基因组dna的提取与电泳鉴定
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基因组DNA的提取与电泳鉴定
一. 【实验目的】
掌握基因组DNA的提取原理和方法
二. 【实验仪器与试剂】
实验仪器:琼脂糖凝胶电泳系统、紫外反射透射分析仪、离心机、恒温水浴锅
实验试剂:氯仿、巯基乙醇、植物基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)
三. 【实验原理】
实验中有两种提取DNA的方法,即试剂盒提取法和普通手提法,本次试验采用试剂盒提取法。
试剂盒方法:试剂盒中有特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,离心吸附柱是一种硅基质材料,可以高效、专一吸附DNA,最大限度去除植物细胞中杂质蛋白及其他有机化合物。
普通手提方法:用机械的方法使组织和细胞破碎,加入SDS等离子型活性剂,溶解细胞膜和核膜蛋白。
加入酚氯仿等表面活性剂使蛋白变性。
离心,除去组织和变性蛋白,上清液中加入冰冻的无水乙醇使DNA沉淀,离心,弃上清,用70%乙醇漂洗DNA,倒掉上清,风干,溶于灭菌的双蒸水中。
四. 【实验内容与步骤】
1.取出处理过的新鲜藻体0.1g,用液氮研磨至粉状。
2.将研磨好的粉末迅速转移到预先装有700μl 65℃预热缓冲液GP1的离心管中(实验前在预热的GP1中加入β-巯基乙醇,使其终浓度为0.1%),迅速颠倒混匀后,将离心管放在65℃水浴中加热20分钟,水浴过程中颠倒离心管以混合样品数次。
3、加入700μl氯仿,充分混匀,12000rpm 离心5min。
4、小心将上一步所得上层水相转入一个新的离心管中,加入700μl缓冲液GP2,充分混匀。
5、将混匀的液体转入吸附柱CB3中,12000rpm离心30s,弃掉废液(吸附柱容积为700l左右,可以分次加入离心)。
6、向吸附柱CB3中加入500μl去蛋白液GD(使用前确认是否加入无水乙醇),12000rpm 离心30s,弃掉废液。
7、向吸附柱CB3中加入700μl漂洗液PW(使用前确认是否加入无水乙醇),12000rpm 离心30s,弃掉废液。
8、向吸附柱CB3中加入500μl漂洗液PW,12000rpm 离心30s,弃掉废液。
9、将吸附柱CB3放入废液回收管中,12000rpm 离心2min,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。
10、将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
11、将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50μl洗脱缓冲液TE,室温放置2min,12,000rpm 离心2min;离心得到的溶液再加入吸附柱C3中,室温放置2min,12,000rpm 离心2min;取出1/10体积提取物进行电泳检测,其余 -20℃保存备用。
五. 【实验结果与讨论】
现象描述及分析
1.根据电泳结果可以看出DNA条带亮度较高,说明提取出的DNA含量较高。
且拖尾现象较轻,
说明可能有部分DNA降解,但是降解程度较小,DNA的完整性保存较好。
2.由电泳结果看出条带位于marker2000bp条带上方,说明提取出的DNA质量大于2000bp,但
具体大小不能确定。
附图
C2
六.【思考题】
1.简述DNA提取过程中需要注意哪些问题。
①使用液氮进行研磨时要戴手套,防止冻伤,并保持室内通风。
②研磨时要保证材料始终处于液氮环境中,不可使液氮完全挥发。
研磨要充分,尽量不要外溅,因为收集细胞的多少是实验成功与否的关键。
③每人所取材料量不能太多,氯仿的加入量不能太少,且要充分摇匀,否则蛋白质变性不完全。
2.查阅资料简单介绍通过紫外分光光度计给核酸定量的原理。
分光光度计计采用一个可以产生多个波长的光源,通过系列分光装置,从而产生特定波长的光源,光源透过测试的样品后,部分光源被吸收,计算样品的吸光值,从而转化成样品的浓度。
样品的吸光值与样品的浓度成正比。