引物探针浓度测定SOP
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引物探针浓度测定SOP
引物探针稀释标准操作规程
稀释
1. 取出待稀释的引物探针,12000转/分钟离心5分钟;
2. 使用TE缓冲液稀释至适当浓度,上下颠倒后涡旋震荡1~2分钟;
3. 取2μL引物探针原液,使用TE缓冲液稀释N倍作为待测溶液,涡旋震荡混匀。
NanoDrop One清洁
开始使用NanoDrop One仪器进行检测之前需清洁上下基座:
1. 抬起仪器检测臂,将3-5μL ddH2O移取至下基座;
2. 降下检测臂并等待2-3分钟;
3. 抬起检测臂,用新的滤纸擦拭上下基座。
检测
1. 在“主页”屏幕上,选择核酸选项卡并点击单链DNA;
2. 点击单链DNA设置,确认“基线矫正”处于关闭状态;
3. 将1-2μL TE缓冲液移取到下基座,然后降下检测臂;
4. 点击空白检测并等待检测完成;
※如果自动空白检测设为“开启”,空白检测将会在您降下检测臂时自动开始。
5. 抬起检测臂,用新的滤纸擦拭上下基座;
6. 将1-2μL待测溶液移取到下基座,然后降下检测臂。
7. 点击检测并等待检测完成。
※如果自动检测设为“开启”,检测将会在您降下检测臂时自动开始。
8. 完成检测后,点击结束实验。
9. 抬起检测臂,用新的滤纸擦拭上下基座。
浓度计算
1. 每条引物探针重复检测4次,去除离群值后计算A260平均值,
回算原液浓度(μmol/L):Co.实测=?X A260÷ε?1000?N。
※ε:Life合成单上Millimolar ExtinctionCoeff.(OD/μmol),N 为稀释倍数。
2. 按照如下公式计算添加TE缓冲液的量:V添加=(Co.实测/100-1)?V。
12. 取2 μL定量过的引物探针,将其稀释N倍,复测回算浓度应在90~110 μmol/L之间。
注意事项
1. NanoDrop One操作说明书中中提到:对于微体积检测,260nm处(核酸)或280nm处(蛋白质)的最大吸光度应小于6
2.5A。
2. TE缓冲液配方:5mL 1M Tris-HCl,pH 8.0;1mL 0.5M EDTA,pH 8.0;ddH2O定容至500mL。
3. 建议引物探针干粉长期保存请置于-20℃。
4. 建议引物探针溶液分装后-20℃保存。
5. 探针测试的A260保持在0.2~0.8之间精密度最好。