《动物数量遗传学》PPT课件

外祖母DD
0.25 0 0.125 0.125 0.25
全同胞FS
0.25 0.25 0.25 0.5
父系半同胞HS
0.125 0.125 0.25
全同胞子女FO
0.25 0.5
半同胞子女HO
0.5
第二节 多性状选择的基本方法
• 1、顺序选择法（tandem selection）/单项选 择法（single trait selection）：对计划选择 的多个性状逐一选择和改进，每个性状选择一 个或数个世代，待这个性状得到满意的选择效 果后，就停止对这个性状的选择，再选择第二 个性状，然后再选择第三个性状等等，顺序递 选。
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• ③双亲单次表型值的均值 来估计个体育种值
• ④双亲各自度量kS、kD次的均值 、 来估计 个体育种值
同胞信息估计个体育种值
• ①一个同胞单次表型值PFS或PHS来估计个体育 种值
• ②一个同胞k次度量表型值的均值 或 来估计 个体育种值
• ③n个同胞单次度量均值 或 来估计个体育 种值
• ④n个同胞各有k次记录均值、来估计个体育种 值
1 (n 1)rO
n个同类个体k次度量均值
—
—
0.5kSh2 1(kS1)re
PS10(.k5kDD h12)re
PD
2)
0.5h kS kD
2)
1(kS1)re 1(kD1)re
nrAz2h2 1 (n 1)rAS z2h2
rAzh
n 1(n1)rAS
z2h2
0.5nz2h2
1(n1)rAO z2h2
• 估计传递力 （estimated transmitting ability，ETA）：估计育种值的一 半。
• 相对育种值 （relative breeding value， RBV）：个体育种值相对与所在群体均值的百 分数 。
• 综合育种值 （total breeding value） ：考虑 不同性状在育种上和经济上的重要性差异，一 般将这些差异用性状的经济加权值表示。
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思考题
1.什么是育种值，估计育种值的基本原理 是什么？ 2.根据不同亲属资料估计育种值时的回归 系数bAP的计算公式是什么？ 3.解释顺序选择，独立淘汰和选择指数这 三种选择方法的关系？ 4.深入理解以下选择指数的概念： ①约束选择指数；②最宜选择指数；③通 用选择指数；④保种选择指数。
• 2、独立淘汰法（independent culling）/独 立水平法：将所要选择的家畜生产性状各确定 一个选择界限，凡是要留种的家畜个体，必须 同时超过各性状的选择标准。
• 3、综合指数法（index selection）：利用对 个体综合育种值的估计值进行选择。
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制定选择计划的步骤
同 bAP 胞 rAP
后 bAP 裔 rAP
h2 h 0.5h2
0.5h rAh2 rAh 0.5h2 0.5h
各单项资料不同信息估计个体育种值的bAP和rAP
一个个体k次 度量均值
kh2 1 (k 1)re
kh 1 (k 1)re
0.5kh2 1 (k 1)re
0.5h
k
1(k 1)re
• ②指数选择法优于其他方法的相对效率随性状增 加而提高，但是随各性状的经济加权值差异增加 而下降，在经济加权值相同时，其优越性最大。
• ③独立淘汰法优于顺序选择法的相对效率随性状 数和选择强度增加而提高，但是随经济加权值差 异增加而下降；
• ④当各性状的经济加权值相同时，指数选择法优 于其他方法的相对效率还受其表型相关的影响较 大，当rP很低或为负值时，其相对效率较高。
n 0.5zh
1(n1)rAOz2h2
多项资料合并估计个体育种值遵循的步骤
• 1) 计算出各项资料的方差及相互间的协方差； • 2) 计算出各项资料间的相关系数； • 3) 计算出以这些相关系数表示的各项资料对被
估计育种值的标准化偏回归系数； • 4) 将这些标准化偏回归系数转化为偏回归系数，
即得到各项资料的加权系数； • 5) 计算合并指数与各项资料间的复相关系数，
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• 制定选择指数时应注意的事项：
（1）突出育种目标性状。 （2）用于遗传评定的信息性状应该是容易度量的
性状。 （3）信息性状尽可能是家畜早期性状。 （4）目标性状中尽量避免有高的负遗传相关性状。
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小结
• ①在任何情况下，指数选择法的效率不低于独立 淘汰法，独立淘汰法的效率不低于顺序选择法；
(6) 双亲各自度量kS，kD次的均值 ， (7) 一个同胞单次表型值PFS或PHS (8) 一个同胞k次度量表型值的均值 或
(9) n个同胞单次度量均值 或
(10) n个同胞各有k次记录均值PFS ，PHS (11) 混合家系 (12) 一个子女单次度量表型值PO (13) 一个子女k次度量表型均值
krA h 2 1 (k 1)re
k rAh 1 (k 1)re
0.5kh2 1 (k 1)re
k 0.5h
1(k 1)re
N个同类个体 单次度量均值
—
—
h2 1)
2 h 1) 2
nrAh 2 1 (n 1)rS
n rAh 1 (n 1)rS
0.5nh 2 1 (n 1)rO
0.5h
n
①性状各种表型参数和遗传参数的估计； ②性状经济加权值的确定； ③选择强度估计； ④选择指数制订和选择效果估计； ⑤计算个体指数值，确定选择决策。
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第三节 综合选择指数的应用前提和局 限以及相对效率比较
• 应用选择指数法需要满足的条件 ：
1、 用于计算指数值的所有观测值不存在系统 环境效应，或者在使用前剔除了系统环境效应 进行校正； 2、 候选个体间不存在固定遗传差异，换言之， 这些个体源于同一均数的群体； 3、所涉及到的各种群体参数，如误差方差协方 差、育种值方差协方差等是已知的。
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2
单项资料估计个体育种值
• （1）个体本身信息估计个体育种值 • （2）系谱信息估计个体育种值 • （3）同胞信息估计个体育种值 • （4）后裔信息估计个体育种值 • （5）各种个体育种值估计方法的相对效率
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3
单项资料估计个体育种值的方法一览表
单项资料（15 种）估计个体 育种值的方法
后裔信息估计个体育种值
• ①一个子女单次度量表型值PO来估计个体育种 值
• ②一个子女k次度量均值来估计个体育种值
• ③n个子女单次度量均值 或 来估计个体育 种值
• ④n个子女各有k次记录均值 或 来估计个体 育种值
信 息
资料 类型
一个个 体单次 度量值
个 bAP 体 rAP
亲 bAP 本 rAP
1. 个体本身资料
2. 亲本资料
3. 同胞资料（包 括全同胞Fs和半 同胞Hs）
4. 后裔资料（包 括Fs子女和Hs子 女资料）
(1) 个体本身单次表型值P (2) 个体本身k次表型值的均值
(3) 一个亲本单次表型值PP (4) 一个亲本k次表型值的均值 P Pk
(5) 双亲单次表型值的均值 P P
并与其它育种值估计方法的复相关系数相比计 算相对效率。
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随机交配群体中常用的亲属间亲缘相关系数
RA 个体I
S D SS SD DS DD FS HS FO HO RHV 0.5 0.5 0.25 0.25 0.25 0.25 0.5 0.25 0.5 0.5 1
父亲S
0 0.5 0.5 0
0 0.5 0.5 0.25 0.25 0.5
母亲D
0
0 0.5 00
0 0.25 0.25 0.125 0.125 0.25
祖母SD
0
0 0.25 0.25 0.125 0.125 0.25
外祖父DS
0 0.25 0 0.125 0.125 0.25
(14) n个子女单次度量均值 或 (15) n个子女各有k次记录均值 POF 或 POH
• ①个体本身单次表型值P来估计个体育种值
• ②个体本身k次表型值的均值 来估计个体育种 值
系谱信息估计个体育种值
• ①一个亲本单次表型值PP来估计个体育种值
• ②一个亲本k次表型值的均值 来估计个体育种 值
第十一章 多性状选择原理和方法概述
重点提示：本章重点论述了个体育种 值估计原理和方法，多性状选择的基 本方法，综合选择指数的应用前提和 局限以及相对效率比较。
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第一节 个体育种值估计
• 估计育种值 （estimated breeding value， EBV）：利用统计分析方法，通过表型值和个 体间的亲缘关系来对育种值进行估计，由此得 到的估计值。