王世康;亐开兴;夏小婷;黄永震;雷初朝
【期刊名称】《中国畜牧杂志》
【年(卷),期】2022(58)10
【摘要】本研究旨在从基因组水平研究郏县红牛Y染色体遗传多样性与父系血统来源,为郏县红牛品种遗传资源的保护与利用提供科学依据。

利用全基因组重测序数据,对16头郏县红牛Y染色体基因组X-退化区单拷贝基因区进行扫描和分析,共覆盖到Y染色体上7个单拷贝基因。

使用发表的5头黄牛Y染色体基因组单倍型作对照,构建郏县红牛Y染色体单倍型最大似然法(ML)系统进化树及网络图,结果表明:16头郏县红牛在Y染色体X-退化区单拷贝基因区域中共发现有178个位点具有多态性,涵盖7个Y染色体单拷贝基因;并定义了5种郏县红牛Y染色体单倍型,分别将其命名为JXR1~5,其中JXR4为优势单倍型,占50.0%;郏县红牛Y染色体单倍型多样度为0.717±0.095,核苷酸多样度为0.0618±0.0198;系统发育树和单倍型网络图表明,郏县红牛有Y2a、Y2b和Y3a 3种亚单倍型组,其中Y2b为主要亚单倍型组。

本研究从Y染色体基因组水平证实郏县红牛有Y2和Y32个父系起源。

【总页数】4页(P175-178)
【作者】常振华;王世康;亐开兴;夏小婷;黄永震;雷初朝
【作者单位】渭南职业技术学院;西北农林科技大学动物科技学院;楚雄师范学院【正文语种】中文
【中图分类】S823.2
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